Protein–RNA interactions for Protein: P49446

Ptpre, Receptor-type tyrosine-protein phosphatase epsilon, mousemouse

Predictions only

Length 699 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PtpreP49446 Prrc2a-206ENSMUST00000174805 6741 ntTSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
PtpreP49446 Prr15l-201ENSMUST00000054311 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
PtpreP49446 Lrrc8d-201ENSMUST00000060531 3923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
PtpreP49446 Rhbdl2-202ENSMUST00000106204 1120 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.53□□□□□ -0.08
PtpreP49446 Mogat1-202ENSMUST00000113524 1228 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.53□□□□□ -0.08
PtpreP49446 Rbm3-202ENSMUST00000115615 1183 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
PtpreP49446 Rbm3-203ENSMUST00000115616 1225 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
PtpreP49446 Gm16178-201ENSMUST00000129408 677 ntTSL 2 BASIC14.53□□□□□ -0.08
PtpreP49446 Gm15966-201ENSMUST00000136853 480 ntTSL 3 BASIC14.53□□□□□ -0.08
PtpreP49446 B9d1os-201ENSMUST00000137010 674 ntBASIC14.53□□□□□ -0.08
PtpreP49446 Gm15395-201ENSMUST00000153724 702 ntTSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
PtpreP49446 Gm22885-201ENSMUST00000157410 107 ntBASIC14.53□□□□□ -0.08
PtpreP49446 Gm17586-201ENSMUST00000181502 908 ntTSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
PtpreP49446 Gm26973-201ENSMUST00000182105 696 ntTSL 3 BASIC14.53□□□□□ -0.08
PtpreP49446 Gm9678-201ENSMUST00000198979 1149 ntBASIC14.53□□□□□ -0.08
PtpreP49446 Ceacam1-209ENSMUST00000206687 1061 ntTSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
PtpreP49446 Gm19208-201ENSMUST00000213861 912 ntBASIC14.53□□□□□ -0.08
PtpreP49446 Gm34466-201ENSMUST00000222218 505 ntTSL 2 BASIC14.53□□□□□ -0.08
PtpreP49446 Cym-201ENSMUST00000029504 1236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
PtpreP49446 Nmnat1-201ENSMUST00000030845 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
PtpreP49446 Tmem110-201ENSMUST00000006701 3742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
PtpreP49446 Slc6a7-201ENSMUST00000025520 3342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
PtpreP49446 1600014C10Rik-205ENSMUST00000178876 3283 ntTSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
PtpreP49446 Rarg-201ENSMUST00000043172 2953 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
PtpreP49446 Ash2l-204ENSMUST00000110610 2337 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
PtpreP49446 Morc4-202ENSMUST00000087401 3862 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
PtpreP49446 Fbxo41-203ENSMUST00000161546 6357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
PtpreP49446 Abr-205ENSMUST00000108408 3534 ntTSL 5 BASIC14.53□□□□□ -0.08
PtpreP49446 AW209491-202ENSMUST00000178289 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
PtpreP49446 Wrap53-201ENSMUST00000048139 1891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
PtpreP49446 Adamts3-204ENSMUST00000198151 1833 ntTSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
PtpreP49446 Tsc2-221ENSMUST00000228412 5432 ntAPPRIS ALT2 BASIC14.52□□□□□ -0.08
PtpreP49446 Gm20488-201ENSMUST00000201641 2996 ntTSL 2 BASIC14.52□□□□□ -0.08
PtpreP49446 Fam83e-201ENSMUST00000129507 2908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
PtpreP49446 Lrrc56-202ENSMUST00000070458 2502 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
PtpreP49446 Grm5-204ENSMUST00000155358 4500 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
PtpreP49446 Cct6a-202ENSMUST00000201414 2454 ntTSL 5 BASIC14.52□□□□□ -0.08
PtpreP49446 Fbp1-201ENSMUST00000092888 1479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
PtpreP49446 Cpt2-201ENSMUST00000030345 2372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
PtpreP49446 Rtp3-201ENSMUST00000084922 1425 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.52□□□□□ -0.08
PtpreP49446 Kcng1-202ENSMUST00000109191 4089 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.52□□□□□ -0.08
PtpreP49446 Akt1-205ENSMUST00000128300 1342 ntTSL 5 BASIC14.52□□□□□ -0.08
PtpreP49446 Ell-201ENSMUST00000093454 3072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
PtpreP49446 4930522L14Rik-201ENSMUST00000100937 599 ntTSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
PtpreP49446 Pja1-202ENSMUST00000113790 2108 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.52□□□□□ -0.09
PtpreP49446 Gm14028-201ENSMUST00000117434 479 ntBASIC14.52□□□□□ -0.09
PtpreP49446 Zfp738-202ENSMUST00000125495 712 ntTSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
PtpreP49446 Endov-204ENSMUST00000129327 1184 ntTSL 5 BASIC14.52□□□□□ -0.09
PtpreP49446 Gm15276-201ENSMUST00000145953 498 ntBASIC14.52□□□□□ -0.09
