Protein–RNA interactions for Protein: P62737

Acta2, Actin, aortic smooth muscle, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 377 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Acta2P62737 Nde1-203ENSMUST00000117958 1551 ntTSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Acta2P62737 Hck-204ENSMUST00000191431 1575 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Acta2P62737 Rnf4-201ENSMUST00000030992 2895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Acta2P62737 Elk1-201ENSMUST00000009550 3548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Acta2P62737 Gdap1l1-202ENSMUST00000109420 2475 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Acta2P62737 Ncln-201ENSMUST00000020463 3118 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Acta2P62737 Rubcn-202ENSMUST00000089684 5311 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Acta2P62737 Fbf1-202ENSMUST00000106435 4651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Acta2P62737 Stx11-202ENSMUST00000163425 4032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Acta2P62737 Gm13883-201ENSMUST00000150450 1404 ntTSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Acta2P62737 AC096628.2-201ENSMUST00000225443 1413 ntBASIC11.63□□□□□ -0.55
Acta2P62737 Pitpnm2-204ENSMUST00000159677 1690 ntTSL 5 BASIC11.63□□□□□ -0.55
Acta2P62737 Bcl2l1-202ENSMUST00000109820 2568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Acta2P62737 Calcoco1-201ENSMUST00000023818 2822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Acta2P62737 Elf1-201ENSMUST00000040131 4235 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Acta2P62737 Vps36-201ENSMUST00000033866 3574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Acta2P62737 Sipa1l3-207ENSMUST00000182484 2420 ntTSL 5 BASIC11.63□□□□□ -0.55
Acta2P62737 Mcfd2-202ENSMUST00000129616 813 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.63□□□□□ -0.55
Acta2P62737 Gm14206-201ENSMUST00000132973 747 ntTSL 3 BASIC11.63□□□□□ -0.55
Acta2P62737 9530003J23Rik-202ENSMUST00000159193 1033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Acta2P62737 Zdhhc23-202ENSMUST00000165648 1278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Acta2P62737 Gm27618-201ENSMUST00000183671 60 ntBASIC11.63□□□□□ -0.55
Acta2P62737 Gm37277-201ENSMUST00000194052 1111 ntBASIC11.63□□□□□ -0.55
Acta2P62737 1700025J12Rik-201ENSMUST00000205586 630 ntTSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Acta2P62737 AC139382.1-201ENSMUST00000221402 498 ntBASIC11.63□□□□□ -0.55
Acta2P62737 Calml4-201ENSMUST00000034777 864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Acta2P62737 Pdzd11-202ENSMUST00000059099 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Acta2P62737 Wdr25-202ENSMUST00000167816 2657 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.63□□□□□ -0.55
Acta2P62737 Flcn-202ENSMUST00000091246 2768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Acta2P62737 Myo18a-220ENSMUST00000164334 5381 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.63□□□□□ -0.55
Acta2P62737 Pygm-201ENSMUST00000035269 2874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Acta2P62737 Klhl26-201ENSMUST00000066597 2991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Acta2P62737 Sorl1-201ENSMUST00000060989 10715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Acta2P62737 Gm11732-201ENSMUST00000151381 1742 ntTSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Acta2P62737 Gnb2-202ENSMUST00000111020 1470 ntTSL 5 BASIC11.63□□□□□ -0.55
Acta2P62737 Rbm39-203ENSMUST00000109587 2810 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Acta2P62737 Olfr533-206ENSMUST00000217179 2825 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.63□□□□□ -0.55
Acta2P62737 Slx4-201ENSMUST00000040790 5706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Acta2P62737 Cyyr1-201ENSMUST00000114174 5464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Acta2P62737 Nub1-202ENSMUST00000197407 3546 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Acta2P62737 Msi2-203ENSMUST00000107909 6436 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Acta2P62737 Acoxl-202ENSMUST00000110344 1573 ntTSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Acta2P62737 9230110C19Rik-201ENSMUST00000065291 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Acta2P62737 Igsf5-202ENSMUST00000081093 1554 ntTSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Acta2P62737 Polr3e-202ENSMUST00000106483 3001 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC11.62□□□□□ -0.55
Acta2P62737 Gm18263-201ENSMUST00000220846 1928 ntBASIC11.62□□□□□ -0.55
