Protein–RNA interactions for Protein: P56857

Cldn18, Claudin-18, mousemouse

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cldn18P56857 Cbx6-202ENSMUST00000109625 3056 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Cldn18P56857 Phka1-206ENSMUST00000122022 6115 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.66□□□□□ -0.54
Cldn18P56857 Phka1-202ENSMUST00000052012 6115 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Cldn18P56857 Hmga2-203ENSMUST00000159699 3810 ntTSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Cldn18P56857 Dst-213ENSMUST00000183302 8788 ntTSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Cldn18P56857 Gm36356-201ENSMUST00000209224 2277 ntTSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Cldn18P56857 Cyfip1-201ENSMUST00000032629 6440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Cldn18P56857 Slc16a3-208ENSMUST00000168579 4335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Cldn18P56857 Zbtb49-202ENSMUST00000114113 2645 ntTSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Cldn18P56857 Cyth1-204ENSMUST00000106305 3179 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Cldn18P56857 Fchsd1-201ENSMUST00000043437 4270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Cldn18P56857 Saa3-202ENSMUST00000210913 2200 ntTSL 3 BASIC11.66□□□□□ -0.54
Cldn18P56857 Lrrc8e-201ENSMUST00000053035 3878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Cldn18P56857 Actc1-201ENSMUST00000090269 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Cldn18P56857 Nr3c1-203ENSMUST00000115567 6436 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Cldn18P56857 Ppp4r3b-201ENSMUST00000020755 5125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Cldn18P56857 Diaph3-202ENSMUST00000168889 4582 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Cldn18P56857 Diaph3-201ENSMUST00000022599 4582 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.66□□□□□ -0.54
Cldn18P56857 Gm13226-201ENSMUST00000117838 404 ntBASIC11.66□□□□□ -0.54
Cldn18P56857 Gm11425-201ENSMUST00000119608 498 ntBASIC11.66□□□□□ -0.54
Cldn18P56857 D930015M05Rik-201ENSMUST00000126002 1190 ntTSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Cldn18P56857 Rpl12-203ENSMUST00000126610 1242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Cldn18P56857 Sbk3-201ENSMUST00000133272 1086 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.66□□□□□ -0.54
Cldn18P56857 Prss51-202ENSMUST00000165710 953 ntTSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Cldn18P56857 Gm10142-201ENSMUST00000179767 363 ntAPPRIS P1 BASIC11.66□□□□□ -0.54
Cldn18P56857 Zfp709-202ENSMUST00000188374 717 ntTSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Cldn18P56857 Gm37042-201ENSMUST00000193816 581 ntBASIC11.66□□□□□ -0.54
Cldn18P56857 Gm31651-201ENSMUST00000198864 560 ntTSL 3 BASIC11.66□□□□□ -0.54
Cldn18P56857 Mymx-204ENSMUST00000208801 437 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.66□□□□□ -0.54
Cldn18P56857 Gm32926-201ENSMUST00000214043 681 ntTSL 3 BASIC11.66□□□□□ -0.54
Cldn18P56857 AC166051.1-201ENSMUST00000214313 210 ntBASIC11.66□□□□□ -0.54
Cldn18P56857 Pfdn1-201ENSMUST00000025204 1077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Cldn18P56857 Gm9396-201ENSMUST00000076703 567 ntBASIC11.66□□□□□ -0.54
Cldn18P56857 Olfr1423-201ENSMUST00000087831 933 ntAPPRIS P1 BASIC11.66□□□□□ -0.54
Cldn18P56857 Ap4b1-203ENSMUST00000106823 2741 ntTSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Cldn18P56857 Mettl17-201ENSMUST00000047899 1623 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Cldn18P56857 Sept10-201ENSMUST00000165971 2532 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Cldn18P56857 Gm7553-201ENSMUST00000185805 1426 ntBASIC11.66□□□□□ -0.54
Cldn18P56857 Skp1a-201ENSMUST00000037324 1440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Cldn18P56857 Plekhb1-204ENSMUST00000107045 1919 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Cldn18P56857 Gm37644-201ENSMUST00000192190 2270 ntBASIC11.66□□□□□ -0.54
Cldn18P56857 Fetub-201ENSMUST00000023587 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Cldn18P56857 Phactr2-201ENSMUST00000079698 1934 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.66□□□□□ -0.54
Cldn18P56857 Slc7a6-201ENSMUST00000034378 3750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Cldn18P56857 Pax6-202ENSMUST00000090397 3069 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC11.66□□□□□ -0.54
Cldn18P56857 Suv39h1-201ENSMUST00000115636 2707 ntTSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Cldn18P56857 Rad9b-202ENSMUST00000117263 2371 ntTSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Cldn18P56857 Kpna7-203ENSMUST00000116454 1500 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Cldn18P56857 Podn-201ENSMUST00000044248 2885 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.65□□□□□ -0.54
