Protein–RNA interactions for Protein: J3KMI0

Gm20815, Predicted gene, 20815, mousemouse

Predictions only

Length 227 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm20815J3KMI0 Stx17-201ENSMUST00000064765 1531 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.95□□□□□ -0.66
Gm20815J3KMI0 Acly-203ENSMUST00000107389 4426 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.95□□□□□ -0.66
Gm20815J3KMI0 Rapsn-202ENSMUST00000111445 1450 ntTSL 5 BASIC10.95□□□□□ -0.66
Gm20815J3KMI0 Apol7a-201ENSMUST00000010745 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.95□□□□□ -0.66
Gm20815J3KMI0 Ccdc126-202ENSMUST00000114491 2372 ntTSL 5 BASIC10.95□□□□□ -0.66
Gm20815J3KMI0 Msh4-201ENSMUST00000005630 3325 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.95□□□□□ -0.66
Gm20815J3KMI0 Pprc1-201ENSMUST00000062322 5205 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.95□□□□□ -0.66
Gm20815J3KMI0 Armc7-201ENSMUST00000035240 2260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.95□□□□□ -0.66
Gm20815J3KMI0 Rtn4-203ENSMUST00000102841 4060 ntTSL 1 (best) BASIC10.95□□□□□ -0.66
Gm20815J3KMI0 Ccdc71-201ENSMUST00000061209 3092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.95□□□□□ -0.66
Gm20815J3KMI0 Slco4a1-202ENSMUST00000038259 3010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.95□□□□□ -0.66
Gm20815J3KMI0 Pmvk-202ENSMUST00000107410 652 ntTSL 5 BASIC10.95□□□□□ -0.66
Gm20815J3KMI0 Mrps17-202ENSMUST00000118420 843 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.95□□□□□ -0.66
Gm20815J3KMI0 Gm6447-201ENSMUST00000118905 835 ntBASIC10.95□□□□□ -0.66
Gm20815J3KMI0 Tspan5-202ENSMUST00000119993 2107 ntTSL 1 (best) BASIC10.95□□□□□ -0.66
Gm20815J3KMI0 Htr2c-207ENSMUST00000156697 4654 ntTSL 5 BASIC10.95□□□□□ -0.66
Gm20815J3KMI0 Gm24694-201ENSMUST00000180054 110 ntBASIC10.95□□□□□ -0.66
Gm20815J3KMI0 Mir8102-201ENSMUST00000184148 139 ntBASIC10.95□□□□□ -0.66
Gm20815J3KMI0 Gm27663-201ENSMUST00000184839 110 ntBASIC10.95□□□□□ -0.66
Gm20815J3KMI0 Gm28237-202ENSMUST00000189477 748 ntTSL 1 (best) BASIC10.95□□□□□ -0.66
Gm20815J3KMI0 2900022M07Rik-201ENSMUST00000193912 1017 ntBASIC10.95□□□□□ -0.66
Gm20815J3KMI0 Gm4610-201ENSMUST00000198222 905 ntTSL 5 BASIC10.95□□□□□ -0.66
Gm20815J3KMI0 Gm40193-201ENSMUST00000209971 237 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.95□□□□□ -0.66
Gm20815J3KMI0 Myl6-205ENSMUST00000217969 608 ntTSL 2 BASIC10.95□□□□□ -0.66
Gm20815J3KMI0 Med10-201ENSMUST00000022089 913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.95□□□□□ -0.66
Gm20815J3KMI0 Sftpa1-201ENSMUST00000022314 851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.95□□□□□ -0.66
Gm20815J3KMI0 Erp29-201ENSMUST00000052590 1123 ntTSL 1 (best) BASIC10.95□□□□□ -0.66
Gm20815J3KMI0 Klhl26-201ENSMUST00000066597 2991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.95□□□□□ -0.66
Gm20815J3KMI0 Hist1h2al-201ENSMUST00000091708 339 ntBASIC10.95□□□□□ -0.66
Gm20815J3KMI0 Gm43045-201ENSMUST00000198725 2095 ntBASIC10.95□□□□□ -0.66
Gm20815J3KMI0 Bcat2-203ENSMUST00000209204 2081 ntTSL 1 (best) BASIC10.95□□□□□ -0.66
Gm20815J3KMI0 Strada-201ENSMUST00000007444 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.95□□□□□ -0.66
Gm20815J3KMI0 Zfp385c-201ENSMUST00000103119 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.95□□□□□ -0.66
Gm20815J3KMI0 Slc7a15-201ENSMUST00000036938 1907 ntTSL 1 (best) BASIC10.95□□□□□ -0.66
