Protein–RNA interactions for Protein: O08540

Msmb, Beta-microseminoprotein, mousemouse

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Length 113 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MsmbO08540 Calcr-203ENSMUST00000168592 2064 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.04□□□□□ -0.8
MsmbO08540 Gm10327-201ENSMUST00000105222 1002 ntBASIC10.04□□□□□ -0.8
MsmbO08540 Apoo-204ENSMUST00000113898 784 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10.04□□□□□ -0.8
MsmbO08540 Cabp5-202ENSMUST00000117400 1258 ntTSL 1 (best) BASIC10.04□□□□□ -0.8
MsmbO08540 Gm14660-201ENSMUST00000119809 575 ntBASIC10.04□□□□□ -0.8
MsmbO08540 Gm12945-201ENSMUST00000140080 674 ntTSL 1 (best) BASIC10.04□□□□□ -0.8
MsmbO08540 Gm14285-201ENSMUST00000146049 380 ntTSL 1 (best) BASIC10.04□□□□□ -0.8
MsmbO08540 Plekhd1os-201ENSMUST00000153297 944 ntTSL 1 (best) BASIC10.04□□□□□ -0.8
MsmbO08540 Gm11754-201ENSMUST00000156576 661 ntTSL 1 (best) BASIC10.04□□□□□ -0.8
MsmbO08540 Gas5-210ENSMUST00000159706 557 ntTSL 2 BASIC10.04□□□□□ -0.8
MsmbO08540 Gm16315-201ENSMUST00000163009 783 ntTSL 3 BASIC10.04□□□□□ -0.8
MsmbO08540 Naa60-209ENSMUST00000175809 279 ntTSL 5 BASIC10.04□□□□□ -0.8
MsmbO08540 Gm27731-201ENSMUST00000185192 107 ntBASIC10.04□□□□□ -0.8
MsmbO08540 1700094J05Rik-202ENSMUST00000190491 997 ntTSL 1 (best) BASIC10.04□□□□□ -0.8
MsmbO08540 Gm37922-201ENSMUST00000195596 455 ntBASIC10.04□□□□□ -0.8
MsmbO08540 Gm42902-201ENSMUST00000199508 662 ntTSL 5 BASIC10.04□□□□□ -0.8
MsmbO08540 Gm20219-201ENSMUST00000209718 1269 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.04□□□□□ -0.8
MsmbO08540 Mdk-201ENSMUST00000028672 1054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.04□□□□□ -0.8
MsmbO08540 H2afv-201ENSMUST00000093346 519 ntTSL 1 (best) BASIC10.04□□□□□ -0.8
MsmbO08540 Smc5-202ENSMUST00000223934 3448 ntAPPRIS P2 BASIC10.04□□□□□ -0.8
MsmbO08540 Ssh1-202ENSMUST00000112298 5584 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.04□□□□□ -0.8
MsmbO08540 Tigd2-201ENSMUST00000062626 3007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.04□□□□□ -0.8
MsmbO08540 Ppp4r3b-201ENSMUST00000020755 5125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.04□□□□□ -0.8
MsmbO08540 Wdr33-201ENSMUST00000025264 6206 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.04□□□□□ -0.8
MsmbO08540 Mul1-202ENSMUST00000105813 3944 ntTSL 5 BASIC10.04□□□□□ -0.8
MsmbO08540 Stk33-204ENSMUST00000121748 2295 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.04□□□□□ -0.8
MsmbO08540 Hoxb9-202ENSMUST00000174042 2269 ntTSL 1 (best) BASIC10.04□□□□□ -0.8
MsmbO08540 Ciz1-203ENSMUST00000113332 2973 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.04□□□□□ -0.8
MsmbO08540 Sass6-206ENSMUST00000198386 1894 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.04□□□□□ -0.8
MsmbO08540 Phf24-202ENSMUST00000107975 6494 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.04□□□□□ -0.8
MsmbO08540 AC131068.2-201ENSMUST00000226175 1453 ntBASIC10.04□□□□□ -0.8
MsmbO08540 Tekt2-201ENSMUST00000030658 1492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.04□□□□□ -0.8
MsmbO08540 Elp4-202ENSMUST00000122965 3048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.04□□□□□ -0.8
