Protein–RNA interactions for Protein: P0DM65

Becn2, Beclin-2, mousemouse

Predictions only

Length 447 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Becn2P0DM65 Glp2r-202ENSMUST00000051765 4873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Becn2P0DM65 Elmsan1-201ENSMUST00000046266 6848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Becn2P0DM65 Nupl1-206ENSMUST00000225111 2936 ntBASIC13.63□□□□□ -0.23
Becn2P0DM65 Gm44758-201ENSMUST00000206096 2068 ntBASIC13.63□□□□□ -0.23
Becn2P0DM65 C030034I22Rik-202ENSMUST00000188481 4231 ntBASIC13.63□□□□□ -0.23
Becn2P0DM65 Dpp9-201ENSMUST00000038794 3374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Becn2P0DM65 Nox3-201ENSMUST00000115800 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Becn2P0DM65 Stx11-201ENSMUST00000042861 4173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Becn2P0DM65 Sec23b-201ENSMUST00000028916 2779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Becn2P0DM65 Pop4-201ENSMUST00000032585 2113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Becn2P0DM65 Gm14123-201ENSMUST00000156345 2658 ntTSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Becn2P0DM65 Cpped1-202ENSMUST00000096272 2663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Becn2P0DM65 Ascc1-201ENSMUST00000050516 1450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Becn2P0DM65 Dnm1-202ENSMUST00000091089 3764 ntTSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Becn2P0DM65 Tbc1d2-201ENSMUST00000084621 4315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Becn2P0DM65 Gm20687-203ENSMUST00000185121 4242 ntTSL 2 BASIC13.63□□□□□ -0.23
Becn2P0DM65 Spata33-202ENSMUST00000212161 2941 ntTSL 2 BASIC13.63□□□□□ -0.23
Becn2P0DM65 Acin1-208ENSMUST00000126166 2369 ntTSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Becn2P0DM65 Wdr18-201ENSMUST00000045247 3911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Becn2P0DM65 Ropn1l-201ENSMUST00000110408 957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Becn2P0DM65 Nudt1-203ENSMUST00000110825 599 ntTSL 2 BASIC13.63□□□□□ -0.23
Becn2P0DM65 Hpca-207ENSMUST00000139450 812 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.63□□□□□ -0.23
Becn2P0DM65 Igfbp4-204ENSMUST00000140772 742 ntTSL 2 BASIC13.63□□□□□ -0.23
Becn2P0DM65 Fam219aos-201ENSMUST00000151164 708 ntTSL 2 BASIC13.63□□□□□ -0.23
Becn2P0DM65 Gm27741-201ENSMUST00000185060 237 ntBASIC13.63□□□□□ -0.23
Becn2P0DM65 Gm19265-201ENSMUST00000201818 894 ntTSL 3 BASIC13.63□□□□□ -0.23
Becn2P0DM65 AC159114.1-201ENSMUST00000220349 266 ntBASIC13.63□□□□□ -0.23
Becn2P0DM65 1500035N22Rik-201ENSMUST00000075081 865 ntTSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Becn2P0DM65 6430531B16Rik-201ENSMUST00000097970 1161 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Becn2P0DM65 Dnm2-201ENSMUST00000072362 3502 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Becn2P0DM65 Mettl7a3-201ENSMUST00000075420 1618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Becn2P0DM65 Tmem25-201ENSMUST00000002100 2448 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Becn2P0DM65 Kpna7-203ENSMUST00000116454 1500 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Becn2P0DM65 Fbln7-202ENSMUST00000110324 3228 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.63□□□□□ -0.23
Becn2P0DM65 Grm5-202ENSMUST00000125009 8047 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.63□□□□□ -0.23
Becn2P0DM65 Wnt7b-202ENSMUST00000109424 3492 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Becn2P0DM65 Gm13883-201ENSMUST00000150450 1404 ntTSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Becn2P0DM65 Acly-203ENSMUST00000107389 4426 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Becn2P0DM65 Wdr45-223ENSMUST00000207675 1335 ntTSL 5 BASIC13.63□□□□□ -0.23
Becn2P0DM65 Prkag2-202ENSMUST00000076306 2838 ntTSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Becn2P0DM65 Gm40377-201ENSMUST00000204604 2015 ntBASIC13.63□□□□□ -0.23
Becn2P0DM65 Pcnx-201ENSMUST00000021567 12139 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC13.62□□□□□ -0.23
Becn2P0DM65 Slc7a6-201ENSMUST00000034378 3750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
Becn2P0DM65 Tfe3-203ENSMUST00000101695 2989 ntTSL 5 BASIC13.62□□□□□ -0.23
Becn2P0DM65 Mixl1-201ENSMUST00000027778 2294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
Becn2P0DM65 5830411N06Rik-202ENSMUST00000093984 2991 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
Becn2P0DM65 Cdc7-203ENSMUST00000117196 2864 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
Becn2P0DM65 Gm5779-202ENSMUST00000219564 1477 ntTSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
Becn2P0DM65 B3gntl1-201ENSMUST00000062654 1488 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
Becn2P0DM65 Bicra-201ENSMUST00000094821 5360 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.62□□□□□ -0.23
