Protein–RNA interactions for Protein: J3QPX5

Gm8888, Predicted gene 8888, mousemouse

Predictions only

Length 126 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm8888J3QPX5 Diablo-201ENSMUST00000031385 681 ntTSL 2 BASIC11.69□□□□□ -0.54
Gm8888J3QPX5 Dmrtc1c2-201ENSMUST00000087896 1255 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Gm8888J3QPX5 Rubcn-202ENSMUST00000089684 5311 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Gm8888J3QPX5 Gm11725-201ENSMUST00000125607 1850 ntTSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Gm8888J3QPX5 Gstt3-201ENSMUST00000001715 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Gm8888J3QPX5 Dnajb4-204ENSMUST00000144950 2459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Gm8888J3QPX5 Gm4858-202ENSMUST00000194595 1810 ntTSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Gm8888J3QPX5 Gm14342-201ENSMUST00000137629 2119 ntTSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Gm8888J3QPX5 Jrk-201ENSMUST00000050234 5853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Gm8888J3QPX5 Sec23b-201ENSMUST00000028916 2779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Gm8888J3QPX5 Abhd18-202ENSMUST00000108078 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Gm8888J3QPX5 Trp53i11-202ENSMUST00000111266 2703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Gm8888J3QPX5 Cnbp-209ENSMUST00000204890 1614 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
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Gm8888J3QPX5 Pxn-202ENSMUST00000086523 2667 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.68□□□□□ -0.54
Gm8888J3QPX5 Tspan5-202ENSMUST00000119993 2107 ntTSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Gm8888J3QPX5 Sectm1a-203ENSMUST00000106119 1302 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Gm8888J3QPX5 Fancc-201ENSMUST00000073029 3165 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Gm8888J3QPX5 Gabpb1-205ENSMUST00000110424 2613 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Gm8888J3QPX5 Fxyd3-205ENSMUST00000167369 2894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Gm8888J3QPX5 Klhdc7b-201ENSMUST00000166926 1818 ntAPPRIS P2 BASIC11.68□□□□□ -0.54
Gm8888J3QPX5 Pianp-207ENSMUST00000162170 2053 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Gm8888J3QPX5 Zfp467-206ENSMUST00000114561 3619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Gm8888J3QPX5 Secisbp2-201ENSMUST00000040117 3328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Gm8888J3QPX5 Ltc4s-202ENSMUST00000102772 649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
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Gm8888J3QPX5 4930527A07Rik-201ENSMUST00000130677 559 ntTSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
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Gm8888J3QPX5 Gm35911-201ENSMUST00000198837 677 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.68□□□□□ -0.54
Gm8888J3QPX5 Ceacam10-201ENSMUST00000038069 1048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Gm8888J3QPX5 Rps5-201ENSMUST00000004554 761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
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Gm8888J3QPX5 Kifc5c-ps-201ENSMUST00000179040 1530 ntBASIC11.68□□□□□ -0.54
Gm8888J3QPX5 Ntrk2-204ENSMUST00000224259 3049 ntBASIC11.68□□□□□ -0.54
Gm8888J3QPX5 Pfn4-204ENSMUST00000219503 4775 ntTSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Gm8888J3QPX5 E2f7-201ENSMUST00000073781 5473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Gm8888J3QPX5 Tfap2c-202ENSMUST00000099058 2985 ntTSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Gm8888J3QPX5 Ccdc25-201ENSMUST00000022614 2230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
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Gm8888J3QPX5 Runx1-201ENSMUST00000023673 5861 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Gm8888J3QPX5 Atp1a2-201ENSMUST00000085913 6227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
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Gm8888J3QPX5 Pglyrp2-202ENSMUST00000170392 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
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Gm8888J3QPX5 M6pr-201ENSMUST00000007602 2515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
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Gm8888J3QPX5 Trp53-202ENSMUST00000108657 1822 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
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Gm8888J3QPX5 Htr2c-207ENSMUST00000156697 4654 ntTSL 5 BASIC11.67□□□□□ -0.54
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Gm8888J3QPX5 Llgl2-201ENSMUST00000103032 3551 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Gm8888J3QPX5 Asph-202ENSMUST00000078139 6694 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Gm8888J3QPX5 Dus2-201ENSMUST00000034375 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Gm8888J3QPX5 Parp2-201ENSMUST00000036126 1894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Gm8888J3QPX5 Tcf4-210ENSMUST00000128706 2066 ntTSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Gm8888J3QPX5 Armcx1-202ENSMUST00000051256 2253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Gm8888J3QPX5 Usp19-210ENSMUST00000193678 4517 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Gm8888J3QPX5 Zmiz1os1-201ENSMUST00000156682 3469 ntTSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Gm8888J3QPX5 Gm45338-207ENSMUST00000211499 1405 ntTSL 5 BASIC11.67□□□□□ -0.54
Gm8888J3QPX5 Pltp-202ENSMUST00000109316 2226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Gm8888J3QPX5 Zmynd15-201ENSMUST00000039093 2804 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Gm8888J3QPX5 Cyth1-204ENSMUST00000106305 3179 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Gm8888J3QPX5 Rbm14-201ENSMUST00000006625 3165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Gm8888J3QPX5 Plk-ps1-201ENSMUST00000119494 1787 ntBASIC11.67□□□□□ -0.54
Gm8888J3QPX5 Zeb2-201ENSMUST00000028229 5335 ntTSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Gm8888J3QPX5 Ldb3-201ENSMUST00000022327 5119 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Gm8888J3QPX5 Tspan31-201ENSMUST00000060991 1556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Gm8888J3QPX5 Gm18630-201ENSMUST00000222109 1397 ntBASIC11.67□□□□□ -0.54
Gm8888J3QPX5 Grm5-202ENSMUST00000125009 8047 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC11.66□□□□□ -0.54
Gm8888J3QPX5 Gm27194-201ENSMUST00000175753 2936 ntBASIC11.66□□□□□ -0.54
Gm8888J3QPX5 Gcdh-202ENSMUST00000109745 2114 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.66□□□□□ -0.54
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Gm8888J3QPX5 Tfe3-206ENSMUST00000115679 3239 ntTSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Gm8888J3QPX5 Adcyap1r1-208ENSMUST00000172084 1344 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.66□□□□□ -0.54
Gm8888J3QPX5 Pphln1-203ENSMUST00000109256 3759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Gm8888J3QPX5 Sema6d-206ENSMUST00000103239 6225 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC11.66□□□□□ -0.54
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