Protein–RNA interactions for Protein: F7BCN9

Gm28038, Predicted gene, 28038 (Fragment), mousemouse

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Length 126 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm28038F7BCN9 Nudt18-202ENSMUST00000228554 3619 ntBASIC9.76□□□□□ -0.85
Gm28038F7BCN9 Zeb2-202ENSMUST00000068415 5624 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.76□□□□□ -0.85
Gm28038F7BCN9 Trav3-1-201ENSMUST00000103569 385 ntAPPRIS P1 BASIC9.76□□□□□ -0.85
Gm28038F7BCN9 Trav3-4-201ENSMUST00000103670 458 ntAPPRIS P1 BASIC9.76□□□□□ -0.85
Gm28038F7BCN9 Rab1a-202ENSMUST00000109601 1200 ntTSL 5 BASIC9.76□□□□□ -0.85
Gm28038F7BCN9 Crybb3-204ENSMUST00000119627 828 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC9.76□□□□□ -0.85
Gm28038F7BCN9 Gm13385-201ENSMUST00000121089 220 ntBASIC9.76□□□□□ -0.85
Gm28038F7BCN9 Gm14822-201ENSMUST00000122247 291 ntBASIC9.76□□□□□ -0.85
Gm28038F7BCN9 Gm12264-201ENSMUST00000123949 500 ntTSL 1 (best) BASIC9.76□□□□□ -0.85
Gm28038F7BCN9 Pcp2-203ENSMUST00000133459 470 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.76□□□□□ -0.85
Gm28038F7BCN9 Psmb1-201ENSMUST00000014913 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.76□□□□□ -0.85
Gm28038F7BCN9 Gm20481-201ENSMUST00000173680 564 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC9.76□□□□□ -0.85
Gm28038F7BCN9 Zc3h18-201ENSMUST00000017622 3810 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC9.76□□□□□ -0.85
Gm28038F7BCN9 Gm9824-201ENSMUST00000178707 561 ntBASIC9.76□□□□□ -0.85
Gm28038F7BCN9 Gm6546-201ENSMUST00000192096 766 ntBASIC9.76□□□□□ -0.85
Gm28038F7BCN9 Prok2-204ENSMUST00000203738 695 ntTSL 1 (best) BASIC9.76□□□□□ -0.85
Gm28038F7BCN9 5830408C22Rik-201ENSMUST00000210072 1115 ntTSL 5 BASIC9.76□□□□□ -0.85
Gm28038F7BCN9 AC154595.1-201ENSMUST00000225533 1059 ntBASIC9.76□□□□□ -0.85
Gm28038F7BCN9 Lce1g-201ENSMUST00000029527 925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.76□□□□□ -0.85
Gm28038F7BCN9 Pcp2-201ENSMUST00000004749 495 ntTSL 1 (best) BASIC9.76□□□□□ -0.85
Gm28038F7BCN9 Fn3k-202ENSMUST00000092302 1803 ntTSL 1 (best) BASIC9.76□□□□□ -0.85
Gm28038F7BCN9 Dmbt1-201ENSMUST00000084509 6243 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.76□□□□□ -0.85
Gm28038F7BCN9 Xkr8-201ENSMUST00000045550 4245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.76□□□□□ -0.85
Gm28038F7BCN9 Pde1c-209ENSMUST00000203372 3147 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.76□□□□□ -0.85
Gm28038F7BCN9 Cpeb1-201ENSMUST00000098331 3111 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.76□□□□□ -0.85
Gm28038F7BCN9 Pitpnm2-201ENSMUST00000086123 6620 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.76□□□□□ -0.85
Gm28038F7BCN9 Iqcm-203ENSMUST00000212704 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.76□□□□□ -0.85
Gm28038F7BCN9 Dhrs1-201ENSMUST00000002403 1477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.76□□□□□ -0.85
Gm28038F7BCN9 Klhl26-201ENSMUST00000066597 2991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.76□□□□□ -0.85
Gm28038F7BCN9 Trappc2l-201ENSMUST00000015157 1659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.76□□□□□ -0.85
Gm28038F7BCN9 Pnpla5-201ENSMUST00000019012 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.76□□□□□ -0.85
Gm28038F7BCN9 Acer1-201ENSMUST00000056113 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.76□□□□□ -0.85
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Gm28038F7BCN9 Slc12a8-206ENSMUST00000122427 2070 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.76□□□□□ -0.85
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Gm28038F7BCN9 Nap1l1-208ENSMUST00000219961 1512 ntTSL 1 (best) BASIC9.76□□□□□ -0.85
