Protein–RNA interactions for Protein: G5E8Z2

Taf4b, Transcription initiation factor TFIID subunit 4B, mousemouse

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Length 855 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Taf4bG5E8Z2 Gm5741-201ENSMUST00000177563 328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.26□□□□□ -0.13
Taf4bG5E8Z2 Gm27839-201ENSMUST00000184242 106 ntBASIC14.26□□□□□ -0.13
Taf4bG5E8Z2 1700094J05Rik-202ENSMUST00000190491 997 ntTSL 1 (best) BASIC14.26□□□□□ -0.13
Taf4bG5E8Z2 Dera-204ENSMUST00000203216 688 ntTSL 5 BASIC14.26□□□□□ -0.13
Taf4bG5E8Z2 Gm6458-201ENSMUST00000211573 635 ntBASIC14.26□□□□□ -0.13
Taf4bG5E8Z2 Degs2-201ENSMUST00000021691 1287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.26□□□□□ -0.13
Taf4bG5E8Z2 Ins2-201ENSMUST00000000220 478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.26□□□□□ -0.13
Taf4bG5E8Z2 Timm10-201ENSMUST00000028470 690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.26□□□□□ -0.13
Taf4bG5E8Z2 Upk2-201ENSMUST00000047740 1083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.26□□□□□ -0.13
Taf4bG5E8Z2 Nkiras2-202ENSMUST00000051947 831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.26□□□□□ -0.13
Taf4bG5E8Z2 Iqcf4-201ENSMUST00000085111 756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.26□□□□□ -0.13
Taf4bG5E8Z2 Gm6091-201ENSMUST00000098307 165 ntBASIC14.26□□□□□ -0.13
Taf4bG5E8Z2 Zyx-202ENSMUST00000164375 3188 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.26□□□□□ -0.13
Taf4bG5E8Z2 Whamm-203ENSMUST00000209044 1879 ntTSL 1 (best) BASIC14.26□□□□□ -0.13
Taf4bG5E8Z2 Trpm4-209ENSMUST00000211743 3673 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.26□□□□□ -0.13
Taf4bG5E8Z2 Eps8l1-214ENSMUST00000171445 2975 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.26□□□□□ -0.13
Taf4bG5E8Z2 Ispd-205ENSMUST00000221895 4022 ntTSL 1 (best) BASIC14.26□□□□□ -0.13
Taf4bG5E8Z2 Ifi47-201ENSMUST00000046704 1690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.26□□□□□ -0.13
Taf4bG5E8Z2 Tufm-201ENSMUST00000098048 1679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.26□□□□□ -0.13
Taf4bG5E8Z2 Ankrd42-202ENSMUST00000118157 2782 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.26□□□□□ -0.13
Taf4bG5E8Z2 Gm36500-201ENSMUST00000221821 1626 ntTSL 5 BASIC14.26□□□□□ -0.13
Taf4bG5E8Z2 Pir-201ENSMUST00000033749 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.26□□□□□ -0.13
Taf4bG5E8Z2 Zranb2-201ENSMUST00000029831 2540 ntTSL 5 BASIC14.25□□□□□ -0.13
Taf4bG5E8Z2 Zfyve28-201ENSMUST00000094868 3983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.25□□□□□ -0.13
Taf4bG5E8Z2 Bhmt-201ENSMUST00000099309 2490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.25□□□□□ -0.13
Taf4bG5E8Z2 Trip4-201ENSMUST00000117083 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.25□□□□□ -0.13
Taf4bG5E8Z2 B3gat1-204ENSMUST00000160899 3801 ntTSL 1 (best) BASIC14.25□□□□□ -0.13
Taf4bG5E8Z2 Dlgap4-201ENSMUST00000000094 1411 ntTSL 5 BASIC14.25□□□□□ -0.13
Taf4bG5E8Z2 Ggnbp1-203ENSMUST00000133257 5012 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.25□□□□□ -0.13
Taf4bG5E8Z2 Pcdhb18-201ENSMUST00000055949 5041 ntAPPRIS P1 BASIC14.25□□□□□ -0.13
Taf4bG5E8Z2 Gm1661-203ENSMUST00000165128 1837 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.25□□□□□ -0.13
Taf4bG5E8Z2 Xndc1-201ENSMUST00000094130 2298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.25□□□□□ -0.13
