Protein–RNA interactions for Protein: O88545

Cops6, COP9 signalosome complex subunit 6, mousemouse

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Length 324 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cops6O88545 Hdac7-202ENSMUST00000088402 4223 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Cops6O88545 Park7-202ENSMUST00000105673 919 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
Cops6O88545 Rps10-203ENSMUST00000114882 614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Cops6O88545 Gm12012-201ENSMUST00000118857 1066 ntBASIC15.84■□□□□ 0.13
Cops6O88545 Gm8908-201ENSMUST00000121633 1024 ntBASIC15.84■□□□□ 0.13
Cops6O88545 Tex22-201ENSMUST00000012355 1267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Cops6O88545 Gm11290-201ENSMUST00000124833 396 ntTSL 3 BASIC15.84■□□□□ 0.13
Cops6O88545 Swi5-207ENSMUST00000183946 768 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Cops6O88545 Gm33115-201ENSMUST00000220913 743 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Cops6O88545 Psma1-201ENSMUST00000033008 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Cops6O88545 Zbtb5-202ENSMUST00000107817 3867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Cops6O88545 Gtf2f1-201ENSMUST00000002733 1717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Cops6O88545 Nos1ap-202ENSMUST00000160456 3022 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
Cops6O88545 Tsta3-201ENSMUST00000023231 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Cops6O88545 Usp20-202ENSMUST00000102849 5088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Cops6O88545 Cacna1b-205ENSMUST00000114447 6987 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
Cops6O88545 Rinl-201ENSMUST00000059857 2871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Cops6O88545 Acadl-201ENSMUST00000027153 1916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Cops6O88545 4933424N20Rik-201ENSMUST00000200749 1463 ntBASIC15.84■□□□□ 0.13
Cops6O88545 Gm10782-202ENSMUST00000223775 1480 ntBASIC15.84■□□□□ 0.13
Cops6O88545 Dnajb4-201ENSMUST00000029669 1497 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
Cops6O88545 Gpr88-201ENSMUST00000090473 3469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Cops6O88545 Samd4-211ENSMUST00000228404 3039 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.84■□□□□ 0.13
Cops6O88545 Dusp26-203ENSMUST00000161713 1524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Cops6O88545 Tekt4-201ENSMUST00000025002 1532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Cops6O88545 Jmjd8-201ENSMUST00000026832 2091 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
Cops6O88545 Pyroxd2-201ENSMUST00000076505 3119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
Cops6O88545 Tmem218-201ENSMUST00000034632 2619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
Cops6O88545 Inhba-201ENSMUST00000042603 6390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
Cops6O88545 Rad23b-201ENSMUST00000030134 3810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
Cops6O88545 Acad12-202ENSMUST00000111776 2269 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
Cops6O88545 Smc5-202ENSMUST00000223934 3448 ntAPPRIS P2 BASIC15.83■□□□□ 0.13
Cops6O88545 Gm36266-201ENSMUST00000196660 1749 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
Cops6O88545 Ccdc85a-201ENSMUST00000042534 5332 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Cops6O88545 Pex12-202ENSMUST00000108146 2389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Cops6O88545 Gata2-201ENSMUST00000015197 3571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Cops6O88545 Trank1-201ENSMUST00000078626 10520 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.12
Cops6O88545 Gucy2e-202ENSMUST00000108664 4415 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.12
Cops6O88545 Gm2606-201ENSMUST00000100754 1002 ntBASIC15.83■□□□□ 0.12
Cops6O88545 Gm12058-201ENSMUST00000118614 437 ntBASIC15.83■□□□□ 0.12
Cops6O88545 Acyp1-204ENSMUST00000121930 634 ntTSL 2 BASIC15.83■□□□□ 0.12
Cops6O88545 Tnfrsf18-203ENSMUST00000122001 1078 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Cops6O88545 D630024D03Rik-201ENSMUST00000126265 720 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Cops6O88545 Gm13442-201ENSMUST00000135749 663 ntTSL 3 BASIC15.83■□□□□ 0.12
Cops6O88545 Gm11961-202ENSMUST00000141157 760 ntTSL 3 BASIC15.83■□□□□ 0.12
Cops6O88545 U2af1l4-206ENSMUST00000163654 781 ntTSL 2 BASIC15.83■□□□□ 0.12
Cops6O88545 U2af1l4-221ENSMUST00000167361 860 ntTSL 2 BASIC15.83■□□□□ 0.12
Cops6O88545 C1qtnf2-203ENSMUST00000173002 1147 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.12
Cops6O88545 1700011D18Rik-201ENSMUST00000205762 277 ntBASIC15.83■□□□□ 0.12
