Protein–RNA interactions for Protein: P10628

Hoxd4, Homeobox protein Hox-D4, mousemouse

Predictions only

Length 250 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Hoxd4P10628 Ccdc172-201ENSMUST00000069419 1086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Hoxd4P10628 Hist1h3f-201ENSMUST00000075558 1261 ntAPPRIS P1 BASIC11.65□□□□□ -0.54
Hoxd4P10628 Cyp2d11-201ENSMUST00000170255 1590 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.65□□□□□ -0.54
Hoxd4P10628 Gtf2i-203ENSMUST00000111261 4381 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.65□□□□□ -0.54
Hoxd4P10628 Tti2-202ENSMUST00000209851 3133 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Hoxd4P10628 Lztr1-201ENSMUST00000023444 3112 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Hoxd4P10628 St6galnac6-202ENSMUST00000081879 2345 ntTSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Hoxd4P10628 Usp5-202ENSMUST00000122110 3076 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Hoxd4P10628 Ppfia4-205ENSMUST00000189361 5238 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.65□□□□□ -0.54
Hoxd4P10628 Pprc1-201ENSMUST00000062322 5205 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Hoxd4P10628 Olfr1234-202ENSMUST00000111543 1386 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.65□□□□□ -0.55
Hoxd4P10628 Tmed1-201ENSMUST00000034698 1378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.55
Hoxd4P10628 Bcat2-202ENSMUST00000120864 1536 ntTSL 5 BASIC11.65□□□□□ -0.55
Hoxd4P10628 Sdf4-201ENSMUST00000050078 5177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.55
Hoxd4P10628 Gm4858-202ENSMUST00000194595 1810 ntTSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.55
Hoxd4P10628 Gpd2-201ENSMUST00000028167 5620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.55
Hoxd4P10628 Dolpp1-201ENSMUST00000028209 2251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.55
Hoxd4P10628 Nrf1-209ENSMUST00000115209 2406 ntTSL 5 BASIC11.65□□□□□ -0.55
Hoxd4P10628 Pou2f1-209ENSMUST00000160908 2591 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.55
Hoxd4P10628 Pafah2-201ENSMUST00000105869 2248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Hoxd4P10628 P4ha2-201ENSMUST00000019050 2230 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.64□□□□□ -0.55
Hoxd4P10628 Gm3252-201ENSMUST00000165619 1949 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.64□□□□□ -0.55
Hoxd4P10628 Gm6210-201ENSMUST00000204734 1942 ntBASIC11.64□□□□□ -0.55
Hoxd4P10628 Riox2-203ENSMUST00000120674 1753 ntTSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Hoxd4P10628 Dcun1d3-203ENSMUST00000106519 1475 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.64□□□□□ -0.55
Hoxd4P10628 Lpar5-203ENSMUST00000171989 1458 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.64□□□□□ -0.55
Hoxd4P10628 Acot7-202ENSMUST00000075363 1457 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Hoxd4P10628 Stk33-203ENSMUST00000121378 1304 ntTSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Hoxd4P10628 Fgf17-202ENSMUST00000227123 1336 ntBASIC11.64□□□□□ -0.55
Hoxd4P10628 Chrnd-201ENSMUST00000073252 2925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Hoxd4P10628 Dcaf8-202ENSMUST00000191689 2754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Hoxd4P10628 Poll-201ENSMUST00000026239 2324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Hoxd4P10628 Ppp1r12b-201ENSMUST00000045665 8840 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.64□□□□□ -0.55
Hoxd4P10628 Chml-201ENSMUST00000104984 6905 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.64□□□□□ -0.55
Hoxd4P10628 Chml-202ENSMUST00000209720 6905 ntTSL 5 BASIC11.64□□□□□ -0.55
Hoxd4P10628 Gm6157-201ENSMUST00000199935 1897 ntBASIC11.64□□□□□ -0.55
Hoxd4P10628 Brf2-201ENSMUST00000033877 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Hoxd4P10628 Rspry1-201ENSMUST00000060389 3852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Hoxd4P10628 Hsf4-206ENSMUST00000173859 1576 ntTSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Hoxd4P10628 Prkca-201ENSMUST00000059595 8409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Hoxd4P10628 Asl-203ENSMUST00000160129 2413 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.64□□□□□ -0.55
Hoxd4P10628 Vsx2-201ENSMUST00000021665 3270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Hoxd4P10628 Hoxa13-202ENSMUST00000114416 769 ntTSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Hoxd4P10628 Gm9385-201ENSMUST00000117563 472 ntBASIC11.64□□□□□ -0.55
Hoxd4P10628 Tspan5-203ENSMUST00000121826 1114 ntTSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Hoxd4P10628 Gm11505-201ENSMUST00000130442 737 ntTSL 3 BASIC11.64□□□□□ -0.55
Hoxd4P10628 Rpl27a-203ENSMUST00000143107 1158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Hoxd4P10628 Bik-201ENSMUST00000016902 943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Hoxd4P10628 Gm27430-201ENSMUST00000184585 107 ntBASIC11.64□□□□□ -0.55
