Protein–RNA interactions for Protein: P50637

Tspo, Translocator protein, mousemouse

Predictions only

Length 169 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TspoP50637 Bcl2l1-202ENSMUST00000109820 2568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.97□□□□□ -0.65
TspoP50637 Eps15l1-203ENSMUST00000212121 2686 ntTSL 1 (best) BASIC10.97□□□□□ -0.65
TspoP50637 Pgm3-201ENSMUST00000070064 2666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.97□□□□□ -0.65
TspoP50637 Snrk-203ENSMUST00000120173 4758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.97□□□□□ -0.65
TspoP50637 Lmf2-201ENSMUST00000023283 2906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.97□□□□□ -0.65
TspoP50637 Pbrm1-206ENSMUST00000112094 5154 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC10.97□□□□□ -0.65
TspoP50637 Nrros-208ENSMUST00000143682 3577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.97□□□□□ -0.65
TspoP50637 Gh-201ENSMUST00000103071 862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.97□□□□□ -0.65
TspoP50637 Gm45799-201ENSMUST00000106785 367 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC10.97□□□□□ -0.65
TspoP50637 Gm11524-201ENSMUST00000119349 807 ntBASIC10.97□□□□□ -0.65
TspoP50637 C430049B03Rik-201ENSMUST00000129764 868 ntTSL 3 BASIC10.97□□□□□ -0.65
TspoP50637 Gm26464-201ENSMUST00000157094 305 ntBASIC10.97□□□□□ -0.65
TspoP50637 Gm26935-201ENSMUST00000182686 519 ntTSL 5 BASIC10.97□□□□□ -0.65
TspoP50637 Gm19078-201ENSMUST00000206311 727 ntBASIC10.97□□□□□ -0.65
TspoP50637 4930593C16Rik-202ENSMUST00000214011 714 ntTSL 5 BASIC10.97□□□□□ -0.65
TspoP50637 4930502A04Rik-201ENSMUST00000214059 865 ntTSL 1 (best) BASIC10.97□□□□□ -0.65
TspoP50637 AC158987.1-201ENSMUST00000214586 961 ntTSL 5 BASIC10.97□□□□□ -0.65
TspoP50637 Gm32926-202ENSMUST00000215162 1176 ntTSL 1 (best) BASIC10.97□□□□□ -0.65
TspoP50637 AC138604.1-201ENSMUST00000226969 739 ntBASIC10.97□□□□□ -0.65
TspoP50637 Tpd52-201ENSMUST00000063496 697 ntTSL 2 BASIC10.97□□□□□ -0.65
TspoP50637 Syce1l-202ENSMUST00000095173 791 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.97□□□□□ -0.65
TspoP50637 Cacna2d1-203ENSMUST00000101581 3879 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.97□□□□□ -0.65
TspoP50637 Cacna2d1-206ENSMUST00000180204 3882 ntTSL 1 (best) BASIC10.97□□□□□ -0.65
TspoP50637 Mamdc4-202ENSMUST00000114223 3998 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.97□□□□□ -0.65
TspoP50637 AC159621.2-201ENSMUST00000223519 1326 ntBASIC10.97□□□□□ -0.65
TspoP50637 Gm29154-231ENSMUST00000215120 1367 ntTSL 5 BASIC10.97□□□□□ -0.65
TspoP50637 Hmgcl-201ENSMUST00000030432 1418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.97□□□□□ -0.65
TspoP50637 AC122371.1-201ENSMUST00000220876 1477 ntTSL 1 (best) BASIC10.97□□□□□ -0.65
TspoP50637 Lrp2bp-202ENSMUST00000110380 1603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.97□□□□□ -0.65
TspoP50637 Fbf1-201ENSMUST00000103031 5252 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.97□□□□□ -0.65
TspoP50637 Gm3052-202ENSMUST00000188254 2224 ntBASIC10.97□□□□□ -0.65
TspoP50637 2610011E03Rik-201ENSMUST00000200128 2235 ntBASIC10.97□□□□□ -0.65
TspoP50637 Naaa-201ENSMUST00000113102 2414 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.97□□□□□ -0.65
TspoP50637 Kctd18-202ENSMUST00000114410 2512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.97□□□□□ -0.65
TspoP50637 Tfe3-203ENSMUST00000101695 2989 ntTSL 5 BASIC10.97□□□□□ -0.65
TspoP50637 A630014C17Rik-201ENSMUST00000150973 2984 ntTSL 1 (best) BASIC10.97□□□□□ -0.65
TspoP50637 Csf1-202ENSMUST00000118593 3058 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.97□□□□□ -0.65
TspoP50637 Xkr8-201ENSMUST00000045550 4245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.97□□□□□ -0.65
TspoP50637 Eprs-201ENSMUST00000046514 4906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.97□□□□□ -0.65
TspoP50637 Myo18a-202ENSMUST00000092884 5117 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.97□□□□□ -0.65
TspoP50637 Tmem168-201ENSMUST00000031554 4587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.96□□□□□ -0.65
TspoP50637 Rap1gds1-202ENSMUST00000098574 3669 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.96□□□□□ -0.65
TspoP50637 Nfkb2-202ENSMUST00000111881 3205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.96□□□□□ -0.65
TspoP50637 Lrrc20-201ENSMUST00000049242 3216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.96□□□□□ -0.65
TspoP50637 Pygm-201ENSMUST00000035269 2874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.96□□□□□ -0.65
TspoP50637 Lrfn3-201ENSMUST00000046351 2886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.96□□□□□ -0.65