MsmbO08540 Edc3-201ENSMUST00000043990 5708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.04□□□□□ -0.8
MsmbO08540 Cfap77-204ENSMUST00000189711 1759 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.03□□□□□ -0.8
MsmbO08540 Mettl1-201ENSMUST00000006915 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.03□□□□□ -0.8
MsmbO08540 Rbm47-204ENSMUST00000113726 4703 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.03□□□□□ -0.8
MsmbO08540 Rnf220-202ENSMUST00000094853 1675 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.03□□□□□ -0.8
MsmbO08540 Slc38a7-204ENSMUST00000212270 3315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.03□□□□□ -0.8
MsmbO08540 Nudt18-201ENSMUST00000089049 3926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.03□□□□□ -0.8
MsmbO08540 Drap1-210ENSMUST00000148219 727 ntTSL 3 BASIC10.03□□□□□ -0.8
MsmbO08540 Surf2-201ENSMUST00000015017 1203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.03□□□□□ -0.8
MsmbO08540 Ccdc103-202ENSMUST00000159834 1156 ntTSL 1 (best) BASIC10.03□□□□□ -0.8
MsmbO08540 Smim17-203ENSMUST00000161855 664 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10.03□□□□□ -0.8
MsmbO08540 Ssr4-208ENSMUST00000166518 800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.03□□□□□ -0.8
MsmbO08540 Gm5741-201ENSMUST00000177563 328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.03□□□□□ -0.8
MsmbO08540 Gm45784-201ENSMUST00000188360 142 ntBASIC10.03□□□□□ -0.8
MsmbO08540 Gm43597-201ENSMUST00000201650 1057 ntTSL 3 BASIC10.03□□□□□ -0.8
MsmbO08540 Gm45684-201ENSMUST00000210244 1571 ntBASIC10.03□□□□□ -0.8
MsmbO08540 Dnaaf2-201ENSMUST00000021356 3390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.03□□□□□ -0.8
MsmbO08540 Lsm7-208ENSMUST00000220225 1129 ntTSL 1 (best) BASIC10.03□□□□□ -0.8
MsmbO08540 AC173210.1-201ENSMUST00000222341 1131 ntBASIC10.03□□□□□ -0.8
MsmbO08540 Snx24-201ENSMUST00000025417 994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.03□□□□□ -0.8
MsmbO08540 Polr2a-202ENSMUST00000071213 5799 ntTSL 5 BASIC10.03□□□□□ -0.8
MsmbO08540 Rpl10-202ENSMUST00000074085 855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.03□□□□□ -0.8
MsmbO08540 Gspt1-205ENSMUST00000167571 3716 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.03□□□□□ -0.8
MsmbO08540 Klhl12-201ENSMUST00000027725 3408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.03□□□□□ -0.8
MsmbO08540 Ddx31-201ENSMUST00000113853 3271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.03□□□□□ -0.8
MsmbO08540 Sema7a-201ENSMUST00000043059 3297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.03□□□□□ -0.8
MsmbO08540 Ppp1r13l-201ENSMUST00000047621 3130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.03□□□□□ -0.8
MsmbO08540 Slc6a21-206ENSMUST00000210861 2838 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.03□□□□□ -0.8
MsmbO08540 Phkg1-201ENSMUST00000026617 2374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.03□□□□□ -0.8
MsmbO08540 Esm1-201ENSMUST00000038144 2097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.03□□□□□ -0.8
MsmbO08540 Srsf10-205ENSMUST00000126641 3754 ntTSL 1 (best) BASIC10.03□□□□□ -0.8
MsmbO08540 Madd-209ENSMUST00000111371 5816 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.03□□□□□ -0.8
