Protein–RNA interactions for Protein: O89079

Cope, Coatomer subunit epsilon, mousemouse

Predictions only

Length 308 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CopeO89079 Tac2-201ENSMUST00000026466 678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
CopeO89079 Isg20-201ENSMUST00000038142 1083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
CopeO89079 Ecscr-201ENSMUST00000097618 1114 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
CopeO89079 Otud7b-201ENSMUST00000035519 8043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
CopeO89079 Sec23b-201ENSMUST00000028916 2779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
CopeO89079 Epm2aip1-201ENSMUST00000060711 7149 ntAPPRIS P1 BASIC13.44□□□□□ -0.26
CopeO89079 Brd3-202ENSMUST00000077737 5272 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
CopeO89079 Tars2-201ENSMUST00000029752 2400 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
CopeO89079 Fgd5-201ENSMUST00000089334 6095 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
CopeO89079 Gnat2-201ENSMUST00000058669 2054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
CopeO89079 Adam19-201ENSMUST00000011400 6383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
CopeO89079 Pdlim5-201ENSMUST00000029941 5016 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
CopeO89079 Cidec-201ENSMUST00000032416 1703 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
CopeO89079 Polr3e-202ENSMUST00000106483 3001 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.44□□□□□ -0.26
CopeO89079 Eif4enif1-213ENSMUST00000179770 3676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
CopeO89079 Csnk1e-202ENSMUST00000120859 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
CopeO89079 Clpx-202ENSMUST00000113824 2809 ntTSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
CopeO89079 Stard5-202ENSMUST00000117410 2832 ntTSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
CopeO89079 Olfr533-206ENSMUST00000217179 2825 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.44□□□□□ -0.26
CopeO89079 Stx17-201ENSMUST00000064765 1531 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.44□□□□□ -0.26
CopeO89079 7420426K07Rik-201ENSMUST00000098460 1504 ntAPPRIS P1 BASIC13.44□□□□□ -0.26
CopeO89079 Unc45a-201ENSMUST00000032748 3260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
CopeO89079 2410131K14Rik-201ENSMUST00000049138 5649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
CopeO89079 Fgfr3-211ENSMUST00000171509 4020 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.43□□□□□ -0.26
CopeO89079 Nfkb2-202ENSMUST00000111881 3205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
CopeO89079 Nub1-202ENSMUST00000197407 3546 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
CopeO89079 Srms-201ENSMUST00000016498 2562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
CopeO89079 Nt5c3b-203ENSMUST00000107397 1348 ntTSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
CopeO89079 Prkcd-204ENSMUST00000112206 2215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
CopeO89079 Thtpa-201ENSMUST00000050575 2830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
CopeO89079 Ptprk-202ENSMUST00000218276 4754 ntTSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
CopeO89079 Pik3r6-202ENSMUST00000102613 3225 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
CopeO89079 Acoxl-202ENSMUST00000110344 1573 ntTSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
CopeO89079 Pebp1-202ENSMUST00000111973 779 ntTSL 3 BASIC13.43□□□□□ -0.26
CopeO89079 Parp3-202ENSMUST00000112479 2030 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
CopeO89079 Nyap1-202ENSMUST00000118326 4565 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
CopeO89079 Rpl9-203ENSMUST00000120094 680 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.43□□□□□ -0.26
CopeO89079 Apoc3-203ENSMUST00000121916 709 ntTSL 2 BASIC13.43□□□□□ -0.26
CopeO89079 Gm12352-201ENSMUST00000154452 760 ntTSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
CopeO89079 Gm26464-201ENSMUST00000157094 305 ntBASIC13.43□□□□□ -0.26
CopeO89079 Nat8f1-201ENSMUST00000161198 1021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
CopeO89079 Gm9522-201ENSMUST00000182394 926 ntBASIC13.43□□□□□ -0.26
CopeO89079 Gm45266-201ENSMUST00000210111 2173 ntBASIC13.43□□□□□ -0.26
CopeO89079 AC132104.2-201ENSMUST00000215011 266 ntBASIC13.43□□□□□ -0.26
CopeO89079 Cutal-201ENSMUST00000028228 2179 ntTSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
CopeO89079 Tpd52-201ENSMUST00000063496 697 ntTSL 2 BASIC13.43□□□□□ -0.26
CopeO89079 Zfp82-201ENSMUST00000080834 2181 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.43□□□□□ -0.26
CopeO89079 Bbof1-201ENSMUST00000081828 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
CopeO89079 Vsx1-201ENSMUST00000046095 3791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