TspoP50637 Ankrd42-205ENSMUST00000138267 2827 ntTSL 1 (best) BASIC10.96□□□□□ -0.65
TspoP50637 Cyth4-201ENSMUST00000043069 2791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.96□□□□□ -0.65
TspoP50637 Capn11-201ENSMUST00000120717 2591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.96□□□□□ -0.65
TspoP50637 Mest-211ENSMUST00000163949 2561 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.96□□□□□ -0.65
TspoP50637 Usp13-201ENSMUST00000072312 7580 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.96□□□□□ -0.65
TspoP50637 Necap1-201ENSMUST00000032477 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.96□□□□□ -0.65
TspoP50637 Pcdh10-203ENSMUST00000171554 7273 ntTSL 1 (best) BASIC10.96□□□□□ -0.65
TspoP50637 Ncan-201ENSMUST00000002412 7195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.96□□□□□ -0.65
TspoP50637 Lmntd1-201ENSMUST00000111706 2350 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.96□□□□□ -0.65
TspoP50637 Pianp-207ENSMUST00000162170 2053 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.96□□□□□ -0.65
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TspoP50637 Slc29a1-203ENSMUST00000097317 1931 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.96□□□□□ -0.65
TspoP50637 Leprot-202ENSMUST00000106927 1754 ntTSL 1 (best) BASIC10.96□□□□□ -0.65
TspoP50637 Zbtb16-201ENSMUST00000093852 5114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.96□□□□□ -0.65
TspoP50637 Tufm-201ENSMUST00000098048 1679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.96□□□□□ -0.65
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TspoP50637 Ecscr-204ENSMUST00000133064 1055 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.96□□□□□ -0.65
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TspoP50637 1700028J19Rik-203ENSMUST00000206686 1166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.96□□□□□ -0.65
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TspoP50637 Tex12-201ENSMUST00000034568 895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.96□□□□□ -0.65
TspoP50637 Iqcf3-201ENSMUST00000062917 1131 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.96□□□□□ -0.65
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TspoP50637 Arrdc5-201ENSMUST00000097303 1054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.96□□□□□ -0.65
TspoP50637 Ecscr-201ENSMUST00000097618 1114 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.96□□□□□ -0.65
TspoP50637 Slc25a25-205ENSMUST00000113310 3278 ntTSL 1 (best) BASIC10.96□□□□□ -0.66
TspoP50637 Cyth1-204ENSMUST00000106305 3179 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.96□□□□□ -0.66
TspoP50637 Spop-202ENSMUST00000107724 2881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.96□□□□□ -0.66
TspoP50637 Tapbp-201ENSMUST00000025161 2894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.96□□□□□ -0.66
TspoP50637 F630040K05Rik-202ENSMUST00000180558 2633 ntTSL 1 (best) BASIC10.96□□□□□ -0.66
TspoP50637 Myo10-201ENSMUST00000022882 5880 ntTSL 1 (best) BASIC10.96□□□□□ -0.66
TspoP50637 Armc6-201ENSMUST00000019679 2263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.96□□□□□ -0.66
TspoP50637 Armc7-201ENSMUST00000035240 2260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.96□□□□□ -0.66
TspoP50637 Zfp954-201ENSMUST00000056246 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.96□□□□□ -0.66
TspoP50637 Sema4a-202ENSMUST00000107531 2897 ntTSL 5 BASIC10.95□□□□□ -0.66
TspoP50637 Cdc42se1-201ENSMUST00000053872 2805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.95□□□□□ -0.66
TspoP50637 Gm16793-201ENSMUST00000181322 1680 ntTSL 1 (best) BASIC10.95□□□□□ -0.66
TspoP50637 Fn1-201ENSMUST00000055226 8315 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.95□□□□□ -0.66
TspoP50637 Psmc3-202ENSMUST00000067663 1636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.95□□□□□ -0.66
TspoP50637 Asxl1-205ENSMUST00000227428 6981 ntAPPRIS ALT2 BASIC10.95□□□□□ -0.66
TspoP50637 Tbx6-202ENSMUST00000172352 1529 ntTSL 1 (best) BASIC10.95□□□□□ -0.66
TspoP50637 Pitpnm3-201ENSMUST00000075258 6555 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.95□□□□□ -0.66
TspoP50637 Ndufaf7-201ENSMUST00000024887 2303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.95□□□□□ -0.66
TspoP50637 Ska3-201ENSMUST00000022536 2260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.95□□□□□ -0.66
TspoP50637 Nt5c3b-203ENSMUST00000107397 1348 ntTSL 1 (best) BASIC10.95□□□□□ -0.66
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TspoP50637 Insrr-202ENSMUST00000107582 4694 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.95□□□□□ -0.66
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 68 ms