Protein–RNA interactions for Protein: P28076

Psmb9, Proteasome subunit beta type-9, mousemouse

Predictions only

Length 219 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Psmb9P28076 Slc39a6-201ENSMUST00000070726 3882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.16□□□□□ -0.46
Psmb9P28076 Lig1-210ENSMUST00000165964 3166 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.16□□□□□ -0.46
Psmb9P28076 Trpm1-219ENSMUST00000206314 2323 ntTSL 1 (best) BASIC12.16□□□□□ -0.46
Psmb9P28076 Mrgprg-201ENSMUST00000058092 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.16□□□□□ -0.46
Psmb9P28076 Mef2b-204ENSMUST00000110146 1342 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.16□□□□□ -0.46
Psmb9P28076 Gbgt1-203ENSMUST00000163121 1335 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.16□□□□□ -0.46
Psmb9P28076 Wdr45-223ENSMUST00000207675 1335 ntTSL 5 BASIC12.16□□□□□ -0.46
Psmb9P28076 Col18a1-203ENSMUST00000105409 4791 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.16□□□□□ -0.46
Psmb9P28076 Fnbp1-206ENSMUST00000113555 1776 ntTSL 5 BASIC12.16□□□□□ -0.46
Psmb9P28076 Taz-202ENSMUST00000114180 1786 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC12.16□□□□□ -0.46
Psmb9P28076 Thrb-203ENSMUST00000091471 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.16□□□□□ -0.46
Psmb9P28076 Ttll12-201ENSMUST00000016901 3220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.16□□□□□ -0.46
Psmb9P28076 Myoc-201ENSMUST00000028020 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.16□□□□□ -0.46
Psmb9P28076 Orai3-202ENSMUST00000118865 768 ntTSL 3 BASIC12.16□□□□□ -0.46
Psmb9P28076 Snhg17-201ENSMUST00000133449 933 ntTSL 1 (best) BASIC12.16□□□□□ -0.46
Psmb9P28076 Frs3os-201ENSMUST00000136531 978 ntTSL 1 (best) BASIC12.16□□□□□ -0.46
Psmb9P28076 Gstt1-201ENSMUST00000001713 1037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.16□□□□□ -0.46
Psmb9P28076 Mir8098-201ENSMUST00000184011 137 ntBASIC12.16□□□□□ -0.46
Psmb9P28076 Gm27244-201ENSMUST00000184260 380 ntTSL 5 BASIC12.16□□□□□ -0.46
Psmb9P28076 Gm21362-201ENSMUST00000194272 928 ntBASIC12.16□□□□□ -0.46
Psmb9P28076 Trip6-203ENSMUST00000199121 366 ntTSL 3 BASIC12.16□□□□□ -0.46
Psmb9P28076 Gm20553-201ENSMUST00000204205 844 ntBASIC12.16□□□□□ -0.46
Psmb9P28076 Tspyl-ps-201ENSMUST00000220692 1117 ntBASIC12.16□□□□□ -0.46
Psmb9P28076 Epc1-202ENSMUST00000050542 565 ntTSL 1 (best) BASIC12.16□□□□□ -0.46
Psmb9P28076 A830031A19Rik-201ENSMUST00000068360 757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.16□□□□□ -0.46
Psmb9P28076 Pmm1-202ENSMUST00000071462 1059 ntTSL 1 (best) BASIC12.16□□□□□ -0.46
Psmb9P28076 S100a7a-201ENSMUST00000079286 1280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.16□□□□□ -0.46
Psmb9P28076 Olfr541-201ENSMUST00000080681 1103 ntAPPRIS P1 BASIC12.16□□□□□ -0.46
Psmb9P28076 Lce3e-201ENSMUST00000098886 607 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC12.16□□□□□ -0.46
Psmb9P28076 Zc3h6-202ENSMUST00000110320 4916 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.16□□□□□ -0.46
Psmb9P28076 Gm13859-201ENSMUST00000119936 1423 ntBASIC12.16□□□□□ -0.46
Psmb9P28076 Gm9025-201ENSMUST00000122415 1575 ntBASIC12.16□□□□□ -0.46
Psmb9P28076 AC113060.1-201ENSMUST00000225689 1573 ntBASIC12.16□□□□□ -0.46
Psmb9P28076 Cpa1-201ENSMUST00000031806 1583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.16□□□□□ -0.46
