Protein–RNA interactions for Protein: O35988

Sdc4, Syndecan-4, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 198 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sdc4O35988 Stk33-202ENSMUST00000106745 2410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Sdc4O35988 Acot7-202ENSMUST00000075363 1457 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Sdc4O35988 Eif4e2-206ENSMUST00000113233 1807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Sdc4O35988 Srebf2-201ENSMUST00000023100 4989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Sdc4O35988 Tspan13-201ENSMUST00000020896 1932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Sdc4O35988 Olfr56-201ENSMUST00000056759 1925 ntTSL 5 BASIC13.41□□□□□ -0.26
Sdc4O35988 Gpat2-201ENSMUST00000062211 2628 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.41□□□□□ -0.26
Sdc4O35988 Nup93-201ENSMUST00000079961 2707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Sdc4O35988 Ubap2l-204ENSMUST00000195995 3516 ntTSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Sdc4O35988 Camk2b-206ENSMUST00000101585 1650 ntTSL 5 BASIC13.4□□□□□ -0.26
Sdc4O35988 Il1rn-204ENSMUST00000114487 2474 ntTSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Sdc4O35988 Cecr2-202ENSMUST00000112686 9212 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.4□□□□□ -0.26
Sdc4O35988 Cfap77-204ENSMUST00000189711 1759 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.4□□□□□ -0.26
Sdc4O35988 Mettl1-201ENSMUST00000006915 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Sdc4O35988 Tjap1-202ENSMUST00000164342 2559 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Sdc4O35988 Ak4-201ENSMUST00000102780 4186 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.4□□□□□ -0.26
Sdc4O35988 Adsl-206ENSMUST00000168756 1439 ntTSL 5 BASIC13.4□□□□□ -0.26
Sdc4O35988 Acta1-201ENSMUST00000034453 1446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Sdc4O35988 Zfp575-201ENSMUST00000094705 2741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Sdc4O35988 4933416C03Rik-201ENSMUST00000099261 2254 ntAPPRIS P1 BASIC13.4□□□□□ -0.26
Sdc4O35988 Rpl3-ps2-201ENSMUST00000117131 1214 ntBASIC13.4□□□□□ -0.26
Sdc4O35988 Gm9431-201ENSMUST00000119765 1051 ntBASIC13.4□□□□□ -0.26
Sdc4O35988 Gm15351-201ENSMUST00000123920 419 ntTSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Sdc4O35988 Gm16124-201ENSMUST00000146938 516 ntTSL 2 BASIC13.4□□□□□ -0.26
Sdc4O35988 Gm29396-201ENSMUST00000185659 716 ntBASIC13.4□□□□□ -0.26
Sdc4O35988 Gm5850-201ENSMUST00000192923 1206 ntBASIC13.4□□□□□ -0.26
Sdc4O35988 Crip2-206ENSMUST00000200380 864 ntTSL 3 BASIC13.4□□□□□ -0.26
Sdc4O35988 Olfr284-202ENSMUST00000206647 966 ntBASIC13.4□□□□□ -0.26
Sdc4O35988 Gm31992-201ENSMUST00000213387 862 ntTSL 5 BASIC13.4□□□□□ -0.26
Sdc4O35988 Rad23b-201ENSMUST00000030134 3810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Sdc4O35988 Olfr1368-201ENSMUST00000055298 1064 ntAPPRIS P1 BASIC13.4□□□□□ -0.26
Sdc4O35988 Lcn10-201ENSMUST00000058912 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Sdc4O35988 Rpl10-201ENSMUST00000008826 799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Sdc4O35988 Pkp3-201ENSMUST00000066873 2848 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Sdc4O35988 Bcl2l1-202ENSMUST00000109820 2568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Sdc4O35988 Hdac5-203ENSMUST00000107151 4852 ntTSL 5 BASIC13.4□□□□□ -0.26
Sdc4O35988 Abcc6-201ENSMUST00000002850 4974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Sdc4O35988 Pacrg-201ENSMUST00000041463 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Sdc4O35988 4930423D22Rik-201ENSMUST00000221909 1674 ntBASIC13.4□□□□□ -0.26
Sdc4O35988 Blzf1-203ENSMUST00000120447 2430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Sdc4O35988 Apbb2-203ENSMUST00000159512 6632 ntTSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Sdc4O35988 Gucy2e-201ENSMUST00000021259 8331 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.4□□□□□ -0.26
Sdc4O35988 Gm5466-201ENSMUST00000119395 1890 ntBASIC13.4□□□□□ -0.26
Sdc4O35988 Pnn-201ENSMUST00000021381 3485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Sdc4O35988 Ctsl-201ENSMUST00000021933 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.27
Sdc4O35988 1110002L01Rik-202ENSMUST00000168012 3569 ntTSL 2 BASIC13.4□□□□□ -0.27
Sdc4O35988 BB123696-201ENSMUST00000222580 2056 ntTSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.27
Sdc4O35988 Usf1-208ENSMUST00000161241 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Sdc4O35988 Kars-203ENSMUST00000164470 2189 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Sdc4O35988 Gm6203-201ENSMUST00000209575 1342 ntBASIC13.39□□□□□ -0.27
