Protein–RNA interactions for Protein: P10400

Pol, Retrovirus-related Pol polyprotein (Fragment), mousemouse

Predictions only

Length 120 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PolP10400 Gm30191-201ENSMUST00000205501 647 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.48□□□□□ -0.89
PolP10400 Gm26953-206ENSMUST00000212840 619 ntTSL 5 BASIC9.48□□□□□ -0.89
PolP10400 Vsig2-204ENSMUST00000215271 891 ntTSL 1 (best) BASIC9.48□□□□□ -0.89
PolP10400 Timm13-203ENSMUST00000218481 471 ntTSL 3 BASIC9.48□□□□□ -0.89
PolP10400 AC151828.1-201ENSMUST00000219552 661 ntTSL 1 (best) BASIC9.48□□□□□ -0.89
PolP10400 4930408O17Rik-202ENSMUST00000222624 1131 ntTSL 5 BASIC9.48□□□□□ -0.89
PolP10400 AC156016.3-201ENSMUST00000228623 344 ntBASIC9.48□□□□□ -0.89
PolP10400 Pecr-201ENSMUST00000027381 1186 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.48□□□□□ -0.89
PolP10400 Selenow-201ENSMUST00000044355 736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.48□□□□□ -0.89
PolP10400 Fbxo18-201ENSMUST00000071564 3567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.48□□□□□ -0.89
PolP10400 C130080G10Rik-203ENSMUST00000154140 1564 ntTSL 1 (best) BASIC9.48□□□□□ -0.89
PolP10400 Hsf4-206ENSMUST00000173859 1576 ntTSL 1 (best) BASIC9.48□□□□□ -0.89
PolP10400 Rsu1-202ENSMUST00000114791 1604 ntTSL 5 BASIC9.48□□□□□ -0.89
PolP10400 Nfe2-205ENSMUST00000133600 1605 ntTSL 5 BASIC9.48□□□□□ -0.89
PolP10400 Gm26883-201ENSMUST00000180945 4878 ntTSL 5 BASIC9.48□□□□□ -0.89
PolP10400 Rims3-202ENSMUST00000106283 6437 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.48□□□□□ -0.89
PolP10400 Tesmin-203ENSMUST00000142193 2279 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.48□□□□□ -0.89
PolP10400 Gm8334-201ENSMUST00000112755 1662 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.48□□□□□ -0.89
PolP10400 Adck2-204ENSMUST00000140364 3542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.48□□□□□ -0.89
PolP10400 Nxf1-201ENSMUST00000010241 2326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.48□□□□□ -0.89
PolP10400 Cep128-210ENSMUST00000141429 4807 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.48□□□□□ -0.89
PolP10400 Strc-201ENSMUST00000038389 5756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.48□□□□□ -0.89
PolP10400 Mpl-203ENSMUST00000106375 1701 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.48□□□□□ -0.89
PolP10400 Cacnb2-203ENSMUST00000114723 3945 ntTSL 1 (best) BASIC9.48□□□□□ -0.89
PolP10400 Rpn1-201ENSMUST00000032143 3633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.48□□□□□ -0.89
PolP10400 4930432E11Rik-202ENSMUST00000063585 10871 ntBASIC9.48□□□□□ -0.89
PolP10400 Dcc-202ENSMUST00000114943 5219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.48□□□□□ -0.89
PolP10400 Irak1-203ENSMUST00000101458 2052 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.47□□□□□ -0.89
PolP10400 Pafah1b2-201ENSMUST00000172450 6873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.47□□□□□ -0.89
PolP10400 Acacb-201ENSMUST00000031583 8482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.47□□□□□ -0.89
PolP10400 Ptgir-201ENSMUST00000086101 2725 ntTSL 1 (best) BASIC9.47□□□□□ -0.89
PolP10400 Lgals12-202ENSMUST00000099729 2757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.47□□□□□ -0.89
