Protein–RNA interactions for Protein: E9Q4T4

Ccdc71l, Coiled-coil domain-containing 71-like, mousemouse

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Length 218 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccdc71lE9Q4T4 Lrrc10-201ENSMUST00000073834 1428 ntAPPRIS P1 BASIC10.28□□□□□ -0.76
Ccdc71lE9Q4T4 Wwox-201ENSMUST00000004756 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.28□□□□□ -0.76
Ccdc71lE9Q4T4 Metrnl-202ENSMUST00000106089 1101 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.28□□□□□ -0.76
Ccdc71lE9Q4T4 Ern1-202ENSMUST00000106799 660 ntTSL 1 (best) BASIC10.28□□□□□ -0.76
Ccdc71lE9Q4T4 Gm6415-201ENSMUST00000118488 348 ntBASIC10.28□□□□□ -0.76
Ccdc71lE9Q4T4 Evx1-202ENSMUST00000129243 1034 ntTSL 3 BASIC10.28□□□□□ -0.76
Ccdc71lE9Q4T4 Atp6v0b-208ENSMUST00000150204 935 ntTSL 5 BASIC10.28□□□□□ -0.76
Ccdc71lE9Q4T4 Gm16046-203ENSMUST00000150889 1001 ntTSL 1 (best) BASIC10.28□□□□□ -0.76
Ccdc71lE9Q4T4 Synj2bp-205ENSMUST00000169158 691 ntTSL 1 (best) BASIC10.28□□□□□ -0.76
Ccdc71lE9Q4T4 Hsf4-207ENSMUST00000174837 1251 ntTSL 5 BASIC10.28□□□□□ -0.76
Ccdc71lE9Q4T4 Gm27525-201ENSMUST00000184465 107 ntBASIC10.28□□□□□ -0.76
Ccdc71lE9Q4T4 Gm27430-201ENSMUST00000184585 107 ntBASIC10.28□□□□□ -0.76
Ccdc71lE9Q4T4 Gm29541-201ENSMUST00000191351 678 ntBASIC10.28□□□□□ -0.76
Ccdc71lE9Q4T4 Gm44333-201ENSMUST00000197168 107 ntBASIC10.28□□□□□ -0.76
Ccdc71lE9Q4T4 Gm43303-201ENSMUST00000200133 669 ntTSL 1 (best) BASIC10.28□□□□□ -0.76
Ccdc71lE9Q4T4 Gm35082-201ENSMUST00000207308 338 ntTSL 3 BASIC10.28□□□□□ -0.76
Ccdc71lE9Q4T4 Thoc7-201ENSMUST00000065865 937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.28□□□□□ -0.76
Ccdc71lE9Q4T4 Epha5-206ENSMUST00000113406 4606 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.28□□□□□ -0.76
Ccdc71lE9Q4T4 Grm7-202ENSMUST00000172951 4197 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.28□□□□□ -0.76
Ccdc71lE9Q4T4 Clip1-204ENSMUST00000111564 5609 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.28□□□□□ -0.76
Ccdc71lE9Q4T4 Cep128-210ENSMUST00000141429 4807 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.28□□□□□ -0.76
Ccdc71lE9Q4T4 Nhlrc3-201ENSMUST00000056749 5047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.28□□□□□ -0.76
Ccdc71lE9Q4T4 Ambra1-203ENSMUST00000099712 5021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.28□□□□□ -0.76
Ccdc71lE9Q4T4 Mvk-202ENSMUST00000112239 1602 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.28□□□□□ -0.76
Ccdc71lE9Q4T4 Sfn-201ENSMUST00000057311 1613 ntAPPRIS P1 BASIC10.28□□□□□ -0.76
Ccdc71lE9Q4T4 Gm45643-201ENSMUST00000211364 1484 ntBASIC10.28□□□□□ -0.76
Ccdc71lE9Q4T4 Ckmt2-201ENSMUST00000022122 1486 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.28□□□□□ -0.76
Ccdc71lE9Q4T4 S100b-201ENSMUST00000036387 1484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.28□□□□□ -0.76
Ccdc71lE9Q4T4 Arl11-201ENSMUST00000055159 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.28□□□□□ -0.76
Ccdc71lE9Q4T4 Nf1-202ENSMUST00000108251 9217 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.28□□□□□ -0.76
Ccdc71lE9Q4T4 Pla2g6-201ENSMUST00000047816 2963 ntTSL 1 (best) BASIC10.28□□□□□ -0.76
Ccdc71lE9Q4T4 Renbp-209ENSMUST00000155597 1310 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.28□□□□□ -0.76
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Ccdc71lE9Q4T4 Uckl1-201ENSMUST00000057816 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.28□□□□□ -0.76
Ccdc71lE9Q4T4 AC125108.1-201ENSMUST00000218986 2330 ntBASIC10.28□□□□□ -0.76
Ccdc71lE9Q4T4 Irf8-201ENSMUST00000047737 2847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.28□□□□□ -0.76
Ccdc71lE9Q4T4 Gtf2i-210ENSMUST00000173341 4302 ntTSL 1 (best) BASIC10.28□□□□□ -0.76
Ccdc71lE9Q4T4 Akr1d1-201ENSMUST00000040987 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.28□□□□□ -0.76
Ccdc71lE9Q4T4 Tbc1d8-204ENSMUST00000193823 3512 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.28□□□□□ -0.76
