Protein–RNA interactions for Protein: P01849

Tcra, T-cell receptor alpha chain C region, mousemouse

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Length 138 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TcraP01849 Dhrs4-201ENSMUST00000022821 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.5□□□□□ -0.89
TcraP01849 Tmed1-201ENSMUST00000034698 1378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.5□□□□□ -0.89
TcraP01849 Prkar1b-202ENSMUST00000110889 2457 ntTSL 5 BASIC9.5□□□□□ -0.89
TcraP01849 Gba-202ENSMUST00000167998 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.5□□□□□ -0.89
TcraP01849 Hck-204ENSMUST00000191431 1575 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.5□□□□□ -0.89
TcraP01849 Slc25a42-201ENSMUST00000063788 3081 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.5□□□□□ -0.89
TcraP01849 AC160411.1-201ENSMUST00000218544 4560 ntTSL 1 (best) BASIC9.5□□□□□ -0.89
TcraP01849 Eps15l1-201ENSMUST00000163643 3129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.5□□□□□ -0.89
TcraP01849 Sstr5-202ENSMUST00000165183 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.5□□□□□ -0.89
TcraP01849 Rbm10-202ENSMUST00000082089 2562 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.5□□□□□ -0.89
TcraP01849 Otof-202ENSMUST00000114747 6881 ntTSL 1 (best) BASIC9.5□□□□□ -0.89
TcraP01849 Zfp335-201ENSMUST00000041361 4587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.5□□□□□ -0.89
TcraP01849 Gm11535-201ENSMUST00000145517 778 ntTSL 3 BASIC9.5□□□□□ -0.89
TcraP01849 Gm15492-201ENSMUST00000156734 606 ntTSL 1 (best) BASIC9.5□□□□□ -0.89
TcraP01849 9130230N09Rik-201ENSMUST00000174568 663 ntTSL 3 BASIC9.5□□□□□ -0.89
TcraP01849 Prss54-202ENSMUST00000180075 1152 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC9.5□□□□□ -0.89
TcraP01849 4930573H18Rik-201ENSMUST00000197696 906 ntTSL 1 (best) BASIC9.5□□□□□ -0.89
TcraP01849 Slc12a5-208ENSMUST00000202479 1202 ntTSL 5 BASIC9.5□□□□□ -0.89
TcraP01849 Gm45231-201ENSMUST00000208629 1064 ntTSL 1 (best) BASIC9.5□□□□□ -0.89
TcraP01849 Gm5628-201ENSMUST00000222318 1049 ntBASIC9.5□□□□□ -0.89
TcraP01849 Gm33785-201ENSMUST00000222961 886 ntTSL 5 BASIC9.5□□□□□ -0.89
TcraP01849 Lce3e-201ENSMUST00000098886 607 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC9.5□□□□□ -0.89
TcraP01849 Zmynd8-203ENSMUST00000099084 5232 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.5□□□□□ -0.89
TcraP01849 Pde9a-203ENSMUST00000127929 1891 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.5□□□□□ -0.89
TcraP01849 Ralgps2-211ENSMUST00000190648 2498 ntTSL 1 (best) BASIC9.5□□□□□ -0.89
TcraP01849 Cyp26b1-204ENSMUST00000204146 4495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.5□□□□□ -0.89
TcraP01849 Fhdc1-202ENSMUST00000107689 5918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.5□□□□□ -0.89
TcraP01849 Apopt1-203ENSMUST00000162316 3107 ntTSL 1 (best) BASIC9.5□□□□□ -0.89
TcraP01849 Gm32479-201ENSMUST00000204226 2739 ntTSL 2 BASIC9.5□□□□□ -0.89
TcraP01849 Tcea1-201ENSMUST00000081551 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.5□□□□□ -0.89
TcraP01849 Zmynd15-202ENSMUST00000092958 2100 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.5□□□□□ -0.89
TcraP01849 Gm3252-201ENSMUST00000165619 1949 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.5□□□□□ -0.89
TcraP01849 Plin4-202ENSMUST00000190703 5756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.5□□□□□ -0.89
TcraP01849 Foxs1-201ENSMUST00000099200 1311 ntAPPRIS P1 BASIC9.5□□□□□ -0.89
TcraP01849 Pcdhgc4-201ENSMUST00000066140 5024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.5□□□□□ -0.89
TcraP01849 Arvcf-204ENSMUST00000115613 4800 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC9.5□□□□□ -0.89
TcraP01849 Gm10097-201ENSMUST00000180100 2784 ntAPPRIS P1 BASIC9.5□□□□□ -0.89
TcraP01849 Zfp597-201ENSMUST00000090522 5668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.5□□□□□ -0.89
TcraP01849 Herpud1-205ENSMUST00000161576 1952 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.5□□□□□ -0.89
TcraP01849 1700025G04Rik-201ENSMUST00000044581 9559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.5□□□□□ -0.89
TcraP01849 Gtf2ird1-208ENSMUST00000167084 3283 ntTSL 5 BASIC9.5□□□□□ -0.89
TcraP01849 Gm26519-201ENSMUST00000181193 2249 ntTSL 1 (best) BASIC9.5□□□□□ -0.89
TcraP01849 Pitpnc1-202ENSMUST00000103064 6329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.49□□□□□ -0.89