PtpreP49446 Gm29331-201ENSMUST00000187215 605 ntTSL 5 BASIC14.52□□□□□ -0.09
PtpreP49446 Gm43275-201ENSMUST00000202053 1020 ntBASIC14.52□□□□□ -0.09
PtpreP49446 4930513D17Rik-203ENSMUST00000202800 1159 ntTSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
PtpreP49446 Gm19605-202ENSMUST00000221514 1084 ntTSL 5 BASIC14.52□□□□□ -0.09
PtpreP49446 Lcn10-201ENSMUST00000058912 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
PtpreP49446 Gm35721-201ENSMUST00000220294 2014 ntTSL 5 BASIC14.52□□□□□ -0.09
PtpreP49446 Scin-202ENSMUST00000078481 2654 ntTSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
PtpreP49446 Slc37a1-201ENSMUST00000165149 3354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
PtpreP49446 Il1r1-202ENSMUST00000114795 4832 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
PtpreP49446 Arfgap1-203ENSMUST00000108860 2326 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
PtpreP49446 Npepps-215ENSMUST00000167806 2307 ntTSL 5 BASIC14.52□□□□□ -0.09
PtpreP49446 Tmprss9-201ENSMUST00000105333 3497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
PtpreP49446 AC123857.2-201ENSMUST00000225756 1582 ntBASIC14.51□□□□□ -0.09
PtpreP49446 Fbxo3-201ENSMUST00000028603 4740 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
PtpreP49446 Gm26732-201ENSMUST00000181807 2771 ntTSL 5 BASIC14.51□□□□□ -0.09
PtpreP49446 Apc-202ENSMUST00000079362 8867 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
PtpreP49446 Qsox1-202ENSMUST00000111764 2722 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
PtpreP49446 D730001G18Rik-202ENSMUST00000191407 1494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
PtpreP49446 Atxn7l1-202ENSMUST00000090597 2563 ntTSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
PtpreP49446 Enox1-201ENSMUST00000022589 3142 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
PtpreP49446 Zfp740-201ENSMUST00000118729 4241 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
PtpreP49446 Epb41l5-201ENSMUST00000027632 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
PtpreP49446 Tomt-202ENSMUST00000106970 1354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
PtpreP49446 Prkcd-203ENSMUST00000112203 1927 ntTSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
PtpreP49446 AC101945.2-201ENSMUST00000227886 1377 ntBASIC14.51□□□□□ -0.09
PtpreP49446 Sntb2-203ENSMUST00000212524 9945 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
PtpreP49446 Yipf1-201ENSMUST00000075693 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
PtpreP49446 Elmo3-202ENSMUST00000212033 2351 ntTSL 5 BASIC14.51□□□□□ -0.09
PtpreP49446 Arid5a-208ENSMUST00000137906 5504 ntTSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
PtpreP49446 Cstf3-201ENSMUST00000028599 2817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
PtpreP49446 Chaf1a-201ENSMUST00000002914 3308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
PtpreP49446 Gm23270-201ENSMUST00000104055 131 ntBASIC14.51□□□□□ -0.09
PtpreP49446 Tmem53-203ENSMUST00000106434 923 ntTSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
PtpreP49446 Prr15l-203ENSMUST00000107633 930 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.51□□□□□ -0.09
PtpreP49446 Gm14130-201ENSMUST00000118417 987 ntBASIC14.51□□□□□ -0.09
PtpreP49446 Gng2-205ENSMUST00000161247 419 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.51□□□□□ -0.09
PtpreP49446 Tmem40-205ENSMUST00000166254 811 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.51□□□□□ -0.09
PtpreP49446 Ccdc188-201ENSMUST00000167061 747 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.51□□□□□ -0.09
PtpreP49446 1700125G22Rik-201ENSMUST00000181124 861 ntTSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
PtpreP49446 Gm2420-203ENSMUST00000202748 447 ntTSL 5 BASIC14.51□□□□□ -0.09
PtpreP49446 Itln1-201ENSMUST00000043094 1141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
PtpreP49446 Vmn1r213-201ENSMUST00000076897 1155 ntAPPRIS P2 BASIC14.51□□□□□ -0.09
PtpreP49446 Rabep2-201ENSMUST00000106405 2279 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
PtpreP49446 Usf1-208ENSMUST00000161241 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
PtpreP49446 Keap1-202ENSMUST00000164812 3614 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
PtpreP49446 Xpot-201ENSMUST00000039810 5992 ntTSL 5 BASIC14.51□□□□□ -0.09
PtpreP49446 Nde1-203ENSMUST00000117958 1551 ntTSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
PtpreP49446 5730409E04Rik-201ENSMUST00000097886 2886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
PtpreP49446 H2-T22-201ENSMUST00000058801 1534 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
PtpreP49446 Entpd2-201ENSMUST00000028328 1935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
PtpreP49446 Sqle-201ENSMUST00000022977 2758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 56.8 ms