Protein–RNA interactions for Protein: P16388

Kcna1, Potassium voltage-gated channel subfamily A member 1, mousemouse

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Length 495 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Kcna1P16388 Sit1-201ENSMUST00000030180 1228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
Kcna1P16388 Mrto4-201ENSMUST00000030513 930 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
Kcna1P16388 Gm9899-201ENSMUST00000065519 555 ntBASIC14.77□□□□□ -0.05
Kcna1P16388 Mdk-203ENSMUST00000090602 714 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.77□□□□□ -0.05
Kcna1P16388 Rp2-201ENSMUST00000033372 4417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
Kcna1P16388 Parp16-202ENSMUST00000213396 2518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
Kcna1P16388 Ppp1r13l-201ENSMUST00000047621 3130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
Kcna1P16388 Sgms1-212ENSMUST00000151289 2488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
Kcna1P16388 Pkp3-202ENSMUST00000106039 2919 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
Kcna1P16388 Zfp618-202ENSMUST00000064814 2868 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.77□□□□□ -0.05
Kcna1P16388 Trappc2l-201ENSMUST00000015157 1659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
Kcna1P16388 Zfp595-205ENSMUST00000171466 2240 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
Kcna1P16388 Prdm5-202ENSMUST00000031976 2155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
Kcna1P16388 4931414P19Rik-201ENSMUST00000022786 2670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
Kcna1P16388 Chml-201ENSMUST00000104984 6905 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.77□□□□□ -0.05
Kcna1P16388 Chml-202ENSMUST00000209720 6905 ntTSL 5 BASIC14.77□□□□□ -0.05
Kcna1P16388 Gm43570-201ENSMUST00000199951 3688 ntBASIC14.77□□□□□ -0.05
Kcna1P16388 Cux2-210ENSMUST00000168288 4697 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.77□□□□□ -0.05
Kcna1P16388 Gemin5-205ENSMUST00000172035 6213 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
Kcna1P16388 Slc25a22-223ENSMUST00000201710 2565 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.77□□□□□ -0.05
Kcna1P16388 Stag1-206ENSMUST00000129269 6186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
Kcna1P16388 Sept10-201ENSMUST00000165971 2532 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Kcna1P16388 Fbxo34-205ENSMUST00000168833 2993 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Kcna1P16388 Abhd18-202ENSMUST00000108078 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Kcna1P16388 Mettl17-206ENSMUST00000164902 1461 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.76□□□□□ -0.05
Kcna1P16388 Bin2-205ENSMUST00000182814 1901 ntTSL 5 BASIC14.76□□□□□ -0.05
Kcna1P16388 Zfp207-206ENSMUST00000165565 2311 ntTSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Kcna1P16388 Olfr649-202ENSMUST00000106859 1382 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.76□□□□□ -0.05
Kcna1P16388 Saa3-202ENSMUST00000210913 2200 ntTSL 3 BASIC14.76□□□□□ -0.05
Kcna1P16388 Fbxw7-201ENSMUST00000029727 2221 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Kcna1P16388 Fnbp1-206ENSMUST00000113555 1776 ntTSL 5 BASIC14.76□□□□□ -0.05
Kcna1P16388 Pax6-202ENSMUST00000090397 3069 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.76□□□□□ -0.05
Kcna1P16388 Cutal-201ENSMUST00000028228 2179 ntTSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Kcna1P16388 Alg2-201ENSMUST00000044148 3021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Kcna1P16388 Gm11658-201ENSMUST00000120913 1008 ntBASIC14.76□□□□□ -0.05
Kcna1P16388 Gm16191-202ENSMUST00000148464 484 ntTSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Kcna1P16388 Rab11b-ps2-201ENSMUST00000178377 657 ntBASIC14.76□□□□□ -0.05
Kcna1P16388 Gm2467-201ENSMUST00000182266 1010 ntBASIC14.76□□□□□ -0.05
Kcna1P16388 Gm6981-201ENSMUST00000182467 1008 ntBASIC14.76□□□□□ -0.05
Kcna1P16388 Gm27230-202ENSMUST00000184671 857 ntTSL 3 BASIC14.76□□□□□ -0.05
Kcna1P16388 Sox2ot-208ENSMUST00000197103 802 ntTSL 2 BASIC14.76□□□□□ -0.05
Kcna1P16388 AC152453.1-201ENSMUST00000218802 1254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Kcna1P16388 Lim2-201ENSMUST00000004732 884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Kcna1P16388 n-R5s195-201ENSMUST00000082891 119 ntBASIC14.76□□□□□ -0.05
Kcna1P16388 Gpr31b-201ENSMUST00000091648 960 ntAPPRIS P1 BASIC14.76□□□□□ -0.05
Kcna1P16388 Chia1-201ENSMUST00000079132 1681 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Kcna1P16388 Usp33-209ENSMUST00000197748 4183 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Kcna1P16388 5330406M23Rik-201ENSMUST00000195672 2094 ntBASIC14.76□□□□□ -0.05
Kcna1P16388 Robo4-205ENSMUST00000214185 4952 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Kcna1P16388 Adam23-205ENSMUST00000114107 6110 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.76□□□□□ -0.05
