Protein–RNA interactions for Protein: P61406

Smg6, Telomerase-binding protein EST1A, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 1,418 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Smg6P61406 AC153938.1-201ENSMUST00000220354 1425 ntTSL 5 BASIC17.89■□□□□ 0.45
Smg6P61406 Alppl2-202ENSMUST00000188310 2016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Smg6P61406 Micalcl-201ENSMUST00000033033 2259 ntTSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Smg6P61406 Tmem39a-201ENSMUST00000002924 2871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Smg6P61406 Dnmt3b-205ENSMUST00000103150 4070 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Smg6P61406 Sh3bp5l-202ENSMUST00000116376 3016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Smg6P61406 Rnf17-202ENSMUST00000223627 2077 ntBASIC17.89■□□□□ 0.45
Smg6P61406 Gpatch4-203ENSMUST00000193398 2210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Smg6P61406 Ifi35-201ENSMUST00000010502 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Smg6P61406 Ficd-201ENSMUST00000065698 3133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Smg6P61406 Tpm3-rs7-201ENSMUST00000072359 2147 ntAPPRIS P1 BASIC17.89■□□□□ 0.45
Smg6P61406 Kcnh1-202ENSMUST00000110844 7161 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Smg6P61406 Tepsin-201ENSMUST00000026442 2752 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Smg6P61406 Qdpr-202ENSMUST00000117425 1231 ntTSL 3 BASIC17.89■□□□□ 0.45
Smg6P61406 Rps2-ps9-201ENSMUST00000121414 817 ntBASIC17.89■□□□□ 0.45
Smg6P61406 Gm15351-201ENSMUST00000123920 419 ntTSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Smg6P61406 Gm8565-201ENSMUST00000183259 1014 ntBASIC17.89■□□□□ 0.45
Smg6P61406 Kitl-204ENSMUST00000218200 564 ntTSL 5 BASIC17.89■□□□□ 0.45
Smg6P61406 Lcn10-201ENSMUST00000058912 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Smg6P61406 Rpl10-202ENSMUST00000074085 855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Smg6P61406 Slamf8-201ENSMUST00000065679 1659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Smg6P61406 Rnf220-202ENSMUST00000094853 1675 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Smg6P61406 Acoxl-202ENSMUST00000110344 1573 ntTSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Smg6P61406 Eif4g1-203ENSMUST00000115457 5440 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.88■□□□□ 0.45
Smg6P61406 Snx14-207ENSMUST00000174806 3082 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.88■□□□□ 0.45
Smg6P61406 B4galnt3-203ENSMUST00000212457 2958 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.88■□□□□ 0.45
Smg6P61406 Gm7114-201ENSMUST00000190159 1789 ntBASIC17.88■□□□□ 0.45
Smg6P61406 Gpat3-201ENSMUST00000031255 2884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Smg6P61406 Slc12a8-206ENSMUST00000122427 2070 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.88■□□□□ 0.45
Smg6P61406 Fbxl5-211ENSMUST00000196483 2814 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Smg6P61406 Fbln1-201ENSMUST00000057410 3659 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Smg6P61406 Mau2-201ENSMUST00000050561 5369 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Smg6P61406 Mapkapk5-205ENSMUST00000111786 975 ntTSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Smg6P61406 Agbl3-202ENSMUST00000115012 790 ntTSL 3 BASIC17.88■□□□□ 0.45
Smg6P61406 Agbl3-203ENSMUST00000115014 805 ntTSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Smg6P61406 Litaf-202ENSMUST00000117360 763 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.88■□□□□ 0.45
Smg6P61406 Mir3102-201ENSMUST00000175555 104 ntBASIC17.88■□□□□ 0.45
Smg6P61406 Gm28380-201ENSMUST00000188800 385 ntTSL 5 BASIC17.88■□□□□ 0.45
Smg6P61406 CU024892.2-201ENSMUST00000224608 832 ntBASIC17.88■□□□□ 0.45
Smg6P61406 Gng8-201ENSMUST00000078182 910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Smg6P61406 Rpl10l-201ENSMUST00000081908 1023 ntAPPRIS P1 BASIC17.88■□□□□ 0.45
Smg6P61406 Lztr1-201ENSMUST00000023444 3112 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Smg6P61406 Psmc3-203ENSMUST00000111441 1419 ntTSL 5 BASIC17.88■□□□□ 0.45
Smg6P61406 Mier3-203ENSMUST00000109272 5279 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Smg6P61406 Map6-205ENSMUST00000207883 3431 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Smg6P61406 Sstr5-202ENSMUST00000165183 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Smg6P61406 Slc6a20a-201ENSMUST00000040960 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Smg6P61406 Agap1-202ENSMUST00000074945 10069 ntTSL 5 BASIC17.88■□□□□ 0.45