CopeO89079 Slc6a20a-201ENSMUST00000040960 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
CopeO89079 Tbx6-202ENSMUST00000172352 1529 ntTSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
CopeO89079 Pla2g6-201ENSMUST00000047816 2963 ntTSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
CopeO89079 Sh3bp5l-201ENSMUST00000073128 2977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
CopeO89079 Kctd18-202ENSMUST00000114410 2512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
CopeO89079 Ncald-211ENSMUST00000168992 3538 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.43□□□□□ -0.26
CopeO89079 Wnt7b-201ENSMUST00000023015 3371 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
CopeO89079 Nek3-202ENSMUST00000110730 2050 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.43□□□□□ -0.26
CopeO89079 Pex5-204ENSMUST00000112531 3075 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
CopeO89079 Gorasp1-201ENSMUST00000035099 3906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
CopeO89079 Psmc3-202ENSMUST00000067663 1636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
CopeO89079 Madd-209ENSMUST00000111371 5816 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.42□□□□□ -0.26
CopeO89079 Madd-210ENSMUST00000111372 5813 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.42□□□□□ -0.26
CopeO89079 Apol7c-201ENSMUST00000062562 2044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
CopeO89079 Siglecg-201ENSMUST00000005592 2569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
CopeO89079 Nde1-203ENSMUST00000117958 1551 ntTSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
CopeO89079 Ldha-202ENSMUST00000048209 1588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
CopeO89079 Tmem104-202ENSMUST00000100235 4561 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
CopeO89079 Tmem104-201ENSMUST00000061450 4564 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
CopeO89079 Tdrd12-205ENSMUST00000205407 1412 ntTSL 5 BASIC13.42□□□□□ -0.26
CopeO89079 Cebpd-201ENSMUST00000096232 3746 ntAPPRIS P1 BASIC13.42□□□□□ -0.26
CopeO89079 Pla2g2e-202ENSMUST00000105803 381 ntTSL 5 BASIC13.42□□□□□ -0.26
CopeO89079 Cryba4-202ENSMUST00000112383 754 ntTSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
CopeO89079 Gm11524-201ENSMUST00000119349 807 ntBASIC13.42□□□□□ -0.26
CopeO89079 Gm11400-201ENSMUST00000120853 1214 ntBASIC13.42□□□□□ -0.26
CopeO89079 Snap47-202ENSMUST00000120940 1192 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
CopeO89079 Gm11752-201ENSMUST00000143291 510 ntTSL 2 BASIC13.42□□□□□ -0.26
CopeO89079 Rpl18a-ps1-201ENSMUST00000161190 523 ntBASIC13.42□□□□□ -0.26
CopeO89079 Ube2m-208ENSMUST00000165394 1228 ntTSL 5 BASIC13.42□□□□□ -0.26
CopeO89079 Gm19078-201ENSMUST00000206311 727 ntBASIC13.42□□□□□ -0.26
CopeO89079 1700028J19Rik-203ENSMUST00000206686 1166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
CopeO89079 Nek4-204ENSMUST00000226833 1252 ntAPPRIS ALT2 BASIC13.42□□□□□ -0.26
CopeO89079 Mrps21-202ENSMUST00000072587 405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
CopeO89079 Syce1l-202ENSMUST00000095173 791 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
CopeO89079 Arrdc5-201ENSMUST00000097303 1054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
CopeO89079 Uchl1os-201ENSMUST00000152002 1685 ntTSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
CopeO89079 Gm16793-201ENSMUST00000181322 1680 ntTSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
CopeO89079 Ttbk2-203ENSMUST00000085840 11152 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.42□□□□□ -0.26
CopeO89079 Kdm5b-201ENSMUST00000047714 8714 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
CopeO89079 Aldh6a1-201ENSMUST00000085192 3399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
CopeO89079 Ocrl-203ENSMUST00000115020 3210 ntTSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
CopeO89079 Rhbdd3-203ENSMUST00000109878 1611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
CopeO89079 Etv3-205ENSMUST00000170036 5127 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
CopeO89079 Ccdc30-202ENSMUST00000063642 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
CopeO89079 Gm45743-201ENSMUST00000212701 2795 ntBASIC13.42□□□□□ -0.26
CopeO89079 Ttbk1-203ENSMUST00000225808 8926 ntAPPRIS ALT2 BASIC13.42□□□□□ -0.26
CopeO89079 Prex1-203ENSMUST00000109246 2386 ntTSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
CopeO89079 Cnn1-201ENSMUST00000001384 2381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
CopeO89079 Gsn-205ENSMUST00000201185 2607 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
CopeO89079 Rpn1-201ENSMUST00000032143 3633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
CopeO89079 Sgk3-201ENSMUST00000097826 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 30.4 ms