Protein–RNA interactions for Protein: P70275

Sema3e, Semaphorin-3E, mousemouse

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Length 775 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sema3eP70275 Tnks1bp1-201ENSMUST00000048400 4799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.02
Sema3eP70275 Gak-201ENSMUST00000046603 4453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.02
Sema3eP70275 Tfap2a-201ENSMUST00000021787 3487 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.02
Sema3eP70275 Cct6a-202ENSMUST00000201414 2454 ntTSL 5 BASIC14.95□□□□□ -0.02
Sema3eP70275 Fbxo41-202ENSMUST00000161078 6562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Sema3eP70275 Apaf1-201ENSMUST00000020157 6577 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Sema3eP70275 Tcirg1-211ENSMUST00000145791 2729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Sema3eP70275 Spg20-204ENSMUST00000118118 3981 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Sema3eP70275 Kctd20-203ENSMUST00000118762 3839 ntTSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Sema3eP70275 Igsf23-204ENSMUST00000208974 1850 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Sema3eP70275 Slc34a1-201ENSMUST00000057167 2433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Sema3eP70275 Cbs-202ENSMUST00000078509 2403 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Sema3eP70275 Gm45779-201ENSMUST00000212189 4064 ntBASIC14.95□□□□□ -0.02
Sema3eP70275 Hhatl-202ENSMUST00000163981 1744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Sema3eP70275 Tulp2-201ENSMUST00000024233 1749 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Sema3eP70275 Sipa1-201ENSMUST00000071857 3868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Sema3eP70275 Mfrp-202ENSMUST00000161381 4254 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Sema3eP70275 Nfat5-203ENSMUST00000125721 5899 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.95□□□□□ -0.02
Sema3eP70275 Cnnm2-202ENSMUST00000099373 3558 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Sema3eP70275 S100pbp-205ENSMUST00000117350 2241 ntTSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Sema3eP70275 Slc25a25-204ENSMUST00000113308 2643 ntTSL 5 BASIC14.95□□□□□ -0.02
Sema3eP70275 Tnfrsf18-202ENSMUST00000103173 1189 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Sema3eP70275 6030468B19Rik-201ENSMUST00000106331 1071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Sema3eP70275 Rpl3-ps1-201ENSMUST00000120557 1210 ntBASIC14.95□□□□□ -0.02
Sema3eP70275 Pdlim2-205ENSMUST00000129174 729 ntTSL 2 BASIC14.95□□□□□ -0.02
Sema3eP70275 Gm11791-201ENSMUST00000139327 336 ntTSL 3 BASIC14.95□□□□□ -0.02
Sema3eP70275 C030017D09Rik-201ENSMUST00000163690 923 ntTSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Sema3eP70275 Gm2546-201ENSMUST00000182630 991 ntBASIC14.95□□□□□ -0.02
Sema3eP70275 Gm4691-202ENSMUST00000182989 885 ntTSL 5 BASIC14.95□□□□□ -0.02
Sema3eP70275 Gm33474-201ENSMUST00000199486 1231 ntTSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Sema3eP70275 Fmr1nb-202ENSMUST00000071848 842 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Sema3eP70275 Lrp10-201ENSMUST00000022782 4228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Sema3eP70275 Daam2-202ENSMUST00000224595 1926 ntBASIC14.95□□□□□ -0.02
Sema3eP70275 Adamts8-201ENSMUST00000068135 3631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Sema3eP70275 Poc1b-203ENSMUST00000159228 1799 ntTSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Sema3eP70275 Dctn2-201ENSMUST00000026479 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Sema3eP70275 Cnppd1-201ENSMUST00000041213 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Sema3eP70275 Etfrf1-207ENSMUST00000111726 1374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Sema3eP70275 Rpe-201ENSMUST00000027157 2692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Sema3eP70275 Arid5a-208ENSMUST00000137906 5504 ntTSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Sema3eP70275 Pip5k1c-210ENSMUST00000163075 4208 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Sema3eP70275 Ebag9-201ENSMUST00000022964 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Sema3eP70275 Tubb2a-201ENSMUST00000056427 1610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Sema3eP70275 Adgrv1-205ENSMUST00000126444 3823 ntTSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Sema3eP70275 Fam20a-201ENSMUST00000020938 2541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Sema3eP70275 Gm19221-201ENSMUST00000221827 1477 ntBASIC14.95□□□□□ -0.02
Sema3eP70275 Ube3b-201ENSMUST00000074002 5194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Sema3eP70275 Zfp574-202ENSMUST00000179556 4140 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Sema3eP70275 Stau2-215ENSMUST00000162435 2735 ntTSL 5 BASIC14.94□□□□□ -0.02