Hoxd4P10628 Gm44333-201ENSMUST00000197168 107 ntBASIC11.64□□□□□ -0.55
Hoxd4P10628 Mlnr-ps-201ENSMUST00000208959 969 ntBASIC11.64□□□□□ -0.55
Hoxd4P10628 Tomm20l-201ENSMUST00000021482 578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Hoxd4P10628 Gm10747-201ENSMUST00000217799 1014 ntTSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Hoxd4P10628 Trem2-201ENSMUST00000024791 1088 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Hoxd4P10628 Ggn-201ENSMUST00000033886 588 ntTSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Hoxd4P10628 Mcrip1-201ENSMUST00000034913 1205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Hoxd4P10628 Pcna-ps2-201ENSMUST00000088040 1257 ntAPPRIS P1 BASIC11.64□□□□□ -0.55
Hoxd4P10628 Gm3002-201ENSMUST00000170480 1955 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.64□□□□□ -0.55
Hoxd4P10628 Gm3005-202ENSMUST00000178728 1955 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.64□□□□□ -0.55
Hoxd4P10628 Bach2-202ENSMUST00000108180 8882 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.64□□□□□ -0.55
Hoxd4P10628 4930520O04Rik-202ENSMUST00000131898 2660 ntTSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Hoxd4P10628 Nup98-201ENSMUST00000070165 4052 ntTSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Hoxd4P10628 Pnpla5-201ENSMUST00000019012 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Hoxd4P10628 Saa3-202ENSMUST00000210913 2200 ntTSL 3 BASIC11.64□□□□□ -0.55
Hoxd4P10628 Tnn-202ENSMUST00000131919 3987 ntTSL 5 BASIC11.64□□□□□ -0.55
Hoxd4P10628 Tas1r1-201ENSMUST00000030792 2863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Hoxd4P10628 Syncrip-209ENSMUST00000174361 1767 ntTSL 5 BASIC11.64□□□□□ -0.55
Hoxd4P10628 Agpat3-205ENSMUST00000105390 3513 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.64□□□□□ -0.55
Hoxd4P10628 Kdm1b-201ENSMUST00000037025 4987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Hoxd4P10628 Esrp1-203ENSMUST00000108311 3864 ntTSL 5 BASIC11.63□□□□□ -0.55
Hoxd4P10628 Lysmd1-201ENSMUST00000066386 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Hoxd4P10628 AC160410.1-201ENSMUST00000219298 1972 ntBASIC11.63□□□□□ -0.55
Hoxd4P10628 Dnajc5-201ENSMUST00000072334 6578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Hoxd4P10628 Prkch-201ENSMUST00000021527 3545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Hoxd4P10628 Vangl1-201ENSMUST00000029453 6531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Hoxd4P10628 Pabpc4-204ENSMUST00000106243 3111 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC11.63□□□□□ -0.55
Hoxd4P10628 Adamtsl4-202ENSMUST00000117782 4036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Hoxd4P10628 Glod4-201ENSMUST00000017430 1434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Hoxd4P10628 Rnf181-201ENSMUST00000069580 1434 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Hoxd4P10628 Ints1-201ENSMUST00000072607 7102 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.63□□□□□ -0.55
Hoxd4P10628 Zfp862-ps-204ENSMUST00000204484 6065 ntTSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Hoxd4P10628 Dhdds-202ENSMUST00000105885 998 ntTSL 5 BASIC11.63□□□□□ -0.55
Hoxd4P10628 Cmc2-202ENSMUST00000128304 394 ntTSL 5 BASIC11.63□□□□□ -0.55
Hoxd4P10628 1700086L19Rik-202ENSMUST00000185822 1028 ntTSL 3 BASIC11.63□□□□□ -0.55
Hoxd4P10628 Prr29-205ENSMUST00000190268 1141 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.63□□□□□ -0.55
Hoxd4P10628 AA619741-201ENSMUST00000195095 646 ntBASIC11.63□□□□□ -0.55
Hoxd4P10628 Gm43474-201ENSMUST00000196415 774 ntBASIC11.63□□□□□ -0.55
Hoxd4P10628 Gm43125-201ENSMUST00000201724 730 ntBASIC11.63□□□□□ -0.55
Hoxd4P10628 Tmem86b-204ENSMUST00000206610 522 ntTSL 3 BASIC11.63□□□□□ -0.55
Hoxd4P10628 Gm34964-201ENSMUST00000207398 417 ntTSL 5 BASIC11.63□□□□□ -0.55
Hoxd4P10628 Tpi-rs5-201ENSMUST00000216947 774 ntBASIC11.63□□□□□ -0.55
Hoxd4P10628 Alkbh7-201ENSMUST00000002737 917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Hoxd4P10628 Tst-201ENSMUST00000058659 1096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Hoxd4P10628 Olfr520-201ENSMUST00000098264 951 ntAPPRIS P1 BASIC11.63□□□□□ -0.55
Hoxd4P10628 Nox3-201ENSMUST00000115800 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Hoxd4P10628 Acly-203ENSMUST00000107389 4426 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Hoxd4P10628 Cdnf-201ENSMUST00000036350 3013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Hoxd4P10628 Cux2-202ENSMUST00000111752 8784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Hoxd4P10628 Pld5-202ENSMUST00000111166 1370 ntTSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Hoxd4P10628 Zfp433-202ENSMUST00000200889 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 37.8 ms