Psmb9P28076 Asph-207ENSMUST00000108333 2652 ntTSL 5 BASIC12.16□□□□□ -0.46
Psmb9P28076 Fam60a-201ENSMUST00000054080 2697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.16□□□□□ -0.46
Psmb9P28076 Plk2-201ENSMUST00000022212 2800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.16□□□□□ -0.46
Psmb9P28076 Osr2-201ENSMUST00000022952 1724 ntTSL 1 (best) BASIC12.16□□□□□ -0.46
Psmb9P28076 Arhgef2-203ENSMUST00000170653 4238 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.16□□□□□ -0.46
Psmb9P28076 Entpd4-206ENSMUST00000184973 3589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.16□□□□□ -0.46
Psmb9P28076 Entpd4b-204ENSMUST00000185072 3589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.16□□□□□ -0.46
Psmb9P28076 Usp53-202ENSMUST00000197314 3586 ntTSL 5 BASIC12.16□□□□□ -0.46
Psmb9P28076 Tcf4-226ENSMUST00000201094 2172 ntTSL 5 BASIC12.16□□□□□ -0.46
Psmb9P28076 Cyth3-202ENSMUST00000116456 3738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.16□□□□□ -0.46
Psmb9P28076 Iqsec2-201ENSMUST00000096275 5252 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC12.16□□□□□ -0.46
Psmb9P28076 Tspan2-201ENSMUST00000029451 4484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.16□□□□□ -0.46
Psmb9P28076 Cacna1c-212ENSMUST00000187940 7507 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.16□□□□□ -0.46
Psmb9P28076 Blzf1-203ENSMUST00000120447 2430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.16□□□□□ -0.46
Psmb9P28076 Psap-203ENSMUST00000165878 2564 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.16□□□□□ -0.46
Psmb9P28076 Plce1-204ENSMUST00000182481 8357 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.15□□□□□ -0.46
Psmb9P28076 Ptpn2-203ENSMUST00000122412 2667 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.15□□□□□ -0.46
Psmb9P28076 Olfr283-202ENSMUST00000215830 2392 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.15□□□□□ -0.46
Psmb9P28076 Zeb2-211ENSMUST00000153561 2070 ntTSL 1 (best) BASIC12.15□□□□□ -0.46
Psmb9P28076 4930444K16Rik-201ENSMUST00000220438 1767 ntBASIC12.15□□□□□ -0.46
Psmb9P28076 Syce1-201ENSMUST00000026553 1460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.15□□□□□ -0.46
Psmb9P28076 Flywch1-201ENSMUST00000045517 2798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.15□□□□□ -0.46
Psmb9P28076 Tcf4-205ENSMUST00000114980 2192 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.15□□□□□ -0.46
Psmb9P28076 Cttnbp2nl-201ENSMUST00000077548 4946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.15□□□□□ -0.46
Psmb9P28076 Asb13-201ENSMUST00000042288 4453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.15□□□□□ -0.46
Psmb9P28076 Cacna1c-203ENSMUST00000112790 7631 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.15□□□□□ -0.46
Psmb9P28076 Egr2-202ENSMUST00000105438 2864 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.15□□□□□ -0.46
Psmb9P28076 Pcdhgc4-201ENSMUST00000066140 5024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.15□□□□□ -0.46
Psmb9P28076 Gm9946-202ENSMUST00000162741 1580 ntTSL 1 (best) BASIC12.15□□□□□ -0.46
Psmb9P28076 Nrros-208ENSMUST00000143682 3577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.15□□□□□ -0.46
Psmb9P28076 Nt5c3b-205ENSMUST00000107399 1427 ntTSL 1 (best) BASIC12.15□□□□□ -0.46
Psmb9P28076 Znhit1-203ENSMUST00000111090 698 ntTSL 2 BASIC12.15□□□□□ -0.46
Psmb9P28076 Chchd6-202ENSMUST00000113550 1042 ntTSL 5 BASIC12.15□□□□□ -0.46
