Protein–RNA interactions for Protein: F6W043

Vmn2r40, Vomeronasal 2, receptor 40, mousemouse

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Length 852 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Vmn2r40F6W043 Slc39a9-208ENSMUST00000219706 5427 ntTSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
Vmn2r40F6W043 Tmem186-201ENSMUST00000052505 2736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
Vmn2r40F6W043 BC048403-202ENSMUST00000136432 2968 ntTSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
Vmn2r40F6W043 Kifc1-204ENSMUST00000173492 2350 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
Vmn2r40F6W043 Tmc6-201ENSMUST00000026659 2865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
Vmn2r40F6W043 Parp2-201ENSMUST00000036126 1894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
Vmn2r40F6W043 Tacc3-202ENSMUST00000079534 2899 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
Vmn2r40F6W043 Vash2-201ENSMUST00000047409 4032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
Vmn2r40F6W043 Rcor2-202ENSMUST00000113369 2013 ntTSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
Vmn2r40F6W043 Emp1-206ENSMUST00000205156 2911 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.83□□□□□ -0.52
Vmn2r40F6W043 Hnf1b-203ENSMUST00000108114 2659 ntTSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
Vmn2r40F6W043 Hdac11-201ENSMUST00000041736 2653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
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Vmn2r40F6W043 Gm14730-201ENSMUST00000122378 1045 ntBASIC11.83□□□□□ -0.52
Vmn2r40F6W043 Gm12840-201ENSMUST00000156081 627 ntTSL 5 BASIC11.83□□□□□ -0.52
Vmn2r40F6W043 Kctd17-202ENSMUST00000159771 986 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.83□□□□□ -0.52
Vmn2r40F6W043 Prss55-203ENSMUST00000171503 1074 ntTSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
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Vmn2r40F6W043 Gm7498-201ENSMUST00000203282 1084 ntBASIC11.83□□□□□ -0.52
Vmn2r40F6W043 Gm11149-204ENSMUST00000216483 1275 ntTSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
Vmn2r40F6W043 Ngf-201ENSMUST00000035952 904 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.83□□□□□ -0.52
Vmn2r40F6W043 Kcnk9-201ENSMUST00000044624 1209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
Vmn2r40F6W043 Gm25857-201ENSMUST00000082788 129 ntBASIC11.83□□□□□ -0.52
Vmn2r40F6W043 Tex13c3-201ENSMUST00000089246 876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
Vmn2r40F6W043 Gpnmb-203ENSMUST00000204260 2430 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
Vmn2r40F6W043 Nrg1-210ENSMUST00000208488 2403 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC11.83□□□□□ -0.52
Vmn2r40F6W043 Col9a3-201ENSMUST00000103059 2846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
Vmn2r40F6W043 Taf1c-201ENSMUST00000093099 3236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
Vmn2r40F6W043 AC125108.1-201ENSMUST00000218986 2330 ntBASIC11.83□□□□□ -0.52
Vmn2r40F6W043 Sidt1-205ENSMUST00000136381 4404 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
Vmn2r40F6W043 Erg-201ENSMUST00000077773 2232 ntTSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
Vmn2r40F6W043 Cpped1-203ENSMUST00000121750 2614 ntTSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
Vmn2r40F6W043 Plcg1-203ENSMUST00000109462 5107 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.83□□□□□ -0.52
Vmn2r40F6W043 Sh2b1-206ENSMUST00000205889 3011 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
Vmn2r40F6W043 Kif1a-202ENSMUST00000112958 5931 ntTSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
Vmn2r40F6W043 Hvcn1-201ENSMUST00000072602 2790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
Vmn2r40F6W043 Pcdhac1-201ENSMUST00000007584 5419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
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Vmn2r40F6W043 Nrf1-211ENSMUST00000115212 3584 ntTSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
Vmn2r40F6W043 Catsper3-202ENSMUST00000109898 1311 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
Vmn2r40F6W043 Gad1-205ENSMUST00000130998 1705 ntTSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
Vmn2r40F6W043 C1qtnf1-202ENSMUST00000106286 2512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
Vmn2r40F6W043 C1qtnf1-201ENSMUST00000017590 2532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
Vmn2r40F6W043 Sh3pxd2a-202ENSMUST00000111800 10380 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
Vmn2r40F6W043 Zfp354c-202ENSMUST00000109135 5325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