Gm28038F7BCN9 Hoxd3os1-202ENSMUST00000139005 1701 ntTSL 1 (best) BASIC9.76□□□□□ -0.85
Gm28038F7BCN9 Gm20687-203ENSMUST00000185121 4242 ntTSL 2 BASIC9.76□□□□□ -0.85
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Gm28038F7BCN9 Actn1-201ENSMUST00000021554 3734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.76□□□□□ -0.85
Gm28038F7BCN9 Ptx4-201ENSMUST00000054930 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.75□□□□□ -0.85
Gm28038F7BCN9 Abo-201ENSMUST00000102900 1779 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.75□□□□□ -0.85
Gm28038F7BCN9 Mlh1-201ENSMUST00000035079 2754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.75□□□□□ -0.85
Gm28038F7BCN9 Wnt5a-201ENSMUST00000063465 7010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.75□□□□□ -0.85
Gm28038F7BCN9 Rasa3-201ENSMUST00000117551 4404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.75□□□□□ -0.85
Gm28038F7BCN9 Glis3-202ENSMUST00000112612 3016 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.75□□□□□ -0.85
Gm28038F7BCN9 Stard5-202ENSMUST00000117410 2832 ntTSL 1 (best) BASIC9.75□□□□□ -0.85
Gm28038F7BCN9 Phrf1-202ENSMUST00000122143 4864 ntTSL 1 (best) BASIC9.75□□□□□ -0.85
Gm28038F7BCN9 Fbxo46-201ENSMUST00000053109 4873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.75□□□□□ -0.85
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Gm28038F7BCN9 Zmiz1os1-201ENSMUST00000156682 3469 ntTSL 1 (best) BASIC9.75□□□□□ -0.85
Gm28038F7BCN9 Pcid2-201ENSMUST00000164416 2860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.75□□□□□ -0.85
Gm28038F7BCN9 Phf21a-206ENSMUST00000111292 2461 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.75□□□□□ -0.85
Gm28038F7BCN9 Armc6-201ENSMUST00000019679 2263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.75□□□□□ -0.85
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Gm28038F7BCN9 2810047C21Rik1-202ENSMUST00000210322 1179 ntTSL 1 (best) BASIC9.75□□□□□ -0.85
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Gm28038F7BCN9 Gm19395-201ENSMUST00000219618 646 ntTSL 1 (best) BASIC9.75□□□□□ -0.85
Gm28038F7BCN9 AC124549.3-201ENSMUST00000225541 367 ntBASIC9.75□□□□□ -0.85
Gm28038F7BCN9 AC154838.2-201ENSMUST00000226602 747 ntBASIC9.75□□□□□ -0.85
Gm28038F7BCN9 Chchd10-201ENSMUST00000058906 939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.75□□□□□ -0.85
Gm28038F7BCN9 Gm20445-201ENSMUST00000061905 565 ntBASIC9.75□□□□□ -0.85
Gm28038F7BCN9 Nagk-202ENSMUST00000113850 1918 ntTSL 5 BASIC9.75□□□□□ -0.85
Gm28038F7BCN9 Kif2a-206ENSMUST00000159772 2570 ntTSL 5 BASIC9.75□□□□□ -0.85
Gm28038F7BCN9 Srms-201ENSMUST00000016498 2562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.75□□□□□ -0.85
Gm28038F7BCN9 Prss8-202ENSMUST00000206124 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.75□□□□□ -0.85
Gm28038F7BCN9 Tceal8-204ENSMUST00000163584 2358 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC9.75□□□□□ -0.85
Gm28038F7BCN9 Stau1-201ENSMUST00000049412 2840 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.75□□□□□ -0.85
Gm28038F7BCN9 Gm6018-201ENSMUST00000216090 1306 ntBASIC9.75□□□□□ -0.85
Gm28038F7BCN9 Msh4-201ENSMUST00000005630 3325 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.75□□□□□ -0.85
Gm28038F7BCN9 Gpatch4-203ENSMUST00000193398 2210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.75□□□□□ -0.85
Gm28038F7BCN9 Adamtsl4-202ENSMUST00000117782 4036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.75□□□□□ -0.85
Gm28038F7BCN9 Parp3-202ENSMUST00000112479 2030 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.75□□□□□ -0.85
Gm28038F7BCN9 Hsf4-206ENSMUST00000173859 1576 ntTSL 1 (best) BASIC9.75□□□□□ -0.85
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