Protein–RNA interactions for Protein: P0CG49

Ubb, Polyubiquitin-B, mousemouse

Predictions only

Length 305 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
UbbP0CG49 Rbm14-201ENSMUST00000006625 3165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
UbbP0CG49 Slc7a11-205ENSMUST00000194462 2419 ntTSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
UbbP0CG49 Gpd1l-202ENSMUST00000129305 2543 ntTSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
UbbP0CG49 F630040K05Rik-202ENSMUST00000180558 2633 ntTSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
UbbP0CG49 Runx1-201ENSMUST00000023673 5861 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
UbbP0CG49 Gm42957-201ENSMUST00000137564 3624 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.35□□□□□ -0.59
UbbP0CG49 Gm11594-201ENSMUST00000122313 162 ntBASIC11.35□□□□□ -0.59
UbbP0CG49 Haghl-211ENSMUST00000150324 1267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
UbbP0CG49 Fam219aos-201ENSMUST00000151164 708 ntTSL 2 BASIC11.35□□□□□ -0.59
UbbP0CG49 Mir99ahg-211ENSMUST00000183099 1189 ntTSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
UbbP0CG49 Gm7390-201ENSMUST00000212452 1216 ntBASIC11.35□□□□□ -0.59
UbbP0CG49 Gm6888-201ENSMUST00000221983 706 ntBASIC11.35□□□□□ -0.59
UbbP0CG49 AC138604.1-201ENSMUST00000226969 739 ntBASIC11.35□□□□□ -0.59
UbbP0CG49 Rbfox2-208ENSMUST00000227930 1218 ntBASIC11.35□□□□□ -0.59
UbbP0CG49 Orc6-201ENSMUST00000034132 1287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
UbbP0CG49 Pdlim7-203ENSMUST00000069968 1006 ntTSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
UbbP0CG49 Knop1-203ENSMUST00000106549 1467 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
UbbP0CG49 Gm5779-202ENSMUST00000219564 1477 ntTSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
UbbP0CG49 Ccr7-201ENSMUST00000103134 1978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
UbbP0CG49 Kif1a-202ENSMUST00000112958 5931 ntTSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
UbbP0CG49 Abcg8-203ENSMUST00000171915 2284 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
UbbP0CG49 Abcb6-201ENSMUST00000027396 2966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
UbbP0CG49 Ddx17-201ENSMUST00000054014 4761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
UbbP0CG49 Calcoco1-201ENSMUST00000023818 2822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
UbbP0CG49 Kcna10-201ENSMUST00000055064 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
UbbP0CG49 Gm33543-203ENSMUST00000211096 1722 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC11.35□□□□□ -0.59
UbbP0CG49 Elovl1-207ENSMUST00000167636 1340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
UbbP0CG49 Fgf17-202ENSMUST00000227123 1336 ntBASIC11.35□□□□□ -0.59
UbbP0CG49 Rab39-201ENSMUST00000068449 2971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
UbbP0CG49 Rpl9-204ENSMUST00000127874 2690 ntTSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
UbbP0CG49 Bcl2l1-202ENSMUST00000109820 2568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
UbbP0CG49 Epb41l2-207ENSMUST00000218903 4115 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
UbbP0CG49 Rrnad1-201ENSMUST00000005016 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
UbbP0CG49 Armc6-201ENSMUST00000019679 2263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
UbbP0CG49 Met-202ENSMUST00000115442 4663 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.34□□□□□ -0.59
UbbP0CG49 Fam214b-203ENSMUST00000107957 3234 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.34□□□□□ -0.59
UbbP0CG49 Trp53i11-202ENSMUST00000111266 2703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
UbbP0CG49 4931409K22Rik-201ENSMUST00000088302 2613 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.34□□□□□ -0.59
UbbP0CG49 Trpv1-201ENSMUST00000006106 2340 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.34□□□□□ -0.59
UbbP0CG49 Gm13453-201ENSMUST00000118708 357 ntBASIC11.34□□□□□ -0.59
UbbP0CG49 Spcs2-ps-201ENSMUST00000122326 682 ntBASIC11.34□□□□□ -0.59
UbbP0CG49 Tex30-206ENSMUST00000133677 935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
UbbP0CG49 Calhm3-201ENSMUST00000178630 1044 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.34□□□□□ -0.59
UbbP0CG49 1700086L19Rik-202ENSMUST00000185822 1028 ntTSL 3 BASIC11.34□□□□□ -0.59
UbbP0CG49 AC093022.5-201ENSMUST00000226841 1079 ntBASIC11.34□□□□□ -0.59
UbbP0CG49 Haus1-201ENSMUST00000048192 1004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
UbbP0CG49 Gm11149-201ENSMUST00000068730 1250 ntTSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
UbbP0CG49 Zmat5-201ENSMUST00000009220 792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
UbbP0CG49 Sh3bp2-201ENSMUST00000067638 2885 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