Taf4bG5E8Z2 Zfp575-201ENSMUST00000094705 2741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.25□□□□□ -0.13
Taf4bG5E8Z2 Gm26525-201ENSMUST00000180666 3616 ntTSL 1 (best) BASIC14.25□□□□□ -0.13
Taf4bG5E8Z2 Gm26867-201ENSMUST00000180963 3615 ntTSL 1 (best) BASIC14.25□□□□□ -0.13
Taf4bG5E8Z2 Eif5-202ENSMUST00000166123 4050 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.25□□□□□ -0.13
Taf4bG5E8Z2 Smg5-201ENSMUST00000001451 4448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.25□□□□□ -0.13
Taf4bG5E8Z2 Sec62-201ENSMUST00000029256 3967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.25□□□□□ -0.13
Taf4bG5E8Z2 Zfhx2os-202ENSMUST00000183750 4375 ntTSL 1 (best) BASIC14.25□□□□□ -0.13
Taf4bG5E8Z2 Mlx-203ENSMUST00000107303 1736 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.25□□□□□ -0.13
Taf4bG5E8Z2 Gcdh-202ENSMUST00000109745 2114 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.25□□□□□ -0.13
Taf4bG5E8Z2 Alkbh2-202ENSMUST00000112279 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.25□□□□□ -0.13
Taf4bG5E8Z2 Pisd-ps1-201ENSMUST00000119128 1115 ntBASIC14.25□□□□□ -0.13
Taf4bG5E8Z2 Gm12291-201ENSMUST00000121627 311 ntBASIC14.25□□□□□ -0.13
Taf4bG5E8Z2 S100a14-201ENSMUST00000164481 915 ntTSL 2 BASIC14.25□□□□□ -0.13
Taf4bG5E8Z2 1700065I16Rik-202ENSMUST00000185477 813 ntTSL 1 (best) BASIC14.25□□□□□ -0.13
Taf4bG5E8Z2 Majin-201ENSMUST00000025699 1239 ntTSL 1 (best) BASIC14.25□□□□□ -0.13
Taf4bG5E8Z2 Kars-202ENSMUST00000093120 2131 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.25□□□□□ -0.13
Taf4bG5E8Z2 Ctdspl2-204ENSMUST00000110578 3386 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.25□□□□□ -0.13
Taf4bG5E8Z2 Cacnb4-206ENSMUST00000178799 7981 ntTSL 5 BASIC14.25□□□□□ -0.13
Taf4bG5E8Z2 Tmem51os1-203ENSMUST00000150202 1667 ntTSL 1 (best) BASIC14.25□□□□□ -0.13
Taf4bG5E8Z2 Gm8798-201ENSMUST00000211877 1661 ntBASIC14.25□□□□□ -0.13
Taf4bG5E8Z2 Cwc27-201ENSMUST00000022228 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.25□□□□□ -0.13
Taf4bG5E8Z2 Tnpo2-202ENSMUST00000166592 4884 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.25□□□□□ -0.13
Taf4bG5E8Z2 Lag3-201ENSMUST00000032217 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.25□□□□□ -0.13
Taf4bG5E8Z2 Llgl2-201ENSMUST00000103032 3551 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.25□□□□□ -0.13
Taf4bG5E8Z2 Gm10433-202ENSMUST00000146364 1984 ntTSL 2 BASIC14.25□□□□□ -0.13
Taf4bG5E8Z2 Chfr-201ENSMUST00000014812 3146 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.25□□□□□ -0.13
Taf4bG5E8Z2 Ptgir-201ENSMUST00000086101 2725 ntTSL 1 (best) BASIC14.25□□□□□ -0.13
Taf4bG5E8Z2 Cngb1-201ENSMUST00000093268 1512 ntTSL 1 (best) BASIC14.25□□□□□ -0.13
Taf4bG5E8Z2 Vrtn-201ENSMUST00000095551 3028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.25□□□□□ -0.13
Taf4bG5E8Z2 Trappc12-201ENSMUST00000020954 3377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.25□□□□□ -0.13
Taf4bG5E8Z2 Rasal3-201ENSMUST00000063824 3681 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.25□□□□□ -0.13
Taf4bG5E8Z2 Cep97-202ENSMUST00000117468 2887 ntTSL 1 (best) BASIC14.24□□□□□ -0.13
Taf4bG5E8Z2 Sirt4-201ENSMUST00000112066 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.24□□□□□ -0.13
Taf4bG5E8Z2 Gm10392-201ENSMUST00000100807 1732 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.24□□□□□ -0.13
