Protein–RNA interactions for Protein: P50608

Fmod, Fibromodulin, mousemouse

Predictions only

Length 376 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FmodP50608 Tufm-201ENSMUST00000098048 1679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
FmodP50608 Otop1-202ENSMUST00000114099 3141 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC10.6□□□□□ -0.71
FmodP50608 Rubcn-202ENSMUST00000089684 5311 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
FmodP50608 Lhx6-201ENSMUST00000112960 3345 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.6□□□□□ -0.71
FmodP50608 Eogt-201ENSMUST00000054344 4424 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
FmodP50608 Smc5-202ENSMUST00000223934 3448 ntAPPRIS P2 BASIC10.59□□□□□ -0.71
FmodP50608 Fgf17-202ENSMUST00000227123 1336 ntBASIC10.59□□□□□ -0.71
FmodP50608 Sipa1l3-207ENSMUST00000182484 2420 ntTSL 5 BASIC10.59□□□□□ -0.71
FmodP50608 Reln-207ENSMUST00000161356 11699 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC10.59□□□□□ -0.71
FmodP50608 Kif1a-202ENSMUST00000112958 5931 ntTSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
FmodP50608 Hsd17b14-201ENSMUST00000107752 1400 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.59□□□□□ -0.71
FmodP50608 Epm2aip1-201ENSMUST00000060711 7149 ntAPPRIS P1 BASIC10.59□□□□□ -0.71
FmodP50608 Gm43417-201ENSMUST00000201586 5207 ntBASIC10.59□□□□□ -0.71
FmodP50608 Met-202ENSMUST00000115442 4663 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.59□□□□□ -0.71
FmodP50608 Kcnq3-201ENSMUST00000070256 11824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
FmodP50608 Tfe3-205ENSMUST00000115678 2658 ntTSL 5 BASIC10.59□□□□□ -0.71
FmodP50608 Ppp1r10-202ENSMUST00000087211 4255 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.59□□□□□ -0.71
FmodP50608 Thoc5-202ENSMUST00000101615 2116 ntTSL 5 BASIC10.59□□□□□ -0.71
FmodP50608 Tomm5-204ENSMUST00000107810 639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
FmodP50608 Igfbp4-204ENSMUST00000140772 742 ntTSL 2 BASIC10.59□□□□□ -0.71
FmodP50608 Cd63-ps-201ENSMUST00000145417 875 ntBASIC10.59□□□□□ -0.71
FmodP50608 Haghl-211ENSMUST00000150324 1267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
FmodP50608 Dpf3-205ENSMUST00000177801 1092 ntTSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
FmodP50608 Gm5108-201ENSMUST00000177891 543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
FmodP50608 Mir99ahg-211ENSMUST00000183099 1189 ntTSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
FmodP50608 Gm27321-201ENSMUST00000185021 205 ntBASIC10.59□□□□□ -0.71
FmodP50608 1700086L19Rik-202ENSMUST00000185822 1028 ntTSL 3 BASIC10.59□□□□□ -0.71
FmodP50608 Selenoh-205ENSMUST00000189636 499 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC10.59□□□□□ -0.71
FmodP50608 Gm44662-201ENSMUST00000206970 412 ntTSL 5 BASIC10.59□□□□□ -0.71
FmodP50608 Gm11149-204ENSMUST00000216483 1275 ntTSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
FmodP50608 Gm6888-201ENSMUST00000221983 706 ntBASIC10.59□□□□□ -0.71
FmodP50608 AC154846.1-201ENSMUST00000226278 862 ntBASIC10.59□□□□□ -0.71
FmodP50608 Adamts5-201ENSMUST00000023611 8091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
FmodP50608 Fbxo48-201ENSMUST00000061327 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
FmodP50608 Rtl8c-201ENSMUST00000063384 401 ntAPPRIS P1 BASIC10.59□□□□□ -0.71
FmodP50608 Pde4d-220ENSMUST00000177907 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
FmodP50608 Lipe-208ENSMUST00000206861 3171 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
FmodP50608 Taco1-201ENSMUST00000002048 1383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
FmodP50608 Ucp3-201ENSMUST00000032958 2448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
FmodP50608 Zfp683-201ENSMUST00000105884 1471 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.59□□□□□ -0.71
FmodP50608 Sorcs1-206ENSMUST00000209783 3489 ntTSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
FmodP50608 Fam83h-201ENSMUST00000060807 4502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
FmodP50608 Gm9742-201ENSMUST00000165220 1553 ntTSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
FmodP50608 Slc39a9-208ENSMUST00000219706 5427 ntTSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
FmodP50608 Asph-202ENSMUST00000078139 6694 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
FmodP50608 Ccrl2-203ENSMUST00000199839 1864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
FmodP50608 Actn1-201ENSMUST00000021554 3734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
FmodP50608 Stk33-204ENSMUST00000121748 2295 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.59□□□□□ -0.71
FmodP50608 Coq3-201ENSMUST00000029909 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
FmodP50608 Fn1-201ENSMUST00000055226 8315 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