Smg6P61406 Pigq-201ENSMUST00000026823 3173 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Smg6P61406 Sugp2-214ENSMUST00000164403 4099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Smg6P61406 Runx2-203ENSMUST00000113572 6463 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Smg6P61406 4933406P04Rik-201ENSMUST00000092680 1789 ntBASIC17.87■□□□□ 0.45
Smg6P61406 Nek3-202ENSMUST00000110730 2050 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.87■□□□□ 0.45
Smg6P61406 Znrf1-203ENSMUST00000168428 4451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Smg6P61406 Dnajc6-204ENSMUST00000106930 5127 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Smg6P61406 Col6a2-202ENSMUST00000105413 4653 ntTSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Smg6P61406 Fam13b-201ENSMUST00000040506 3343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Smg6P61406 Rnf4-201ENSMUST00000030992 2895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Smg6P61406 Gcdh-202ENSMUST00000109745 2114 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.87■□□□□ 0.45
Smg6P61406 Ube2j2-204ENSMUST00000105582 1394 ntTSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Smg6P61406 Ccdc71-201ENSMUST00000061209 3092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Smg6P61406 Vmp1-201ENSMUST00000018315 2787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Smg6P61406 Rgs12-205ENSMUST00000114283 2628 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.87■□□□□ 0.45
Smg6P61406 Cutal-201ENSMUST00000028228 2179 ntTSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Smg6P61406 Ahcyl2-205ENSMUST00000125911 2039 ntTSL 5 BASIC17.87■□□□□ 0.45
Smg6P61406 Eif4ebp2-201ENSMUST00000020288 5784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Smg6P61406 Pou2af1-201ENSMUST00000034554 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Smg6P61406 Kpnb1-201ENSMUST00000001479 5894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Smg6P61406 Gm12050-201ENSMUST00000127483 615 ntTSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Smg6P61406 1600014C10Rik-203ENSMUST00000177983 403 ntTSL 2 BASIC17.87■□□□□ 0.45
Smg6P61406 Mien1-201ENSMUST00000002655 747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Smg6P61406 Lats2-202ENSMUST00000038381 933 ntTSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Smg6P61406 Rpl29-201ENSMUST00000059802 710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Smg6P61406 Dnal4-202ENSMUST00000069877 1011 ntTSL 5 BASIC17.87■□□□□ 0.45
Smg6P61406 Cenpm-202ENSMUST00000089157 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Smg6P61406 Usmg5-201ENSMUST00000096014 341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Smg6P61406 Scarb2-201ENSMUST00000031377 4698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Smg6P61406 Chchd10-203ENSMUST00000219839 1488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Smg6P61406 Senp5-201ENSMUST00000023457 3498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Smg6P61406 Gm10339-203ENSMUST00000225409 1671 ntBASIC17.86■□□□□ 0.45
Smg6P61406 Eln-201ENSMUST00000015138 3853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Smg6P61406 Enc1-201ENSMUST00000041623 4737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Smg6P61406 Jade1-204ENSMUST00000170711 2896 ntTSL 5 BASIC17.86■□□□□ 0.45
Smg6P61406 Bcat2-203ENSMUST00000209204 2081 ntTSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Smg6P61406 Ccnk-201ENSMUST00000101055 2627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.86■□□□□ 0.45
Smg6P61406 AC013548.1-201ENSMUST00000228850 4738 ntAPPRIS P1 BASIC17.86■□□□□ 0.45
Smg6P61406 Foxb1-201ENSMUST00000071281 2984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Smg6P61406 Plk-ps1-201ENSMUST00000119494 1787 ntBASIC17.86■□□□□ 0.45
Smg6P61406 Sh3bp2-202ENSMUST00000101316 3031 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Smg6P61406 Gm26593-201ENSMUST00000181848 1970 ntTSL 5 BASIC17.86■□□□□ 0.45
Smg6P61406 Magi1-201ENSMUST00000055224 7007 ntTSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Smg6P61406 4933431E20Rik-209ENSMUST00000146337 1636 ntTSL 5 BASIC17.86■□□□□ 0.45
Smg6P61406 Snap25-202ENSMUST00000110098 1014 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC17.86■□□□□ 0.45
Smg6P61406 Emd-204ENSMUST00000119197 768 ntTSL 3 BASIC17.86■□□□□ 0.45
Smg6P61406 Gm13369-201ENSMUST00000119442 987 ntBASIC17.86■□□□□ 0.45
Smg6P61406 Timm10-201ENSMUST00000028470 690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Smg6P61406 Nsmce1-201ENSMUST00000033006 1120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Smg6P61406 Prss2-201ENSMUST00000070380 815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Smg6P61406 Ints3-202ENSMUST00000071488 4038 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Smg6P61406 Col4a2-201ENSMUST00000033899 6450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 31 ms