Protein–RNA interactions for Protein: P18532

Ig heavy chain V region 1B43, mousemouse

Predictions only

Length 116 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
P18532 Nbdy-202ENSMUST00000149514 775 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.37□□□□□ -0.59
P18532 Rhoc-204ENSMUST00000176347 583 ntTSL 5 BASIC11.37□□□□□ -0.59
P18532 1700125G22Rik-201ENSMUST00000181124 861 ntTSL 1 (best) BASIC11.37□□□□□ -0.59
P18532 Gm28287-201ENSMUST00000186612 546 ntTSL 5 BASIC11.37□□□□□ -0.59
P18532 Vmo1-201ENSMUST00000021179 672 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.37□□□□□ -0.59
P18532 4930578M07Rik-202ENSMUST00000212946 552 ntTSL 1 (best) BASIC11.37□□□□□ -0.59
P18532 Tnfrsf17-201ENSMUST00000023140 815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.37□□□□□ -0.59
P18532 Syngr4-201ENSMUST00000039049 967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.37□□□□□ -0.59
P18532 Tnnt3-201ENSMUST00000074187 1007 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.37□□□□□ -0.59
P18532 Ankmy2-201ENSMUST00000041640 2456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.37□□□□□ -0.59
P18532 Gm6992-201ENSMUST00000217973 1607 ntBASIC11.37□□□□□ -0.59
P18532 Noto-201ENSMUST00000089578 1602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.37□□□□□ -0.59
P18532 Aspm-205ENSMUST00000200083 6072 ntTSL 1 (best) BASIC11.37□□□□□ -0.59
P18532 Srr-204ENSMUST00000121738 3183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.37□□□□□ -0.59
P18532 Zfp786-201ENSMUST00000058844 3191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.37□□□□□ -0.59
P18532 Yeats2-201ENSMUST00000090052 5997 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.37□□□□□ -0.59
P18532 Lmx1b-201ENSMUST00000041730 4790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.37□□□□□ -0.59
P18532 Lzts3-203ENSMUST00000110260 3827 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.37□□□□□ -0.59
P18532 Hnrnpf-203ENSMUST00000167182 2271 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.37□□□□□ -0.59
P18532 Marco-201ENSMUST00000027639 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.37□□□□□ -0.59
P18532 Phactr2-201ENSMUST00000079698 1934 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.37□□□□□ -0.59
P18532 Mto1-201ENSMUST00000034896 2366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
P18532 Irf3-201ENSMUST00000003284 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
P18532 Crry-ps-201ENSMUST00000079090 1309 ntBASIC11.36□□□□□ -0.59
P18532 Actrt2-201ENSMUST00000060062 1435 ntAPPRIS P1 BASIC11.36□□□□□ -0.59
P18532 Rpe-201ENSMUST00000027157 2692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
P18532 Gm5466-201ENSMUST00000119395 1890 ntBASIC11.36□□□□□ -0.59
P18532 Dnpep-209ENSMUST00000187836 1862 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
P18532 Ngly1-207ENSMUST00000224656 2329 ntAPPRIS ALT2 BASIC11.36□□□□□ -0.59
P18532 Lexm-204ENSMUST00000189032 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
P18532 Ccdc163-201ENSMUST00000030452 1524 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.36□□□□□ -0.59
P18532 2310035C23Rik-201ENSMUST00000039173 4328 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
P18532 Gm43666-201ENSMUST00000197116 2989 ntTSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
P18532 Sphk2-201ENSMUST00000072836 2968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
P18532 Zcchc3-201ENSMUST00000099207 3073 ntAPPRIS P1 BASIC11.36□□□□□ -0.59
P18532 Poli-205ENSMUST00000161542 2736 ntTSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
P18532 Tle3-215ENSMUST00000162583 4299 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC11.36□□□□□ -0.59
P18532 Gm11595-201ENSMUST00000107440 1200 ntAPPRIS P1 BASIC11.36□□□□□ -0.59
P18532 Cdc26-202ENSMUST00000107459 654 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.36□□□□□ -0.59
P18532 Apoc1-202ENSMUST00000108451 532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
P18532 Gm6370-201ENSMUST00000110611 1142 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.36□□□□□ -0.59
P18532 Gm7857-201ENSMUST00000117957 358 ntBASIC11.36□□□□□ -0.59
P18532 Gm12566-201ENSMUST00000121479 359 ntBASIC11.36□□□□□ -0.59
P18532 Rpl13-ps1-201ENSMUST00000121801 668 ntBASIC11.36□□□□□ -0.59
P18532 Gm13388-201ENSMUST00000126659 425 ntTSL 3 BASIC11.36□□□□□ -0.59
P18532 Gm11772-201ENSMUST00000136542 532 ntTSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
P18532 Mitd1-205ENSMUST00000139725 1175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
P18532 Gm25043-201ENSMUST00000158604 212 ntBASIC11.36□□□□□ -0.59
