Protein–RNA interactions for Protein: P54987

Acod1, Cis-aconitate decarboxylase, mousemouse

Predictions only

Length 488 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Acod1P54987 Dad1-201ENSMUST00000022781 878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
Acod1P54987 Lce1d-201ENSMUST00000029524 678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
Acod1P54987 Urgcp-203ENSMUST00000118076 4208 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
Acod1P54987 2810407A14Rik-201ENSMUST00000069809 1699 ntTSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
Acod1P54987 Pfkfb3-213ENSMUST00000171188 2058 ntTSL 5 BASIC11.89□□□□□ -0.51
Acod1P54987 Shtn1-202ENSMUST00000163821 3767 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
Acod1P54987 Psmd9-201ENSMUST00000100729 2597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
Acod1P54987 Serpinf2-202ENSMUST00000108437 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
Acod1P54987 Abra-201ENSMUST00000054742 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
Acod1P54987 Slc22a5-201ENSMUST00000019044 3062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
Acod1P54987 Prkcd-202ENSMUST00000112202 2005 ntTSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
Acod1P54987 Rsu1-202ENSMUST00000114791 1604 ntTSL 5 BASIC11.89□□□□□ -0.51
Acod1P54987 Armc7-201ENSMUST00000035240 2260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
Acod1P54987 Rnf25-202ENSMUST00000113721 1451 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
Acod1P54987 Dclk1-211ENSMUST00000199169 1499 ntTSL 2 BASIC11.89□□□□□ -0.51
Acod1P54987 Lmnb2-201ENSMUST00000057623 3531 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
Acod1P54987 Gabrg3-202ENSMUST00000068911 9767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
Acod1P54987 Ttc34-201ENSMUST00000050220 3200 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
Acod1P54987 Gm9025-201ENSMUST00000122415 1575 ntBASIC11.88□□□□□ -0.51
Acod1P54987 AC113060.1-201ENSMUST00000225689 1573 ntBASIC11.88□□□□□ -0.51
Acod1P54987 Ces2f-201ENSMUST00000076384 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
Acod1P54987 Brd4-201ENSMUST00000003726 5955 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
Acod1P54987 Gm44806-201ENSMUST00000205574 2303 ntBASIC11.88□□□□□ -0.51
Acod1P54987 Nup98-201ENSMUST00000070165 4052 ntTSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
Acod1P54987 Vmn1r198-202ENSMUST00000226786 6195 ntAPPRIS P2 BASIC11.88□□□□□ -0.51
Acod1P54987 Lrrc10-201ENSMUST00000073834 1428 ntAPPRIS P1 BASIC11.88□□□□□ -0.51
Acod1P54987 Upk3b-201ENSMUST00000062606 3530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
Acod1P54987 C2cd4c-201ENSMUST00000059699 6729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
Acod1P54987 Cmtm6-201ENSMUST00000035007 3383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
Acod1P54987 Cd300lf-203ENSMUST00000106562 1762 ntTSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
Acod1P54987 Gm13453-201ENSMUST00000118708 357 ntBASIC11.88□□□□□ -0.51
Acod1P54987 Gm13616-201ENSMUST00000120600 222 ntBASIC11.88□□□□□ -0.51
Acod1P54987 1700042O10Rik-201ENSMUST00000151032 1075 ntTSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
Acod1P54987 Gm27321-201ENSMUST00000185021 205 ntBASIC11.88□□□□□ -0.51
Acod1P54987 Panct2-202ENSMUST00000188631 625 ntTSL 3 BASIC11.88□□□□□ -0.51
Acod1P54987 Tcta-203ENSMUST00000195615 597 ntTSL 5 BASIC11.88□□□□□ -0.51
Acod1P54987 Gm19931-201ENSMUST00000198920 368 ntBASIC11.88□□□□□ -0.51
Acod1P54987 Gm30191-201ENSMUST00000205501 647 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.88□□□□□ -0.51
Acod1P54987 Gm42196-201ENSMUST00000209618 730 ntTSL 5 BASIC11.88□□□□□ -0.51
Acod1P54987 Gm38948-201ENSMUST00000210035 688 ntTSL 3 BASIC11.88□□□□□ -0.51
Acod1P54987 Cfd-201ENSMUST00000061653 922 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
Acod1P54987 Anxa8-201ENSMUST00000022519 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
Acod1P54987 Ahi1-201ENSMUST00000105525 4851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
Acod1P54987 Prdx2-203ENSMUST00000109734 1612 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.88□□□□□ -0.51
Acod1P54987 Lig1-210ENSMUST00000165964 3166 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.88□□□□□ -0.51
Acod1P54987 Zp1-201ENSMUST00000025641 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
Acod1P54987 Ngly1-207ENSMUST00000224656 2329 ntAPPRIS ALT2 BASIC11.88□□□□□ -0.51
Acod1P54987 Kdm4d-201ENSMUST00000058796 2695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
Acod1P54987 Gm16534-201ENSMUST00000149300 1492 ntTSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
Acod1P54987 S100b-201ENSMUST00000036387 1484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
Acod1P54987 Commd1-201ENSMUST00000057843 1459 ntTSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