FmodP50608 Hook2-204ENSMUST00000210326 3080 ntTSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
FmodP50608 Prdx2-203ENSMUST00000109734 1612 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.58□□□□□ -0.72
FmodP50608 Pprc1-201ENSMUST00000062322 5205 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.72
FmodP50608 Nin-204ENSMUST00000169074 6636 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.72
FmodP50608 CT573086.2-201ENSMUST00000227277 4992 ntBASIC10.58□□□□□ -0.72
FmodP50608 Ddah1-201ENSMUST00000029845 3764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.72
FmodP50608 Rcan2-202ENSMUST00000044895 3363 ntTSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.72
FmodP50608 Setdb2-205ENSMUST00000161459 2995 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.72
FmodP50608 Ralgps2-211ENSMUST00000190648 2498 ntTSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.72
FmodP50608 Acad12-202ENSMUST00000111776 2269 ntTSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.72
FmodP50608 Car3-201ENSMUST00000029076 1679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.72
FmodP50608 Car6-202ENSMUST00000105683 1460 ntTSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.72
FmodP50608 Pdcd6-203ENSMUST00000222759 1376 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC10.58□□□□□ -0.72
FmodP50608 Cd63-202ENSMUST00000105229 1043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.72
FmodP50608 Tmsb4x-202ENSMUST00000112175 864 ntTSL 2 BASIC10.58□□□□□ -0.72
FmodP50608 Gm21982-201ENSMUST00000146232 3821 ntTSL 2 BASIC10.58□□□□□ -0.72
FmodP50608 Plekhd1os-201ENSMUST00000153297 944 ntTSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.72
FmodP50608 1700061E18Rik-201ENSMUST00000154159 588 ntTSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.72
FmodP50608 Pkig-209ENSMUST00000164399 983 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.58□□□□□ -0.72
FmodP50608 Bricd5-202ENSMUST00000164508 701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.72
FmodP50608 Gm37277-201ENSMUST00000194052 1111 ntBASIC10.58□□□□□ -0.72
FmodP50608 Atp6v0c-ps1-201ENSMUST00000206596 463 ntBASIC10.58□□□□□ -0.72
FmodP50608 Gm7390-201ENSMUST00000212452 1216 ntBASIC10.58□□□□□ -0.72
FmodP50608 Tmem38a-203ENSMUST00000212763 882 ntTSL 3 BASIC10.58□□□□□ -0.72
FmodP50608 Gm17795-201ENSMUST00000214505 757 ntBASIC10.58□□□□□ -0.72
FmodP50608 Cd63-204ENSMUST00000219317 1109 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.58□□□□□ -0.72
FmodP50608 AC124732.2-201ENSMUST00000221977 316 ntBASIC10.58□□□□□ -0.72
FmodP50608 AC132467.2-202ENSMUST00000227726 559 ntBASIC10.58□□□□□ -0.72
FmodP50608 Nupl1-206ENSMUST00000225111 2936 ntBASIC10.58□□□□□ -0.72
FmodP50608 Cdc37l1-208ENSMUST00000225310 4079 ntAPPRIS ALT2 BASIC10.58□□□□□ -0.72
FmodP50608 Ints5-201ENSMUST00000096249 3294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.72
FmodP50608 Xkr8-201ENSMUST00000045550 4245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.72
FmodP50608 Gm33543-203ENSMUST00000211096 1722 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC10.58□□□□□ -0.72
FmodP50608 Rsu1-202ENSMUST00000114791 1604 ntTSL 5 BASIC10.58□□□□□ -0.72
FmodP50608 Art3-208ENSMUST00000121096 1600 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.72
FmodP50608 Nsun7-204ENSMUST00000202994 3632 ntTSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.72
FmodP50608 Psap-203ENSMUST00000165878 2564 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.72
FmodP50608 Snx10-201ENSMUST00000049152 2480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.72
FmodP50608 Adam19-201ENSMUST00000011400 6383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.72
FmodP50608 Incenp-201ENSMUST00000025562 3217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.72
FmodP50608 Phyhd1-204ENSMUST00000113645 1325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.72
FmodP50608 Shtn1-202ENSMUST00000163821 3767 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.57□□□□□ -0.72
FmodP50608 Tnk2-205ENSMUST00000115124 4424 ntTSL 1 (best) BASIC10.57□□□□□ -0.72
FmodP50608 Myo15b-208ENSMUST00000222123 5154 ntTSL 5 BASIC10.57□□□□□ -0.72
FmodP50608 Cenpl-202ENSMUST00000111618 1996 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.57□□□□□ -0.72
FmodP50608 Syt6-203ENSMUST00000118117 1856 ntTSL 1 (best) BASIC10.57□□□□□ -0.72
FmodP50608 Rdh19-201ENSMUST00000077530 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.57□□□□□ -0.72
FmodP50608 Leprot-202ENSMUST00000106927 1754 ntTSL 1 (best) BASIC10.57□□□□□ -0.72
FmodP50608 Pak1-201ENSMUST00000033040 3065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.57□□□□□ -0.72
FmodP50608 Sec14l5-201ENSMUST00000165810 2337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.57□□□□□ -0.72
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 47 ms