Protein–RNA interactions for Protein: P38585

Ttl, Tubulin--tyrosine ligase, mousemouse

Predictions only

Length 377 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TtlP38585 Gm26770-201ENSMUST00000180586 2237 ntTSL 1 (best) BASIC12.4□□□□□ -0.42
TtlP38585 Erg-201ENSMUST00000077773 2232 ntTSL 1 (best) BASIC12.4□□□□□ -0.42
TtlP38585 Cep89-201ENSMUST00000079414 2610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.4□□□□□ -0.42
TtlP38585 Setdb2-201ENSMUST00000095775 3034 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.4□□□□□ -0.42
TtlP38585 Prss45-201ENSMUST00000011391 1232 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.4□□□□□ -0.42
TtlP38585 Gm11814-201ENSMUST00000119515 929 ntBASIC12.4□□□□□ -0.42
TtlP38585 Pou2f3-rs1-201ENSMUST00000120271 1046 ntBASIC12.4□□□□□ -0.42
TtlP38585 Apoc3-203ENSMUST00000121916 709 ntTSL 2 BASIC12.4□□□□□ -0.42
TtlP38585 Gm12138-201ENSMUST00000122180 951 ntBASIC12.4□□□□□ -0.42
TtlP38585 Gm16175-201ENSMUST00000128181 248 ntTSL 3 BASIC12.4□□□□□ -0.42
TtlP38585 Ift20-203ENSMUST00000128788 1141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.4□□□□□ -0.42
TtlP38585 Gm12945-201ENSMUST00000140080 674 ntTSL 1 (best) BASIC12.4□□□□□ -0.42
TtlP38585 Slc2a9-207ENSMUST00000143758 1296 ntTSL 1 (best) BASIC12.4□□□□□ -0.42
TtlP38585 Gm17232-201ENSMUST00000164515 453 ntTSL 2 BASIC12.4□□□□□ -0.42
TtlP38585 Gm27486-201ENSMUST00000184923 80 ntBASIC12.4□□□□□ -0.42
TtlP38585 Gm9124-201ENSMUST00000191789 1092 ntBASIC12.4□□□□□ -0.42
TtlP38585 Gm9113-201ENSMUST00000192510 1018 ntBASIC12.4□□□□□ -0.42
TtlP38585 Gm9131-201ENSMUST00000193557 1089 ntBASIC12.4□□□□□ -0.42
TtlP38585 Gm9121-201ENSMUST00000193749 1071 ntBASIC12.4□□□□□ -0.42
TtlP38585 C030018K13Rik-202ENSMUST00000196829 712 ntTSL 3 BASIC12.4□□□□□ -0.42
TtlP38585 Gm44064-201ENSMUST00000204964 1087 ntBASIC12.4□□□□□ -0.42
TtlP38585 Gm45059-201ENSMUST00000205558 1077 ntBASIC12.4□□□□□ -0.42
TtlP38585 Nudt17-201ENSMUST00000029742 1039 ntTSL 1 (best) BASIC12.4□□□□□ -0.42
TtlP38585 Cracr2a-201ENSMUST00000071563 1094 ntTSL 1 (best) BASIC12.4□□□□□ -0.42
TtlP38585 Cav3-201ENSMUST00000075477 1157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.4□□□□□ -0.42
TtlP38585 Tmem107-201ENSMUST00000075980 779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.4□□□□□ -0.42
TtlP38585 Gm10322-201ENSMUST00000095646 336 ntAPPRIS P1 BASIC12.4□□□□□ -0.42
TtlP38585 Ldha-214ENSMUST00000210815 1535 ntTSL 5 BASIC12.4□□□□□ -0.42
TtlP38585 Eps8l1-214ENSMUST00000171445 2975 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.4□□□□□ -0.42
TtlP38585 Sv2c-203ENSMUST00000182289 2197 ntTSL 1 (best) BASIC12.4□□□□□ -0.42
TtlP38585 Dnmt3a-201ENSMUST00000020991 9685 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.4□□□□□ -0.42
TtlP38585 Top2b-201ENSMUST00000017629 10335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.4□□□□□ -0.42
TtlP38585 Nxf1-211ENSMUST00000184970 5591 ntTSL 1 (best) BASIC12.4□□□□□ -0.42
TtlP38585 Klk6-203ENSMUST00000107968 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.4□□□□□ -0.42
TtlP38585 Psmb9-204ENSMUST00000174576 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.4□□□□□ -0.42
TtlP38585 Ppfia4-201ENSMUST00000168515 6067 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.4□□□□□ -0.42
