Protein–RNA interactions for Protein: P54728

Rad23b, UV excision repair protein RAD23 homolog B, mousemouse

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Length 416 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rad23bP54728 Cox16-202ENSMUST00000110340 668 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
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Rad23bP54728 Gm12816-201ENSMUST00000118069 1212 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
Rad23bP54728 Gm29187-201ENSMUST00000186681 689 ntTSL 3 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Rad23bP54728 Gm17889-201ENSMUST00000198410 598 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
Rad23bP54728 Gzmn-202ENSMUST00000225535 989 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
Rad23bP54728 Tspan8-201ENSMUST00000035563 1244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Rad23bP54728 Gm5879-201ENSMUST00000089501 1209 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
Rad23bP54728 Rab7-201ENSMUST00000095048 1275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Rad23bP54728 Nek7-202ENSMUST00000186017 5258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Rad23bP54728 Sirt2-202ENSMUST00000122915 1828 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Rad23bP54728 Iah1-204ENSMUST00000223345 1890 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Rad23bP54728 Efemp1-201ENSMUST00000020759 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Rad23bP54728 Angptl7-201ENSMUST00000030840 2157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Rad23bP54728 Olfr317-203ENSMUST00000216196 2781 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Rad23bP54728 Slc39a8-202ENSMUST00000081978 3314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Rad23bP54728 Tap2-201ENSMUST00000025197 3442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Rad23bP54728 Atp2b3-201ENSMUST00000033744 3894 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Rad23bP54728 Asap1-216ENSMUST00000177083 4415 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Rad23bP54728 Dhx9-202ENSMUST00000186380 4561 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Rad23bP54728 Rtn4-205ENSMUST00000102843 4618 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Rad23bP54728 Grm5-204ENSMUST00000155358 4500 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Rad23bP54728 Mfrp-202ENSMUST00000161381 4254 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Rad23bP54728 Kdm2b-201ENSMUST00000031435 3532 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Rad23bP54728 Klhl12-203ENSMUST00000116528 3277 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Rad23bP54728 Rasa4-202ENSMUST00000100570 2660 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Rad23bP54728 Palm-201ENSMUST00000046945 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Rad23bP54728 Npepps-215ENSMUST00000167806 2307 ntTSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Rad23bP54728 Prkcsh-205ENSMUST00000216344 2228 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Rad23bP54728 Apaf1-201ENSMUST00000020157 6577 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Rad23bP54728 Eno2-216ENSMUST00000204896 1640 ntTSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Rad23bP54728 Cyp4x1-201ENSMUST00000051400 1524 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Rad23bP54728 Vwa2-201ENSMUST00000026068 4049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Rad23bP54728 Pla2g10-202ENSMUST00000115807 964 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Rad23bP54728 Gm12165-201ENSMUST00000117047 342 ntBASIC16.06■□□□□ 0.16
Rad23bP54728 Gm14396-201ENSMUST00000126966 548 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Rad23bP54728 Gm25043-201ENSMUST00000158604 212 ntBASIC16.06■□□□□ 0.16
Rad23bP54728 Gm19287-201ENSMUST00000203190 358 ntBASIC16.06■□□□□ 0.16
Rad23bP54728 AC159462.1-201ENSMUST00000214822 687 ntTSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Rad23bP54728 CT009486.1-201ENSMUST00000222047 661 ntTSL 3 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Rad23bP54728 Dhrs2-201ENSMUST00000022820 1268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Rad23bP54728 Cthrc1-201ENSMUST00000067072 1166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Rad23bP54728 Olfr76-201ENSMUST00000087822 1048 ntAPPRIS P1 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Rad23bP54728 Commd7-201ENSMUST00000071852 3210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Rad23bP54728 Ubiad1-201ENSMUST00000051633 2992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Rad23bP54728 Pim1-201ENSMUST00000024811 2638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Rad23bP54728 2010300F17Rik-202ENSMUST00000181758 2493 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Rad23bP54728 Orai2-201ENSMUST00000041048 3908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Rad23bP54728 Mdfic-201ENSMUST00000101663 3431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
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Rad23bP54728 Mdfic-207ENSMUST00000190255 3431 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Rad23bP54728 A430034D21Rik-201ENSMUST00000194339 1802 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Rad23bP54728 P2ry2-201ENSMUST00000037540 3011 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Rad23bP54728 A230077H06Rik-201ENSMUST00000188579 2918 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Rad23bP54728 Tpr-203ENSMUST00000124973 7430 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Rad23bP54728 Creg2-201ENSMUST00000053355 6091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Rad23bP54728 Tnks1bp1-202ENSMUST00000111605 5747 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Rad23bP54728 Papd5-201ENSMUST00000066748 4489 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
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Rad23bP54728 Ddx4-202ENSMUST00000099166 3012 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
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Rad23bP54728 Lpcat1-208ENSMUST00000223060 2141 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
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Rad23bP54728 Canx-205ENSMUST00000179865 4281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Rad23bP54728 Nfyc-203ENSMUST00000118902 1887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Rad23bP54728 Clcnka-202ENSMUST00000105790 2511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Rad23bP54728 Osbpl11-201ENSMUST00000039733 4520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Rad23bP54728 Pgbd5-203ENSMUST00000136892 1739 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Rad23bP54728 Arhgap26-201ENSMUST00000097593 7898 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Rad23bP54728 Sohlh2-201ENSMUST00000029369 2364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Rad23bP54728 Mindy3-201ENSMUST00000028105 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Rad23bP54728 Aspm-205ENSMUST00000200083 6072 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Rad23bP54728 Dapk1-201ENSMUST00000044083 5304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Rad23bP54728 Gm8228-201ENSMUST00000189949 2192 ntBASIC16.04■□□□□ 0.16
Rad23bP54728 Dimt1-201ENSMUST00000022203 2051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Rad23bP54728 Nphp4-202ENSMUST00000081393 5027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Rad23bP54728 Gm4864-201ENSMUST00000219894 1461 ntBASIC16.04■□□□□ 0.16
Rad23bP54728 Lag3-201ENSMUST00000032217 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Rad23bP54728 Fubp1-206ENSMUST00000196739 2526 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Rad23bP54728 Clcnkb-202ENSMUST00000105788 2490 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Rad23bP54728 Glmn-202ENSMUST00000082121 1945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Rad23bP54728 Ncdn-202ENSMUST00000106116 2434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Rad23bP54728 Otop3-202ENSMUST00000106543 2369 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Rad23bP54728 N4bp3-201ENSMUST00000001080 2367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Rad23bP54728 Gbe1-207ENSMUST00000171132 3303 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Rad23bP54728 Ighv10-1-201ENSMUST00000103492 359 ntAPPRIS P1 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Rad23bP54728 Gm25880-201ENSMUST00000104331 132 ntBASIC16.04■□□□□ 0.16
Rad23bP54728 Gm11564-201ENSMUST00000105055 691 ntAPPRIS P1 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Rad23bP54728 Uxt-202ENSMUST00000123836 875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Rad23bP54728 Mocs2-205ENSMUST00000165022 962 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
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Rad23bP54728 Polr2i-201ENSMUST00000019882 819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 34 ms