Protein–RNA interactions for Protein: O35599

Opn1mw, Medium-wave-sensitive opsin 1, mousemouse

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Length 359 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Opn1mwO35599 Gm38391-201ENSMUST00000191720 4069 ntBASIC12.89□□□□□ -0.35
Opn1mwO35599 Maged2-201ENSMUST00000026302 2207 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.89□□□□□ -0.35
Opn1mwO35599 Rgs17-203ENSMUST00000117676 1651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
Opn1mwO35599 Mmp2-201ENSMUST00000034187 3078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
Opn1mwO35599 Pax2-201ENSMUST00000004340 3095 ntTSL 5 BASIC12.89□□□□□ -0.35
Opn1mwO35599 Zcchc3-201ENSMUST00000099207 3073 ntAPPRIS P1 BASIC12.89□□□□□ -0.35
Opn1mwO35599 Iffo2-201ENSMUST00000040023 5227 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC12.89□□□□□ -0.35
Opn1mwO35599 2410018L13Rik-205ENSMUST00000149246 3370 ntTSL 2 BASIC12.89□□□□□ -0.35
Opn1mwO35599 Gm5124-201ENSMUST00000127554 1970 ntTSL 5 BASIC12.89□□□□□ -0.35
Opn1mwO35599 Zfp429-201ENSMUST00000109732 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
Opn1mwO35599 Myef2-206ENSMUST00000142718 2942 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.89□□□□□ -0.35
Opn1mwO35599 Nfasc-208ENSMUST00000188307 3049 ntTSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
Opn1mwO35599 Crry-ps-201ENSMUST00000079090 1309 ntBASIC12.88□□□□□ -0.35
Opn1mwO35599 Cmip-201ENSMUST00000095172 2276 ntTSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
Opn1mwO35599 Pga5-201ENSMUST00000025647 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
Opn1mwO35599 Gm14371-201ENSMUST00000138925 1518 ntBASIC12.88□□□□□ -0.35
Opn1mwO35599 Ociad2-201ENSMUST00000087195 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
Opn1mwO35599 Hnrnpa2b1-204ENSMUST00000203220 1638 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
Opn1mwO35599 Pxdn-202ENSMUST00000122328 6614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
Opn1mwO35599 Trib1-202ENSMUST00000118228 3081 ntTSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
Opn1mwO35599 Pxylp1-204ENSMUST00000120101 3189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
Opn1mwO35599 Daam2-202ENSMUST00000224595 1926 ntBASIC12.88□□□□□ -0.35
Opn1mwO35599 Umad1-204ENSMUST00000159433 2025 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
Opn1mwO35599 Cacna2d1-205ENSMUST00000167946 7436 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC12.88□□□□□ -0.35
Opn1mwO35599 Prss43-201ENSMUST00000077549 2327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
Opn1mwO35599 Slc22a15-207ENSMUST00000190824 3010 ntTSL 5 BASIC12.88□□□□□ -0.35
Opn1mwO35599 Gbe1-207ENSMUST00000171132 3303 ntTSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
Opn1mwO35599 Prox1os-201ENSMUST00000110279 828 ntTSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
Opn1mwO35599 Gm13492-201ENSMUST00000119772 665 ntBASIC12.88□□□□□ -0.35
Opn1mwO35599 Adamtsl1-204ENSMUST00000120678 977 ntTSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
Opn1mwO35599 Iqcf6-201ENSMUST00000171091 537 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.88□□□□□ -0.35
Opn1mwO35599 1700125G22Rik-201ENSMUST00000181124 861 ntTSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
Opn1mwO35599 2010010A06Rik-201ENSMUST00000185628 258 ntBASIC12.88□□□□□ -0.35
Opn1mwO35599 Gm3096-201ENSMUST00000185770 364 ntBASIC12.88□□□□□ -0.35
Opn1mwO35599 Ak6-205ENSMUST00000190729 1184 ntTSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
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Opn1mwO35599 Gm44772-201ENSMUST00000207623 1191 ntBASIC12.88□□□□□ -0.35
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Opn1mwO35599 AC161537.1-201ENSMUST00000226199 1015 ntBASIC12.88□□□□□ -0.35
Opn1mwO35599 Otos-201ENSMUST00000053144 704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
Opn1mwO35599 Kbtbd7-201ENSMUST00000061222 4526 ntAPPRIS P1 BASIC12.88□□□□□ -0.35
Opn1mwO35599 Nfatc1-202ENSMUST00000078049 4607 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
Opn1mwO35599 Dimt1-201ENSMUST00000022203 2051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
Opn1mwO35599 Tspyl1-201ENSMUST00000061372 3086 ntAPPRIS P1 BASIC12.88□□□□□ -0.35
Opn1mwO35599 Smo-201ENSMUST00000001812 3779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
Opn1mwO35599 Camk2d-206ENSMUST00000106402 4180 ntTSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
