Protein–RNA interactions for Protein: P46414

Cdkn1b, Cyclin-dependent kinase inhibitor 1B, mousemouse

Predictions only

Length 197 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cdkn1bP46414 Gm27230-202ENSMUST00000184671 857 ntTSL 3 BASIC11.03□□□□□ -0.64
Cdkn1bP46414 Gm43597-201ENSMUST00000201650 1057 ntTSL 3 BASIC11.03□□□□□ -0.64
Cdkn1bP46414 Majin-201ENSMUST00000025699 1239 ntTSL 1 (best) BASIC11.03□□□□□ -0.64
Cdkn1bP46414 Crybb2-201ENSMUST00000031295 724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.03□□□□□ -0.64
Cdkn1bP46414 Nsmce1-201ENSMUST00000033006 1120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.03□□□□□ -0.64
Cdkn1bP46414 Fau-201ENSMUST00000043074 574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.03□□□□□ -0.64
Cdkn1bP46414 Lcn10-201ENSMUST00000058912 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.03□□□□□ -0.64
Cdkn1bP46414 Ccdc169-202ENSMUST00000061099 887 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.03□□□□□ -0.64
Cdkn1bP46414 Rpl10-202ENSMUST00000074085 855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.03□□□□□ -0.64
Cdkn1bP46414 Rpl10l-201ENSMUST00000081908 1023 ntAPPRIS P1 BASIC11.03□□□□□ -0.64
Cdkn1bP46414 Tpd52-204ENSMUST00000094381 1074 ntTSL 3 BASIC11.03□□□□□ -0.64
Cdkn1bP46414 Prok2-203ENSMUST00000101120 1450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.03□□□□□ -0.64
Cdkn1bP46414 Pde7b-202ENSMUST00000164195 1665 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.03□□□□□ -0.64
Cdkn1bP46414 Ackr4-204ENSMUST00000219146 1654 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.03□□□□□ -0.64
Cdkn1bP46414 Gm43423-201ENSMUST00000198390 2094 ntBASIC11.03□□□□□ -0.64
Cdkn1bP46414 Sumf2-204ENSMUST00000171300 2264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.03□□□□□ -0.64
Cdkn1bP46414 Gm37795-201ENSMUST00000194216 2459 ntBASIC11.03□□□□□ -0.64
Cdkn1bP46414 4933434E20Rik-206ENSMUST00000160640 2510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.03□□□□□ -0.64
Cdkn1bP46414 Gcdh-202ENSMUST00000109745 2114 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.03□□□□□ -0.64
Cdkn1bP46414 Olfr742-202ENSMUST00000213935 2117 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.03□□□□□ -0.64
Cdkn1bP46414 Prkca-201ENSMUST00000059595 8409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.03□□□□□ -0.64
Cdkn1bP46414 Apol9b-201ENSMUST00000109775 1545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.03□□□□□ -0.64
Cdkn1bP46414 Vsir-203ENSMUST00000105460 4843 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.03□□□□□ -0.64
Cdkn1bP46414 Vsir-201ENSMUST00000020301 4846 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.03□□□□□ -0.64
Cdkn1bP46414 Usp19-203ENSMUST00000166103 4473 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.03□□□□□ -0.64
Cdkn1bP46414 Sirt4-201ENSMUST00000112066 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.03□□□□□ -0.64
Cdkn1bP46414 Poc1b-203ENSMUST00000159228 1799 ntTSL 1 (best) BASIC11.03□□□□□ -0.64
Cdkn1bP46414 E230029C05Rik-202ENSMUST00000207458 2445 ntTSL 5 BASIC11.03□□□□□ -0.64
Cdkn1bP46414 Clcn4-203ENSMUST00000210061 2445 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.03□□□□□ -0.64
Cdkn1bP46414 Rinl-201ENSMUST00000059857 2871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.02□□□□□ -0.64
Cdkn1bP46414 Cldn34c1-201ENSMUST00000113343 3301 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.02□□□□□ -0.64
