Protein–RNA interactions for Protein: P13373

Vpreb2, Immunoglobulin omega chain, mousemouse

Predictions only

Length 142 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Vpreb2P13373 Gm20488-201ENSMUST00000201641 2996 ntTSL 2 BASIC8.71□□□□□ -1.02
Vpreb2P13373 Rab11fip5-201ENSMUST00000060837 4035 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC8.71□□□□□ -1.02
Vpreb2P13373 Slit2-216ENSMUST00000174313 7734 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC8.71□□□□□ -1.02
Vpreb2P13373 Scg3-201ENSMUST00000034699 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.71□□□□□ -1.02
Vpreb2P13373 Poli-205ENSMUST00000161542 2736 ntTSL 1 (best) BASIC8.71□□□□□ -1.02
Vpreb2P13373 Jpt1-201ENSMUST00000021083 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.71□□□□□ -1.02
Vpreb2P13373 Mfap4-202ENSMUST00000064783 1722 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC8.71□□□□□ -1.02
Vpreb2P13373 Armcx1-204ENSMUST00000113198 2085 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC8.71□□□□□ -1.02
Vpreb2P13373 Ntrk2-201ENSMUST00000079828 8744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.71□□□□□ -1.02
Vpreb2P13373 Usp3-205ENSMUST00000127569 5607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.71□□□□□ -1.02
Vpreb2P13373 Erbin-201ENSMUST00000022222 6369 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC8.71□□□□□ -1.02
Vpreb2P13373 Wisp3-201ENSMUST00000076713 1419 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC8.71□□□□□ -1.02
Vpreb2P13373 Col6a2-201ENSMUST00000001181 3949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.71□□□□□ -1.02
Vpreb2P13373 Scamp5-201ENSMUST00000046587 3225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.71□□□□□ -1.02
Vpreb2P13373 Kpna1-201ENSMUST00000004054 5039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.71□□□□□ -1.02
Vpreb2P13373 Mid1-215ENSMUST00000171433 2546 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC8.71□□□□□ -1.02
Vpreb2P13373 Scg2-201ENSMUST00000049972 2515 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC8.71□□□□□ -1.02
Vpreb2P13373 Gm45650-201ENSMUST00000211162 2169 ntTSL 5 BASIC8.71□□□□□ -1.02
Vpreb2P13373 4931440F15Rik-201ENSMUST00000104962 3274 ntAPPRIS P1 BASIC8.71□□□□□ -1.02
Vpreb2P13373 Ube2d-ps-205ENSMUST00000142942 1840 ntTSL 1 (best) BASIC8.7□□□□□ -1.02
Vpreb2P13373 Hps3-201ENSMUST00000012580 4016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.7□□□□□ -1.02
Vpreb2P13373 Pla2g3-202ENSMUST00000064265 2566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.7□□□□□ -1.02
Vpreb2P13373 Pdlim3-203ENSMUST00000210422 1479 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC8.7□□□□□ -1.02
Vpreb2P13373 Psmd2-201ENSMUST00000007212 2961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.7□□□□□ -1.02
Vpreb2P13373 Iqsec2-201ENSMUST00000096275 5252 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC8.7□□□□□ -1.02
Vpreb2P13373 Gm38376-201ENSMUST00000195493 2253 ntBASIC8.7□□□□□ -1.02
Vpreb2P13373 Slc22a18-201ENSMUST00000052348 1525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.7□□□□□ -1.02
Vpreb2P13373 Trim68-205ENSMUST00000210855 2301 ntTSL 1 (best) BASIC8.7□□□□□ -1.02
Vpreb2P13373 Asb10-201ENSMUST00000048302 2327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.7□□□□□ -1.02
Vpreb2P13373 Psd2-205ENSMUST00000176873 4375 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC8.7□□□□□ -1.02
Vpreb2P13373 Epha5-202ENSMUST00000113398 4830 ntTSL 5 BASIC8.7□□□□□ -1.02
