Protein–RNA interactions for Protein: O54693

Eda, Ectodysplasin-A, mousemouse

Predictions only

Length 391 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
EdaO54693 Col3a1-201ENSMUST00000087883 5564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.63□□□□□ -0.39
EdaO54693 Ube3a-201ENSMUST00000107537 4911 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.63□□□□□ -0.39
EdaO54693 Ebf4-201ENSMUST00000110286 2670 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.63□□□□□ -0.39
EdaO54693 Prkcd-203ENSMUST00000112203 1927 ntTSL 1 (best) BASIC12.63□□□□□ -0.39
EdaO54693 Adam22-207ENSMUST00000115388 9161 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.63□□□□□ -0.39
EdaO54693 Phldb1-214ENSMUST00000147495 5424 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC12.63□□□□□ -0.39
EdaO54693 Snord83b-201ENSMUST00000104546 94 ntBASIC12.63□□□□□ -0.39
EdaO54693 Gm25214-201ENSMUST00000104573 129 ntBASIC12.63□□□□□ -0.39
EdaO54693 Gngt2-207ENSMUST00000107714 558 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC12.63□□□□□ -0.39
EdaO54693 Igfbp2-202ENSMUST00000120564 991 ntTSL 3 BASIC12.63□□□□□ -0.39
EdaO54693 Rpl13-ps1-201ENSMUST00000121801 668 ntBASIC12.63□□□□□ -0.39
EdaO54693 Mcpt8-201ENSMUST00000015594 836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.63□□□□□ -0.39
EdaO54693 Hsbp1l1-201ENSMUST00000166219 1251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.63□□□□□ -0.39
EdaO54693 Rhoc-204ENSMUST00000176347 583 ntTSL 5 BASIC12.63□□□□□ -0.39
EdaO54693 Gm38297-201ENSMUST00000195122 1057 ntBASIC12.63□□□□□ -0.39
EdaO54693 Gm43947-201ENSMUST00000203019 959 ntBASIC12.63□□□□□ -0.39
EdaO54693 Plin1-203ENSMUST00000205413 1294 ntTSL 1 (best) BASIC12.63□□□□□ -0.39
EdaO54693 H2-Oa-201ENSMUST00000025192 1088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.63□□□□□ -0.39
EdaO54693 Cyb5d1-201ENSMUST00000051620 753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.63□□□□□ -0.39
EdaO54693 Agrp-201ENSMUST00000005849 661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.63□□□□□ -0.39
EdaO54693 Cyp4f16-208ENSMUST00000169591 2242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.63□□□□□ -0.39
EdaO54693 Rap2b-201ENSMUST00000049064 6793 ntAPPRIS P1 BASIC12.63□□□□□ -0.39
EdaO54693 Ilvbl-201ENSMUST00000105384 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.63□□□□□ -0.39
EdaO54693 Ilvbl-203ENSMUST00000218215 2331 ntTSL 1 (best) BASIC12.63□□□□□ -0.39
EdaO54693 Ist1-201ENSMUST00000034164 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.63□□□□□ -0.39
EdaO54693 Rnf220-202ENSMUST00000094853 1675 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.63□□□□□ -0.39
EdaO54693 Ncor2-203ENSMUST00000111393 8661 ntTSL 1 (best) BASIC12.63□□□□□ -0.39
EdaO54693 I730028E13Rik-201ENSMUST00000216012 1959 ntTSL 1 (best) BASIC12.63□□□□□ -0.39
EdaO54693 Zfp429-201ENSMUST00000109732 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.63□□□□□ -0.39
EdaO54693 Etnk2-201ENSMUST00000129213 2074 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.63□□□□□ -0.39
EdaO54693 Zfp541-202ENSMUST00000209369 4879 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.63□□□□□ -0.39
EdaO54693 Tcp11l1-201ENSMUST00000028597 3512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.63□□□□□ -0.39
