Protein–RNA interactions for Protein: P19253

Rpl13a, 60S ribosomal protein L13a, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 203 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rpl13aP19253 Tmem132a-201ENSMUST00000025645 3657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.53□□□□□ -0.88
Rpl13aP19253 Thap6-204ENSMUST00000193925 1337 ntTSL 1 (best) BASIC9.53□□□□□ -0.88
Rpl13aP19253 Slc45a4-201ENSMUST00000054266 4664 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.53□□□□□ -0.88
Rpl13aP19253 Celsr3-201ENSMUST00000024238 11547 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.53□□□□□ -0.88
Rpl13aP19253 Cast-211ENSMUST00000223206 5141 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.53□□□□□ -0.88
Rpl13aP19253 Tiam2-201ENSMUST00000072156 6127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.53□□□□□ -0.88
Rpl13aP19253 Trappc2-203ENSMUST00000116495 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.53□□□□□ -0.88
Rpl13aP19253 BC026585-201ENSMUST00000046743 1618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.53□□□□□ -0.88
Rpl13aP19253 Nhlrc3-201ENSMUST00000056749 5047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.53□□□□□ -0.88
Rpl13aP19253 4933434M16Rik-202ENSMUST00000153429 1940 ntTSL 1 (best) BASIC9.52□□□□□ -0.88
Rpl13aP19253 Plxdc2-203ENSMUST00000114703 2061 ntTSL 5 BASIC9.52□□□□□ -0.88
Rpl13aP19253 Tbl1xr1-211ENSMUST00000202747 4209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.52□□□□□ -0.88
Rpl13aP19253 Vmn1r184-207ENSMUST00000228369 6361 ntAPPRIS P1 BASIC9.52□□□□□ -0.88
Rpl13aP19253 Lrrc20-201ENSMUST00000049242 3216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.52□□□□□ -0.88
Rpl13aP19253 Sema3f-204ENSMUST00000192727 2383 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.52□□□□□ -0.88
Rpl13aP19253 Rps6ka4-202ENSMUST00000170516 3105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.52□□□□□ -0.89
Rpl13aP19253 Rps6ka4-201ENSMUST00000025903 3105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.52□□□□□ -0.89
Rpl13aP19253 Kifap3-202ENSMUST00000077642 4012 ntTSL 1 (best) BASIC9.52□□□□□ -0.89
Rpl13aP19253 Pcdhb19-201ENSMUST00000059571 7138 ntAPPRIS P1 BASIC9.52□□□□□ -0.89
Rpl13aP19253 Mest-211ENSMUST00000163949 2561 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.52□□□□□ -0.89
Rpl13aP19253 Rpusd2-201ENSMUST00000028796 2706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.52□□□□□ -0.89
Rpl13aP19253 Ltc4s-202ENSMUST00000102772 649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.52□□□□□ -0.89
Rpl13aP19253 Fam53b-205ENSMUST00000106166 1270 ntTSL 1 (best) BASIC9.52□□□□□ -0.89
Rpl13aP19253 Rps13-ps4-201ENSMUST00000117927 456 ntBASIC9.52□□□□□ -0.89
Rpl13aP19253 Rps13-ps5-201ENSMUST00000117939 456 ntBASIC9.52□□□□□ -0.89
Rpl13aP19253 Gm6415-201ENSMUST00000118488 348 ntBASIC9.52□□□□□ -0.89
Rpl13aP19253 Gm13453-201ENSMUST00000118708 357 ntBASIC9.52□□□□□ -0.89
Rpl13aP19253 Gm15483-201ENSMUST00000120338 456 ntBASIC9.52□□□□□ -0.89
Rpl13aP19253 Akt2-ps-201ENSMUST00000120718 1449 ntBASIC9.52□□□□□ -0.89
Rpl13aP19253 Hras-203ENSMUST00000124314 1073 ntTSL 5 BASIC9.52□□□□□ -0.89
Rpl13aP19253 Gm14321-202ENSMUST00000139927 351 ntTSL 5 BASIC9.52□□□□□ -0.89
Rpl13aP19253 Gm11682-201ENSMUST00000144689 516 ntTSL 3 BASIC9.52□□□□□ -0.89
Rpl13aP19253 Gm16244-201ENSMUST00000159313 2327 ntTSL 1 (best) BASIC9.52□□□□□ -0.89
