Protein–RNA interactions for Protein: O35309

Nmi, N-myc-interactor, mousemouse

Predictions only

Length 314 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NmiO35309 Kcnf1-201ENSMUST00000170580 4789 ntAPPRIS P1 BASIC16.09■□□□□ 0.17
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NmiO35309 Gm13387-202ENSMUST00000131147 2646 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
NmiO35309 Gm2237-202ENSMUST00000170694 2090 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
NmiO35309 Adamts15-201ENSMUST00000065112 5928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
NmiO35309 Acad12-202ENSMUST00000111776 2269 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
NmiO35309 Hdac7-202ENSMUST00000088402 4223 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
NmiO35309 Hps5-201ENSMUST00000014562 4953 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
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NmiO35309 Shc4-203ENSMUST00000110480 3671 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
NmiO35309 Smpd4-206ENSMUST00000163997 1722 ntTSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.17
NmiO35309 Pdlim5-208ENSMUST00000196220 1725 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
NmiO35309 Rnf180-201ENSMUST00000069686 1728 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.17
NmiO35309 Gata2-202ENSMUST00000170089 3135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
NmiO35309 Gdap1l1-202ENSMUST00000109420 2475 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
NmiO35309 Dctn2-201ENSMUST00000026479 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
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NmiO35309 Mob1a-202ENSMUST00000055261 4412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
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NmiO35309 Atat1-212ENSMUST00000141662 2034 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
NmiO35309 Cacna1b-205ENSMUST00000114447 6987 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
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NmiO35309 BB123696-201ENSMUST00000222580 2056 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
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NmiO35309 C030047K22Rik-201ENSMUST00000150382 1164 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
NmiO35309 Fhit-206ENSMUST00000162278 981 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
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NmiO35309 Tnfrsf4-201ENSMUST00000030952 1030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
NmiO35309 Ggact-201ENSMUST00000038075 1076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
NmiO35309 Cyb5d1-201ENSMUST00000051620 753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
NmiO35309 Txn2-201ENSMUST00000005487 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
NmiO35309 Shmt2-206ENSMUST00000219239 2238 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
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NmiO35309 Hs3st1-202ENSMUST00000117944 1686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
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NmiO35309 Gm16741-201ENSMUST00000145085 1818 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
NmiO35309 Olfr56-204ENSMUST00000203149 1808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
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NmiO35309 Scg3-201ENSMUST00000034699 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
NmiO35309 Trpm4-201ENSMUST00000042194 4234 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
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NmiO35309 Fetub-201ENSMUST00000023587 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
NmiO35309 Gps1-201ENSMUST00000100134 1925 ntTSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
NmiO35309 Gm8228-201ENSMUST00000189949 2192 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
NmiO35309 Nrg1-210ENSMUST00000208488 2403 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
NmiO35309 Araf-203ENSMUST00000122312 2854 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
NmiO35309 Sema7a-201ENSMUST00000043059 3297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
NmiO35309 Gm43570-201ENSMUST00000199951 3688 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
NmiO35309 B3galnt2-201ENSMUST00000099747 3892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
NmiO35309 Arid3a-202ENSMUST00000105376 4892 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
NmiO35309 Megf9-202ENSMUST00000107359 7924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
NmiO35309 Ermard-203ENSMUST00000097393 2535 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
NmiO35309 Phkg1-201ENSMUST00000026617 2374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
NmiO35309 Kcnd3-201ENSMUST00000079169 2102 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
NmiO35309 Gm8206-201ENSMUST00000164139 1956 ntTSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
NmiO35309 Pdlim5-206ENSMUST00000195975 1845 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
NmiO35309 Noto-201ENSMUST00000089578 1602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
NmiO35309 Crx-203ENSMUST00000172758 1469 ntTSL 3 BASIC16.06■□□□□ 0.16
NmiO35309 Adsl-206ENSMUST00000168756 1439 ntTSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
NmiO35309 0610010K14Rik-203ENSMUST00000100950 545 ntTSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
NmiO35309 Mrps17-205ENSMUST00000119985 859 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
NmiO35309 Mogat1-201ENSMUST00000012331 1178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
NmiO35309 Gm11851-201ENSMUST00000132219 692 ntTSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
NmiO35309 Bcas1os1-201ENSMUST00000133586 1239 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
NmiO35309 E130006D01Rik-203ENSMUST00000137398 906 ntTSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 32.6 ms