Protein–RNA interactions for Protein: J3QN17

Gm20918, Predicted gene, 20918, mousemouse

Predictions only

Length 227 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm20918J3QN17 Adck5-207ENSMUST00000160784 1998 ntTSL 5 BASIC10.99□□□□□ -0.65
Gm20918J3QN17 Man1a2-201ENSMUST00000008907 7969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
Gm20918J3QN17 Gm45253-201ENSMUST00000210694 2076 ntTSL 5 BASIC10.99□□□□□ -0.65
Gm20918J3QN17 Mest-202ENSMUST00000124665 2665 ntTSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
Gm20918J3QN17 Smug1-201ENSMUST00000064067 3281 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.99□□□□□ -0.65
Gm20918J3QN17 Nhlh2-203ENSMUST00000198675 3943 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.99□□□□□ -0.65
Gm20918J3QN17 Kcnk16-202ENSMUST00000225596 2127 ntBASIC10.99□□□□□ -0.65
Gm20918J3QN17 Tpm3-rs7-201ENSMUST00000072359 2147 ntAPPRIS P1 BASIC10.99□□□□□ -0.65
Gm20918J3QN17 Fmo1-202ENSMUST00000111518 1506 ntTSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
Gm20918J3QN17 Mamdc4-202ENSMUST00000114223 3998 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.99□□□□□ -0.65
Gm20918J3QN17 Sec23b-201ENSMUST00000028916 2779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
Gm20918J3QN17 Flcn-202ENSMUST00000091246 2768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
Gm20918J3QN17 Calcr-204ENSMUST00000170266 2175 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
Gm20918J3QN17 Cpne1-201ENSMUST00000079312 1683 ntTSL 5 BASIC10.98□□□□□ -0.65
Gm20918J3QN17 Gm26747-201ENSMUST00000180597 1716 ntTSL 5 BASIC10.98□□□□□ -0.65
Gm20918J3QN17 Sh3kbp1-206ENSMUST00000112456 7317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
Gm20918J3QN17 Kiss1r-201ENSMUST00000045529 3163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
Gm20918J3QN17 Ctps2-206ENSMUST00000112303 3289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
Gm20918J3QN17 Tln1-201ENSMUST00000030187 8393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
Gm20918J3QN17 Gm43463-201ENSMUST00000195967 1803 ntBASIC10.98□□□□□ -0.65
Gm20918J3QN17 Washc5-201ENSMUST00000022976 4033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
Gm20918J3QN17 AI661453-202ENSMUST00000150819 4866 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.98□□□□□ -0.65
Gm20918J3QN17 Dnm2-206ENSMUST00000172482 2613 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC10.98□□□□□ -0.65
Gm20918J3QN17 Ap3m2-201ENSMUST00000163739 3417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
Gm20918J3QN17 Nr3c1-201ENSMUST00000025300 4989 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
Gm20918J3QN17 Sidt1-201ENSMUST00000047446 4279 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
Gm20918J3QN17 Kcnt1-201ENSMUST00000037580 5881 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
Gm20918J3QN17 Zbtb16-201ENSMUST00000093852 5114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
Gm20918J3QN17 Tepsin-201ENSMUST00000026442 2752 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
Gm20918J3QN17 Mlh1-201ENSMUST00000035079 2754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
Gm20918J3QN17 Dnajc16-201ENSMUST00000038014 5969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
Gm20918J3QN17 Alppl2-202ENSMUST00000188310 2016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
Gm20918J3QN17 Vps53-204ENSMUST00000129256 650 ntTSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
Gm20918J3QN17 Sumo3-204ENSMUST00000129492 487 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.98□□□□□ -0.65
Gm20918J3QN17 Gm20499-201ENSMUST00000140374 444 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.98□□□□□ -0.65
Gm20918J3QN17 4930456L15Rik-201ENSMUST00000145577 1185 ntTSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
Gm20918J3QN17 Rims3-204ENSMUST00000171363 977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
Gm20918J3QN17 Gm29417-201ENSMUST00000188160 571 ntTSL 5 BASIC10.98□□□□□ -0.65
Gm20918J3QN17 Gm43714-201ENSMUST00000198351 1204 ntTSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
Gm20918J3QN17 Tbc1d17-209ENSMUST00000207293 692 ntTSL 3 BASIC10.98□□□□□ -0.65
Gm20918J3QN17 Gm7730-201ENSMUST00000212486 454 ntBASIC10.98□□□□□ -0.65
Gm20918J3QN17 Zfp36l1-201ENSMUST00000021552 2990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
Gm20918J3QN17 Gm19220-201ENSMUST00000222682 803 ntBASIC10.98□□□□□ -0.65
Gm20918J3QN17 Acbd5-208ENSMUST00000226571 3802 ntAPPRIS ALT2 BASIC10.98□□□□□ -0.65
Gm20918J3QN17 1700020A23Rik-201ENSMUST00000028898 712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
Gm20918J3QN17 Srd5a2-201ENSMUST00000043458 854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
Gm20918J3QN17 Rpl29-201ENSMUST00000059802 710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
Gm20918J3QN17 Grid2ip-203ENSMUST00000120825 3865 ntTSL 5 BASIC10.98□□□□□ -0.65
Gm20918J3QN17 AC117194.1-201ENSMUST00000224847 3002 ntBASIC10.98□□□□□ -0.65
Gm20918J3QN17 Gpatch4-203ENSMUST00000193398 2210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
Gm20918J3QN17 Saa3-202ENSMUST00000210913 2200 ntTSL 3 BASIC10.98□□□□□ -0.65