TtlP38585 Rnf214-201ENSMUST00000058720 3964 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.4□□□□□ -0.42
TtlP38585 Rbm47-206ENSMUST00000200775 3180 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.4□□□□□ -0.42
TtlP38585 Sall4-202ENSMUST00000075044 2534 ntTSL 1 (best) BASIC12.4□□□□□ -0.42
TtlP38585 Iws1-201ENSMUST00000025243 9613 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.4□□□□□ -0.42
TtlP38585 Efhc1-201ENSMUST00000038447 2146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.4□□□□□ -0.43
TtlP38585 Ilvbl-208ENSMUST00000218875 3020 ntTSL 1 (best) BASIC12.4□□□□□ -0.43
TtlP38585 Gm38273-201ENSMUST00000194987 2382 ntBASIC12.4□□□□□ -0.43
TtlP38585 Lzts1-204ENSMUST00000185176 5019 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.39□□□□□ -0.43
TtlP38585 Casc4-202ENSMUST00000089912 3602 ntTSL 1 (best) BASIC12.39□□□□□ -0.43
TtlP38585 Otop2-202ENSMUST00000106544 2220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.39□□□□□ -0.43
TtlP38585 Renbp-209ENSMUST00000155597 1310 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.39□□□□□ -0.43
TtlP38585 Krt40-201ENSMUST00000074253 1320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.39□□□□□ -0.43
TtlP38585 A930007I19Rik-203ENSMUST00000181726 2099 ntTSL 1 (best) BASIC12.39□□□□□ -0.43
TtlP38585 Ccpg1-208ENSMUST00000150826 2939 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.39□□□□□ -0.43
TtlP38585 Rnf4-204ENSMUST00000182047 2944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.39□□□□□ -0.43
TtlP38585 Misp-201ENSMUST00000046833 2414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.39□□□□□ -0.43
TtlP38585 Sorbs1-203ENSMUST00000165212 2175 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.39□□□□□ -0.43
TtlP38585 1300002E11Rik-202ENSMUST00000181780 1650 ntTSL 2 BASIC12.39□□□□□ -0.43
TtlP38585 B430212C06Rik-205ENSMUST00000145081 2623 ntTSL 1 (best) BASIC12.39□□□□□ -0.43
TtlP38585 Kifc5c-ps-201ENSMUST00000179040 1530 ntBASIC12.39□□□□□ -0.43
TtlP38585 Dmbx1-201ENSMUST00000064806 5799 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.39□□□□□ -0.43
TtlP38585 Birc7-201ENSMUST00000108875 1178 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.39□□□□□ -0.43
TtlP38585 Dctn6-202ENSMUST00000117243 962 ntTSL 3 BASIC12.39□□□□□ -0.43
TtlP38585 Tmem80-205ENSMUST00000132061 667 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC12.39□□□□□ -0.43
TtlP38585 2210408F21Rik-210ENSMUST00000151076 539 ntTSL 1 (best) BASIC12.39□□□□□ -0.43
TtlP38585 BC046401-201ENSMUST00000155786 847 ntTSL 3 BASIC12.39□□□□□ -0.43
TtlP38585 Grp-202ENSMUST00000173530 617 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.39□□□□□ -0.43
TtlP38585 Gm7653-201ENSMUST00000214567 508 ntBASIC12.39□□□□□ -0.43
TtlP38585 AC151971.1-201ENSMUST00000217329 993 ntTSL 5 BASIC12.39□□□□□ -0.43
TtlP38585 Lnx1-201ENSMUST00000039744 2727 ntTSL 1 (best) BASIC12.39□□□□□ -0.43
TtlP38585 Alx4-202ENSMUST00000111254 7056 ntTSL 1 (best) BASIC12.39□□□□□ -0.43
TtlP38585 Map3k20-201ENSMUST00000090824 3334 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.39□□□□□ -0.43
TtlP38585 Lgals12-203ENSMUST00000159983 2470 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.39□□□□□ -0.43