MsmbO08540 Madd-210ENSMUST00000111372 5813 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.03□□□□□ -0.8
MsmbO08540 Zfp853-202ENSMUST00000212355 2871 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC10.03□□□□□ -0.8
MsmbO08540 Unc45bos-201ENSMUST00000156395 1306 ntTSL 1 (best) BASIC10.03□□□□□ -0.8
MsmbO08540 Map10-201ENSMUST00000053078 3542 ntAPPRIS P1 BASIC10.03□□□□□ -0.8
MsmbO08540 Pdcd6ip-202ENSMUST00000111861 3223 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.03□□□□□ -0.8
MsmbO08540 Snx13-201ENSMUST00000048519 6231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.03□□□□□ -0.8
MsmbO08540 Tle3-204ENSMUST00000159386 4527 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.03□□□□□ -0.8
MsmbO08540 Pnpla5-201ENSMUST00000019012 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.02□□□□□ -0.8
MsmbO08540 Pdlim7-201ENSMUST00000046246 1697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.02□□□□□ -0.8
MsmbO08540 Bhmt2-201ENSMUST00000015941 2467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.02□□□□□ -0.8
MsmbO08540 Tifa-203ENSMUST00000164447 1538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.02□□□□□ -0.8
MsmbO08540 BC039966-201ENSMUST00000141582 1371 ntTSL 1 (best) BASIC10.02□□□□□ -0.8
MsmbO08540 Gngt2-201ENSMUST00000036088 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.02□□□□□ -0.81
MsmbO08540 Tcf4-204ENSMUST00000114978 2437 ntTSL 1 (best) BASIC10.02□□□□□ -0.81
MsmbO08540 Kcnt1-211ENSMUST00000171268 3771 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.02□□□□□ -0.81
MsmbO08540 Ddo-203ENSMUST00000213503 1759 ntTSL 1 (best) BASIC10.02□□□□□ -0.81
MsmbO08540 Zfp157-202ENSMUST00000100524 869 ntTSL 3 BASIC10.02□□□□□ -0.81
MsmbO08540 Lsm2-202ENSMUST00000114011 840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.02□□□□□ -0.81
MsmbO08540 1700012C14Rik-201ENSMUST00000132023 498 ntTSL 1 (best) BASIC10.02□□□□□ -0.81
MsmbO08540 Rdh18-ps-201ENSMUST00000137395 944 ntBASIC10.02□□□□□ -0.81
MsmbO08540 Rdh18-ps-202ENSMUST00000143917 953 ntTSL 1 (best) BASIC10.02□□□□□ -0.81
MsmbO08540 Tldc2-202ENSMUST00000166140 639 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.02□□□□□ -0.81
MsmbO08540 Rwdd3-209ENSMUST00000170781 1111 ntTSL 5 BASIC10.02□□□□□ -0.81
MsmbO08540 Gm4271-201ENSMUST00000174444 973 ntBASIC10.02□□□□□ -0.81
MsmbO08540 Mir6420-201ENSMUST00000185032 102 ntBASIC10.02□□□□□ -0.81
MsmbO08540 1700065I16Rik-202ENSMUST00000185477 813 ntTSL 1 (best) BASIC10.02□□□□□ -0.81
MsmbO08540 2310040G24Rik-202ENSMUST00000189386 775 ntTSL 1 (best) BASIC10.02□□□□□ -0.81
MsmbO08540 Lsmem2-201ENSMUST00000191791 369 ntTSL 3 BASIC10.02□□□□□ -0.81
MsmbO08540 Myl10-202ENSMUST00000196068 911 ntTSL 1 (best) BASIC10.02□□□□□ -0.81
MsmbO08540 Myl10-203ENSMUST00000196436 598 ntTSL 3 BASIC10.02□□□□□ -0.81
MsmbO08540 Dnd1-ps-201ENSMUST00000196992 964 ntBASIC10.02□□□□□ -0.81
MsmbO08540 Gm6458-201ENSMUST00000211573 635 ntBASIC10.02□□□□□ -0.81
MsmbO08540 Rps21-201ENSMUST00000059080 394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.02□□□□□ -0.81
MsmbO08540 Gng8-201ENSMUST00000078182 910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.02□□□□□ -0.81
MsmbO08540 4933431E20Rik-209ENSMUST00000146337 1636 ntTSL 5 BASIC10.02□□□□□ -0.81
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