Sdc4O35988 Fn1-211ENSMUST00000187938 7965 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Sdc4O35988 Sptb-201ENSMUST00000021458 10394 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Sdc4O35988 Ntrk2-209ENSMUST00000225950 2640 ntBASIC13.39□□□□□ -0.27
Sdc4O35988 Dnase2a-206ENSMUST00000145292 678 ntTSL 5 BASIC13.39□□□□□ -0.27
Sdc4O35988 Cabp2-201ENSMUST00000159148 1030 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Sdc4O35988 Hspb9-201ENSMUST00000017976 652 ntAPPRIS ALT2 BASIC13.39□□□□□ -0.27
Sdc4O35988 Gm26618-201ENSMUST00000181123 497 ntTSL 2 BASIC13.39□□□□□ -0.27
Sdc4O35988 Gm3890-201ENSMUST00000182416 207 ntBASIC13.39□□□□□ -0.27
Sdc4O35988 1190007I07Rik-205ENSMUST00000185168 469 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.39□□□□□ -0.27
Sdc4O35988 Mb-201ENSMUST00000019037 966 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.39□□□□□ -0.27
Sdc4O35988 Rfxank-203ENSMUST00000212320 1121 ntTSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Sdc4O35988 CT033793.1-201ENSMUST00000216883 565 ntTSL 5 BASIC13.39□□□□□ -0.27
Sdc4O35988 Nsmce1-201ENSMUST00000033006 1120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Sdc4O35988 Olfr1423-201ENSMUST00000087831 933 ntAPPRIS P1 BASIC13.39□□□□□ -0.27
Sdc4O35988 Akr1b3-201ENSMUST00000102980 1387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Sdc4O35988 Alkbh3-202ENSMUST00000111240 1395 ntTSL 5 BASIC13.39□□□□□ -0.27
Sdc4O35988 Aamp-202ENSMUST00000178235 1756 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.39□□□□□ -0.27
Sdc4O35988 Myadm-203ENSMUST00000203328 1899 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.39□□□□□ -0.27
Sdc4O35988 Zfp422-202ENSMUST00000079749 3187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Sdc4O35988 Luc7l3-202ENSMUST00000107820 3478 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.39□□□□□ -0.27
Sdc4O35988 Rpusd2-201ENSMUST00000028796 2706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Sdc4O35988 Taz-204ENSMUST00000124200 1742 ntTSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Sdc4O35988 Asap1-218ENSMUST00000177374 4582 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Sdc4O35988 Eln-201ENSMUST00000015138 3853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Sdc4O35988 Scg3-201ENSMUST00000034699 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
Sdc4O35988 Lrig2-205ENSMUST00000198332 3946 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
Sdc4O35988 Zfp236-201ENSMUST00000171071 9626 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
Sdc4O35988 Pnkp-201ENSMUST00000003044 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
Sdc4O35988 Mlkl-202ENSMUST00000120432 1976 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
Sdc4O35988 Timp3-201ENSMUST00000020234 4722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
Sdc4O35988 Chpf2-201ENSMUST00000088295 5371 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.38□□□□□ -0.27
Sdc4O35988 Gm37885-201ENSMUST00000192568 1391 ntTSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
Sdc4O35988 Phlda2-201ENSMUST00000010904 757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
Sdc4O35988 Apoo-204ENSMUST00000113898 784 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.38□□□□□ -0.27
Sdc4O35988 Gm12241-201ENSMUST00000118330 726 ntBASIC13.38□□□□□ -0.27
Sdc4O35988 Gm14723-201ENSMUST00000118686 215 ntBASIC13.38□□□□□ -0.27
Sdc4O35988 Gm11658-201ENSMUST00000120913 1008 ntBASIC13.38□□□□□ -0.27
Sdc4O35988 Gm2467-201ENSMUST00000182266 1010 ntBASIC13.38□□□□□ -0.27
Sdc4O35988 Gm6981-201ENSMUST00000182467 1008 ntBASIC13.38□□□□□ -0.27
Sdc4O35988 Gm43822-201ENSMUST00000200285 476 ntBASIC13.38□□□□□ -0.27
Sdc4O35988 Gm7172-201ENSMUST00000218047 1152 ntBASIC13.38□□□□□ -0.27
Sdc4O35988 Gm9368-201ENSMUST00000219348 831 ntBASIC13.38□□□□□ -0.27
Sdc4O35988 Nr0b2-201ENSMUST00000042706 1132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
Sdc4O35988 1500011B03Rik-201ENSMUST00000061251 579 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
Sdc4O35988 Pik3ip1-201ENSMUST00000045153 2573 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
Sdc4O35988 Arhgef5-201ENSMUST00000031750 5469 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.38□□□□□ -0.27
Sdc4O35988 Clec16a-205ENSMUST00000115827 2949 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
Sdc4O35988 Pkdrej-201ENSMUST00000064370 7058 ntAPPRIS P1 BASIC13.38□□□□□ -0.27
Sdc4O35988 Mrm3-201ENSMUST00000040577 1510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
Sdc4O35988 Stx17-201ENSMUST00000064765 1531 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.38□□□□□ -0.27
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