TtlP38585 Dmrtc1c1-201ENSMUST00000118218 1611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.39□□□□□ -0.43
TtlP38585 Dmrtc1c2-203ENSMUST00000120314 1611 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.39□□□□□ -0.43
TtlP38585 Zap70-201ENSMUST00000027291 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.39□□□□□ -0.43
TtlP38585 Glrx3-203ENSMUST00000211496 3440 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.39□□□□□ -0.43
TtlP38585 Nup62cl-201ENSMUST00000101212 1996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.39□□□□□ -0.43
TtlP38585 Ctsl-201ENSMUST00000021933 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.39□□□□□ -0.43
TtlP38585 Ndufaf7-201ENSMUST00000024887 2303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.39□□□□□ -0.43
TtlP38585 Dlgap3-203ENSMUST00000106094 4207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.39□□□□□ -0.43
TtlP38585 Tmem163-205ENSMUST00000185560 3488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.39□□□□□ -0.43
TtlP38585 Nepn-201ENSMUST00000067085 1844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.39□□□□□ -0.43
TtlP38585 Ackr2-201ENSMUST00000050327 2853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.39□□□□□ -0.43
TtlP38585 Lysmd4-201ENSMUST00000058771 2898 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.39□□□□□ -0.43
TtlP38585 Slc39a8-201ENSMUST00000029810 3203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.39□□□□□ -0.43
TtlP38585 Nup93-201ENSMUST00000079961 2707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.39□□□□□ -0.43
TtlP38585 Bscl2-203ENSMUST00000159634 1684 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.38□□□□□ -0.43
TtlP38585 Srl-201ENSMUST00000023161 5000 ntTSL 1 (best) BASIC12.38□□□□□ -0.43
TtlP38585 Hyal1-204ENSMUST00000144392 1332 ntTSL 5 BASIC12.38□□□□□ -0.43
TtlP38585 Otx2-201ENSMUST00000118578 2144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.38□□□□□ -0.43
TtlP38585 Galns-203ENSMUST00000212319 2111 ntTSL 1 (best) BASIC12.38□□□□□ -0.43
TtlP38585 Alas1-201ENSMUST00000074082 2129 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.38□□□□□ -0.43
TtlP38585 Syngr2-202ENSMUST00000120928 1402 ntTSL 2 BASIC12.38□□□□□ -0.43
TtlP38585 Mast3-203ENSMUST00000211948 4251 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.38□□□□□ -0.43
TtlP38585 Evi5l-203ENSMUST00000176149 3938 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.38□□□□□ -0.43
TtlP38585 Nup205-204ENSMUST00000201374 6411 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.38□□□□□ -0.43
TtlP38585 Atp6v1b1-201ENSMUST00000006431 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.38□□□□□ -0.43
TtlP38585 Tmem51os1-204ENSMUST00000153023 3440 ntTSL 1 (best) BASIC12.38□□□□□ -0.43
TtlP38585 Aqp6-201ENSMUST00000023754 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.38□□□□□ -0.43
TtlP38585 Sec62-201ENSMUST00000029256 3967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.38□□□□□ -0.43
TtlP38585 Taok2-202ENSMUST00000117394 4985 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.38□□□□□ -0.43
TtlP38585 Kcnt1-204ENSMUST00000114176 4166 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.38□□□□□ -0.43
TtlP38585 Gm11618-201ENSMUST00000117946 267 ntBASIC12.38□□□□□ -0.43
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 24.9 ms