PolP10400 Sspn-201ENSMUST00000032383 4431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.47□□□□□ -0.89
PolP10400 Rapgef3-205ENSMUST00000129223 3750 ntTSL 1 (best) BASIC9.47□□□□□ -0.89
PolP10400 Osbpl9-202ENSMUST00000084366 3134 ntTSL 1 (best) BASIC9.47□□□□□ -0.89
PolP10400 Qrich2-201ENSMUST00000093909 2156 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.47□□□□□ -0.89
PolP10400 Cyb5rl-203ENSMUST00000106758 2516 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.47□□□□□ -0.89
PolP10400 Zfp296-201ENSMUST00000108453 1530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.47□□□□□ -0.89
PolP10400 Nfyb-204ENSMUST00000130911 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.47□□□□□ -0.89
PolP10400 Pcdhb1-201ENSMUST00000052366 2588 ntAPPRIS P1 BASIC9.47□□□□□ -0.89
PolP10400 Hs6st2-202ENSMUST00000114871 4351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.47□□□□□ -0.89
PolP10400 Psd2-205ENSMUST00000176873 4375 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.47□□□□□ -0.89
PolP10400 Zyg11a-201ENSMUST00000043793 2289 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC9.47□□□□□ -0.89
PolP10400 Palb2-201ENSMUST00000063587 1553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.47□□□□□ -0.89
PolP10400 Eng-202ENSMUST00000113272 3021 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.47□□□□□ -0.89
PolP10400 Abcd1-202ENSMUST00000114461 2323 ntTSL 1 (best) BASIC9.47□□□□□ -0.89
PolP10400 Pcdhb16-201ENSMUST00000051442 5225 ntAPPRIS P1 BASIC9.47□□□□□ -0.89
PolP10400 Eef1akmt3-201ENSMUST00000116231 2719 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.47□□□□□ -0.89
PolP10400 Trim29-201ENSMUST00000034511 2735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.47□□□□□ -0.89
PolP10400 Haghl-203ENSMUST00000133071 1128 ntTSL 1 (best) BASIC9.47□□□□□ -0.89
PolP10400 Gm16122-201ENSMUST00000142625 1158 ntTSL 1 (best) BASIC9.47□□□□□ -0.89
PolP10400 Cd63-ps-201ENSMUST00000145417 875 ntBASIC9.47□□□□□ -0.89
PolP10400 Gm15862-201ENSMUST00000146349 361 ntTSL 2 BASIC9.47□□□□□ -0.89
PolP10400 Gm3809-201ENSMUST00000180973 1006 ntBASIC9.47□□□□□ -0.89
PolP10400 Gm21470-201ENSMUST00000187680 696 ntBASIC9.47□□□□□ -0.89
PolP10400 AC153872.1-201ENSMUST00000199539 128 ntBASIC9.47□□□□□ -0.89
PolP10400 Ino80e-214ENSMUST00000206349 883 ntTSL 2 BASIC9.47□□□□□ -0.89
PolP10400 AC126408.1-201ENSMUST00000225184 523 ntBASIC9.47□□□□□ -0.89
PolP10400 AC149294.4-201ENSMUST00000227870 882 ntBASIC9.47□□□□□ -0.89
PolP10400 Mesp1-201ENSMUST00000032760 1275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.47□□□□□ -0.89
PolP10400 Cmtm5-201ENSMUST00000037814 1095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.47□□□□□ -0.89
PolP10400 Apobec2-201ENSMUST00000046549 1218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.47□□□□□ -0.89
PolP10400 Zswim7-201ENSMUST00000072916 732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.47□□□□□ -0.89
PolP10400 Gpnmb-203ENSMUST00000204260 2430 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.47□□□□□ -0.89
PolP10400 Zbtb42-203ENSMUST00000174780 3160 ntTSL 2 BASIC9.47□□□□□ -0.89
PolP10400 Mdm1-208ENSMUST00000219087 1318 ntTSL 2 BASIC9.47□□□□□ -0.89
PolP10400 Mtr-201ENSMUST00000099856 8294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.47□□□□□ -0.89
PolP10400 Wnt16-202ENSMUST00000128245 3285 ntTSL 1 (best) BASIC9.47□□□□□ -0.89