Vpreb2P13373 Stau1-201ENSMUST00000049412 2840 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC8.7□□□□□ -1.02
Vpreb2P13373 Samd4-203ENSMUST00000125113 2442 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC8.7□□□□□ -1.02
Vpreb2P13373 Prodh-205ENSMUST00000136776 2041 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC8.7□□□□□ -1.02
Vpreb2P13373 Gm14452-201ENSMUST00000118680 1632 ntBASIC8.7□□□□□ -1.02
Vpreb2P13373 Pnpla6-202ENSMUST00000111070 4496 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC8.7□□□□□ -1.02
Vpreb2P13373 Wiz-201ENSMUST00000064694 2871 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC8.7□□□□□ -1.02
Vpreb2P13373 Gpr132-201ENSMUST00000021729 2478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.7□□□□□ -1.02
Vpreb2P13373 Rab1a-202ENSMUST00000109601 1200 ntTSL 5 BASIC8.7□□□□□ -1.02
Vpreb2P13373 Ccdc169-203ENSMUST00000118963 740 ntTSL 3 BASIC8.7□□□□□ -1.02
Vpreb2P13373 Mrps10-202ENSMUST00000119841 1113 ntTSL 1 (best) BASIC8.7□□□□□ -1.02
Vpreb2P13373 4930456L15Rik-201ENSMUST00000145577 1185 ntTSL 1 (best) BASIC8.7□□□□□ -1.02
Vpreb2P13373 Gm17409-201ENSMUST00000167423 962 ntAPPRIS P1 BASIC8.7□□□□□ -1.02
Vpreb2P13373 Pax5-213ENSMUST00000173821 996 ntTSL 5 BASIC8.7□□□□□ -1.02
Vpreb2P13373 1700022A21Rik-201ENSMUST00000182745 1051 ntBASIC8.7□□□□□ -1.02
Vpreb2P13373 Pbx2-205ENSMUST00000183827 1186 ntTSL 5 BASIC8.7□□□□□ -1.02
Vpreb2P13373 Gm18307-201ENSMUST00000206864 949 ntBASIC8.7□□□□□ -1.02
Vpreb2P13373 Isca2-201ENSMUST00000021667 883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.7□□□□□ -1.02
Vpreb2P13373 AC155258.1-201ENSMUST00000219303 253 ntBASIC8.7□□□□□ -1.02
Vpreb2P13373 Batf3-201ENSMUST00000027943 801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.7□□□□□ -1.02
Vpreb2P13373 Wdr74-201ENSMUST00000049424 1204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.7□□□□□ -1.02
Vpreb2P13373 Ube2i-201ENSMUST00000049911 1138 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC8.7□□□□□ -1.02
Vpreb2P13373 Ccdc169-202ENSMUST00000061099 887 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC8.7□□□□□ -1.02
Vpreb2P13373 Gm5356-201ENSMUST00000093326 615 ntBASIC8.7□□□□□ -1.02
Vpreb2P13373 Camta2-202ENSMUST00000100933 4383 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC8.7□□□□□ -1.02
Vpreb2P13373 Camta2-204ENSMUST00000108545 4377 ntTSL 1 (best) BASIC8.7□□□□□ -1.02
Vpreb2P13373 Camta2-206ENSMUST00000120261 4398 ntTSL 5 BASIC8.7□□□□□ -1.02
Vpreb2P13373 Sgk1-204ENSMUST00000120509 3096 ntTSL 1 (best) BASIC8.7□□□□□ -1.02
Vpreb2P13373 Zscan12-203ENSMUST00000225545 4405 ntAPPRIS P1 BASIC8.7□□□□□ -1.02
Vpreb2P13373 Gucy1a2-201ENSMUST00000115733 2243 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC8.7□□□□□ -1.02
Vpreb2P13373 Tmub2-205ENSMUST00000156326 2249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.7□□□□□ -1.02
Vpreb2P13373 Egfl6-201ENSMUST00000000412 2704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.7□□□□□ -1.02
Vpreb2P13373 Abcg8-203ENSMUST00000171915 2284 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC8.7□□□□□ -1.02
Vpreb2P13373 Gprc5c-208ENSMUST00000177952 1809 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC8.7□□□□□ -1.02
Vpreb2P13373 Tbc1d22a-201ENSMUST00000063414 3229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.7□□□□□ -1.02
Vpreb2P13373 Hhipl2-202ENSMUST00000192527 2310 ntTSL 1 (best) BASIC8.7□□□□□ -1.02
Vpreb2P13373 Kyat1-205ENSMUST00000113662 1850 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC8.7□□□□□ -1.02