Psmb9P28076 Tekt5-202ENSMUST00000115831 1277 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.15□□□□□ -0.46
Psmb9P28076 Gm8116-201ENSMUST00000182917 1201 ntBASIC12.15□□□□□ -0.46
Psmb9P28076 Gm21470-201ENSMUST00000187680 696 ntBASIC12.15□□□□□ -0.46
Psmb9P28076 Gm33320-201ENSMUST00000192232 530 ntBASIC12.15□□□□□ -0.46
Psmb9P28076 Cd3g-201ENSMUST00000002101 1023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.15□□□□□ -0.46
Psmb9P28076 Higd1b-201ENSMUST00000021302 735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.15□□□□□ -0.46
Psmb9P28076 Msrb2-201ENSMUST00000023856 1196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.15□□□□□ -0.46
Psmb9P28076 Chchd6-201ENSMUST00000032172 1121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.15□□□□□ -0.46
Psmb9P28076 Crygn-201ENSMUST00000047119 768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.15□□□□□ -0.46
Psmb9P28076 Lce1f-201ENSMUST00000047153 728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.15□□□□□ -0.46
Psmb9P28076 2010003K11Rik-201ENSMUST00000048482 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.15□□□□□ -0.46
Psmb9P28076 Cyp2d40-201ENSMUST00000055721 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.15□□□□□ -0.46
Psmb9P28076 Cmc2-201ENSMUST00000078589 523 ntTSL 2 BASIC12.15□□□□□ -0.46
Psmb9P28076 Kcnip2-203ENSMUST00000086993 1005 ntTSL 1 (best) BASIC12.15□□□□□ -0.46
Psmb9P28076 Cenpl-202ENSMUST00000111618 1996 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.15□□□□□ -0.46
Psmb9P28076 Polm-202ENSMUST00000109837 2697 ntTSL 5 BASIC12.15□□□□□ -0.46
Psmb9P28076 Ap5b1-201ENSMUST00000096318 3092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.15□□□□□ -0.46
Psmb9P28076 Yae1d1-204ENSMUST00000222796 1382 ntTSL 5 BASIC12.15□□□□□ -0.46
Psmb9P28076 Ccdc114-201ENSMUST00000038720 2460 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.15□□□□□ -0.46
Psmb9P28076 Hs6st2-202ENSMUST00000114871 4351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.15□□□□□ -0.46
Psmb9P28076 Rasgrp4-214ENSMUST00000205027 2717 ntTSL 5 BASIC12.15□□□□□ -0.47
Psmb9P28076 Runx1-202ENSMUST00000113956 4738 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.15□□□□□ -0.47
Psmb9P28076 Anxa8-201ENSMUST00000022519 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.14□□□□□ -0.47
Psmb9P28076 Gm26728-202ENSMUST00000203423 1333 ntTSL 1 (best) BASIC12.14□□□□□ -0.47
Psmb9P28076 Zp1-201ENSMUST00000025641 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.14□□□□□ -0.47
Psmb9P28076 2010315B03Rik-202ENSMUST00000177714 2623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.14□□□□□ -0.47
Psmb9P28076 Gtf2i-210ENSMUST00000173341 4302 ntTSL 1 (best) BASIC12.14□□□□□ -0.47
Psmb9P28076 Adora1-202ENSMUST00000086465 4968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.14□□□□□ -0.47
Psmb9P28076 Usp2-201ENSMUST00000034508 3867 ntTSL 1 (best) BASIC12.14□□□□□ -0.47
Psmb9P28076 Ambra1-203ENSMUST00000099712 5021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.14□□□□□ -0.47
Psmb9P28076 Plin4-201ENSMUST00000002908 5755 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.14□□□□□ -0.47
Psmb9P28076 Robo3-201ENSMUST00000034643 4712 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.14□□□□□ -0.47
Psmb9P28076 Dnajc8-205ENSMUST00000105939 746 ntTSL 5 BASIC12.14□□□□□ -0.47
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 41.4 ms