Protein–RNA interactions for Protein: P18528

Ig heavy chain V region 6.96, mousemouse

Predictions only

Length 98 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
P18528 Gm43365-201ENSMUST00000196522 2106 ntBASIC10.42□□□□□ -0.74
P18528 Capn3-205ENSMUST00000110719 2778 ntTSL 5 BASIC10.42□□□□□ -0.74
P18528 Lpar1-205ENSMUST00000107575 3421 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.42□□□□□ -0.74
P18528 Mlxip-201ENSMUST00000068237 7303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.42□□□□□ -0.74
P18528 Usp5-202ENSMUST00000122110 3076 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.42□□□□□ -0.74
P18528 Gadl1-203ENSMUST00000121770 1763 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.42□□□□□ -0.74
P18528 C530008M17Rik-204ENSMUST00000121160 6921 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.42□□□□□ -0.74
P18528 Iba57-201ENSMUST00000054523 4021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.42□□□□□ -0.74
P18528 Dab2ip-206ENSMUST00000112987 6287 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.42□□□□□ -0.74
P18528 Gm45833-201ENSMUST00000211931 2730 ntTSL 5 BASIC10.42□□□□□ -0.74
P18528 Plekhg2-203ENSMUST00000121085 4649 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.42□□□□□ -0.74
P18528 Cacna1g-203ENSMUST00000103166 8104 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.42□□□□□ -0.74
P18528 Nrxn1-207ENSMUST00000160844 9309 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.41□□□□□ -0.74
P18528 Atat1-212ENSMUST00000141662 2034 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.41□□□□□ -0.74
P18528 Gm44094-201ENSMUST00000204703 2030 ntBASIC10.41□□□□□ -0.74
P18528 Dnajc14-207ENSMUST00000219508 2298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.41□□□□□ -0.74
P18528 Ap1g2-211ENSMUST00000170285 2596 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.41□□□□□ -0.74
P18528 Btnl2-202ENSMUST00000178562 2563 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.41□□□□□ -0.74
P18528 Btnl2-201ENSMUST00000025198 2564 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.41□□□□□ -0.74
P18528 Dnajb1-202ENSMUST00000212300 2854 ntTSL 1 (best) BASIC10.41□□□□□ -0.74
P18528 Ptgdr-201ENSMUST00000095959 3187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.41□□□□□ -0.74
P18528 Islr-201ENSMUST00000041477 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.41□□□□□ -0.74
P18528 Nt5c3b-203ENSMUST00000107397 1348 ntTSL 1 (best) BASIC10.41□□□□□ -0.74
P18528 Ppargc1b-202ENSMUST00000075299 3656 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.41□□□□□ -0.74
P18528 Mcm8-202ENSMUST00000066559 3397 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.41□□□□□ -0.74
P18528 Slc22a5-201ENSMUST00000019044 3062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.41□□□□□ -0.74
P18528 Dnaic2-202ENSMUST00000092469 2799 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.41□□□□□ -0.74
P18528 AC157950.1-201ENSMUST00000217561 2168 ntBASIC10.41□□□□□ -0.74
P18528 Armcx2-203ENSMUST00000119010 3007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.41□□□□□ -0.74
P18528 Acyp1-203ENSMUST00000117138 735 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.41□□□□□ -0.74
P18528 AC155937.1-201ENSMUST00000125635 831 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10.41□□□□□ -0.74
P18528 Gm3436-201ENSMUST00000179930 840 ntBASIC10.41□□□□□ -0.74
P18528 Gm29608-201ENSMUST00000190444 463 ntBASIC10.41□□□□□ -0.74
P18528 AC147241.1-201ENSMUST00000222173 785 ntTSL 3 BASIC10.41□□□□□ -0.74
P18528 AC154846.1-201ENSMUST00000226278 862 ntBASIC10.41□□□□□ -0.74
P18528 Il17b-201ENSMUST00000025471 692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.41□□□□□ -0.74
P18528 Lce1d-201ENSMUST00000029524 678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.41□□□□□ -0.74
P18528 Zswim7-201ENSMUST00000072916 732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.41□□□□□ -0.74
P18528 Kcnd3-201ENSMUST00000079169 2102 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.41□□□□□ -0.74
P18528 Pparg-204ENSMUST00000203732 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.41□□□□□ -0.74
P18528 Ylpm1-202ENSMUST00000101202 4605 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.41□□□□□ -0.74
P18528 Olfr283-202ENSMUST00000215830 2392 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.41□□□□□ -0.74
P18528 2010315B03Rik-202ENSMUST00000177714 2623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.41□□□□□ -0.74
P18528 Gm43721-201ENSMUST00000199677 2313 ntBASIC10.41□□□□□ -0.74
P18528 Plekha1-202ENSMUST00000075181 2301 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.41□□□□□ -0.74
P18528 Pkm-202ENSMUST00000163694 2041 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC10.41□□□□□ -0.74
P18528 Fbxl5-211ENSMUST00000196483 2814 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.41□□□□□ -0.74
P18528 Zfp683-201ENSMUST00000105884 1471 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.41□□□□□ -0.74