Taf4bG5E8Z2 Cd80-201ENSMUST00000099816 1701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.24□□□□□ -0.13
Taf4bG5E8Z2 Hsd17b6-201ENSMUST00000026462 1392 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.24□□□□□ -0.13
Taf4bG5E8Z2 Ntrk2-204ENSMUST00000224259 3049 ntBASIC14.24□□□□□ -0.13
Taf4bG5E8Z2 Ablim2-209ENSMUST00000129347 1995 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.24□□□□□ -0.13
Taf4bG5E8Z2 Slc36a1-202ENSMUST00000108867 1611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.24□□□□□ -0.13
Taf4bG5E8Z2 Actn4-211ENSMUST00000217157 3530 ntTSL 5 BASIC14.24□□□□□ -0.13
Taf4bG5E8Z2 Pias3-202ENSMUST00000107076 2858 ntTSL 1 (best) BASIC14.24□□□□□ -0.13
Taf4bG5E8Z2 Kifc3-202ENSMUST00000169353 2898 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.24□□□□□ -0.13
Taf4bG5E8Z2 Anapc15-204ENSMUST00000106973 650 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.24□□□□□ -0.13
Taf4bG5E8Z2 Lsm2-202ENSMUST00000114011 840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.24□□□□□ -0.13
Taf4bG5E8Z2 Gm14921-201ENSMUST00000118643 908 ntBASIC14.24□□□□□ -0.13
Taf4bG5E8Z2 Gm12539-201ENSMUST00000121549 1098 ntBASIC14.24□□□□□ -0.13
Taf4bG5E8Z2 Pfdn6-205ENSMUST00000174426 396 ntTSL 2 BASIC14.24□□□□□ -0.13
Taf4bG5E8Z2 Zc3h18-201ENSMUST00000017622 3810 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.24□□□□□ -0.13
Taf4bG5E8Z2 Gm9061-201ENSMUST00000182707 1006 ntBASIC14.24□□□□□ -0.13
Taf4bG5E8Z2 Asb1-205ENSMUST00000188081 1272 ntTSL 1 (best) BASIC14.24□□□□□ -0.13
Taf4bG5E8Z2 Gm38230-201ENSMUST00000193572 1159 ntBASIC14.24□□□□□ -0.13
Taf4bG5E8Z2 9130604C24Rik-201ENSMUST00000197965 956 ntBASIC14.24□□□□□ -0.13
Taf4bG5E8Z2 Polr2h-201ENSMUST00000021405 950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.24□□□□□ -0.13
Taf4bG5E8Z2 Chd3os-203ENSMUST00000218008 1026 ntTSL 1 (best) BASIC14.24□□□□□ -0.13
Taf4bG5E8Z2 Otud6a-201ENSMUST00000060241 873 ntAPPRIS P1 BASIC14.24□□□□□ -0.13
Taf4bG5E8Z2 Haus7-202ENSMUST00000077243 1032 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.24□□□□□ -0.13
Taf4bG5E8Z2 Ap2s1-201ENSMUST00000086112 836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.24□□□□□ -0.13
Taf4bG5E8Z2 Dmrtc1c2-201ENSMUST00000087896 1255 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.24□□□□□ -0.13
Taf4bG5E8Z2 S100a16-201ENSMUST00000098910 1123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.24□□□□□ -0.13
Taf4bG5E8Z2 Armcx1-206ENSMUST00000113201 2228 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.24□□□□□ -0.13
Taf4bG5E8Z2 Rbm47-206ENSMUST00000200775 3180 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.24□□□□□ -0.13
Taf4bG5E8Z2 Cavin1-201ENSMUST00000060792 3491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.24□□□□□ -0.13
Taf4bG5E8Z2 Gm5385-201ENSMUST00000118988 1559 ntBASIC14.24□□□□□ -0.13
Taf4bG5E8Z2 Srrm1-202ENSMUST00000084846 3740 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.24□□□□□ -0.13
Taf4bG5E8Z2 C5ar1-201ENSMUST00000050770 2481 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.24□□□□□ -0.13
Taf4bG5E8Z2 Gpr12-203ENSMUST00000197431 1455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.24□□□□□ -0.13
Taf4bG5E8Z2 Dhx30-201ENSMUST00000062368 3806 ntTSL 1 (best) BASIC14.24□□□□□ -0.13
Taf4bG5E8Z2 Prkcd-202ENSMUST00000112202 2005 ntTSL 1 (best) BASIC14.24□□□□□ -0.13
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