P18532 Gm6309-201ENSMUST00000174320 1154 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.36□□□□□ -0.59
P18532 Gm20470-201ENSMUST00000174654 331 ntTSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
P18532 Dleu2-205ENSMUST00000182325 463 ntTSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
P18532 Dleu2-212ENSMUST00000183079 535 ntTSL 3 BASIC11.36□□□□□ -0.59
P18532 Mir7221-201ENSMUST00000184009 72 ntBASIC11.36□□□□□ -0.59
P18532 2010010A06Rik-201ENSMUST00000185628 258 ntBASIC11.36□□□□□ -0.59
P18532 Gm8885-201ENSMUST00000189382 598 ntBASIC11.36□□□□□ -0.59
P18532 Gm37986-201ENSMUST00000193285 383 ntBASIC11.36□□□□□ -0.59
P18532 Gm45925-201ENSMUST00000218882 744 ntBASIC11.36□□□□□ -0.59
P18532 AC166095.1-201ENSMUST00000223731 1241 ntBASIC11.36□□□□□ -0.59
P18532 AC167013.1-201ENSMUST00000228592 202 ntBASIC11.36□□□□□ -0.59
P18532 4921530L21Rik-202ENSMUST00000228913 1115 ntAPPRIS P1 BASIC11.36□□□□□ -0.59
P18532 Pxt1-201ENSMUST00000051526 710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
P18532 Tpr-201ENSMUST00000119161 7480 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.36□□□□□ -0.59
P18532 Sdha-201ENSMUST00000022062 2900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
P18532 Col6a2-202ENSMUST00000105413 4653 ntTSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
P18532 Max-201ENSMUST00000082136 1926 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
P18532 Rabggtb-201ENSMUST00000089950 1381 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.36□□□□□ -0.59
P18532 H2-Q1-201ENSMUST00000073208 2024 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
P18532 Cchcr1-202ENSMUST00000164242 2656 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
P18532 Cd27-201ENSMUST00000032486 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
P18532 Gm26525-201ENSMUST00000180666 3616 ntTSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
P18532 Mllt6-201ENSMUST00000044730 7274 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
P18532 Abra-201ENSMUST00000054742 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
P18532 Bmp3-202ENSMUST00000197143 2739 ntTSL 2 BASIC11.36□□□□□ -0.59
P18532 Il12rb1-205ENSMUST00000212657 2741 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.36□□□□□ -0.59
P18532 Vps53-201ENSMUST00000056601 2833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
P18532 Nek3-202ENSMUST00000110730 2050 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.36□□□□□ -0.59
P18532 5330426L24Rik-201ENSMUST00000200008 2175 ntBASIC11.35□□□□□ -0.59
P18532 Tcf4-226ENSMUST00000201094 2172 ntTSL 5 BASIC11.35□□□□□ -0.59
P18532 Serpinh1-205ENSMUST00000208119 2173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
P18532 Serpinb13-201ENSMUST00000027564 1607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
P18532 Six3os1-211ENSMUST00000176958 2889 ntTSL 2 BASIC11.35□□□□□ -0.59
P18532 Hrg-201ENSMUST00000023590 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
P18532 Zfp574-202ENSMUST00000179556 4140 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
P18532 Adam15-201ENSMUST00000029676 2975 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
P18532 Zfp711-202ENSMUST00000113409 4330 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.35□□□□□ -0.59
P18532 Rbm47-206ENSMUST00000200775 3180 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
P18532 Tc2n-203ENSMUST00000160830 2005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
P18532 Pde4dip-201ENSMUST00000045243 6185 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
P18532 Jazf1-201ENSMUST00000074541 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
P18532 Eif4g3-203ENSMUST00000084215 8134 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.35□□□□□ -0.59
P18532 Zc3h13-201ENSMUST00000022577 6151 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.35□□□□□ -0.59
P18532 Gngt2-207ENSMUST00000107714 558 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.35□□□□□ -0.59
P18532 Tax1bp3-202ENSMUST00000108477 1153 ntTSL 5 BASIC11.35□□□□□ -0.59
P18532 Gm14208-201ENSMUST00000119645 678 ntBASIC11.35□□□□□ -0.59
P18532 Dnajc25-204ENSMUST00000152199 1141 ntTSL 5 BASIC11.35□□□□□ -0.59
P18532 Smim17-203ENSMUST00000161855 664 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.35□□□□□ -0.59
P18532 Adtrp-204ENSMUST00000179758 1046 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.35□□□□□ -0.59
P18532 Pfn1-201ENSMUST00000018437 861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
P18532 2310047D07Rik-201ENSMUST00000189493 735 ntTSL 3 BASIC11.35□□□□□ -0.59
P18532 Ak6-205ENSMUST00000190729 1184 ntTSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 53.9 ms