Gm20815J3KMI0 Otud7b-201ENSMUST00000035519 8043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.95□□□□□ -0.66
Gm20815J3KMI0 Colgalt2-201ENSMUST00000044311 4093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.95□□□□□ -0.66
Gm20815J3KMI0 Gm27196-201ENSMUST00000184787 2582 ntBASIC10.95□□□□□ -0.66
Gm20815J3KMI0 Slc39a9-208ENSMUST00000219706 5427 ntTSL 1 (best) BASIC10.95□□□□□ -0.66
Gm20815J3KMI0 Hpse2-201ENSMUST00000099428 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.95□□□□□ -0.66
Gm20815J3KMI0 Gm37324-201ENSMUST00000194500 4504 ntBASIC10.95□□□□□ -0.66
Gm20815J3KMI0 Tjap1-201ENSMUST00000012440 2426 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.95□□□□□ -0.66
Gm20815J3KMI0 Sh3bp5l-202ENSMUST00000116376 3016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.95□□□□□ -0.66
Gm20815J3KMI0 B4galnt3-203ENSMUST00000212457 2958 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.95□□□□□ -0.66
Gm20815J3KMI0 Kifc1-201ENSMUST00000114361 2260 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.95□□□□□ -0.66
Gm20815J3KMI0 Hsd3b4-202ENSMUST00000196861 1610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.95□□□□□ -0.66
Gm20815J3KMI0 Gm10681-201ENSMUST00000058728 1610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.95□□□□□ -0.66
Gm20815J3KMI0 Gm3052-202ENSMUST00000188254 2224 ntBASIC10.94□□□□□ -0.66
Gm20815J3KMI0 Sec23b-201ENSMUST00000028916 2779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.94□□□□□ -0.66
Gm20815J3KMI0 Gm36864-203ENSMUST00000223070 1513 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC10.94□□□□□ -0.66
Gm20815J3KMI0 Slc25a25-205ENSMUST00000113310 3278 ntTSL 1 (best) BASIC10.94□□□□□ -0.66
Gm20815J3KMI0 Ahsg-201ENSMUST00000023583 1474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.94□□□□□ -0.66
Gm20815J3KMI0 Ptpru-201ENSMUST00000030741 4416 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.94□□□□□ -0.66
Gm20815J3KMI0 Gpr35-205ENSMUST00000186298 2647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.94□□□□□ -0.66
Gm20815J3KMI0 Zfp536-203ENSMUST00000176114 4341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.94□□□□□ -0.66
Gm20815J3KMI0 Gm17435-202ENSMUST00000212699 1998 ntBASIC10.94□□□□□ -0.66
Gm20815J3KMI0 Zbtb20-201ENSMUST00000079441 3086 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC10.94□□□□□ -0.66
Gm20815J3KMI0 Brd3-202ENSMUST00000077737 5272 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.94□□□□□ -0.66
Gm20815J3KMI0 Lpar5-201ENSMUST00000088292 1393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.94□□□□□ -0.66
Gm20815J3KMI0 Tmem104-202ENSMUST00000100235 4561 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.94□□□□□ -0.66
Gm20815J3KMI0 Tmem104-201ENSMUST00000061450 4564 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.94□□□□□ -0.66
Gm20815J3KMI0 Stx11-202ENSMUST00000163425 4032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.94□□□□□ -0.66
Gm20815J3KMI0 Gm11978-202ENSMUST00000127510 1303 ntTSL 1 (best) BASIC10.94□□□□□ -0.66
Gm20815J3KMI0 Unc45bos-201ENSMUST00000156395 1306 ntTSL 1 (best) BASIC10.94□□□□□ -0.66
Gm20815J3KMI0 Lmntd1-201ENSMUST00000111706 2350 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.94□□□□□ -0.66
Gm20815J3KMI0 Cdc42se1-201ENSMUST00000053872 2805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.94□□□□□ -0.66
Gm20815J3KMI0 Commd6-201ENSMUST00000100339 1090 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.94□□□□□ -0.66