Acod1P54987 B230217C12Rik-202ENSMUST00000155954 2181 ntTSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
Acod1P54987 Usp19-204ENSMUST00000178075 4512 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
Acod1P54987 Usp19-202ENSMUST00000085044 4520 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
Acod1P54987 Cpa1-201ENSMUST00000031806 1583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
Acod1P54987 Timd2-201ENSMUST00000055102 1941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
Acod1P54987 Wnt3-201ENSMUST00000000127 3076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
Acod1P54987 Asap1-218ENSMUST00000177374 4582 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
Acod1P54987 Pdp1-203ENSMUST00000108297 4201 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
Acod1P54987 Rcsd1-202ENSMUST00000097474 5001 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
Acod1P54987 Rfc3-201ENSMUST00000038131 1317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
Acod1P54987 Map3k11-201ENSMUST00000004156 3801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
Acod1P54987 Lnx1-209ENSMUST00000153543 2208 ntTSL 5 BASIC11.87□□□□□ -0.51
Acod1P54987 Zc3h4-202ENSMUST00000209289 5853 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.87□□□□□ -0.51
Acod1P54987 4933439K11Rik-203ENSMUST00000169111 1869 ntTSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
Acod1P54987 Itgb4-203ENSMUST00000106458 5779 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.87□□□□□ -0.51
Acod1P54987 Dab2ip-204ENSMUST00000112983 6051 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
Acod1P54987 Zyg11a-201ENSMUST00000043793 2289 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.87□□□□□ -0.51
Acod1P54987 Ercc1-203ENSMUST00000160369 1175 ntTSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
Acod1P54987 Zdhhc23-202ENSMUST00000165648 1278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
Acod1P54987 Synj2bp-205ENSMUST00000169158 691 ntTSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
Acod1P54987 Cxcl17-202ENSMUST00000200880 760 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
Acod1P54987 Cxcl17-201ENSMUST00000074040 761 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.87□□□□□ -0.51
Acod1P54987 Mrgprg-201ENSMUST00000058092 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
Acod1P54987 Reep2-201ENSMUST00000043484 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
Acod1P54987 Polrmt-201ENSMUST00000020580 3755 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
Acod1P54987 Slc7a6-201ENSMUST00000034378 3750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
Acod1P54987 Serpinb6d-201ENSMUST00000059637 1463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
Acod1P54987 Tepsin-202ENSMUST00000093901 2770 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
Acod1P54987 Atp8a1-201ENSMUST00000037380 8178 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
Acod1P54987 Zbtb49-201ENSMUST00000094833 2978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
Acod1P54987 Trpm1-219ENSMUST00000206314 2323 ntTSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
Acod1P54987 Ahdc1-203ENSMUST00000105915 6341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
Acod1P54987 Hnrnpc-211ENSMUST00000228748 1691 ntAPPRIS P5 BASIC11.87□□□□□ -0.51
Acod1P54987 Nox3-201ENSMUST00000115800 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
Acod1P54987 Gm31518-201ENSMUST00000211925 2548 ntTSL 5 BASIC11.87□□□□□ -0.51
Acod1P54987 Gm10406-202ENSMUST00000170738 1955 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.87□□□□□ -0.51
Acod1P54987 Pianp-207ENSMUST00000162170 2053 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
Acod1P54987 Rgs12-207ENSMUST00000114285 2924 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.87□□□□□ -0.51
Acod1P54987 Arvcf-201ENSMUST00000090103 4620 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
Acod1P54987 Olfr61-202ENSMUST00000210241 1348 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.86□□□□□ -0.51
Acod1P54987 Eps15l1-201ENSMUST00000163643 3129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
Acod1P54987 Chrdl1-202ENSMUST00000074660 4096 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
Acod1P54987 Zscan10-202ENSMUST00000115509 2368 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
Acod1P54987 Gm6210-201ENSMUST00000204734 1942 ntBASIC11.86□□□□□ -0.51
Acod1P54987 Sesn2-201ENSMUST00000030724 3475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
Acod1P54987 Tfdp2-205ENSMUST00000179416 2408 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
Acod1P54987 AI661453-202ENSMUST00000150819 4866 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.86□□□□□ -0.51
Acod1P54987 Bace1-201ENSMUST00000034591 6058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
Acod1P54987 Nedd8-201ENSMUST00000010520 824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 31.3 ms