EdaO54693 Grid2ip-202ENSMUST00000110733 3825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.63□□□□□ -0.39
EdaO54693 Atxn7l1-202ENSMUST00000090597 2563 ntTSL 1 (best) BASIC12.63□□□□□ -0.39
EdaO54693 Ap3d1-201ENSMUST00000020420 4805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.63□□□□□ -0.39
EdaO54693 Gpr157-201ENSMUST00000094451 4900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.63□□□□□ -0.39
EdaO54693 Rcsd1-202ENSMUST00000097474 5001 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.63□□□□□ -0.39
EdaO54693 Ebag9-201ENSMUST00000022964 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.62□□□□□ -0.39
EdaO54693 Pcdha6-202ENSMUST00000193777 5367 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.62□□□□□ -0.39
EdaO54693 Plch2-208ENSMUST00000145662 1818 ntTSL 1 (best) BASIC12.62□□□□□ -0.39
EdaO54693 Xpot-201ENSMUST00000039810 5992 ntTSL 5 BASIC12.62□□□□□ -0.39
EdaO54693 Gm26770-201ENSMUST00000180586 2237 ntTSL 1 (best) BASIC12.62□□□□□ -0.39
EdaO54693 Megf6-201ENSMUST00000030897 6851 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.62□□□□□ -0.39
EdaO54693 9030407P20Rik-201ENSMUST00000180933 2310 ntTSL 1 (best) BASIC12.62□□□□□ -0.39
EdaO54693 Shroom1-201ENSMUST00000018531 2630 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.62□□□□□ -0.39
EdaO54693 Rufy3-203ENSMUST00000196894 3703 ntTSL 1 (best) BASIC12.62□□□□□ -0.39
EdaO54693 Fnbp1-209ENSMUST00000113562 4515 ntTSL 1 (best) BASIC12.62□□□□□ -0.39
EdaO54693 Dnajc27-201ENSMUST00000020986 4698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.62□□□□□ -0.39
EdaO54693 Zfp467-205ENSMUST00000114560 3266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.62□□□□□ -0.39
EdaO54693 Syvn1-201ENSMUST00000025723 2780 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.62□□□□□ -0.39
EdaO54693 Rhoj-201ENSMUST00000055390 2350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.62□□□□□ -0.39
EdaO54693 Lrrc14-210ENSMUST00000155735 2286 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.62□□□□□ -0.39
EdaO54693 Gm8228-201ENSMUST00000189949 2192 ntBASIC12.62□□□□□ -0.39
EdaO54693 Tuft1-203ENSMUST00000196655 2156 ntTSL 5 BASIC12.62□□□□□ -0.39
EdaO54693 Tmed5-202ENSMUST00000061203 2194 ntTSL 1 (best) BASIC12.62□□□□□ -0.39
EdaO54693 Pcdhga8-201ENSMUST00000066149 4730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.62□□□□□ -0.39
EdaO54693 Gm14109-201ENSMUST00000118814 309 ntBASIC12.62□□□□□ -0.39
EdaO54693 Lamr1-ps1-201ENSMUST00000119759 874 ntBASIC12.62□□□□□ -0.39
EdaO54693 Gm6161-201ENSMUST00000121942 1102 ntBASIC12.62□□□□□ -0.39
EdaO54693 Gm13388-201ENSMUST00000126659 425 ntTSL 3 BASIC12.62□□□□□ -0.39
EdaO54693 Mitd1-205ENSMUST00000139725 1175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.62□□□□□ -0.39
EdaO54693 Gm16099-202ENSMUST00000151873 660 ntTSL 5 BASIC12.62□□□□□ -0.39
EdaO54693 9330162012Rik-201ENSMUST00000154919 3836 ntTSL 1 (best) BASIC12.62□□□□□ -0.39
EdaO54693 Hnrnpa3-207ENSMUST00000164947 1074 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.62□□□□□ -0.39
EdaO54693 Gm6254-201ENSMUST00000168178 1072 ntBASIC12.62□□□□□ -0.39
EdaO54693 Gm6153-201ENSMUST00000172004 1058 ntBASIC12.62□□□□□ -0.39
EdaO54693 Gm9242-201ENSMUST00000177820 1074 ntAPPRIS P1 BASIC12.62□□□□□ -0.39
