Protein–RNA interactions for Protein: O54909

Rdh16, Cis-retinol androgen dehydrogenase 1, mousemouse

Predictions only

Length 317 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rdh16O54909 Gm8463-201ENSMUST00000208573 613 ntBASIC11.01□□□□□ -0.65
Rdh16O54909 Atpif1-201ENSMUST00000067496 539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.01□□□□□ -0.65
Rdh16O54909 Rhox2e-201ENSMUST00000072167 799 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.01□□□□□ -0.65
Rdh16O54909 Snap23-202ENSMUST00000110711 2723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.01□□□□□ -0.65
Rdh16O54909 H1fnt-201ENSMUST00000060855 1326 ntAPPRIS P1 BASIC11.01□□□□□ -0.65
Rdh16O54909 Usp13-201ENSMUST00000072312 7580 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.01□□□□□ -0.65
Rdh16O54909 Lims1-202ENSMUST00000020078 4327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.01□□□□□ -0.65
Rdh16O54909 Gm13288-201ENSMUST00000094977 2850 ntAPPRIS P1 BASIC11.01□□□□□ -0.65
Rdh16O54909 Gpc2-205ENSMUST00000161827 2586 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.01□□□□□ -0.65
Rdh16O54909 Ska3-201ENSMUST00000022536 2260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.01□□□□□ -0.65
Rdh16O54909 Pdlim7-201ENSMUST00000046246 1697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.01□□□□□ -0.65
Rdh16O54909 H2-T22-202ENSMUST00000077960 1694 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.01□□□□□ -0.65
Rdh16O54909 Gm18630-201ENSMUST00000222109 1397 ntBASIC11.01□□□□□ -0.65
Rdh16O54909 Sp3-202ENSMUST00000102689 4181 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.01□□□□□ -0.65
Rdh16O54909 Apol6-206ENSMUST00000149569 2315 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.01□□□□□ -0.65
Rdh16O54909 Gm5912-201ENSMUST00000122282 1438 ntBASIC11.01□□□□□ -0.65
Rdh16O54909 Tigd2-201ENSMUST00000062626 3007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.01□□□□□ -0.65
Rdh16O54909 Fam110b-209ENSMUST00000171403 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
Rdh16O54909 Dnajb4-204ENSMUST00000144950 2459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
Rdh16O54909 Nup88-201ENSMUST00000035283 2450 ntTSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
Rdh16O54909 Cavin1-201ENSMUST00000060792 3491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
Rdh16O54909 Zranb2-201ENSMUST00000029831 2540 ntTSL 5 BASIC11□□□□□ -0.65
Rdh16O54909 Gm3764-205ENSMUST00000181134 2203 ntTSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
Rdh16O54909 Ddx46-202ENSMUST00000172272 5676 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11□□□□□ -0.65
Rdh16O54909 Ddx46-201ENSMUST00000099479 5664 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11□□□□□ -0.65
Rdh16O54909 Kif16b-201ENSMUST00000043589 6383 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11□□□□□ -0.65
Rdh16O54909 Sp6-202ENSMUST00000107622 3621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
Rdh16O54909 Dysf-216ENSMUST00000204987 6474 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11□□□□□ -0.65
Rdh16O54909 Kif13a-201ENSMUST00000056978 6866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
Rdh16O54909 Abhd6-203ENSMUST00000225234 1958 ntBASIC11□□□□□ -0.65
Rdh16O54909 Dab2ip-205ENSMUST00000112986 5580 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11□□□□□ -0.65
Rdh16O54909 Fam43a-201ENSMUST00000059078 3075 ntAPPRIS P1 BASIC11□□□□□ -0.65
Rdh16O54909 Dlk1-202ENSMUST00000109841 879 ntTSL 5 BASIC11□□□□□ -0.65
Rdh16O54909 Prss45-201ENSMUST00000011391 1232 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
Rdh16O54909 Cd209g-201ENSMUST00000130372 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
Rdh16O54909 Glo1-202ENSMUST00000167624 895 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11□□□□□ -0.65
Rdh16O54909 1600017P15Rik-202ENSMUST00000193960 890 ntBASIC11□□□□□ -0.65
Rdh16O54909 1700029B24Rik-201ENSMUST00000194040 497 ntBASIC11□□□□□ -0.65
Rdh16O54909 3830422I06Rik-201ENSMUST00000200199 1181 ntBASIC11□□□□□ -0.65
Rdh16O54909 Gm44985-201ENSMUST00000206202 1016 ntBASIC11□□□□□ -0.65
Rdh16O54909 Jakmip1-215ENSMUST00000212047 1191 ntTSL 5 BASIC11□□□□□ -0.65
Rdh16O54909 Atp5d-201ENSMUST00000003156 931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
Rdh16O54909 Senp5-201ENSMUST00000023457 3498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
Rdh16O54909 Sfpq-201ENSMUST00000030623 3465 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
Rdh16O54909 Gm5989-201ENSMUST00000096092 2077 ntBASIC11□□□□□ -0.65
Rdh16O54909 Nt5c3b-203ENSMUST00000107397 1348 ntTSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
Rdh16O54909 Ctbs-202ENSMUST00000061937 2892 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
Rdh16O54909 Epm2aip1-201ENSMUST00000060711 7149 ntAPPRIS P1 BASIC11□□□□□ -0.65
Rdh16O54909 Wdr66-202ENSMUST00000121964 4873 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11□□□□□ -0.65