Becn2P0DM65 Coq3-201ENSMUST00000029909 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
Becn2P0DM65 Gm11732-201ENSMUST00000151381 1742 ntTSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
Becn2P0DM65 Zp1-201ENSMUST00000025641 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
Becn2P0DM65 Itga2b-201ENSMUST00000103086 3437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
Becn2P0DM65 Sgk1-204ENSMUST00000120509 3096 ntTSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
Becn2P0DM65 Arhgap25-202ENSMUST00000101197 2493 ntTSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
Becn2P0DM65 Trim29-201ENSMUST00000034511 2735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
Becn2P0DM65 Trmt1l-201ENSMUST00000065625 2749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
Becn2P0DM65 Aig1-202ENSMUST00000105534 617 ntTSL 5 BASIC13.62□□□□□ -0.23
Becn2P0DM65 Trmt1-203ENSMUST00000109767 2138 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
Becn2P0DM65 Cntf-201ENSMUST00000112933 1073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
Becn2P0DM65 Crybb3-203ENSMUST00000118226 892 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.62□□□□□ -0.23
Becn2P0DM65 Haghl-206ENSMUST00000138759 1074 ntTSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
Becn2P0DM65 Gm20481-201ENSMUST00000173680 564 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.62□□□□□ -0.23
Becn2P0DM65 Gm28277-201ENSMUST00000187450 885 ntTSL 3 BASIC13.62□□□□□ -0.23
Becn2P0DM65 Gm5312-201ENSMUST00000203728 547 ntBASIC13.62□□□□□ -0.23
Becn2P0DM65 Serpinh1-203ENSMUST00000207849 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
Becn2P0DM65 Gm26953-206ENSMUST00000212840 619 ntTSL 5 BASIC13.62□□□□□ -0.23
Becn2P0DM65 Gm17795-201ENSMUST00000214505 757 ntBASIC13.62□□□□□ -0.23
Becn2P0DM65 Terb2-201ENSMUST00000028661 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
Becn2P0DM65 Brk1-201ENSMUST00000035725 1095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
Becn2P0DM65 Crybb3-201ENSMUST00000076069 816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
Becn2P0DM65 Wnt7b-201ENSMUST00000023015 3371 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
Becn2P0DM65 Sf1-208ENSMUST00000131252 4353 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
Becn2P0DM65 Khdrbs2-205ENSMUST00000189878 3259 ntTSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
Becn2P0DM65 Spryd7-201ENSMUST00000022497 4002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
Becn2P0DM65 Inip-202ENSMUST00000107526 1438 ntTSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
Becn2P0DM65 Gm16070-203ENSMUST00000155588 1902 ntTSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
Becn2P0DM65 Madd-203ENSMUST00000075269 5756 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.62□□□□□ -0.23
Becn2P0DM65 Arnt-203ENSMUST00000102749 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
Becn2P0DM65 Acadsb-201ENSMUST00000015829 6081 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
Becn2P0DM65 Dll1-201ENSMUST00000014917 3581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
Becn2P0DM65 Gm13722-201ENSMUST00000117964 3066 ntBASIC13.62□□□□□ -0.23
Becn2P0DM65 D230017M19Rik-201ENSMUST00000180722 3096 ntTSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
Becn2P0DM65 Ankrd42-205ENSMUST00000138267 2827 ntTSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
Becn2P0DM65 Siglecg-201ENSMUST00000005592 2569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
Becn2P0DM65 Igsf5-202ENSMUST00000081093 1554 ntTSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
Becn2P0DM65 Nt5c3b-203ENSMUST00000107397 1348 ntTSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
Becn2P0DM65 Reln-207ENSMUST00000161356 11699 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.62□□□□□ -0.23
Becn2P0DM65 Chrna3-201ENSMUST00000034851 4358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
Becn2P0DM65 Pyroxd2-201ENSMUST00000076505 3119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
Becn2P0DM65 Pld5-202ENSMUST00000111166 1370 ntTSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
Becn2P0DM65 Wwox-203ENSMUST00000109108 1771 ntTSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
Becn2P0DM65 Abra-201ENSMUST00000054742 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
Becn2P0DM65 AL732309.2-201ENSMUST00000228052 3210 ntAPPRIS P1 BASIC13.61□□□□□ -0.23
Becn2P0DM65 Trappc9-204ENSMUST00000170633 4688 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
Becn2P0DM65 AI464131-201ENSMUST00000054920 4173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
Becn2P0DM65 E2f7-209ENSMUST00000174857 2865 ntTSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
Becn2P0DM65 Gm44942-201ENSMUST00000096093 2072 ntBASIC13.61□□□□□ -0.23
Becn2P0DM65 Cmss1-201ENSMUST00000114371 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
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