P18528 Rnf25-201ENSMUST00000027357 1479 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.41□□□□□ -0.74
P18528 Mzf1-205ENSMUST00000182515 3340 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.41□□□□□ -0.74
P18528 Corin-201ENSMUST00000005352 4862 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.41□□□□□ -0.74
P18528 Gm43061-201ENSMUST00000198850 2241 ntBASIC10.41□□□□□ -0.74
P18528 Slc39a8-205ENSMUST00000167390 3533 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.41□□□□□ -0.74
P18528 Ctgf-203ENSMUST00000176228 2490 ntTSL 2 BASIC10.41□□□□□ -0.74
P18528 AC096628.2-201ENSMUST00000225443 1413 ntBASIC10.41□□□□□ -0.74
P18528 Pcdhga11-201ENSMUST00000061279 4756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.41□□□□□ -0.74
P18528 Gcdh-201ENSMUST00000003907 2167 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.41□□□□□ -0.74
P18528 Fam234b-202ENSMUST00000111916 2927 ntTSL 1 (best) BASIC10.4□□□□□ -0.74
P18528 Lipe-208ENSMUST00000206861 3171 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.4□□□□□ -0.74
P18528 Nemp1-203ENSMUST00000118728 2362 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.4□□□□□ -0.74
P18528 Gm14149-201ENSMUST00000123048 1853 ntTSL 1 (best) BASIC10.4□□□□□ -0.74
P18528 Ddx10-201ENSMUST00000065630 3128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.4□□□□□ -0.74
P18528 Lig1-201ENSMUST00000098814 3091 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.4□□□□□ -0.74
P18528 Acoxl-202ENSMUST00000110344 1573 ntTSL 1 (best) BASIC10.4□□□□□ -0.74
P18528 C030034I22Rik-202ENSMUST00000188481 4231 ntBASIC10.4□□□□□ -0.74
P18528 Pcdh7-203ENSMUST00000191837 8785 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.4□□□□□ -0.74
P18528 Ppp2r2b-202ENSMUST00000117687 2271 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.4□□□□□ -0.74
P18528 Fmo1-202ENSMUST00000111518 1506 ntTSL 1 (best) BASIC10.4□□□□□ -0.74
P18528 Rasgef1a-202ENSMUST00000203482 2227 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.4□□□□□ -0.74
P18528 Bdp1-201ENSMUST00000038104 9921 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.4□□□□□ -0.74
P18528 Lef1-204ENSMUST00000106341 3357 ntTSL 1 (best) BASIC10.4□□□□□ -0.74
P18528 Lef1-202ENSMUST00000066849 3398 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC10.4□□□□□ -0.74
P18528 Ocln-203ENSMUST00000159459 1950 ntTSL 1 (best) BASIC10.4□□□□□ -0.74
P18528 Ctbp2-209ENSMUST00000166439 1997 ntTSL 1 (best) BASIC10.4□□□□□ -0.74
P18528 Gm26531-201ENSMUST00000181727 1967 ntTSL 1 (best) BASIC10.4□□□□□ -0.74
P18528 Hist1h3e-201ENSMUST00000105107 836 ntAPPRIS P1 BASIC10.4□□□□□ -0.74
P18528 1110004F10Rik-203ENSMUST00000106608 927 ntTSL 3 BASIC10.4□□□□□ -0.74
P18528 Nudt1-203ENSMUST00000110825 599 ntTSL 2 BASIC10.4□□□□□ -0.74
P18528 Cntf-201ENSMUST00000112933 1073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.4□□□□□ -0.74
P18528 Qdpr-202ENSMUST00000117425 1231 ntTSL 3 BASIC10.4□□□□□ -0.74
P18528 Tex30-206ENSMUST00000133677 935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.4□□□□□ -0.74
P18528 Cd63-ps-201ENSMUST00000145417 875 ntBASIC10.4□□□□□ -0.74
P18528 Cox6c-205ENSMUST00000156915 606 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.4□□□□□ -0.74
P18528 Gm38144-201ENSMUST00000192790 465 ntBASIC10.4□□□□□ -0.74
P18528 Cxcl17-202ENSMUST00000200880 760 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.4□□□□□ -0.74
P18528 Tpi-rs5-201ENSMUST00000216947 774 ntBASIC10.4□□□□□ -0.74
P18528 AC154276.1-201ENSMUST00000228874 1299 ntBASIC10.4□□□□□ -0.74
P18528 Fahd2a-201ENSMUST00000028848 1211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.4□□□□□ -0.74
P18528 Hes5-201ENSMUST00000049621 1273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.4□□□□□ -0.74
P18528 Cxcl17-201ENSMUST00000074040 761 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.4□□□□□ -0.74
P18528 Tfdp2-205ENSMUST00000179416 2408 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.4□□□□□ -0.74
P18528 Tada3-202ENSMUST00000043333 1708 ntTSL 1 (best) BASIC10.4□□□□□ -0.74
P18528 Catsper4-201ENSMUST00000055892 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.4□□□□□ -0.74
P18528 Kcp-203ENSMUST00000101614 4885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.4□□□□□ -0.74
P18528 Ppp6r3-202ENSMUST00000113997 4952 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC10.4□□□□□ -0.75
P18528 Nr2c2-201ENSMUST00000113460 7647 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.4□□□□□ -0.75
P18528 Gm7224-201ENSMUST00000121359 2066 ntBASIC10.4□□□□□ -0.75
P18528 Cisd2-201ENSMUST00000029815 3361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.4□□□□□ -0.75
P18528 Slc35g3-201ENSMUST00000102586 1618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.4□□□□□ -0.75
P18528 Rbm12b1-201ENSMUST00000050069 2949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.4□□□□□ -0.75
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