Protein–RNA interactions for Protein: P58404

Strn4, Striatin-4, mousemouse

Predictions only

Length 760 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Strn4P58404 Etfrf1-202ENSMUST00000111719 968 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Strn4P58404 Gm14726-201ENSMUST00000120623 896 ntBASIC16.36■□□□□ 0.21
Strn4P58404 Nr2f1-203ENSMUST00000127137 991 ntTSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Strn4P58404 Tmem255b-202ENSMUST00000167505 1219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Strn4P58404 Gm45186-201ENSMUST00000206874 478 ntBASIC16.36■□□□□ 0.21
Strn4P58404 Gm18041-201ENSMUST00000218210 618 ntBASIC16.36■□□□□ 0.21
Strn4P58404 Odf4-201ENSMUST00000038932 1078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Strn4P58404 Mrps21-201ENSMUST00000067298 488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Strn4P58404 Pla2g5-204ENSMUST00000102513 2289 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Strn4P58404 Prr33-201ENSMUST00000054910 2251 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Strn4P58404 Acat2-201ENSMUST00000007005 2250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Strn4P58404 Iffo2-201ENSMUST00000040023 5227 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Strn4P58404 Rbm8a2-201ENSMUST00000104983 1338 ntAPPRIS P1 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Strn4P58404 Camsap2-202ENSMUST00000192001 6329 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Strn4P58404 Dnmt3l-208ENSMUST00000151242 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Strn4P58404 Wapl-205ENSMUST00000169910 4066 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Strn4P58404 Esm1-201ENSMUST00000038144 2097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Strn4P58404 Etv3-202ENSMUST00000119109 5309 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Strn4P58404 Rtn4-205ENSMUST00000102843 4618 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Strn4P58404 Rtp3-201ENSMUST00000084922 1425 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Strn4P58404 Serpinb6d-201ENSMUST00000059637 1463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Strn4P58404 Tmem215-202ENSMUST00000179526 2276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Strn4P58404 Ppp2r5c-204ENSMUST00000221074 1971 ntTSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
Strn4P58404 Pou4f3-201ENSMUST00000025374 2360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Strn4P58404 Brinp1-201ENSMUST00000030036 3212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Strn4P58404 Grin3a-201ENSMUST00000076674 7431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Strn4P58404 Gm16278-201ENSMUST00000148064 2071 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Strn4P58404 Sall4-202ENSMUST00000075044 2534 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Strn4P58404 Trpm4-201ENSMUST00000042194 4234 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Strn4P58404 Cog3-201ENSMUST00000049168 4222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Strn4P58404 Gm23270-201ENSMUST00000104055 131 ntBASIC16.35■□□□□ 0.21
Strn4P58404 Platr29-201ENSMUST00000130022 830 ntTSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
Strn4P58404 1700003G18Rik-201ENSMUST00000140689 633 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Strn4P58404 Gm17586-201ENSMUST00000181502 908 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Strn4P58404 Nmral1-201ENSMUST00000074970 1155 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Strn4P58404 Tmem51os1-204ENSMUST00000153023 3440 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Strn4P58404 5830418P13Rik-201ENSMUST00000143564 2178 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Strn4P58404 Fam110b-209ENSMUST00000171403 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Strn4P58404 Egr2-203ENSMUST00000127820 2665 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
Strn4P58404 Poli-205ENSMUST00000161542 2736 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Strn4P58404 Ttc5-201ENSMUST00000006451 1842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Strn4P58404 Nfyc-203ENSMUST00000118902 1887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Strn4P58404 Cd74-202ENSMUST00000097563 1410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Strn4P58404 Tmem251-201ENSMUST00000057416 3367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Strn4P58404 Cep85-201ENSMUST00000040271 3893 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Strn4P58404 Cog7-201ENSMUST00000057576 2902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Strn4P58404 Cggbp1-201ENSMUST00000067744 4425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Strn4P58404 Actc1-201ENSMUST00000090269 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Strn4P58404 Tpr-203ENSMUST00000124973 7430 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Strn4P58404 Rbm33-201ENSMUST00000030920 3955 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Strn4P58404 Fam20a-201ENSMUST00000020938 2541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Strn4P58404 Fbxl19-202ENSMUST00000186116 3641 ntTSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
