Protein–RNA interactions for Protein: P18828

Sdc1, Syndecan-1, mousemouse

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Length 311 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sdc1P18828 Pja1-204ENSMUST00000113797 1676 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.64□□□□□ -0.71
Sdc1P18828 Prr12-201ENSMUST00000057293 7023 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.64□□□□□ -0.71
Sdc1P18828 Cant1-203ENSMUST00000106287 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Sdc1P18828 Pak6-201ENSMUST00000099557 4411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Sdc1P18828 Jrk-201ENSMUST00000050234 5853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Sdc1P18828 Mbd3-202ENSMUST00000105347 914 ntTSL 2 BASIC10.64□□□□□ -0.71
Sdc1P18828 Hmgn2-204ENSMUST00000105893 973 ntTSL 3 BASIC10.64□□□□□ -0.71
Sdc1P18828 Snhg15-203ENSMUST00000134527 675 ntTSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Sdc1P18828 Atp6v0c-ps1-201ENSMUST00000206596 463 ntBASIC10.64□□□□□ -0.71
Sdc1P18828 Gm45453-201ENSMUST00000211758 853 ntBASIC10.64□□□□□ -0.71
Sdc1P18828 Tmem52-201ENSMUST00000023920 932 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Sdc1P18828 Caly-201ENSMUST00000026541 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Sdc1P18828 Alkbh2-201ENSMUST00000053657 1073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Sdc1P18828 Olfr324-201ENSMUST00000054683 1122 ntAPPRIS P2 BASIC10.64□□□□□ -0.71
Sdc1P18828 Tmod4-201ENSMUST00000005769 1242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Sdc1P18828 Cd300c-201ENSMUST00000061637 690 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.64□□□□□ -0.71
Sdc1P18828 Atp5h-202ENSMUST00000073791 659 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.64□□□□□ -0.71
Sdc1P18828 Zfp524-201ENSMUST00000086349 1142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Sdc1P18828 Cd300c-202ENSMUST00000092466 700 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC10.64□□□□□ -0.71
Sdc1P18828 AC164441.2-201ENSMUST00000220818 2746 ntTSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Sdc1P18828 Mvk-202ENSMUST00000112239 1602 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Sdc1P18828 Pogk-202ENSMUST00000128861 4848 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Sdc1P18828 A230072C01Rik-202ENSMUST00000136447 1412 ntTSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Sdc1P18828 Fbxo44-205ENSMUST00000151127 1403 ntTSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Sdc1P18828 G6pc3-201ENSMUST00000070334 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Sdc1P18828 Wwox-203ENSMUST00000109108 1771 ntTSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Sdc1P18828 Rgs3-205ENSMUST00000107424 4084 ntTSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Sdc1P18828 Rlbp1-202ENSMUST00000179243 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Sdc1P18828 Synpo-211ENSMUST00000155195 4442 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Sdc1P18828 Kcnh6-202ENSMUST00000106903 2816 ntTSL 5 BASIC10.64□□□□□ -0.71
Sdc1P18828 Pabpc4-204ENSMUST00000106243 3111 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC10.64□□□□□ -0.71
Sdc1P18828 Jarid2-201ENSMUST00000044608 5019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Sdc1P18828 Ptger4-201ENSMUST00000047379 3264 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Sdc1P18828 Rapgef2-202ENSMUST00000118340 6544 ntTSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Sdc1P18828 9430038I01Rik-203ENSMUST00000120340 4643 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Sdc1P18828 Gm26584-201ENSMUST00000180551 3216 ntTSL 5 BASIC10.63□□□□□ -0.71
Sdc1P18828 Mcm8-202ENSMUST00000066559 3397 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Sdc1P18828 Gm31518-201ENSMUST00000211925 2548 ntTSL 5 BASIC10.63□□□□□ -0.71
Sdc1P18828 Bbs4-201ENSMUST00000026265 2518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Sdc1P18828 Zeb2-201ENSMUST00000028229 5335 ntTSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Sdc1P18828 Hnrnph2-205ENSMUST00000113203 2315 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.63□□□□□ -0.71
Sdc1P18828 Cyyr1-201ENSMUST00000114174 5464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Sdc1P18828 Gm5780-201ENSMUST00000217774 1834 ntBASIC10.63□□□□□ -0.71
Sdc1P18828 Carmil1-201ENSMUST00000072889 4988 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Sdc1P18828 Gm42934-201ENSMUST00000196920 1345 ntBASIC10.63□□□□□ -0.71
Sdc1P18828 Lypd6-202ENSMUST00000112712 3495 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.63□□□□□ -0.71
Sdc1P18828 Prrt3-204ENSMUST00000205075 1956 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.63□□□□□ -0.71