Gm20918J3QN17 Ttbk1-203ENSMUST00000225808 8926 ntAPPRIS ALT2 BASIC10.98□□□□□ -0.65
Gm20918J3QN17 AC154527.2-201ENSMUST00000225256 1466 ntBASIC10.98□□□□□ -0.65
Gm20918J3QN17 Kdm5b-201ENSMUST00000047714 8714 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
Gm20918J3QN17 Cgnl1-202ENSMUST00000121322 6541 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.98□□□□□ -0.65
Gm20918J3QN17 Slc26a5-201ENSMUST00000030878 2962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
Gm20918J3QN17 Srr-202ENSMUST00000108447 3138 ntTSL 5 BASIC10.98□□□□□ -0.65
Gm20918J3QN17 Gm14149-201ENSMUST00000123048 1853 ntTSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
Gm20918J3QN17 Rcor2-202ENSMUST00000113369 2013 ntTSL 1 (best) BASIC10.97□□□□□ -0.65
Gm20918J3QN17 Tmem254a-204ENSMUST00000185006 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.97□□□□□ -0.65
Gm20918J3QN17 Capn9-201ENSMUST00000093033 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.97□□□□□ -0.65
Gm20918J3QN17 Acer1-201ENSMUST00000056113 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.97□□□□□ -0.65
Gm20918J3QN17 Kcnj12-203ENSMUST00000108717 2463 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.97□□□□□ -0.65
Gm20918J3QN17 Dnajb4-204ENSMUST00000144950 2459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.97□□□□□ -0.65
Gm20918J3QN17 Mest-211ENSMUST00000163949 2561 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.97□□□□□ -0.65
Gm20918J3QN17 Zfp28-201ENSMUST00000081022 4447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.97□□□□□ -0.65
Gm20918J3QN17 Mfap3l-202ENSMUST00000160719 6335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.97□□□□□ -0.65
Gm20918J3QN17 Ip6k1-201ENSMUST00000035214 4559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.97□□□□□ -0.65
Gm20918J3QN17 Il12rb1-201ENSMUST00000000808 2873 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.97□□□□□ -0.65
Gm20918J3QN17 Kcnc1-203ENSMUST00000160433 3156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.97□□□□□ -0.65
Gm20918J3QN17 Map6-201ENSMUST00000068973 3430 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.97□□□□□ -0.65
Gm20918J3QN17 Actn1-201ENSMUST00000021554 3734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.97□□□□□ -0.65
Gm20918J3QN17 Mrto4-202ENSMUST00000102503 1221 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.97□□□□□ -0.65
Gm20918J3QN17 Ccdc69-202ENSMUST00000108880 1020 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.97□□□□□ -0.65
Gm20918J3QN17 Rab4a-201ENSMUST00000117702 1080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.97□□□□□ -0.65
Gm20918J3QN17 Gm15920-201ENSMUST00000118998 402 ntBASIC10.97□□□□□ -0.65
Gm20918J3QN17 Rpl17-ps5-201ENSMUST00000121001 555 ntBASIC10.97□□□□□ -0.65
Gm20918J3QN17 Gm16342-201ENSMUST00000124025 1025 ntBASIC10.97□□□□□ -0.65
Gm20918J3QN17 Gm26894-201ENSMUST00000180828 1134 ntTSL 1 (best) BASIC10.97□□□□□ -0.65
Gm20918J3QN17 4930448I06Rik-201ENSMUST00000194002 546 ntTSL 1 (best) BASIC10.97□□□□□ -0.65
Gm20918J3QN17 Pomc-202ENSMUST00000218089 977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.97□□□□□ -0.65
Gm20918J3QN17 AC173210.1-201ENSMUST00000222341 1131 ntBASIC10.97□□□□□ -0.65
Gm20918J3QN17 Leap2-201ENSMUST00000036045 531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.97□□□□□ -0.65
Gm20918J3QN17 Ins1-201ENSMUST00000039652 1016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.97□□□□□ -0.65
Gm20918J3QN17 Cited1-201ENSMUST00000050551 901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.97□□□□□ -0.65
Gm20918J3QN17 Rgs6-204ENSMUST00000185674 1362 ntTSL 5 BASIC10.97□□□□□ -0.65
Gm20918J3QN17 Cnmd-201ENSMUST00000022603 1433 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.97□□□□□ -0.65
Gm20918J3QN17 Wisp3-201ENSMUST00000076713 1419 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.97□□□□□ -0.65
Gm20918J3QN17 Fam83h-201ENSMUST00000060807 4502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.97□□□□□ -0.65
Gm20918J3QN17 Gm36864-203ENSMUST00000223070 1513 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC10.97□□□□□ -0.65
Gm20918J3QN17 Celrr-202ENSMUST00000181433 1561 ntTSL 1 (best) BASIC10.97□□□□□ -0.65
Gm20918J3QN17 Slitrk5-201ENSMUST00000042767 4831 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.97□□□□□ -0.65
Gm20918J3QN17 Hpcal4-202ENSMUST00000106246 1627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.97□□□□□ -0.65
Gm20918J3QN17 Zfp354c-202ENSMUST00000109135 5325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.97□□□□□ -0.65
Gm20918J3QN17 Ddx39b-202ENSMUST00000172549 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.97□□□□□ -0.65
Gm20918J3QN17 Ctbp2-209ENSMUST00000166439 1997 ntTSL 1 (best) BASIC10.97□□□□□ -0.65
Gm20918J3QN17 Asl-202ENSMUST00000159619 2088 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.97□□□□□ -0.65
Gm20918J3QN17 Bbof1-201ENSMUST00000081828 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.97□□□□□ -0.65
Gm20918J3QN17 Wdr81-204ENSMUST00000173320 6908 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.97□□□□□ -0.65
Gm20918J3QN17 Ccdc126-202ENSMUST00000114491 2372 ntTSL 5 BASIC10.97□□□□□ -0.65
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 35.4 ms