Strn4P58404 Pafah1b1-202ENSMUST00000102520 5789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Strn4P58404 Mbp-207ENSMUST00000114674 2108 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Strn4P58404 Gm34376-201ENSMUST00000218529 2107 ntTSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
Strn4P58404 Gpr4-201ENSMUST00000060225 2882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Strn4P58404 Tbx4-201ENSMUST00000000096 3011 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Strn4P58404 Fam46a-201ENSMUST00000034802 5479 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC16.34■□□□□ 0.21
Strn4P58404 Sgms1-212ENSMUST00000151289 2488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Strn4P58404 Smg5-201ENSMUST00000001451 4448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Strn4P58404 Snord83b-201ENSMUST00000104546 94 ntBASIC16.34■□□□□ 0.21
Strn4P58404 Spsb1-202ENSMUST00000105684 1002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Strn4P58404 Styxl1-205ENSMUST00000111164 1243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Strn4P58404 Clic3-202ENSMUST00000114265 808 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Strn4P58404 Zfp629-204ENSMUST00000128731 823 ntTSL 3 BASIC16.34■□□□□ 0.21
Strn4P58404 Ly6g6c-201ENSMUST00000173207 598 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.34■□□□□ 0.21
Strn4P58404 Ly6g6c-202ENSMUST00000173478 962 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Strn4P58404 Grp-203ENSMUST00000173985 952 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
Strn4P58404 Gm27341-201ENSMUST00000183570 106 ntBASIC16.34■□□□□ 0.21
Strn4P58404 Gm9678-201ENSMUST00000198979 1149 ntBASIC16.34■□□□□ 0.21
Strn4P58404 Gm43138-201ENSMUST00000199123 708 ntBASIC16.34■□□□□ 0.21
Strn4P58404 Gm44967-201ENSMUST00000207047 631 ntBASIC16.34■□□□□ 0.21
Strn4P58404 Gm19605-202ENSMUST00000221514 1084 ntTSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
Strn4P58404 Gm18615-201ENSMUST00000222919 1031 ntBASIC16.34■□□□□ 0.21
Strn4P58404 Nmnat1-201ENSMUST00000030845 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Strn4P58404 BC049730-201ENSMUST00000051714 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Strn4P58404 Lcn10-201ENSMUST00000058912 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Strn4P58404 Arap1-204ENSMUST00000107010 5147 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Strn4P58404 Sgsm1-201ENSMUST00000048112 5161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Strn4P58404 Mroh1-202ENSMUST00000096385 5268 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Strn4P58404 Igf1-204ENSMUST00000121161 1344 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Strn4P58404 Xkr5-202ENSMUST00000095438 2838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Strn4P58404 4933431M02Rik-201ENSMUST00000203905 1432 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Strn4P58404 Chd1-202ENSMUST00000024627 7916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Strn4P58404 1700065D16Rik-205ENSMUST00000190890 2903 ntBASIC16.34■□□□□ 0.21
Strn4P58404 Gm43289-201ENSMUST00000200537 1475 ntBASIC16.34■□□□□ 0.21
Strn4P58404 Ube2g1-201ENSMUST00000021148 3815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Strn4P58404 Sema6d-208ENSMUST00000103241 6157 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
Strn4P58404 Gm10451-201ENSMUST00000101281 1598 ntTSL 2 BASIC16.34■□□□□ 0.21
Strn4P58404 Tspan32-203ENSMUST00000082008 1587 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Strn4P58404 Cct3-ps1-201ENSMUST00000118023 1647 ntBASIC16.34■□□□□ 0.21
Strn4P58404 Pcdha1-202ENSMUST00000193839 4925 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Strn4P58404 Tollip-204ENSMUST00000151890 1753 ntTSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
Strn4P58404 Nup93-201ENSMUST00000079961 2707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
Strn4P58404 Nat8f3-201ENSMUST00000050780 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
Strn4P58404 Prkg1-202ENSMUST00000073581 2841 ntTSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
Strn4P58404 Lrrc29-201ENSMUST00000070508 1922 ntTSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
Strn4P58404 Pnkp-201ENSMUST00000003044 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Strn4P58404 Fnbp1-209ENSMUST00000113562 4515 ntTSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Strn4P58404 Ap2a1-203ENSMUST00000166972 3449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 68.1 ms