TcraP01849 E430018J23Rik-203ENSMUST00000165495 3324 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC9.49□□□□□ -0.89
TcraP01849 Gm15684-201ENSMUST00000160605 1814 ntTSL 1 (best) BASIC9.49□□□□□ -0.89
TcraP01849 Olfr707-203ENSMUST00000210644 1817 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC9.49□□□□□ -0.89
TcraP01849 Zfp541-202ENSMUST00000209369 4879 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC9.49□□□□□ -0.89
TcraP01849 Dnaja2-201ENSMUST00000034138 2919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.49□□□□□ -0.89
TcraP01849 Zscan22-203ENSMUST00000119989 2087 ntTSL 1 (best) BASIC9.49□□□□□ -0.89
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TcraP01849 Taf6-201ENSMUST00000048698 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.49□□□□□ -0.89
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TcraP01849 5830417I10Rik-201ENSMUST00000135913 6190 ntBASIC9.49□□□□□ -0.89
TcraP01849 Ppp1r18-203ENSMUST00000127442 3524 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.49□□□□□ -0.89
TcraP01849 Rspo3-201ENSMUST00000092623 3085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.49□□□□□ -0.89
TcraP01849 Qrich2-201ENSMUST00000093909 2156 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.49□□□□□ -0.89
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TcraP01849 Acer1-201ENSMUST00000056113 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.49□□□□□ -0.89
TcraP01849 Mettl23-201ENSMUST00000106370 1276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.49□□□□□ -0.89
TcraP01849 Abhd11-202ENSMUST00000111216 972 ntTSL 3 BASIC9.49□□□□□ -0.89
TcraP01849 Gm15678-201ENSMUST00000117573 960 ntBASIC9.49□□□□□ -0.89
TcraP01849 Uqcc2-203ENSMUST00000119227 452 ntTSL 3 BASIC9.49□□□□□ -0.89
TcraP01849 Gm11508-201ENSMUST00000129337 440 ntTSL 2 BASIC9.49□□□□□ -0.89
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TcraP01849 Crem-221ENSMUST00000142690 1256 ntTSL 1 (best) BASIC9.49□□□□□ -0.89
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TcraP01849 Guca2b-201ENSMUST00000044426 605 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.49□□□□□ -0.89
TcraP01849 Sun2-201ENSMUST00000046259 3804 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.49□□□□□ -0.89
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TcraP01849 Tmem139-201ENSMUST00000095987 1147 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC9.49□□□□□ -0.89
TcraP01849 Map1b-203ENSMUST00000223725 2669 ntBASIC9.49□□□□□ -0.89
TcraP01849 Lingo4-201ENSMUST00000050975 3645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.49□□□□□ -0.89
TcraP01849 Slc27a2-201ENSMUST00000061491 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.49□□□□□ -0.89
TcraP01849 Bcat2-202ENSMUST00000120864 1536 ntTSL 5 BASIC9.49□□□□□ -0.89
TcraP01849 Akap10-202ENSMUST00000102650 3874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.49□□□□□ -0.89
TcraP01849 Calm1-202ENSMUST00000110082 4115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.49□□□□□ -0.89
TcraP01849 Dgkg-201ENSMUST00000023578 2725 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.49□□□□□ -0.89
TcraP01849 Tacc2-201ENSMUST00000033141 3940 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.49□□□□□ -0.89
TcraP01849 Gm17276-201ENSMUST00000180839 2782 ntTSL 1 (best) BASIC9.49□□□□□ -0.89
TcraP01849 Cdc14a-201ENSMUST00000090464 4485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.49□□□□□ -0.89
TcraP01849 Mtnr1a-201ENSMUST00000067984 1576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.49□□□□□ -0.89
TcraP01849 Ccng1-201ENSMUST00000020576 3512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.49□□□□□ -0.89
TcraP01849 Gm16741-201ENSMUST00000145085 1818 ntTSL 1 (best) BASIC9.49□□□□□ -0.89
TcraP01849 Aaas-201ENSMUST00000041208 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.49□□□□□ -0.89
TcraP01849 Pltp-201ENSMUST00000059954 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.49□□□□□ -0.89
TcraP01849 Pex26-202ENSMUST00000118234 3778 ntTSL 1 (best) BASIC9.49□□□□□ -0.89
TcraP01849 Plxdc2-203ENSMUST00000114703 2061 ntTSL 5 BASIC9.49□□□□□ -0.89
TcraP01849 P4ha2-215ENSMUST00000174616 2094 ntTSL 5 BASIC9.49□□□□□ -0.89
TcraP01849 Nfe2-205ENSMUST00000133600 1605 ntTSL 5 BASIC9.49□□□□□ -0.89
TcraP01849 AC159196.2-201ENSMUST00000224082 1622 ntBASIC9.49□□□□□ -0.89
TcraP01849 Mmp21-201ENSMUST00000033278 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.49□□□□□ -0.89
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