Protein–RNA interactions for Protein: P35278

Rab5c, Ras-related protein Rab-5C, mousemouse

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Length 216 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rab5cP35278 Pde6c-201ENSMUST00000025956 2586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
Rab5cP35278 Ankrd50-201ENSMUST00000094300 1944 ntTSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
Rab5cP35278 Arfrp1-202ENSMUST00000108808 1133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
Rab5cP35278 Bad-203ENSMUST00000113426 740 ntTSL 5 BASIC10.59□□□□□ -0.71
Rab5cP35278 Orai3-202ENSMUST00000118865 768 ntTSL 3 BASIC10.59□□□□□ -0.71
Rab5cP35278 Gm6184-201ENSMUST00000120403 1261 ntBASIC10.59□□□□□ -0.71
Rab5cP35278 Ctcflos-201ENSMUST00000142165 469 ntTSL 3 BASIC10.59□□□□□ -0.71
Rab5cP35278 Tsen15-201ENSMUST00000015124 1133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
Rab5cP35278 Gm18737-201ENSMUST00000173594 937 ntBASIC10.59□□□□□ -0.71
Rab5cP35278 4930467K11Rik-201ENSMUST00000180831 723 ntTSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
Rab5cP35278 Ankrd39-202ENSMUST00000194894 664 ntTSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
Rab5cP35278 Krt10-202ENSMUST00000211768 557 ntTSL 3 BASIC10.59□□□□□ -0.71
Rab5cP35278 Gm40513-201ENSMUST00000217258 411 ntTSL 3 BASIC10.59□□□□□ -0.71
Rab5cP35278 Gm32351-201ENSMUST00000220503 438 ntTSL 5 BASIC10.59□□□□□ -0.71
Rab5cP35278 Tmem52-201ENSMUST00000023920 932 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
Rab5cP35278 Mrps6-201ENSMUST00000047429 846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
Rab5cP35278 Nthl1-201ENSMUST00000047611 1080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
Rab5cP35278 Casp16-ps-201ENSMUST00000088673 531 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.59□□□□□ -0.71
Rab5cP35278 Cep170b-201ENSMUST00000092279 3817 ntTSL 5 BASIC10.59□□□□□ -0.71
Rab5cP35278 Olfr279-203ENSMUST00000216822 5605 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.59□□□□□ -0.71
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Rab5cP35278 Saa3-202ENSMUST00000210913 2200 ntTSL 3 BASIC10.59□□□□□ -0.71
Rab5cP35278 Wdcp-205ENSMUST00000220215 2202 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
Rab5cP35278 Gm10044-203ENSMUST00000166813 1471 ntTSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
Rab5cP35278 Syvn1-204ENSMUST00000138532 3464 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
Rab5cP35278 Taf9b-201ENSMUST00000055497 2633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
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Rab5cP35278 Esrp1-203ENSMUST00000108311 3864 ntTSL 5 BASIC10.59□□□□□ -0.71
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Rab5cP35278 Zfp593-201ENSMUST00000030644 1994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
Rab5cP35278 Foxj3-202ENSMUST00000106310 4660 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
Rab5cP35278 Gcdh-201ENSMUST00000003907 2167 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
Rab5cP35278 Zfp41-201ENSMUST00000054555 3736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
Rab5cP35278 Bcl11a-201ENSMUST00000000881 3061 ntTSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
Rab5cP35278 Nt5c3b-202ENSMUST00000092689 1344 ntTSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.71
Rab5cP35278 Nup98-201ENSMUST00000070165 4052 ntTSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.71
Rab5cP35278 Syt8-204ENSMUST00000118276 1503 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.72
Rab5cP35278 Catsper4-201ENSMUST00000055892 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.72
Rab5cP35278 Gsdme-205ENSMUST00000170142 2133 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.72
Rab5cP35278 Poll-201ENSMUST00000026239 2324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.72
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Rab5cP35278 Adgre5-201ENSMUST00000002964 2986 ntTSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.72
Rab5cP35278 Slc23a4-201ENSMUST00000044387 2175 ntTSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.72
Rab5cP35278 Phactr1-206ENSMUST00000131942 2056 ntTSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.72
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Rab5cP35278 Tor1aip1-202ENSMUST00000097527 4234 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.72
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Rab5cP35278 Tmem254a-204ENSMUST00000185006 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.72
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Rab5cP35278 Chl1-204ENSMUST00000203912 4628 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.72
Rab5cP35278 Lig1-201ENSMUST00000098814 3091 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.58□□□□□ -0.72
Rab5cP35278 Lrrn4-201ENSMUST00000049787 3715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.72
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Rab5cP35278 Rad9b-202ENSMUST00000117263 2371 ntTSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.72
Rab5cP35278 Zfp977-201ENSMUST00000173283 1425 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.58□□□□□ -0.72
Rab5cP35278 Dnajc14-207ENSMUST00000219508 2298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.72
Rab5cP35278 Kcnt1-211ENSMUST00000171268 3771 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.57□□□□□ -0.72
Rab5cP35278 Prc1-206ENSMUST00000173824 2912 ntTSL 1 (best) BASIC10.57□□□□□ -0.72
Rab5cP35278 Pepd-201ENSMUST00000075068 1881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.57□□□□□ -0.72
Rab5cP35278 Gm9025-201ENSMUST00000122415 1575 ntBASIC10.57□□□□□ -0.72
Rab5cP35278 Cyp2d11-201ENSMUST00000170255 1590 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.57□□□□□ -0.72
Rab5cP35278 AC113060.1-201ENSMUST00000225689 1573 ntBASIC10.57□□□□□ -0.72
Rab5cP35278 Vmp1-201ENSMUST00000018315 2787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.57□□□□□ -0.72
Rab5cP35278 Asph-207ENSMUST00000108333 2652 ntTSL 5 BASIC10.57□□□□□ -0.72
Rab5cP35278 Polrmt-201ENSMUST00000020580 3755 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.57□□□□□ -0.72
Rab5cP35278 March7-203ENSMUST00000102748 3594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.57□□□□□ -0.72
Rab5cP35278 Coq6-203ENSMUST00000110278 1354 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.57□□□□□ -0.72
Rab5cP35278 Pus1-204ENSMUST00000112426 1389 ntTSL 1 (best) BASIC10.57□□□□□ -0.72
Rab5cP35278 Zdhhc23-201ENSMUST00000036321 1380 ntTSL 1 (best) BASIC10.57□□□□□ -0.72
Rab5cP35278 Cdnf-201ENSMUST00000036350 3013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.57□□□□□ -0.72
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