Vpreb2P13373 4930473A02Rik-202ENSMUST00000136793 1409 ntTSL 1 (best) BASIC8.7□□□□□ -1.02
Vpreb2P13373 Ppp1r10-202ENSMUST00000087211 4255 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC8.7□□□□□ -1.02
Vpreb2P13373 Sirpa-214ENSMUST00000179001 3812 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC8.7□□□□□ -1.02
Vpreb2P13373 Mgll-201ENSMUST00000089449 3867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.7□□□□□ -1.02
Vpreb2P13373 Lmf2-201ENSMUST00000023283 2906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.7□□□□□ -1.02
Vpreb2P13373 Dph3-202ENSMUST00000067955 2953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.7□□□□□ -1.02
Vpreb2P13373 Rapgef2-206ENSMUST00000195708 6964 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC8.7□□□□□ -1.02
Vpreb2P13373 Dnajc5g-201ENSMUST00000066544 1565 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC8.69□□□□□ -1.02
Vpreb2P13373 Madd-214ENSMUST00000111381 5873 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC8.69□□□□□ -1.02
Vpreb2P13373 Begain-204ENSMUST00000209829 3272 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC8.69□□□□□ -1.02
Vpreb2P13373 Myt1l-201ENSMUST00000021009 5027 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC8.69□□□□□ -1.02
Vpreb2P13373 Setd5-201ENSMUST00000042889 6755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.69□□□□□ -1.02
Vpreb2P13373 Prr33-201ENSMUST00000054910 2251 ntTSL 1 (best) BASIC8.69□□□□□ -1.02
Vpreb2P13373 Cplx4-201ENSMUST00000025397 1751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.69□□□□□ -1.02
Vpreb2P13373 Ap5z1-202ENSMUST00000196055 2965 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC8.69□□□□□ -1.02
Vpreb2P13373 Epb41l2-204ENSMUST00000217929 3621 ntTSL 1 (best) BASIC8.69□□□□□ -1.02
Vpreb2P13373 Pja1-203ENSMUST00000113792 3038 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC8.69□□□□□ -1.02
Vpreb2P13373 Stard8-201ENSMUST00000036606 4963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.69□□□□□ -1.02
Vpreb2P13373 Gm7899-201ENSMUST00000192935 1897 ntBASIC8.69□□□□□ -1.02
Vpreb2P13373 Trim46-201ENSMUST00000041022 3122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.69□□□□□ -1.02
Vpreb2P13373 Zfp536-202ENSMUST00000175941 4423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.69□□□□□ -1.02
Vpreb2P13373 Plod1-202ENSMUST00000105712 1059 ntTSL 2 BASIC8.69□□□□□ -1.02
Vpreb2P13373 Bola2-202ENSMUST00000106369 642 ntTSL 1 (best) BASIC8.69□□□□□ -1.02
Vpreb2P13373 Prcd-202ENSMUST00000116318 799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.69□□□□□ -1.02
Vpreb2P13373 Gm12960-201ENSMUST00000120017 1066 ntBASIC8.69□□□□□ -1.02
Vpreb2P13373 Gm15201-201ENSMUST00000136472 1210 ntTSL 1 (best) BASIC8.69□□□□□ -1.02
Vpreb2P13373 Tmem262-201ENSMUST00000143303 545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.69□□□□□ -1.02
Vpreb2P13373 Cpne8-201ENSMUST00000014777 697 ntTSL 1 (best) BASIC8.69□□□□□ -1.02
Vpreb2P13373 Otx2os1-202ENSMUST00000183803 743 ntTSL 1 (best) BASIC8.69□□□□□ -1.02
Vpreb2P13373 Gm27701-201ENSMUST00000184498 110 ntBASIC8.69□□□□□ -1.02
Vpreb2P13373 Lrcol1-202ENSMUST00000185691 764 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC8.69□□□□□ -1.02
Vpreb2P13373 Dap-204ENSMUST00000186425 597 ntTSL 3 BASIC8.69□□□□□ -1.02
Vpreb2P13373 2810429I04Rik-210ENSMUST00000189464 868 ntTSL 1 (best) BASIC8.69□□□□□ -1.02
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 41.3 ms