Vmn2r40F6W043 Fbf1-202ENSMUST00000106435 4651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
Vmn2r40F6W043 Met-202ENSMUST00000115442 4663 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.83□□□□□ -0.52
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Vmn2r40F6W043 Gm29455-201ENSMUST00000186504 2659 ntTSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
Vmn2r40F6W043 Prpf19-203ENSMUST00000179297 6035 ntTSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
Vmn2r40F6W043 Car6-202ENSMUST00000105683 1460 ntTSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
Vmn2r40F6W043 Clcn3-201ENSMUST00000004430 4175 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.82□□□□□ -0.52
Vmn2r40F6W043 Decr2-201ENSMUST00000040907 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.82□□□□□ -0.52
Vmn2r40F6W043 Slco3a1-202ENSMUST00000098371 2709 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.82□□□□□ -0.52
Vmn2r40F6W043 Ptprk-202ENSMUST00000218276 4754 ntTSL 1 (best) BASIC11.82□□□□□ -0.52
Vmn2r40F6W043 Hpse2-201ENSMUST00000099428 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.82□□□□□ -0.52
Vmn2r40F6W043 Gm13288-201ENSMUST00000094977 2850 ntAPPRIS P1 BASIC11.82□□□□□ -0.52
Vmn2r40F6W043 Urgcp-204ENSMUST00000120306 3972 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.82□□□□□ -0.52
Vmn2r40F6W043 Arhgef2-229ENSMUST00000177303 3000 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.82□□□□□ -0.52
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Vmn2r40F6W043 Btrc-202ENSMUST00000111936 2064 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.82□□□□□ -0.52
Vmn2r40F6W043 Net1-201ENSMUST00000091853 2680 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.82□□□□□ -0.52
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Vmn2r40F6W043 Ccdc169-203ENSMUST00000118963 740 ntTSL 3 BASIC11.82□□□□□ -0.52
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Vmn2r40F6W043 Otx2os1-202ENSMUST00000183803 743 ntTSL 1 (best) BASIC11.82□□□□□ -0.52
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Vmn2r40F6W043 Txn1-201ENSMUST00000030051 1051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.82□□□□□ -0.52
Vmn2r40F6W043 Tmem116-201ENSMUST00000031405 1288 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.82□□□□□ -0.52
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Vmn2r40F6W043 Fhl2-202ENSMUST00000185893 1421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.82□□□□□ -0.52
Vmn2r40F6W043 Gm36065-202ENSMUST00000219654 1424 ntTSL 5 BASIC11.82□□□□□ -0.52
Vmn2r40F6W043 Scn5a-201ENSMUST00000065196 8287 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC11.82□□□□□ -0.52
Vmn2r40F6W043 Msi2-203ENSMUST00000107909 6436 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.82□□□□□ -0.52
Vmn2r40F6W043 Gm9195-201ENSMUST00000208955 8870 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.82□□□□□ -0.52
Vmn2r40F6W043 Ddx27-201ENSMUST00000018143 2714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.82□□□□□ -0.52
Vmn2r40F6W043 Spock3-201ENSMUST00000093480 3024 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC11.82□□□□□ -0.52
Vmn2r40F6W043 Xlr-202ENSMUST00000067782 1860 ntTSL 1 (best) BASIC11.82□□□□□ -0.52
Vmn2r40F6W043 Ahcyl2-205ENSMUST00000125911 2039 ntTSL 5 BASIC11.82□□□□□ -0.52
Vmn2r40F6W043 Crtc1-201ENSMUST00000076615 5683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.82□□□□□ -0.52
Vmn2r40F6W043 Acap1-201ENSMUST00000001631 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.82□□□□□ -0.52
Vmn2r40F6W043 Ankmy2-201ENSMUST00000041640 2456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.82□□□□□ -0.52
Vmn2r40F6W043 Gm11978-202ENSMUST00000127510 1303 ntTSL 1 (best) BASIC11.82□□□□□ -0.52
Vmn2r40F6W043 Hlf-201ENSMUST00000004051 5642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.82□□□□□ -0.52
Vmn2r40F6W043 Nif3l1-206ENSMUST00000171597 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.82□□□□□ -0.52
Vmn2r40F6W043 AC137842.1-201ENSMUST00000227896 2064 ntBASIC11.82□□□□□ -0.52
Vmn2r40F6W043 Vmn1r65-201ENSMUST00000086338 2682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.82□□□□□ -0.52
Vmn2r40F6W043 Mpp3-202ENSMUST00000100400 2997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.82□□□□□ -0.52
Vmn2r40F6W043 Sema4a-213ENSMUST00000165898 3125 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.82□□□□□ -0.52
Vmn2r40F6W043 Psmd1-201ENSMUST00000027432 3112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.82□□□□□ -0.52
Vmn2r40F6W043 Unc5d-204ENSMUST00000210785 3404 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.82□□□□□ -0.52
Vmn2r40F6W043 Eif4enif1-202ENSMUST00000110048 3712 ntTSL 5 BASIC11.82□□□□□ -0.52
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