Rpl13aP19253 Pde8b-207ENSMUST00000162153 2474 ntTSL 1 (best) BASIC9.52□□□□□ -0.89
Rpl13aP19253 Mroh1-217ENSMUST00000162319 1244 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.52□□□□□ -0.89
Rpl13aP19253 Adsl-206ENSMUST00000168756 1439 ntTSL 5 BASIC9.52□□□□□ -0.89
Rpl13aP19253 A430057M04Rik-201ENSMUST00000169054 3835 ntTSL 1 (best) BASIC9.52□□□□□ -0.89
Rpl13aP19253 2010015M23Rik-201ENSMUST00000181900 1199 ntTSL 1 (best) BASIC9.52□□□□□ -0.89
Rpl13aP19253 Tmod2-207ENSMUST00000215462 1564 ntTSL 1 (best) BASIC9.52□□□□□ -0.89
Rpl13aP19253 Gpc5-201ENSMUST00000022707 1719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.52□□□□□ -0.89
Rpl13aP19253 Aif1-201ENSMUST00000025257 847 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC9.52□□□□□ -0.89
Rpl13aP19253 Tmod4-201ENSMUST00000005769 1242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.52□□□□□ -0.89
Rpl13aP19253 Slc27a2-201ENSMUST00000061491 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.52□□□□□ -0.89
Rpl13aP19253 Capn2-201ENSMUST00000068505 3225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.52□□□□□ -0.89
Rpl13aP19253 Olfr1410-201ENSMUST00000079790 969 ntTSL 5 BASIC9.52□□□□□ -0.89
Rpl13aP19253 Rhox9-201ENSMUST00000089062 882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.52□□□□□ -0.89
Rpl13aP19253 Pde5a-201ENSMUST00000066728 6939 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.52□□□□□ -0.89
Rpl13aP19253 A630014C17Rik-201ENSMUST00000150973 2984 ntTSL 1 (best) BASIC9.52□□□□□ -0.89
Rpl13aP19253 Ap5z1-202ENSMUST00000196055 2965 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.52□□□□□ -0.89
Rpl13aP19253 Psmd2-201ENSMUST00000007212 2961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.52□□□□□ -0.89
Rpl13aP19253 Ace3-201ENSMUST00000190995 2214 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.52□□□□□ -0.89
Rpl13aP19253 Trp73-201ENSMUST00000097762 2205 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.52□□□□□ -0.89
Rpl13aP19253 Cfap74-209ENSMUST00000151083 5487 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.52□□□□□ -0.89
Rpl13aP19253 Fam149a-201ENSMUST00000093526 5469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.52□□□□□ -0.89
Rpl13aP19253 Gm26604-201ENSMUST00000180926 1766 ntTSL 1 (best) BASIC9.52□□□□□ -0.89
Rpl13aP19253 Grm1-203ENSMUST00000105561 4435 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.52□□□□□ -0.89
Rpl13aP19253 Mtmr4-201ENSMUST00000092802 5525 ntTSL 1 (best) BASIC9.52□□□□□ -0.89
Rpl13aP19253 Gm42466-201ENSMUST00000202099 1301 ntBASIC9.52□□□□□ -0.89
Rpl13aP19253 Map2k4-201ENSMUST00000046963 3695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.52□□□□□ -0.89
Rpl13aP19253 Rtn4rl1-201ENSMUST00000102514 3525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.52□□□□□ -0.89
Rpl13aP19253 Zmym3-209ENSMUST00000121520 5564 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.52□□□□□ -0.89
Rpl13aP19253 Brinp2-201ENSMUST00000004133 4167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.52□□□□□ -0.89
Rpl13aP19253 Gm10433-202ENSMUST00000146364 1984 ntTSL 2 BASIC9.52□□□□□ -0.89
Rpl13aP19253 Gm3373-202ENSMUST00000177556 1955 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC9.52□□□□□ -0.89
Rpl13aP19253 Gm3500-201ENSMUST00000177986 1955 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.52□□□□□ -0.89
Rpl13aP19253 Gabra1-201ENSMUST00000020707 4688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.52□□□□□ -0.89