Sdc1P18828 P2rx7-203ENSMUST00000100737 4936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Sdc1P18828 March7-203ENSMUST00000102748 3594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Sdc1P18828 Zfp426-202ENSMUST00000115562 3557 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Sdc1P18828 Ralgps2-209ENSMUST00000189316 2924 ntTSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Sdc1P18828 Armc7-201ENSMUST00000035240 2260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Sdc1P18828 Tle1-201ENSMUST00000030095 2569 ntTSL 5 BASIC10.63□□□□□ -0.71
Sdc1P18828 Hlcs-201ENSMUST00000099512 4833 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Sdc1P18828 Platr15-201ENSMUST00000147128 768 ntTSL 5 BASIC10.63□□□□□ -0.71
Sdc1P18828 Edf1-201ENSMUST00000015236 722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Sdc1P18828 Tcta-202ENSMUST00000192886 1094 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.63□□□□□ -0.71
Sdc1P18828 Ighv1-25-201ENSMUST00000195638 345 ntBASIC10.63□□□□□ -0.71
Sdc1P18828 Gm10252-201ENSMUST00000209541 832 ntBASIC10.63□□□□□ -0.71
Sdc1P18828 Xpa-201ENSMUST00000030013 955 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Sdc1P18828 Cmc1-201ENSMUST00000044220 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Sdc1P18828 Rps4l-201ENSMUST00000071745 943 ntBASIC10.63□□□□□ -0.71
Sdc1P18828 Gpbar1-201ENSMUST00000077985 1075 ntAPPRIS P1 BASIC10.63□□□□□ -0.71
Sdc1P18828 Eif4a2-223ENSMUST00000168891 2203 ntTSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Sdc1P18828 4930425O10Rik-201ENSMUST00000197761 1418 ntTSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Sdc1P18828 Sbk2-205ENSMUST00000208109 1422 ntTSL 5 BASIC10.63□□□□□ -0.71
Sdc1P18828 2600006K01Rik-201ENSMUST00000047607 1406 ntTSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Sdc1P18828 Tgfb2-206ENSMUST00000195201 3485 ntTSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Sdc1P18828 Nsmce2-202ENSMUST00000168722 2679 ntTSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Sdc1P18828 Adamts1-201ENSMUST00000023610 4884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Sdc1P18828 Tbcd-201ENSMUST00000103013 3906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Sdc1P18828 Tfr2-204ENSMUST00000196471 2839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Sdc1P18828 Adgre5-208ENSMUST00000166939 2980 ntTSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Sdc1P18828 Adgre5-201ENSMUST00000002964 2986 ntTSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Sdc1P18828 Rbm6-207ENSMUST00000183032 3716 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Sdc1P18828 Gm43102-201ENSMUST00000201004 2324 ntBASIC10.63□□□□□ -0.71
Sdc1P18828 1200007C13Rik-201ENSMUST00000143649 2455 ntTSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Sdc1P18828 Gtf2i-210ENSMUST00000173341 4302 ntTSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Sdc1P18828 Utp23-203ENSMUST00000137116 2921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Sdc1P18828 Ggt6-201ENSMUST00000076443 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Sdc1P18828 Cenpl-202ENSMUST00000111618 1996 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.63□□□□□ -0.71
Sdc1P18828 Ccdc151-202ENSMUST00000115336 2103 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Sdc1P18828 Arhgap20os-204ENSMUST00000152203 2113 ntTSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Sdc1P18828 Kcnj5-203ENSMUST00000216033 2440 ntTSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Sdc1P18828 Tollip-201ENSMUST00000001950 3788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Sdc1P18828 Duox2-201ENSMUST00000053734 5744 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.63□□□□□ -0.71
Sdc1P18828 Rph3a-201ENSMUST00000079204 4150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
Sdc1P18828 Snap23-201ENSMUST00000028743 2658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
Sdc1P18828 Apbb1-201ENSMUST00000081165 2530 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC10.62□□□□□ -0.71
Sdc1P18828 Oxnad1-201ENSMUST00000022462 2376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
Sdc1P18828 Taf6-203ENSMUST00000110937 2093 ntTSL 5 BASIC10.62□□□□□ -0.71
Sdc1P18828 Prok2-203ENSMUST00000101120 1450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
Sdc1P18828 Brms1-201ENSMUST00000116567 1338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
Sdc1P18828 Fgfr1op-201ENSMUST00000024636 3077 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
Sdc1P18828 Ino80c-204ENSMUST00000153360 2498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
Sdc1P18828 Herc4-208ENSMUST00000219577 3914 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
Sdc1P18828 Poll-201ENSMUST00000026239 2324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
Sdc1P18828 AC156031.2-201ENSMUST00000213107 3310 ntBASIC10.62□□□□□ -0.71
Sdc1P18828 Vps16-201ENSMUST00000028900 3161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
Sdc1P18828 Nol4l-202ENSMUST00000109784 5610 ntTSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
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