EdaO54693 Adtrp-204ENSMUST00000179758 1046 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.62□□□□□ -0.39
EdaO54693 Gm29264-201ENSMUST00000191240 1264 ntTSL 1 (best) BASIC12.62□□□□□ -0.39
EdaO54693 Gm5641-202ENSMUST00000198699 1080 ntBASIC12.62□□□□□ -0.39
EdaO54693 Gm43378-201ENSMUST00000199336 582 ntBASIC12.62□□□□□ -0.39
EdaO54693 Gm8099-201ENSMUST00000200510 742 ntBASIC12.62□□□□□ -0.39
EdaO54693 Gm4598-201ENSMUST00000206756 1080 ntTSL 1 (best) BASIC12.62□□□□□ -0.39
EdaO54693 AC154595.3-201ENSMUST00000224579 384 ntBASIC12.62□□□□□ -0.39
EdaO54693 Nppc-201ENSMUST00000027449 1042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.62□□□□□ -0.39
EdaO54693 Dab2ip-206ENSMUST00000112987 6287 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.62□□□□□ -0.39
EdaO54693 Nek6-203ENSMUST00000112902 3147 ntTSL 1 (best) BASIC12.62□□□□□ -0.39
EdaO54693 Pomgnt1-201ENSMUST00000106494 2226 ntTSL 1 (best) BASIC12.62□□□□□ -0.39
EdaO54693 Cntfr-204ENSMUST00000102962 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.62□□□□□ -0.39
EdaO54693 Dnmt3l-205ENSMUST00000138785 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.62□□□□□ -0.39
EdaO54693 Olfr56-204ENSMUST00000203149 1808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.62□□□□□ -0.39
EdaO54693 Ablim1-202ENSMUST00000099294 6232 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.62□□□□□ -0.39
EdaO54693 Phactr3-203ENSMUST00000108915 2694 ntTSL 1 (best) BASIC12.62□□□□□ -0.39
EdaO54693 Phactr3-204ENSMUST00000108916 2656 ntTSL 1 (best) BASIC12.62□□□□□ -0.39
EdaO54693 Radil-201ENSMUST00000063635 3700 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.62□□□□□ -0.39
EdaO54693 Gm14371-201ENSMUST00000138925 1518 ntBASIC12.62□□□□□ -0.39
EdaO54693 Togaram2-205ENSMUST00000153445 3302 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.62□□□□□ -0.39
EdaO54693 Actrt2-201ENSMUST00000060062 1435 ntAPPRIS P1 BASIC12.62□□□□□ -0.39
EdaO54693 Krt71-201ENSMUST00000023710 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.62□□□□□ -0.39
EdaO54693 Bid-201ENSMUST00000004560 2189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.62□□□□□ -0.39
EdaO54693 Clic6-201ENSMUST00000023670 3758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.61□□□□□ -0.39
EdaO54693 Spg20-201ENSMUST00000044116 3770 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.61□□□□□ -0.39
EdaO54693 Arl6ip6-201ENSMUST00000028336 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.61□□□□□ -0.39
EdaO54693 Cfap77-204ENSMUST00000189711 1759 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.61□□□□□ -0.39
EdaO54693 Myh3-201ENSMUST00000007301 5992 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.61□□□□□ -0.39
EdaO54693 Slc41a3-201ENSMUST00000032177 2324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.61□□□□□ -0.39
EdaO54693 Crx-203ENSMUST00000172758 1469 ntTSL 3 BASIC12.61□□□□□ -0.39
EdaO54693 Lmf2-201ENSMUST00000023283 2906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.61□□□□□ -0.39
EdaO54693 Hectd1-202ENSMUST00000179265 9012 ntTSL 5 BASIC12.61□□□□□ -0.39
EdaO54693 Grin3a-202ENSMUST00000093859 7491 ntTSL 1 (best) BASIC12.61□□□□□ -0.39
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 52.7 ms