Cdkn1bP46414 Clec16a-205ENSMUST00000115827 2949 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.02□□□□□ -0.64
Cdkn1bP46414 Cckar-201ENSMUST00000031093 2930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.02□□□□□ -0.64
Cdkn1bP46414 Usp17le-201ENSMUST00000053464 1626 ntTSL 5 BASIC11.02□□□□□ -0.64
Cdkn1bP46414 Pgpep1-201ENSMUST00000070173 4883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.02□□□□□ -0.64
Cdkn1bP46414 Tecpr1-201ENSMUST00000085701 5106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.02□□□□□ -0.64
Cdkn1bP46414 Mageb10-ps-201ENSMUST00000119697 1407 ntBASIC11.02□□□□□ -0.64
Cdkn1bP46414 Phrf1-201ENSMUST00000106027 5248 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.02□□□□□ -0.64
Cdkn1bP46414 Opa1-201ENSMUST00000038867 3230 ntTSL 1 (best) BASIC11.02□□□□□ -0.64
Cdkn1bP46414 Gm10339-203ENSMUST00000225409 1671 ntBASIC11.02□□□□□ -0.64
Cdkn1bP46414 Otx2-201ENSMUST00000118578 2144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.02□□□□□ -0.64
Cdkn1bP46414 Tspan5-202ENSMUST00000119993 2107 ntTSL 1 (best) BASIC11.02□□□□□ -0.64
Cdkn1bP46414 Efhc1-201ENSMUST00000038447 2146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.02□□□□□ -0.64
Cdkn1bP46414 Stx18-203ENSMUST00000114126 3002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.02□□□□□ -0.65
Cdkn1bP46414 Gm10561-201ENSMUST00000181563 1943 ntTSL 1 (best) BASIC11.02□□□□□ -0.65
Cdkn1bP46414 Tbc1d8-204ENSMUST00000193823 3512 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.02□□□□□ -0.65
Cdkn1bP46414 Gm28043-201ENSMUST00000130871 6521 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.02□□□□□ -0.65
Cdkn1bP46414 Eprs-201ENSMUST00000046514 4906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.02□□□□□ -0.65
Cdkn1bP46414 Ctbs-202ENSMUST00000061937 2892 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.02□□□□□ -0.65
Cdkn1bP46414 Elmsan1-201ENSMUST00000046266 6848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.02□□□□□ -0.65
Cdkn1bP46414 Rps8-201ENSMUST00000102696 860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.02□□□□□ -0.65
Cdkn1bP46414 Ndufs5-202ENSMUST00000106206 599 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.02□□□□□ -0.65
Cdkn1bP46414 Mpc1-202ENSMUST00000124023 555 ntTSL 2 BASIC11.02□□□□□ -0.65
Cdkn1bP46414 1700012C14Rik-201ENSMUST00000132023 498 ntTSL 1 (best) BASIC11.02□□□□□ -0.65
Cdkn1bP46414 Pelp1-202ENSMUST00000135148 562 ntTSL 1 (best) BASIC11.02□□□□□ -0.65
Cdkn1bP46414 Drap1-210ENSMUST00000148219 727 ntTSL 3 BASIC11.02□□□□□ -0.65
Cdkn1bP46414 Snora78-201ENSMUST00000158630 128 ntBASIC11.02□□□□□ -0.65
Cdkn1bP46414 Lamtor1-202ENSMUST00000193465 661 ntTSL 5 BASIC11.02□□□□□ -0.65
Cdkn1bP46414 Lrp8os1-201ENSMUST00000030352 672 ntTSL 5 BASIC11.02□□□□□ -0.65
Cdkn1bP46414 Rnase2b-201ENSMUST00000075648 759 ntAPPRIS P1 BASIC11.02□□□□□ -0.65
Cdkn1bP46414 Gm10268-201ENSMUST00000085340 555 ntBASIC11.02□□□□□ -0.65
Cdkn1bP46414 Ndc80-201ENSMUST00000024851 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.02□□□□□ -0.65
Cdkn1bP46414 Vcl-201ENSMUST00000022369 5267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.02□□□□□ -0.65
Cdkn1bP46414 Ccdc163-201ENSMUST00000030452 1524 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.02□□□□□ -0.65
Cdkn1bP46414 Pdpk1-204ENSMUST00000115409 4623 ntTSL 5 BASIC11.02□□□□□ -0.65
Cdkn1bP46414 Gria4-203ENSMUST00000163309 2338 ntTSL 1 (best) BASIC11.02□□□□□ -0.65
Cdkn1bP46414 Slc6a21-206ENSMUST00000210861 2838 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.02□□□□□ -0.65