Opn1mwO35599 Celf1-202ENSMUST00000068726 7851 ntTSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
Opn1mwO35599 Tspan15-201ENSMUST00000047883 3638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
Opn1mwO35599 Gtf2ird1-209ENSMUST00000171794 3524 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
Opn1mwO35599 Nup93-201ENSMUST00000079961 2707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
Opn1mwO35599 Cabp7-201ENSMUST00000009219 2628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
Opn1mwO35599 Zkscan4-201ENSMUST00000062609 2400 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.88□□□□□ -0.35
Opn1mwO35599 Oxr1-204ENSMUST00000110297 4596 ntTSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
Opn1mwO35599 Adh6a-202ENSMUST00000106247 1341 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
Opn1mwO35599 Cep131-201ENSMUST00000106227 3578 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
Opn1mwO35599 Cep131-202ENSMUST00000106229 3581 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
Opn1mwO35599 Cep131-207ENSMUST00000180242 3581 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.87□□□□□ -0.35
Opn1mwO35599 Foxo4-201ENSMUST00000062000 3162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
Opn1mwO35599 Gdf10-201ENSMUST00000168727 5210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
Opn1mwO35599 Klhdc8b-207ENSMUST00000193286 2956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
Opn1mwO35599 Tcirg1-201ENSMUST00000001801 2688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
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Opn1mwO35599 Wwox-201ENSMUST00000004756 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
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Opn1mwO35599 Usp19-201ENSMUST00000006854 4791 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
Opn1mwO35599 Gngt2-207ENSMUST00000107714 558 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC12.87□□□□□ -0.35
Opn1mwO35599 Pom121l12-201ENSMUST00000117584 1039 ntAPPRIS P1 BASIC12.87□□□□□ -0.35
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Opn1mwO35599 Nbdy-201ENSMUST00000140575 788 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
Opn1mwO35599 Nbdy-202ENSMUST00000149514 775 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.87□□□□□ -0.35
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Opn1mwO35599 Cmtm1-201ENSMUST00000159039 1130 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
Opn1mwO35599 Rhoc-204ENSMUST00000176347 583 ntTSL 5 BASIC12.87□□□□□ -0.35
Opn1mwO35599 Gm9061-201ENSMUST00000182707 1006 ntBASIC12.87□□□□□ -0.35
Opn1mwO35599 Gm37986-201ENSMUST00000193285 383 ntBASIC12.87□□□□□ -0.35
Opn1mwO35599 1700012D14Rik-202ENSMUST00000209959 629 ntTSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
Opn1mwO35599 Gm32468-201ENSMUST00000214199 1040 ntTSL 5 BASIC12.87□□□□□ -0.35
Opn1mwO35599 AC154595.3-201ENSMUST00000224579 384 ntBASIC12.87□□□□□ -0.35
Opn1mwO35599 H2-Oa-201ENSMUST00000025192 1088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
Opn1mwO35599 Riiad1-201ENSMUST00000029785 630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
Opn1mwO35599 Ubiad1-201ENSMUST00000051633 2992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
Opn1mwO35599 Cand1-201ENSMUST00000020315 7766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
Opn1mwO35599 AW209491-202ENSMUST00000178289 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
Opn1mwO35599 Mcc-202ENSMUST00000164666 3606 ntTSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
Opn1mwO35599 Ormdl1-201ENSMUST00000027266 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
Opn1mwO35599 Rasa4-202ENSMUST00000100570 2660 ntTSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
Opn1mwO35599 Mme-206ENSMUST00000194150 3345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
Opn1mwO35599 Apol8-202ENSMUST00000089450 2498 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.87□□□□□ -0.35
Opn1mwO35599 Stip1-201ENSMUST00000025918 2173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
Opn1mwO35599 Lexm-204ENSMUST00000189032 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
Opn1mwO35599 Ccdc27-201ENSMUST00000047207 2089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
Opn1mwO35599 Gm7789-202ENSMUST00000211273 1400 ntBASIC12.87□□□□□ -0.35
Opn1mwO35599 Hlcs-202ENSMUST00000163193 5371 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
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