PolP10400 Zfp341-201ENSMUST00000081926 3299 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.47□□□□□ -0.89
PolP10400 Gm19817-201ENSMUST00000199764 2132 ntBASIC9.47□□□□□ -0.89
PolP10400 Slc38a10-216ENSMUST00000179094 4052 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.47□□□□□ -0.89
PolP10400 Sirt5-207ENSMUST00000221515 1793 ntTSL 5 BASIC9.47□□□□□ -0.89
PolP10400 Pde4d-201ENSMUST00000074103 2167 ntTSL 1 (best) BASIC9.47□□□□□ -0.89
PolP10400 F630040K05Rik-202ENSMUST00000180558 2633 ntTSL 1 (best) BASIC9.47□□□□□ -0.89
PolP10400 Grm1-202ENSMUST00000105560 4265 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.47□□□□□ -0.89
PolP10400 Foxred1-202ENSMUST00000127996 2289 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.47□□□□□ -0.89
PolP10400 Abcg8-203ENSMUST00000171915 2284 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.47□□□□□ -0.89
PolP10400 Gm37269-201ENSMUST00000193906 1891 ntBASIC9.47□□□□□ -0.89
PolP10400 Cercam-201ENSMUST00000047521 2715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.47□□□□□ -0.89
PolP10400 Dclk1-211ENSMUST00000199169 1499 ntTSL 2 BASIC9.47□□□□□ -0.89
PolP10400 Taf1a-201ENSMUST00000097043 1472 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.47□□□□□ -0.89
PolP10400 Alpi-201ENSMUST00000113270 2337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.47□□□□□ -0.89
PolP10400 Trpv1-201ENSMUST00000006106 2340 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.47□□□□□ -0.89
PolP10400 Tlk2-209ENSMUST00000145048 2776 ntTSL 1 (best) BASIC9.46□□□□□ -0.89
PolP10400 Frmd4a-202ENSMUST00000091497 6208 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.46□□□□□ -0.89
PolP10400 Scamp5-201ENSMUST00000046587 3225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.46□□□□□ -0.89
PolP10400 Klhl3-202ENSMUST00000160860 7149 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.46□□□□□ -0.89
PolP10400 Fer-202ENSMUST00000038080 2365 ntTSL 1 (best) BASIC9.46□□□□□ -0.89
PolP10400 Dtnb-201ENSMUST00000077930 2376 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.46□□□□□ -0.89
PolP10400 Mthfsd-202ENSMUST00000116415 1520 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.46□□□□□ -0.89
PolP10400 Evi5l-208ENSMUST00000176825 3728 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.46□□□□□ -0.89
PolP10400 Tcf4-204ENSMUST00000114978 2437 ntTSL 1 (best) BASIC9.46□□□□□ -0.89
PolP10400 Trip13-201ENSMUST00000022053 3399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.46□□□□□ -0.89
PolP10400 Naaladl1-201ENSMUST00000044451 2491 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC9.46□□□□□ -0.89
PolP10400 Cttnbp2nl-201ENSMUST00000077548 4946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.46□□□□□ -0.89
PolP10400 Me3-202ENSMUST00000032856 4485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.46□□□□□ -0.89
PolP10400 Cdc37-201ENSMUST00000019615 7851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.46□□□□□ -0.89
PolP10400 Pbrm1-207ENSMUST00000112095 7907 ntTSL 5 BASIC9.46□□□□□ -0.89
PolP10400 Ficd-201ENSMUST00000065698 3133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.46□□□□□ -0.89
PolP10400 Opn4-201ENSMUST00000022331 2156 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.46□□□□□ -0.89
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 43.1 ms