Cldn18P56857 Slc6a18-208ENSMUST00000222029 2005 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Cldn18P56857 Rcan2-202ENSMUST00000044895 3363 ntTSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Cldn18P56857 Gm10339-203ENSMUST00000225409 1671 ntBASIC11.65□□□□□ -0.54
Cldn18P56857 Gtf2ird1-205ENSMUST00000100654 3156 ntTSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Cldn18P56857 Fam219a-202ENSMUST00000108050 3321 ntTSL 5 BASIC11.65□□□□□ -0.54
Cldn18P56857 Zfp207-206ENSMUST00000165565 2311 ntTSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Cldn18P56857 Abhd18-202ENSMUST00000108078 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Cldn18P56857 CT009713.10-201ENSMUST00000225013 1986 ntBASIC11.65□□□□□ -0.54
Cldn18P56857 Gpr12-203ENSMUST00000197431 1455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Cldn18P56857 Cpeb3-204ENSMUST00000126188 4224 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Cldn18P56857 Nfkb2-201ENSMUST00000073116 3054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Cldn18P56857 Samd11-202ENSMUST00000217934 2413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Cldn18P56857 Trim26-210ENSMUST00000179968 3203 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.65□□□□□ -0.54
Cldn18P56857 Apbb1-212ENSMUST00000189072 2085 ntTSL 5 BASIC11.65□□□□□ -0.54
Cldn18P56857 Snap25-202ENSMUST00000110098 1014 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC11.65□□□□□ -0.54
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Cldn18P56857 Pelp1-202ENSMUST00000135148 562 ntTSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
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Cldn18P56857 Gm27731-201ENSMUST00000185192 107 ntBASIC11.65□□□□□ -0.54
Cldn18P56857 Chfr-212ENSMUST00000200038 606 ntTSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Cldn18P56857 Atp6v0c-201ENSMUST00000024932 1183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Cldn18P56857 Fam241b-202ENSMUST00000064050 1096 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.65□□□□□ -0.54
Cldn18P56857 Lce3a-201ENSMUST00000067318 549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Cldn18P56857 B230118H07Rik-202ENSMUST00000099682 895 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.65□□□□□ -0.54
Cldn18P56857 Mageb10-ps-201ENSMUST00000119697 1407 ntBASIC11.65□□□□□ -0.54
Cldn18P56857 Olfr763-201ENSMUST00000077460 2523 ntAPPRIS P1 BASIC11.65□□□□□ -0.54
Cldn18P56857 AC151895.1-201ENSMUST00000219025 1742 ntBASIC11.65□□□□□ -0.54
Cldn18P56857 Igsf23-204ENSMUST00000208974 1850 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Cldn18P56857 Lztr1-201ENSMUST00000023444 3112 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Cldn18P56857 Dcaf4-208ENSMUST00000223291 2005 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Cldn18P56857 Lag3-201ENSMUST00000032217 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Cldn18P56857 Prrt3-203ENSMUST00000204268 3741 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Cldn18P56857 P2rx6-201ENSMUST00000023441 2345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Cldn18P56857 Naaladl1-201ENSMUST00000044451 2491 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.65□□□□□ -0.54
Cldn18P56857 Sall4-201ENSMUST00000029061 5073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Cldn18P56857 Hid1-201ENSMUST00000044152 3236 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Cldn18P56857 Gm20149-201ENSMUST00000214691 1667 ntTSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.55
Cldn18P56857 4930423D22Rik-201ENSMUST00000221909 1674 ntBASIC11.65□□□□□ -0.55
Cldn18P56857 BC006965-201ENSMUST00000124028 1952 ntTSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.55
Cldn18P56857 Gm15477-201ENSMUST00000140578 2130 ntTSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.55
Cldn18P56857 Dpysl4-202ENSMUST00000121184 2727 ntTSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.55
Cldn18P56857 Ddx23-201ENSMUST00000003450 3187 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.65□□□□□ -0.55
Cldn18P56857 Olfr607-202ENSMUST00000214347 5706 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC11.65□□□□□ -0.55
Cldn18P56857 Ahdc1-204ENSMUST00000105916 6602 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.65□□□□□ -0.55
Cldn18P56857 Eif4enif1-202ENSMUST00000110048 3712 ntTSL 5 BASIC11.64□□□□□ -0.55
Cldn18P56857 Gtf2ird1-201ENSMUST00000073161 3572 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Cldn18P56857 Atg16l1-203ENSMUST00000113190 3102 ntTSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
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