UbbP0CG49 BC027072-201ENSMUST00000057405 5004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
UbbP0CG49 Wnt9a-201ENSMUST00000000128 3320 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.34□□□□□ -0.59
UbbP0CG49 Lrrc20-201ENSMUST00000049242 3216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
UbbP0CG49 Eps8l3-201ENSMUST00000037375 2271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
UbbP0CG49 Jade2-203ENSMUST00000109091 6099 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
UbbP0CG49 Fen1-203ENSMUST00000142241 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
UbbP0CG49 Gm16278-201ENSMUST00000148064 2071 ntTSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
UbbP0CG49 Hsd17b14-201ENSMUST00000107752 1400 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.34□□□□□ -0.59
UbbP0CG49 Ebna1bp2-201ENSMUST00000030501 2960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
UbbP0CG49 Syt6-203ENSMUST00000118117 1856 ntTSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
UbbP0CG49 Smc5-202ENSMUST00000223934 3448 ntAPPRIS P2 BASIC11.34□□□□□ -0.59
UbbP0CG49 Rbms1-201ENSMUST00000028347 4436 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
UbbP0CG49 Eogt-201ENSMUST00000054344 4424 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
UbbP0CG49 Zfp219-202ENSMUST00000166169 3017 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
UbbP0CG49 Pkm-202ENSMUST00000163694 2041 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC11.33□□□□□ -0.6
UbbP0CG49 Hadhb-201ENSMUST00000026841 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
UbbP0CG49 Pik3r1-202ENSMUST00000055518 7113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
UbbP0CG49 Tekt2-201ENSMUST00000030658 1492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
UbbP0CG49 Ddx46-201ENSMUST00000099479 5664 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.33□□□□□ -0.6
UbbP0CG49 Ugt1a6a-201ENSMUST00000014263 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
UbbP0CG49 F830212C03Rik-201ENSMUST00000191701 2285 ntBASIC11.33□□□□□ -0.6
UbbP0CG49 Foxl2os-201ENSMUST00000181706 3095 ntTSL 2 BASIC11.33□□□□□ -0.6
UbbP0CG49 Rab3a-202ENSMUST00000110090 1375 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.33□□□□□ -0.6
UbbP0CG49 Csrnp2-201ENSMUST00000061457 4126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
UbbP0CG49 Rdm1-201ENSMUST00000010506 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
UbbP0CG49 Nudt1-203ENSMUST00000110825 599 ntTSL 2 BASIC11.33□□□□□ -0.6
UbbP0CG49 Pax8-208ENSMUST00000153601 1226 ntTSL 5 BASIC11.33□□□□□ -0.6
UbbP0CG49 Pkig-209ENSMUST00000164399 983 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.33□□□□□ -0.6
UbbP0CG49 Dpf3-205ENSMUST00000177801 1092 ntTSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
UbbP0CG49 Gm27618-201ENSMUST00000183671 60 ntBASIC11.33□□□□□ -0.6
UbbP0CG49 Gm28277-201ENSMUST00000187450 885 ntTSL 3 BASIC11.33□□□□□ -0.6
UbbP0CG49 Mpv17-209ENSMUST00000202241 903 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC11.33□□□□□ -0.6
UbbP0CG49 Gm8239-201ENSMUST00000204094 444 ntTSL 2 BASIC11.33□□□□□ -0.6
UbbP0CG49 Dkkl1-204ENSMUST00000210741 662 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.33□□□□□ -0.6
UbbP0CG49 Epo-201ENSMUST00000031723 715 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
UbbP0CG49 Calml4-201ENSMUST00000034777 864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
UbbP0CG49 Rtl8c-201ENSMUST00000063384 401 ntAPPRIS P1 BASIC11.33□□□□□ -0.6
UbbP0CG49 S100a8-201ENSMUST00000069927 486 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
UbbP0CG49 Eif5a-203ENSMUST00000071026 1286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
UbbP0CG49 Dmrtc1c1-201ENSMUST00000118218 1611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
UbbP0CG49 Dmrtc1c2-203ENSMUST00000120314 1611 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
UbbP0CG49 Ctsl-201ENSMUST00000021933 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
UbbP0CG49 Ap1g2-201ENSMUST00000036041 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
UbbP0CG49 Ptprk-202ENSMUST00000218276 4754 ntTSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
UbbP0CG49 Shank2-202ENSMUST00000105900 8169 ntTSL 5 BASIC11.33□□□□□ -0.6
UbbP0CG49 Tor1aip2-207ENSMUST00000128941 2925 ntTSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
UbbP0CG49 Klhl38-201ENSMUST00000022985 2212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
UbbP0CG49 Ate1-204ENSMUST00000178534 1530 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
UbbP0CG49 Ccdc106-201ENSMUST00000045543 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
UbbP0CG49 Myo15b-208ENSMUST00000222123 5154 ntTSL 5 BASIC11.33□□□□□ -0.6
UbbP0CG49 Chrna3-201ENSMUST00000034851 4358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 51.5 ms