Protein–RNA interactions for Protein: P62858

Rps28, 40S ribosomal protein S28, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 69 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rps28P62858 Lrpap1-201ENSMUST00000030986 2981 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.5□□□□□ -1.21
Rps28P62858 Micalcl-201ENSMUST00000033033 2259 ntTSL 1 (best) BASIC7.5□□□□□ -1.21
Rps28P62858 Git2-202ENSMUST00000086564 2984 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.5□□□□□ -1.21
Rps28P62858 Olfr429-202ENSMUST00000216346 2510 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC7.5□□□□□ -1.21
Rps28P62858 Rac1-201ENSMUST00000080537 4159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.5□□□□□ -1.21
Rps28P62858 4930518J20Rik-201ENSMUST00000195064 1478 ntBASIC7.5□□□□□ -1.21
Rps28P62858 Alg5-201ENSMUST00000044567 1471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.5□□□□□ -1.21
Rps28P62858 Ankrd11-201ENSMUST00000098333 7995 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.5□□□□□ -1.21
Rps28P62858 Ctnnd1-205ENSMUST00000111670 5047 ntTSL 1 (best) BASIC7.5□□□□□ -1.21
Rps28P62858 Tulp2-201ENSMUST00000024233 1749 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC7.5□□□□□ -1.21
Rps28P62858 Dennd4a-201ENSMUST00000038890 8645 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.5□□□□□ -1.21
Rps28P62858 Zfp512-201ENSMUST00000076264 3299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.5□□□□□ -1.21
Rps28P62858 Kcnj9-201ENSMUST00000062387 3857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.5□□□□□ -1.21
Rps28P62858 Ccdc171-204ENSMUST00000126429 1388 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.5□□□□□ -1.21
Rps28P62858 Mms22l-205ENSMUST00000138567 1350 ntTSL 2 BASIC7.5□□□□□ -1.21
Rps28P62858 Peg3-201ENSMUST00000051209 8694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.5□□□□□ -1.21
Rps28P62858 Rad17-201ENSMUST00000022136 2839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.5□□□□□ -1.21
Rps28P62858 Hpcal4-202ENSMUST00000106246 1627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.5□□□□□ -1.21
Rps28P62858 Sema4g-203ENSMUST00000179305 4290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.5□□□□□ -1.21
Rps28P62858 Ap5z1-201ENSMUST00000038699 3689 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC7.5□□□□□ -1.21
Rps28P62858 Nrf1-208ENSMUST00000115208 2492 ntTSL 5 BASIC7.5□□□□□ -1.21
Rps28P62858 Megf11-203ENSMUST00000118485 3944 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.5□□□□□ -1.21
Rps28P62858 Dis3l-208ENSMUST00000168844 3575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.5□□□□□ -1.21
Rps28P62858 Olfr775-202ENSMUST00000214109 3598 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.5□□□□□ -1.21
Rps28P62858 Tbc1d14-205ENSMUST00000136189 4436 ntTSL 1 (best) BASIC7.5□□□□□ -1.21
Rps28P62858 Arpc3-202ENSMUST00000102525 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.5□□□□□ -1.21
Rps28P62858 Gosr2-202ENSMUST00000107013 1044 ntTSL 2 BASIC7.5□□□□□ -1.21
Rps28P62858 Gm13186-201ENSMUST00000118031 316 ntBASIC7.5□□□□□ -1.21
Rps28P62858 Mpc1-205ENSMUST00000142594 961 ntTSL 5 BASIC7.5□□□□□ -1.21
Rps28P62858 Rin3-207ENSMUST00000150795 937 ntTSL 1 (best) BASIC7.5□□□□□ -1.21
Rps28P62858 Sirpa-213ENSMUST00000163034 677 ntTSL 3 BASIC7.5□□□□□ -1.21
Rps28P62858 Gm18958-201ENSMUST00000174258 762 ntBASIC7.5□□□□□ -1.21
Rps28P62858 Gpx7-202ENSMUST00000184609 331 ntTSL 3 BASIC7.5□□□□□ -1.21
