Protein–RNA interactions for Protein: O35245

Pkd2, Polycystin-2, mousemouse

Predictions only

Length 966 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pkd2O35245 Gm6502-202ENSMUST00000097478 1218 ntTSL 5 BASIC18.5■□□□□ 0.55
Pkd2O35245 2810402E24Rik-201ENSMUST00000190699 3040 ntBASIC18.5■□□□□ 0.55
Pkd2O35245 Adamts2-201ENSMUST00000040523 7266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Pkd2O35245 Eln-201ENSMUST00000015138 3853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Pkd2O35245 Mtnr1a-201ENSMUST00000067984 1576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Pkd2O35245 Ppig-201ENSMUST00000040915 6245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Pkd2O35245 Sall4-202ENSMUST00000075044 2534 ntTSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Pkd2O35245 Gtpbp1-201ENSMUST00000046463 3398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Pkd2O35245 Zbp1-201ENSMUST00000029018 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Pkd2O35245 Nek3-202ENSMUST00000110730 2050 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.5■□□□□ 0.55
Pkd2O35245 Pkp3-202ENSMUST00000106039 2919 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Pkd2O35245 Camk2d-202ENSMUST00000066466 4075 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Pkd2O35245 Ski-202ENSMUST00000084103 5309 ntTSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
Pkd2O35245 Abhd18-202ENSMUST00000108078 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Pkd2O35245 Micu1-201ENSMUST00000020311 2336 ntTSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
Pkd2O35245 B3galnt2-201ENSMUST00000099747 3892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Pkd2O35245 Galnt6-203ENSMUST00000161514 2746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Pkd2O35245 Prss23-201ENSMUST00000041761 3228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Pkd2O35245 Gm10434-201ENSMUST00000101158 471 ntBASIC18.49■□□□□ 0.55
Pkd2O35245 Ufc1-202ENSMUST00000111302 914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Pkd2O35245 Gm13492-201ENSMUST00000119772 665 ntBASIC18.49■□□□□ 0.55
Pkd2O35245 U2af1l4-206ENSMUST00000163654 781 ntTSL 2 BASIC18.49■□□□□ 0.55
Pkd2O35245 U2af1l4-221ENSMUST00000167361 860 ntTSL 2 BASIC18.49■□□□□ 0.55
Pkd2O35245 Aprt-203ENSMUST00000211823 590 ntTSL 3 BASIC18.49■□□□□ 0.55
Pkd2O35245 CT025533.2-201ENSMUST00000228715 1248 ntBASIC18.49■□□□□ 0.55
Pkd2O35245 Mrps21-201ENSMUST00000067298 488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Pkd2O35245 Ndufa3-201ENSMUST00000076657 515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Pkd2O35245 Cdk10-212ENSMUST00000213005 1580 ntTSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Pkd2O35245 Gm16853-201ENSMUST00000181812 1986 ntTSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Pkd2O35245 Shank1-202ENSMUST00000107935 6649 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
Pkd2O35245 Tcf4-230ENSMUST00000201205 2270 ntTSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
Pkd2O35245 Dnajc14-207ENSMUST00000219508 2298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Pkd2O35245 Sema3b-205ENSMUST00000102532 3191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Pkd2O35245 Slc45a1-201ENSMUST00000037827 3387 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Pkd2O35245 Dnm2-201ENSMUST00000072362 3502 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Pkd2O35245 Adtrp-202ENSMUST00000121404 1602 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Pkd2O35245 Gm30725-201ENSMUST00000195170 1419 ntTSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Pkd2O35245 Gm36445-201ENSMUST00000209344 1432 ntTSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
Pkd2O35245 Camk2d-206ENSMUST00000106402 4180 ntTSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Pkd2O35245 Parp3-203ENSMUST00000123555 2495 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Pkd2O35245 Sfxn3-202ENSMUST00000084493 2843 ntTSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Pkd2O35245 Iqsec3-201ENSMUST00000046373 6840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Pkd2O35245 Bptf-201ENSMUST00000057892 11488 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.48■□□□□ 0.55
Pkd2O35245 Zfp574-202ENSMUST00000179556 4140 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Pkd2O35245 Gm13813-201ENSMUST00000120998 787 ntBASIC18.48■□□□□ 0.55
Pkd2O35245 Igf1-206ENSMUST00000122100 651 ntTSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Pkd2O35245 Tmbim6-206ENSMUST00000161250 1148 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.48■□□□□ 0.55
Pkd2O35245 Crb3-205ENSMUST00000169543 778 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.48■□□□□ 0.55
Pkd2O35245 Gm38241-201ENSMUST00000192641 898 ntBASIC18.48■□□□□ 0.55
Pkd2O35245 Gm45022-201ENSMUST00000208332 545 ntTSL 5 BASIC18.48■□□□□ 0.55