Cops6O88545 Gm44967-201ENSMUST00000207047 631 ntBASIC15.83■□□□□ 0.12
Cops6O88545 Gm44992-206ENSMUST00000209313 1261 ntTSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.12
Cops6O88545 Gm7293-201ENSMUST00000216682 1007 ntBASIC15.83■□□□□ 0.12
Cops6O88545 Mtus2-202ENSMUST00000085554 1009 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Cops6O88545 Aurkc-201ENSMUST00000086248 1154 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Cops6O88545 Tmem19-206ENSMUST00000218731 1346 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Cops6O88545 8430408G22Rik-201ENSMUST00000067354 1339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Cops6O88545 Sema6c-202ENSMUST00000090823 4029 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Cops6O88545 Wapl-205ENSMUST00000169910 4066 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Cops6O88545 Fchsd1-201ENSMUST00000043437 4270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Cops6O88545 Pkp3-202ENSMUST00000106039 2919 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Cops6O88545 Ate1-201ENSMUST00000033139 4735 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Cops6O88545 Zfp664-201ENSMUST00000111417 4092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Cops6O88545 Usp1-202ENSMUST00000091358 3527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Cops6O88545 4930444K16Rik-201ENSMUST00000220438 1767 ntBASIC15.82■□□□□ 0.12
Cops6O88545 Rpusd2-201ENSMUST00000028796 2706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Cops6O88545 Sirt2-201ENSMUST00000072965 1843 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Cops6O88545 Rtn4-205ENSMUST00000102843 4618 ntTSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Cops6O88545 Grk6-203ENSMUST00000224118 1997 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.82■□□□□ 0.12
Cops6O88545 Prkcd-202ENSMUST00000112202 2005 ntTSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Cops6O88545 Hadhb-202ENSMUST00000114783 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Cops6O88545 Lysmd3-201ENSMUST00000049055 2338 ntTSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Cops6O88545 Dnajc27-201ENSMUST00000020986 4698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Cops6O88545 Gm14921-201ENSMUST00000118643 908 ntBASIC15.82■□□□□ 0.12
Cops6O88545 C230066G23Rik-201ENSMUST00000150195 650 ntTSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Cops6O88545 Gm14809-201ENSMUST00000152025 695 ntTSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Cops6O88545 Rn7s1-201ENSMUST00000174924 300 ntBASIC15.82■□□□□ 0.12
Cops6O88545 Rn7s2-201ENSMUST00000175032 300 ntBASIC15.82■□□□□ 0.12
Cops6O88545 Gm26461-201ENSMUST00000175064 290 ntBASIC15.82■□□□□ 0.12
Cops6O88545 Gm26602-201ENSMUST00000181321 285 ntAPPRIS P1 BASIC15.82■□□□□ 0.12
Cops6O88545 Gsdmcl-ps-204ENSMUST00000191285 637 ntTSL 3 BASIC15.82■□□□□ 0.12
Cops6O88545 Dmrt1i-203ENSMUST00000197311 718 ntTSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Cops6O88545 Gm44405-201ENSMUST00000198952 126 ntBASIC15.82■□□□□ 0.12
Cops6O88545 Gm13097-201ENSMUST00000210722 397 ntBASIC15.82■□□□□ 0.12
Cops6O88545 Caly-204ENSMUST00000211283 975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Cops6O88545 AC155813.1-201ENSMUST00000213224 590 ntTSL 3 BASIC15.82■□□□□ 0.12
Cops6O88545 Tnfrsf17-201ENSMUST00000023140 815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Cops6O88545 Tmem50a-201ENSMUST00000030626 1204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Cops6O88545 Gm38391-201ENSMUST00000191720 4069 ntBASIC15.82■□□□□ 0.12
Cops6O88545 Gm30725-201ENSMUST00000195170 1419 ntTSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Cops6O88545 Asic3-202ENSMUST00000196296 1593 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.82■□□□□ 0.12
Cops6O88545 Nmbr-201ENSMUST00000020015 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Cops6O88545 Tmem17-201ENSMUST00000059319 1568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Cops6O88545 Zfp57-211ENSMUST00000174524 1747 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Cops6O88545 Gm45242-201ENSMUST00000210666 2129 ntBASIC15.82■□□□□ 0.12
Cops6O88545 Gm30238-201ENSMUST00000195528 2603 ntBASIC15.81■□□□□ 0.12
Cops6O88545 Dok7-203ENSMUST00000114270 2779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Cops6O88545 Dnajb12-205ENSMUST00000147914 3041 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Cops6O88545 Moxd1-201ENSMUST00000095784 3090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Cops6O88545 Ripk4-201ENSMUST00000019386 3541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Cops6O88545 Actn4-211ENSMUST00000217157 3530 ntTSL 5 BASIC15.81■□□□□ 0.12
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 59.8 ms