Kcna1P16388 Gm26551-201ENSMUST00000181262 2432 ntTSL 5 BASIC14.76□□□□□ -0.05
Kcna1P16388 Hid1-201ENSMUST00000044152 3236 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Kcna1P16388 Atg10-201ENSMUST00000022119 1583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Kcna1P16388 Dhx29-201ENSMUST00000038574 4682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Kcna1P16388 Gm34006-202ENSMUST00000216467 1918 ntTSL 2 BASIC14.76□□□□□ -0.05
Kcna1P16388 Dppa4-202ENSMUST00000096045 1534 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Kcna1P16388 Syt2-204ENSMUST00000188842 3386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Kcna1P16388 Bcs1l-203ENSMUST00000113733 1488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Kcna1P16388 Arrdc4-201ENSMUST00000048068 3905 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Kcna1P16388 Necab1-202ENSMUST00000108273 2135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Kcna1P16388 Pnn-201ENSMUST00000021381 3485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Kcna1P16388 Atp2a3-202ENSMUST00000108484 4467 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.75□□□□□ -0.05
Kcna1P16388 Gak-201ENSMUST00000046603 4453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Kcna1P16388 Galnt6-201ENSMUST00000052069 3798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Kcna1P16388 Oraov1-201ENSMUST00000033388 2015 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Kcna1P16388 Ackr4-204ENSMUST00000219146 1654 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.75□□□□□ -0.05
Kcna1P16388 Gm42863-201ENSMUST00000197875 2958 ntBASIC14.75□□□□□ -0.05
Kcna1P16388 AC153366.2-201ENSMUST00000219461 1984 ntBASIC14.75□□□□□ -0.05
Kcna1P16388 Slc6a18-210ENSMUST00000223074 1975 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Kcna1P16388 Pcdha1-202ENSMUST00000193839 4925 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Kcna1P16388 D030068K23Rik-201ENSMUST00000180382 2617 ntTSL 2 BASIC14.75□□□□□ -0.05
Kcna1P16388 Kif5c-201ENSMUST00000028102 6856 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Kcna1P16388 Akp-ps1-201ENSMUST00000188050 1600 ntBASIC14.75□□□□□ -0.05
Kcna1P16388 Trav4d-2-201ENSMUST00000120914 335 ntBASIC14.75□□□□□ -0.05
Kcna1P16388 Gm20521-201ENSMUST00000134077 1245 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.75□□□□□ -0.05
Kcna1P16388 Abhd14b-202ENSMUST00000185347 1200 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.75□□□□□ -0.05
Kcna1P16388 Gm38002-201ENSMUST00000193255 180 ntBASIC14.75□□□□□ -0.05
Kcna1P16388 Gm44772-201ENSMUST00000207623 1191 ntBASIC14.75□□□□□ -0.05
Kcna1P16388 1700029I15Rik-201ENSMUST00000054316 364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Kcna1P16388 Tnnt3-201ENSMUST00000074187 1007 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Kcna1P16388 Scrn3-202ENSMUST00000112050 1897 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Kcna1P16388 Arhgap20-201ENSMUST00000065496 7161 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.75□□□□□ -0.05
Kcna1P16388 Ap2a1-201ENSMUST00000085399 3442 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.75□□□□□ -0.05
Kcna1P16388 Bop1-201ENSMUST00000023217 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Kcna1P16388 Aspg-201ENSMUST00000079400 2722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Kcna1P16388 Spry2-201ENSMUST00000022709 2087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Kcna1P16388 Aph1a-201ENSMUST00000015894 2863 ntTSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Kcna1P16388 Abtb2-201ENSMUST00000076212 4558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Kcna1P16388 Ficd-201ENSMUST00000065698 3133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Kcna1P16388 Gm29530-201ENSMUST00000187556 1956 ntTSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Kcna1P16388 Etv3-202ENSMUST00000119109 5309 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Kcna1P16388 Hnf1b-201ENSMUST00000021016 2759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Kcna1P16388 Ddx27-205ENSMUST00000150571 2151 ntTSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Kcna1P16388 Zfp36l1-201ENSMUST00000021552 2990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Kcna1P16388 Arnt-203ENSMUST00000102749 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Kcna1P16388 Osbpl11-201ENSMUST00000039733 4520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Kcna1P16388 Taf3-201ENSMUST00000026888 4792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Kcna1P16388 2310026I22Rik-201ENSMUST00000180941 1300 ntTSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Kcna1P16388 Cab39-201ENSMUST00000097666 2369 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.74□□□□□ -0.05
Kcna1P16388 Pak4-201ENSMUST00000032823 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
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