Pkd2O35245 Spata33-205ENSMUST00000212523 486 ntTSL 3 BASIC18.48■□□□□ 0.55
Pkd2O35245 Coq7-202ENSMUST00000098090 1215 ntTSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Pkd2O35245 Pfkl-201ENSMUST00000020522 3730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Pkd2O35245 Tsc22d2-201ENSMUST00000099090 9799 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC18.48■□□□□ 0.55
Pkd2O35245 Ppard-201ENSMUST00000002320 3218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Pkd2O35245 Shc4-203ENSMUST00000110480 3671 ntTSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Pkd2O35245 Hps1-208ENSMUST00000162004 2847 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Pkd2O35245 Cdc42se1-201ENSMUST00000053872 2805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Pkd2O35245 Tgm1-203ENSMUST00000178034 2730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Pkd2O35245 Kmt5b-206ENSMUST00000113973 6130 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.48■□□□□ 0.55
Pkd2O35245 Tcf4-249ENSMUST00000202435 2427 ntTSL 5 BASIC18.48■□□□□ 0.55
Pkd2O35245 Cep97-202ENSMUST00000117468 2887 ntTSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Pkd2O35245 Kcnf1-201ENSMUST00000170580 4789 ntAPPRIS P1 BASIC18.47■□□□□ 0.55
Pkd2O35245 Anapc11-201ENSMUST00000026128 3229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Pkd2O35245 Kdm6b-201ENSMUST00000094077 6654 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
Pkd2O35245 Ncaph-201ENSMUST00000110387 2695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Pkd2O35245 4931414P19Rik-201ENSMUST00000022786 2670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Pkd2O35245 Marco-201ENSMUST00000027639 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Pkd2O35245 Dhx29-201ENSMUST00000038574 4682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Pkd2O35245 Shroom3-202ENSMUST00000113054 6401 ntTSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Pkd2O35245 Eme1-201ENSMUST00000039949 2444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Pkd2O35245 Adgrg3-201ENSMUST00000051259 2439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Pkd2O35245 Ficd-201ENSMUST00000065698 3133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Pkd2O35245 Gm13850-201ENSMUST00000140465 623 ntTSL 3 BASIC18.47■□□□□ 0.55
Pkd2O35245 Tmcc1-205ENSMUST00000173031 1024 ntTSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Pkd2O35245 6430590A07Rik-201ENSMUST00000181813 1032 ntTSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Pkd2O35245 1700065D16Rik-203ENSMUST00000189279 393 ntTSL 2 BASIC18.47■□□□□ 0.55
Pkd2O35245 Txndc17-201ENSMUST00000021158 981 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Pkd2O35245 1700023F06Rik-201ENSMUST00000021323 1199 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
Pkd2O35245 AC122371.3-201ENSMUST00000223402 1061 ntBASIC18.47■□□□□ 0.55
Pkd2O35245 Zdhhc12-201ENSMUST00000081838 1187 ntTSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Pkd2O35245 Slc36a1-202ENSMUST00000108867 1611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Pkd2O35245 Rusc2-207ENSMUST00000131668 5093 ntTSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
Pkd2O35245 Gm7789-202ENSMUST00000211273 1400 ntBASIC18.47■□□□□ 0.55
Pkd2O35245 Cdkn2aip-201ENSMUST00000038738 3464 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Pkd2O35245 Pam-201ENSMUST00000058762 4095 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Pkd2O35245 Gm4366-201ENSMUST00000201488 1342 ntBASIC18.47■□□□□ 0.55
Pkd2O35245 Eif4g3-204ENSMUST00000105830 3252 ntTSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Pkd2O35245 Nepn-201ENSMUST00000067085 1844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Pkd2O35245 Clec16a-204ENSMUST00000115824 6244 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.55
Pkd2O35245 Clec16a-202ENSMUST00000066345 6244 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.55
Pkd2O35245 Olfr683-202ENSMUST00000209879 3841 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.55
Pkd2O35245 Tet3-203ENSMUST00000186548 5944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Pkd2O35245 Zfp36l1-201ENSMUST00000021552 2990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Pkd2O35245 Plekha2-204ENSMUST00000128715 3463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Pkd2O35245 Gm34376-201ENSMUST00000218529 2107 ntTSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.55
Pkd2O35245 Slc4a7-201ENSMUST00000057015 8132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Pkd2O35245 Atg16l1-202ENSMUST00000113186 3004 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Pkd2O35245 Cdk5rap3-201ENSMUST00000103152 2250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Pkd2O35245 CT025610.1-201ENSMUST00000224552 1786 ntBASIC18.46■□□□□ 0.55
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 39.1 ms