Gm20815J3KMI0 Gm12416-201ENSMUST00000120911 1008 ntBASIC10.94□□□□□ -0.66
Gm20815J3KMI0 Mvk-203ENSMUST00000124260 1051 ntTSL 5 BASIC10.94□□□□□ -0.66
Gm20815J3KMI0 Haghl-203ENSMUST00000133071 1128 ntTSL 1 (best) BASIC10.94□□□□□ -0.66
Gm20815J3KMI0 Btf3-204ENSMUST00000134542 780 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.94□□□□□ -0.66
Gm20815J3KMI0 Ncr3-ps-201ENSMUST00000134687 525 ntBASIC10.94□□□□□ -0.66
Gm20815J3KMI0 Gm12840-201ENSMUST00000156081 627 ntTSL 5 BASIC10.94□□□□□ -0.66
Gm20815J3KMI0 Mir6956-201ENSMUST00000183598 62 ntBASIC10.94□□□□□ -0.66
Gm20815J3KMI0 Timm13-203ENSMUST00000218481 471 ntTSL 3 BASIC10.94□□□□□ -0.66
Gm20815J3KMI0 AC132863.2-201ENSMUST00000226643 799 ntBASIC10.94□□□□□ -0.66
Gm20815J3KMI0 Hrasls5-201ENSMUST00000025929 1063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.94□□□□□ -0.66
Gm20815J3KMI0 Exosc7-201ENSMUST00000026891 1053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.94□□□□□ -0.66
Gm20815J3KMI0 Mlf1-202ENSMUST00000077916 1114 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.94□□□□□ -0.66
Gm20815J3KMI0 Gm26841-201ENSMUST00000180725 1787 ntTSL 1 (best) BASIC10.94□□□□□ -0.66
Gm20815J3KMI0 4933406P04Rik-201ENSMUST00000092680 1789 ntBASIC10.94□□□□□ -0.66
Gm20815J3KMI0 Gm43417-201ENSMUST00000201586 5207 ntBASIC10.94□□□□□ -0.66
Gm20815J3KMI0 E130308A19Rik-201ENSMUST00000052420 3205 ntTSL 1 (best) BASIC10.94□□□□□ -0.66
Gm20815J3KMI0 Ldb3-201ENSMUST00000022327 5119 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.94□□□□□ -0.66
Gm20815J3KMI0 Lztr1-201ENSMUST00000023444 3112 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.94□□□□□ -0.66
Gm20815J3KMI0 F630040K05Rik-202ENSMUST00000180558 2633 ntTSL 1 (best) BASIC10.94□□□□□ -0.66
Gm20815J3KMI0 Tspan9-202ENSMUST00000112171 2584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.94□□□□□ -0.66
Gm20815J3KMI0 Mest-211ENSMUST00000163949 2561 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.94□□□□□ -0.66
Gm20815J3KMI0 Elp4-202ENSMUST00000122965 3048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.94□□□□□ -0.66
Gm20815J3KMI0 Dysf-205ENSMUST00000113823 6578 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.94□□□□□ -0.66
Gm20815J3KMI0 Hjurp-206ENSMUST00000147393 2030 ntTSL 1 (best) BASIC10.94□□□□□ -0.66
Gm20815J3KMI0 Zfp954-201ENSMUST00000056246 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.94□□□□□ -0.66
Gm20815J3KMI0 Nrf1-209ENSMUST00000115209 2406 ntTSL 5 BASIC10.94□□□□□ -0.66
Gm20815J3KMI0 Ak4-202ENSMUST00000106945 4175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.94□□□□□ -0.66
Gm20815J3KMI0 Lrrc20-201ENSMUST00000049242 3216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.94□□□□□ -0.66
Gm20815J3KMI0 Madd-203ENSMUST00000075269 5756 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.94□□□□□ -0.66
Gm20815J3KMI0 Duox1-201ENSMUST00000099461 5267 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.93□□□□□ -0.66
Gm20815J3KMI0 Orc6-202ENSMUST00000170141 1466 ntTSL 1 (best) BASIC10.93□□□□□ -0.66
Gm20815J3KMI0 Msi2-203ENSMUST00000107909 6436 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.93□□□□□ -0.66
Gm20815J3KMI0 Runx1-201ENSMUST00000023673 5861 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.93□□□□□ -0.66
Gm20815J3KMI0 Slc7a6-201ENSMUST00000034378 3750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.93□□□□□ -0.66
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