Rps28P62858 1700097N02Rik-201ENSMUST00000188852 845 ntTSL 3 BASIC7.5□□□□□ -1.21
Rps28P62858 Jsrp1-201ENSMUST00000020435 955 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC7.5□□□□□ -1.21
Rps28P62858 Taf11-201ENSMUST00000025057 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.5□□□□□ -1.21
Rps28P62858 Fbl-201ENSMUST00000042405 1197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.5□□□□□ -1.21
Rps28P62858 Hspb1-201ENSMUST00000005077 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.5□□□□□ -1.21
Rps28P62858 Rpl35-201ENSMUST00000080861 946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.5□□□□□ -1.21
Rps28P62858 Pik3c3-201ENSMUST00000091978 2998 ntTSL 1 (best) BASIC7.5□□□□□ -1.21
Rps28P62858 Mslnl-201ENSMUST00000047098 2628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.5□□□□□ -1.21
Rps28P62858 Pld1-201ENSMUST00000067757 4804 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC7.5□□□□□ -1.21
Rps28P62858 Fam83c-201ENSMUST00000029143 3972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.5□□□□□ -1.21
Rps28P62858 Zfp384-204ENSMUST00000088308 2875 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC7.5□□□□□ -1.21
Rps28P62858 Alg14-201ENSMUST00000039442 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.5□□□□□ -1.21
Rps28P62858 Enpp5-201ENSMUST00000024756 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.5□□□□□ -1.21
Rps28P62858 Svs1-201ENSMUST00000037696 2775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.5□□□□□ -1.21
Rps28P62858 Gm10371-201ENSMUST00000127429 1411 ntTSL 2 BASIC7.5□□□□□ -1.21
Rps28P62858 Agmat-201ENSMUST00000038161 1407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.5□□□□□ -1.21
Rps28P62858 Ces1f-201ENSMUST00000034178 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.5□□□□□ -1.21
Rps28P62858 Ube2c-201ENSMUST00000001439 2191 ntTSL 1 (best) BASIC7.5□□□□□ -1.21
Rps28P62858 Olfr1124-202ENSMUST00000215909 2422 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.5□□□□□ -1.21
Rps28P62858 Celf5-202ENSMUST00000119060 4166 ntTSL 1 (best) BASIC7.5□□□□□ -1.21
Rps28P62858 Capn15-204ENSMUST00000212149 4555 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC7.5□□□□□ -1.21
Rps28P62858 Gm28042-203ENSMUST00000156805 2844 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.5□□□□□ -1.21
Rps28P62858 Henmt1-203ENSMUST00000106586 1838 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC7.5□□□□□ -1.21
Rps28P62858 Gm16741-201ENSMUST00000145085 1818 ntTSL 1 (best) BASIC7.5□□□□□ -1.21
Rps28P62858 Smpd5-202ENSMUST00000163991 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.5□□□□□ -1.21
Rps28P62858 Lgals8-201ENSMUST00000099820 2736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.5□□□□□ -1.21
Rps28P62858 Herc4-201ENSMUST00000020258 3898 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC7.5□□□□□ -1.21
Rps28P62858 Fam53c-202ENSMUST00000097622 4256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.49□□□□□ -1.21
Rps28P62858 A130010J15Rik-205ENSMUST00000178744 3782 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC7.49□□□□□ -1.21
Rps28P62858 Kansl3-201ENSMUST00000010597 4663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.49□□□□□ -1.21
Rps28P62858 Tns1-201ENSMUST00000169786 9966 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.49□□□□□ -1.21
Rps28P62858 Fyn-205ENSMUST00000135242 2114 ntTSL 1 (best) BASIC7.49□□□□□ -1.21