Rdh16O54909 Lmln-201ENSMUST00000023497 6147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
Rdh16O54909 Pced1b-201ENSMUST00000059433 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
Rdh16O54909 Plekhg2-203ENSMUST00000121085 4649 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11□□□□□ -0.65
Rdh16O54909 Cpn1-201ENSMUST00000026210 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
Rdh16O54909 Dhx57-202ENSMUST00000086555 5077 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
Rdh16O54909 Matr3-206ENSMUST00000187389 3107 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11□□□□□ -0.65
Rdh16O54909 Duox1-201ENSMUST00000099461 5267 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11□□□□□ -0.65
Rdh16O54909 Actr8-204ENSMUST00000224797 2328 ntAPPRIS P1 BASIC11□□□□□ -0.65
Rdh16O54909 Kifc5c-ps-201ENSMUST00000179040 1530 ntBASIC10.99□□□□□ -0.65
Rdh16O54909 Plaur-201ENSMUST00000002284 1506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
Rdh16O54909 Begain-204ENSMUST00000209829 3272 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.99□□□□□ -0.65
Rdh16O54909 Cyyr1-201ENSMUST00000114174 5464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
Rdh16O54909 Gm15082-201ENSMUST00000147045 1960 ntTSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
Rdh16O54909 Adgrg3-201ENSMUST00000051259 2439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
Rdh16O54909 Tmc6-201ENSMUST00000026659 2865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
Rdh16O54909 Grid1-201ENSMUST00000043349 5720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
Rdh16O54909 Ciz1-202ENSMUST00000113331 2604 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.99□□□□□ -0.65
Rdh16O54909 Gm16793-201ENSMUST00000181322 1680 ntTSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
Rdh16O54909 4931414P19Rik-201ENSMUST00000022786 2670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
Rdh16O54909 Cidec-201ENSMUST00000032416 1703 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
Rdh16O54909 AC164702.1-201ENSMUST00000220135 2212 ntBASIC10.99□□□□□ -0.65
Rdh16O54909 Ndc80-201ENSMUST00000024851 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
Rdh16O54909 Anapc11-201ENSMUST00000026128 3229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
Rdh16O54909 Gabpb1-204ENSMUST00000103227 2751 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
Rdh16O54909 Stk33-204ENSMUST00000121748 2295 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.99□□□□□ -0.65
Rdh16O54909 Tacr2-201ENSMUST00000020278 2258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
Rdh16O54909 Eif2ak1-201ENSMUST00000100487 4325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
Rdh16O54909 Trav13d-2-201ENSMUST00000103596 264 ntAPPRIS P1 BASIC10.99□□□□□ -0.65
Rdh16O54909 Trav13n-2-201ENSMUST00000103622 264 ntAPPRIS P1 BASIC10.99□□□□□ -0.65
Rdh16O54909 Gm6161-201ENSMUST00000121942 1102 ntBASIC10.99□□□□□ -0.65
Rdh16O54909 Gm13834-201ENSMUST00000123757 137 ntTSL 3 BASIC10.99□□□□□ -0.65
Rdh16O54909 Gm20479-201ENSMUST00000126587 556 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10.99□□□□□ -0.65
Rdh16O54909 Slc2a9-207ENSMUST00000143758 1296 ntTSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
Rdh16O54909 Hnrnpa3-207ENSMUST00000164947 1074 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.99□□□□□ -0.65
Rdh16O54909 Gm6254-201ENSMUST00000168178 1072 ntBASIC10.99□□□□□ -0.65
Rdh16O54909 Gm6153-201ENSMUST00000172004 1058 ntBASIC10.99□□□□□ -0.65
Rdh16O54909 Gm9242-201ENSMUST00000177820 1074 ntAPPRIS P1 BASIC10.99□□□□□ -0.65
Rdh16O54909 Gm5641-202ENSMUST00000198699 1080 ntBASIC10.99□□□□□ -0.65
Rdh16O54909 Gm18473-201ENSMUST00000220543 868 ntBASIC10.99□□□□□ -0.65
Rdh16O54909 AC140375.2-201ENSMUST00000225283 584 ntBASIC10.99□□□□□ -0.65
Rdh16O54909 CT573086.1-201ENSMUST00000227202 1074 ntBASIC10.99□□□□□ -0.65
Rdh16O54909 AC134335.2-201ENSMUST00000227660 440 ntBASIC10.99□□□□□ -0.65
Rdh16O54909 Rdh5-201ENSMUST00000026406 1258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
Rdh16O54909 Elane-201ENSMUST00000046091 984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
Rdh16O54909 Wdr74-201ENSMUST00000049424 1204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
Rdh16O54909 Rps15-201ENSMUST00000062674 572 ntTSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
Rdh16O54909 Cracr2a-201ENSMUST00000071563 1094 ntTSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
Rdh16O54909 Lamc3-201ENSMUST00000028187 5871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
Rdh16O54909 Pigq-209ENSMUST00000140304 1835 ntTSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
Rdh16O54909 Egr2-202ENSMUST00000105438 2864 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
Rdh16O54909 Mul1-202ENSMUST00000105813 3944 ntTSL 5 BASIC10.99□□□□□ -0.65
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 46.3 ms