Cdkn1bP46414 Rab3d-201ENSMUST00000115351 3835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.02□□□□□ -0.65
Cdkn1bP46414 Gm12846-201ENSMUST00000120431 1373 ntBASIC11.02□□□□□ -0.65
Cdkn1bP46414 Shroom1-201ENSMUST00000018531 2630 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.02□□□□□ -0.65
Cdkn1bP46414 Gtpbp1-201ENSMUST00000046463 3398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.02□□□□□ -0.65
Cdkn1bP46414 Dag1-204ENSMUST00000191899 5662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.02□□□□□ -0.65
Cdkn1bP46414 Il1rapl2-202ENSMUST00000113063 3437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.02□□□□□ -0.65
Cdkn1bP46414 Trim59-201ENSMUST00000107802 2939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.02□□□□□ -0.65
Cdkn1bP46414 Gm6198-201ENSMUST00000191337 2929 ntBASIC11.02□□□□□ -0.65
Cdkn1bP46414 Lmf2-201ENSMUST00000023283 2906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.02□□□□□ -0.65
Cdkn1bP46414 Gm34006-202ENSMUST00000216467 1918 ntTSL 2 BASIC11.01□□□□□ -0.65
Cdkn1bP46414 Slc7a15-201ENSMUST00000036938 1907 ntTSL 1 (best) BASIC11.01□□□□□ -0.65
Cdkn1bP46414 Cep164-201ENSMUST00000117194 5541 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.01□□□□□ -0.65
Cdkn1bP46414 Myl6-202ENSMUST00000217733 1668 ntTSL 1 (best) BASIC11.01□□□□□ -0.65
Cdkn1bP46414 Serpine3-201ENSMUST00000171692 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.01□□□□□ -0.65
Cdkn1bP46414 Ift52-201ENSMUST00000018002 2248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.01□□□□□ -0.65
Cdkn1bP46414 Ncor2-204ENSMUST00000111394 7452 ntTSL 1 (best) BASIC11.01□□□□□ -0.65
Cdkn1bP46414 Pgghg-204ENSMUST00000164580 3001 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.01□□□□□ -0.65
Cdkn1bP46414 Grk6-203ENSMUST00000224118 1997 ntAPPRIS ALT2 BASIC11.01□□□□□ -0.65
Cdkn1bP46414 Cd33-201ENSMUST00000004728 1962 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.01□□□□□ -0.65
Cdkn1bP46414 Gjb5-201ENSMUST00000046498 1721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.01□□□□□ -0.65
Cdkn1bP46414 Rfx7-203ENSMUST00000183372 1457 ntTSL 1 (best) BASIC11.01□□□□□ -0.65
Cdkn1bP46414 Sv2b-202ENSMUST00000165175 5524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.01□□□□□ -0.65
Cdkn1bP46414 Tjap1-202ENSMUST00000164342 2559 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.01□□□□□ -0.65
Cdkn1bP46414 Cfap77-204ENSMUST00000189711 1759 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.01□□□□□ -0.65
Cdkn1bP46414 Slc25a5-ps-202ENSMUST00000223716 1786 ntBASIC11.01□□□□□ -0.65
Cdkn1bP46414 Dlgap1-208ENSMUST00000135938 2895 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.01□□□□□ -0.65
Cdkn1bP46414 Rab11fip1-202ENSMUST00000054212 7965 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC11.01□□□□□ -0.65
Cdkn1bP46414 Cbfa2t2-ps1-201ENSMUST00000117165 730 ntBASIC11.01□□□□□ -0.65
Cdkn1bP46414 Shisa5-203ENSMUST00000154184 1038 ntTSL 1 (best) BASIC11.01□□□□□ -0.65
Cdkn1bP46414 Mmgt2-207ENSMUST00000155759 589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.01□□□□□ -0.65
Cdkn1bP46414 Krtap16-3-201ENSMUST00000179707 601 ntAPPRIS P1 BASIC11.01□□□□□ -0.65
Cdkn1bP46414 Gm27682-201ENSMUST00000183930 110 ntBASIC11.01□□□□□ -0.65
Cdkn1bP46414 Tmem254a-204ENSMUST00000185006 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.01□□□□□ -0.65
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 48.6 ms