Acta2P62737 Lrrc8c-201ENSMUST00000067924 6976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Acta2P62737 Nup98-201ENSMUST00000070165 4052 ntTSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Acta2P62737 Il12rb1-201ENSMUST00000000808 2873 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Acta2P62737 Micalcl-201ENSMUST00000033033 2259 ntTSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Acta2P62737 Coasy-202ENSMUST00000107308 2386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Acta2P62737 9130019O22Rik-202ENSMUST00000164345 2735 ntTSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Acta2P62737 Extl3-203ENSMUST00000225633 6013 ntAPPRIS P1 BASIC11.62□□□□□ -0.55
Acta2P62737 Ccng1-201ENSMUST00000020576 3512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Acta2P62737 7420426K07Rik-201ENSMUST00000098460 1504 ntAPPRIS P1 BASIC11.62□□□□□ -0.55
Acta2P62737 Stox2-209ENSMUST00000211882 9696 ntTSL 5 BASIC11.62□□□□□ -0.55
Acta2P62737 Rbm11-203ENSMUST00000114253 2699 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Acta2P62737 B9d1-201ENSMUST00000102657 817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Acta2P62737 Mif4gd-202ENSMUST00000106506 993 ntTSL 3 BASIC11.62□□□□□ -0.55
Acta2P62737 Gfpt1-203ENSMUST00000113657 1200 ntTSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Acta2P62737 Isg20-202ENSMUST00000118867 697 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.62□□□□□ -0.55
Acta2P62737 Gm15317-201ENSMUST00000129569 699 ntTSL 3 BASIC11.62□□□□□ -0.55
Acta2P62737 Gm11752-201ENSMUST00000143291 510 ntTSL 2 BASIC11.62□□□□□ -0.55
Acta2P62737 1010001B22Rik-201ENSMUST00000181488 589 ntTSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Acta2P62737 Gm26808-201ENSMUST00000181569 411 ntTSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Acta2P62737 Gm17837-201ENSMUST00000186435 985 ntBASIC11.62□□□□□ -0.55
Acta2P62737 Gm19265-201ENSMUST00000201818 894 ntTSL 3 BASIC11.62□□□□□ -0.55
Acta2P62737 Gm8239-201ENSMUST00000204094 444 ntTSL 2 BASIC11.62□□□□□ -0.55
Acta2P62737 4930502A04Rik-201ENSMUST00000214059 865 ntTSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Acta2P62737 AC165157.4-201ENSMUST00000220587 139 ntBASIC11.62□□□□□ -0.55
Acta2P62737 AC154305.4-201ENSMUST00000224520 614 ntBASIC11.62□□□□□ -0.55
Acta2P62737 Isg20-201ENSMUST00000038142 1083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Acta2P62737 Cfd-201ENSMUST00000061653 922 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Acta2P62737 Map3k4-201ENSMUST00000089058 5305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Acta2P62737 Bcl2l13-201ENSMUST00000009256 6925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Acta2P62737 Ctdspl2-201ENSMUST00000036647 5053 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Acta2P62737 Tfe3-206ENSMUST00000115679 3239 ntTSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Acta2P62737 Cidec-201ENSMUST00000032416 1703 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Acta2P62737 Pik3r1-202ENSMUST00000055518 7113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Acta2P62737 Arl14ep-201ENSMUST00000028536 3337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Acta2P62737 Adk-207ENSMUST00000224069 1818 ntAPPRIS ALT1 BASIC11.62□□□□□ -0.55
Acta2P62737 Armc7-201ENSMUST00000035240 2260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Acta2P62737 Tspan13-201ENSMUST00000020896 1932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Acta2P62737 Kcnb1-204ENSMUST00000207917 11153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Acta2P62737 Pbrm1-206ENSMUST00000112094 5154 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC11.62□□□□□ -0.55
Acta2P62737 Parp3-202ENSMUST00000112479 2030 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Acta2P62737 Arhgap30-201ENSMUST00000056449 4494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Acta2P62737 Gm595-201ENSMUST00000114928 2122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Acta2P62737 Gm14866-201ENSMUST00000149206 2118 ntTSL 2 BASIC11.62□□□□□ -0.55
Acta2P62737 Tmem254a-204ENSMUST00000185006 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Acta2P62737 Zkscan3-207ENSMUST00000223831 2101 ntBASIC11.62□□□□□ -0.55
Acta2P62737 Ccdc187-201ENSMUST00000057224 3148 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Acta2P62737 Rpl9-204ENSMUST00000127874 2690 ntTSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Acta2P62737 Gsdme-201ENSMUST00000031845 2502 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
Acta2P62737 Tbata-201ENSMUST00000035894 1506 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC11.61□□□□□ -0.55
Acta2P62737 Cnn1-201ENSMUST00000001384 2381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
Acta2P62737 Kcnq3-201ENSMUST00000070256 11824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
Acta2P62737 Olfr707-203ENSMUST00000210644 1817 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.61□□□□□ -0.55
Acta2P62737 Arhgap22-202ENSMUST00000111956 2596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
Acta2P62737 Sstr5-202ENSMUST00000165183 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 56.6 ms