Sema3eP70275 Gm16741-201ENSMUST00000145085 1818 ntTSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Sema3eP70275 Zfp219-201ENSMUST00000067549 2933 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Sema3eP70275 Usf1-208ENSMUST00000161241 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Sema3eP70275 Abi2-201ENSMUST00000052332 5768 ntTSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Sema3eP70275 Gm7789-202ENSMUST00000211273 1400 ntBASIC14.94□□□□□ -0.02
Sema3eP70275 Tcp11l1-201ENSMUST00000028597 3512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Sema3eP70275 Dnm1-203ENSMUST00000113350 3258 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.94□□□□□ -0.02
Sema3eP70275 Tbx4-201ENSMUST00000000096 3011 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Sema3eP70275 Cog3-201ENSMUST00000049168 4222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Sema3eP70275 Abra-201ENSMUST00000054742 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Sema3eP70275 Nccrp1-201ENSMUST00000057974 1531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Sema3eP70275 Tbl1xr1-203ENSMUST00000193734 8237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Sema3eP70275 Mrpl55-203ENSMUST00000108785 792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Sema3eP70275 Gm20521-201ENSMUST00000134077 1245 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.94□□□□□ -0.02
Sema3eP70275 Gm5597-201ENSMUST00000182353 1193 ntBASIC14.94□□□□□ -0.02
Sema3eP70275 6530403H02Rik-204ENSMUST00000183276 659 ntTSL 3 BASIC14.94□□□□□ -0.02
Sema3eP70275 Gm6652-201ENSMUST00000186414 1070 ntBASIC14.94□□□□□ -0.02
Sema3eP70275 Pcbd1-201ENSMUST00000020298 789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Sema3eP70275 Timm9-203ENSMUST00000220482 859 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.94□□□□□ -0.02
Sema3eP70275 H2-M10.2-201ENSMUST00000023845 1113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Sema3eP70275 Olfr524-201ENSMUST00000051943 1058 ntAPPRIS P1 BASIC14.94□□□□□ -0.02
Sema3eP70275 Gm22058-201ENSMUST00000083393 310 ntBASIC14.94□□□□□ -0.02
Sema3eP70275 Gm6502-202ENSMUST00000097478 1218 ntTSL 5 BASIC14.94□□□□□ -0.02
Sema3eP70275 Sass6-206ENSMUST00000198386 1894 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Sema3eP70275 Klhl18-203ENSMUST00000198164 4538 ntTSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Sema3eP70275 AC167669.2-201ENSMUST00000224417 1620 ntBASIC14.94□□□□□ -0.02
Sema3eP70275 Serpinb13-201ENSMUST00000027564 1607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Sema3eP70275 Nek8-201ENSMUST00000017549 2809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Sema3eP70275 Gm7993-201ENSMUST00000200970 1384 ntBASIC14.94□□□□□ -0.02
Sema3eP70275 Gm28230-201ENSMUST00000053932 3527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Sema3eP70275 2210406O10Rik-202ENSMUST00000122882 1743 ntTSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Sema3eP70275 Nfasc-207ENSMUST00000187861 4927 ntTSL 5 BASIC14.94□□□□□ -0.02
Sema3eP70275 AC139054.1-201ENSMUST00000226898 1598 ntBASIC14.94□□□□□ -0.02
Sema3eP70275 Tead1-201ENSMUST00000059768 9964 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Sema3eP70275 Kcnk13-204ENSMUST00000177549 3075 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.94□□□□□ -0.02
Sema3eP70275 Ell-201ENSMUST00000093454 3072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Sema3eP70275 Myt1l-204ENSMUST00000218198 2735 ntTSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Sema3eP70275 Atat1-212ENSMUST00000141662 2034 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Sema3eP70275 Tmem51os1-203ENSMUST00000150202 1667 ntTSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Sema3eP70275 Dnmt3b-206ENSMUST00000103151 3956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Sema3eP70275 Lmx1b-201ENSMUST00000041730 4790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Sema3eP70275 Cggbp1-201ENSMUST00000067744 4425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Sema3eP70275 Tufm-202ENSMUST00000106392 1754 ntTSL 2 BASIC14.93□□□□□ -0.02
Sema3eP70275 Gm30725-201ENSMUST00000195170 1419 ntTSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Sema3eP70275 Ank-201ENSMUST00000022875 3498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Sema3eP70275 Lamb2-201ENSMUST00000065014 5629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Sema3eP70275 Dnajc27-201ENSMUST00000020986 4698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Sema3eP70275 Ccser2-202ENSMUST00000090024 7509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Sema3eP70275 Mrps35-201ENSMUST00000036111 4162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Sema3eP70275 Smpd4-206ENSMUST00000163997 1722 ntTSL 5 BASIC14.93□□□□□ -0.02
Sema3eP70275 Pax7-202ENSMUST00000174681 1725 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.93□□□□□ -0.02
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 51.1 ms