Rps28P62858 Dcc-202ENSMUST00000114943 5219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.49□□□□□ -1.21
Rps28P62858 Ptn-201ENSMUST00000101534 1614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.49□□□□□ -1.21
Rps28P62858 Zfp597-201ENSMUST00000090522 5668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.49□□□□□ -1.21
Rps28P62858 Fank1-201ENSMUST00000065359 2004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.49□□□□□ -1.21
Rps28P62858 Gm45191-201ENSMUST00000205846 5439 ntBASIC7.49□□□□□ -1.21
Rps28P62858 Lrg1-201ENSMUST00000041357 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.49□□□□□ -1.21
Rps28P62858 Gm37798-201ENSMUST00000193026 2169 ntTSL 1 (best) BASIC7.49□□□□□ -1.21
Rps28P62858 Krt42-201ENSMUST00000017270 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.49□□□□□ -1.21
Rps28P62858 Mirg-201ENSMUST00000181496 1906 ntTSL 1 (best) BASIC7.49□□□□□ -1.21
Rps28P62858 Trpm1-219ENSMUST00000206314 2323 ntTSL 1 (best) BASIC7.49□□□□□ -1.21
Rps28P62858 Gdpd5-208ENSMUST00000213887 2711 ntTSL 5 BASIC7.49□□□□□ -1.21
Rps28P62858 Cit-201ENSMUST00000051704 9514 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC7.49□□□□□ -1.21
Rps28P62858 Zfp217-202ENSMUST00000109155 5670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.49□□□□□ -1.21
Rps28P62858 Lingo1-201ENSMUST00000053568 3295 ntTSL 1 (best) BASIC7.49□□□□□ -1.21
Rps28P62858 Gpr108-201ENSMUST00000005975 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.49□□□□□ -1.21
Rps28P62858 Gm15440-201ENSMUST00000110042 1231 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.49□□□□□ -1.21
Rps28P62858 Gng12-206ENSMUST00000114227 1125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.49□□□□□ -1.21
Rps28P62858 Gm11439-201ENSMUST00000118598 409 ntBASIC7.49□□□□□ -1.21
Rps28P62858 Tspan2-202ENSMUST00000119902 961 ntTSL 1 (best) BASIC7.49□□□□□ -1.21
Rps28P62858 Gm13534-201ENSMUST00000121169 513 ntBASIC7.49□□□□□ -1.21
Rps28P62858 Gm2445-201ENSMUST00000182798 989 ntBASIC7.49□□□□□ -1.21
Rps28P62858 Rab6b-202ENSMUST00000189134 716 ntTSL 3 BASIC7.49□□□□□ -1.21
Rps28P62858 Gm33037-201ENSMUST00000217927 642 ntTSL 3 BASIC7.49□□□□□ -1.21
Rps28P62858 Rtn4rl2-201ENSMUST00000054514 1263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.49□□□□□ -1.21
Rps28P62858 Eif3a-201ENSMUST00000025955 5176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.49□□□□□ -1.21
Rps28P62858 Rrp7a-201ENSMUST00000018184 4363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.49□□□□□ -1.21
Rps28P62858 Eif4a2-201ENSMUST00000023599 2208 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC7.49□□□□□ -1.21
Rps28P62858 Gm43720-201ENSMUST00000159067 6411 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.49□□□□□ -1.21
Rps28P62858 A530021J07Rik-202ENSMUST00000207727 1406 ntTSL 1 (best) BASIC7.49□□□□□ -1.21
Rps28P62858 Synpr-201ENSMUST00000070323 2541 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC7.49□□□□□ -1.21
Rps28P62858 Zfp217-201ENSMUST00000063710 5685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.49□□□□□ -1.21
Rps28P62858 Ppp1r11-201ENSMUST00000040402 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.49□□□□□ -1.21
Rps28P62858 Qtrt2-201ENSMUST00000023387 2838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.49□□□□□ -1.21
Rps28P62858 5930420M18Rik-201ENSMUST00000202893 2281 ntBASIC7.49□□□□□ -1.21
Rps28P62858 AC131104.1-201ENSMUST00000222118 1739 ntTSL 5 BASIC7.49□□□□□ -1.21
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 41.9 ms