Rpl13aP19253 Pcsk7-209ENSMUST00000216672 3599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.52□□□□□ -0.89
Rpl13aP19253 Ptpn23-201ENSMUST00000040021 5346 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.52□□□□□ -0.89
Rpl13aP19253 Afg3l1-201ENSMUST00000001520 4227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.51□□□□□ -0.89
Rpl13aP19253 Kifap3-201ENSMUST00000027877 3946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.51□□□□□ -0.89
Rpl13aP19253 Tacc2-201ENSMUST00000033141 3940 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.51□□□□□ -0.89
Rpl13aP19253 Olah-201ENSMUST00000027955 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.51□□□□□ -0.89
Rpl13aP19253 Fyttd1-211ENSMUST00000171325 4295 ntTSL 1 (best) BASIC9.51□□□□□ -0.89
Rpl13aP19253 4933427G23Rik-201ENSMUST00000122963 2515 ntTSL 1 (best) BASIC9.51□□□□□ -0.89
Rpl13aP19253 Kalrn-206ENSMUST00000114954 4677 ntTSL 1 (best) BASIC9.51□□□□□ -0.89
Rpl13aP19253 Cyp2a4-201ENSMUST00000098657 1738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.51□□□□□ -0.89
Rpl13aP19253 Frmpd3-203ENSMUST00000208130 7314 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.51□□□□□ -0.89
Rpl13aP19253 Kyat1-204ENSMUST00000113661 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.51□□□□□ -0.89
Rpl13aP19253 Svil-211ENSMUST00000143254 6594 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.51□□□□□ -0.89
Rpl13aP19253 Fbxo15-204ENSMUST00000224467 1908 ntAPPRIS ALT2 BASIC9.51□□□□□ -0.89
Rpl13aP19253 Slc4a2-202ENSMUST00000115047 4264 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.51□□□□□ -0.89
Rpl13aP19253 Mageh1-201ENSMUST00000051484 1410 ntAPPRIS P1 BASIC9.51□□□□□ -0.89
Rpl13aP19253 Ptprm-203ENSMUST00000224091 3773 ntBASIC9.51□□□□□ -0.89
Rpl13aP19253 Gabpb1-202ENSMUST00000089745 3254 ntTSL 1 (best) BASIC9.51□□□□□ -0.89
Rpl13aP19253 Gm26616-202ENSMUST00000195676 3107 ntBASIC9.51□□□□□ -0.89
Rpl13aP19253 Pitpnb-204ENSMUST00000200298 2632 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC9.51□□□□□ -0.89
Rpl13aP19253 H60b-201ENSMUST00000105522 1029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.51□□□□□ -0.89
Rpl13aP19253 Nme1-202ENSMUST00000107844 452 ntTSL 3 BASIC9.51□□□□□ -0.89
Rpl13aP19253 Apip-201ENSMUST00000011055 919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.51□□□□□ -0.89
Rpl13aP19253 Gm3054-201ENSMUST00000111075 265 ntTSL 5 BASIC9.51□□□□□ -0.89
Rpl13aP19253 Ninj2-202ENSMUST00000112711 853 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.51□□□□□ -0.89
Rpl13aP19253 Gm14767-201ENSMUST00000121559 586 ntBASIC9.51□□□□□ -0.89
Rpl13aP19253 Slc25a12-206ENSMUST00000151937 6351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.51□□□□□ -0.89
Rpl13aP19253 AC155937.1-202ENSMUST00000156229 621 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC9.51□□□□□ -0.89
Rpl13aP19253 Gm9726-201ENSMUST00000180321 678 ntBASIC9.51□□□□□ -0.89
Rpl13aP19253 Gm26935-201ENSMUST00000182686 519 ntTSL 5 BASIC9.51□□□□□ -0.89
Rpl13aP19253 Gpx4-207ENSMUST00000183037 735 ntTSL 2 BASIC9.51□□□□□ -0.89
Rpl13aP19253 Irs3-202ENSMUST00000196511 1281 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.51□□□□□ -0.89
Rpl13aP19253 5830408C22Rik-201ENSMUST00000210072 1115 ntTSL 5 BASIC9.51□□□□□ -0.89
Rpl13aP19253 Tomm20l-201ENSMUST00000021482 578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.51□□□□□ -0.89
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 28 ms