Ccdc71lE9Q4T4 Emilin1-201ENSMUST00000031055 3852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.28□□□□□ -0.76
Ccdc71lE9Q4T4 Akap12-202ENSMUST00000215696 5931 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.28□□□□□ -0.76
Ccdc71lE9Q4T4 Jak1-201ENSMUST00000102781 4906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.28□□□□□ -0.76
Ccdc71lE9Q4T4 Kcnk2-202ENSMUST00000110920 3572 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC10.27□□□□□ -0.76
Ccdc71lE9Q4T4 Tfdp2-203ENSMUST00000165768 2212 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.27□□□□□ -0.76
Ccdc71lE9Q4T4 9530077C05Rik-201ENSMUST00000058868 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.27□□□□□ -0.76
Ccdc71lE9Q4T4 Rplp0-201ENSMUST00000086519 1358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.27□□□□□ -0.76
Ccdc71lE9Q4T4 Man2c1-215ENSMUST00000161182 2909 ntTSL 5 BASIC10.27□□□□□ -0.76
Ccdc71lE9Q4T4 Plod3-201ENSMUST00000004968 3280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.27□□□□□ -0.76
Ccdc71lE9Q4T4 Tex19.1-201ENSMUST00000039088 1745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.27□□□□□ -0.76
Ccdc71lE9Q4T4 Cnppd1-201ENSMUST00000041213 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.27□□□□□ -0.76
Ccdc71lE9Q4T4 Matr3-206ENSMUST00000187389 3107 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.27□□□□□ -0.76
Ccdc71lE9Q4T4 Prnd-203ENSMUST00000110171 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.27□□□□□ -0.76
Ccdc71lE9Q4T4 Gm36745-201ENSMUST00000213455 1594 ntTSL 1 (best) BASIC10.27□□□□□ -0.76
Ccdc71lE9Q4T4 Gm34006-202ENSMUST00000216467 1918 ntTSL 2 BASIC10.27□□□□□ -0.76
Ccdc71lE9Q4T4 Secisbp2-201ENSMUST00000040117 3328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.27□□□□□ -0.76
Ccdc71lE9Q4T4 BC024139-201ENSMUST00000054022 2623 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.27□□□□□ -0.76
Ccdc71lE9Q4T4 Astl-202ENSMUST00000089673 2251 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.27□□□□□ -0.76
Ccdc71lE9Q4T4 Tex2-201ENSMUST00000042780 4934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.27□□□□□ -0.76
Ccdc71lE9Q4T4 Faap100-201ENSMUST00000026448 3193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.27□□□□□ -0.77
Ccdc71lE9Q4T4 Cast-211ENSMUST00000223206 5141 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.27□□□□□ -0.77
Ccdc71lE9Q4T4 Usp22-201ENSMUST00000041683 4434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.27□□□□□ -0.77
Ccdc71lE9Q4T4 Ppp1r16b-203ENSMUST00000103116 6370 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.27□□□□□ -0.77
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Ccdc71lE9Q4T4 Efhc1-201ENSMUST00000038447 2146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.27□□□□□ -0.77
Ccdc71lE9Q4T4 Ajuba-201ENSMUST00000054487 3397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.27□□□□□ -0.77
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Ccdc71lE9Q4T4 Slc23a4-201ENSMUST00000044387 2175 ntTSL 1 (best) BASIC10.27□□□□□ -0.77
Ccdc71lE9Q4T4 Dgkz-203ENSMUST00000111303 4169 ntTSL 1 (best) BASIC10.27□□□□□ -0.77
Ccdc71lE9Q4T4 Emc1-201ENSMUST00000042096 4706 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.27□□□□□ -0.77
Ccdc71lE9Q4T4 Apoo-203ENSMUST00000113897 1218 ntTSL 1 (best) BASIC10.27□□□□□ -0.77
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Ccdc71lE9Q4T4 9330198N18Rik-201ENSMUST00000146702 1247 ntTSL 1 (best) BASIC10.27□□□□□ -0.77
Ccdc71lE9Q4T4 Fbxw4-209ENSMUST00000162433 789 ntTSL 3 BASIC10.27□□□□□ -0.77
Ccdc71lE9Q4T4 Erdr1-204ENSMUST00000179483 688 ntTSL 1 (best) BASIC10.27□□□□□ -0.77
Ccdc71lE9Q4T4 Gm27622-201ENSMUST00000183779 60 ntBASIC10.27□□□□□ -0.77
Ccdc71lE9Q4T4 Gm15411-202ENSMUST00000201913 668 ntTSL 3 BASIC10.27□□□□□ -0.77
Ccdc71lE9Q4T4 Gm4756-204ENSMUST00000209038 990 ntTSL 5 BASIC10.27□□□□□ -0.77
Ccdc71lE9Q4T4 Gm34397-203ENSMUST00000214991 630 ntTSL 5 BASIC10.27□□□□□ -0.77
Ccdc71lE9Q4T4 AC140397.2-201ENSMUST00000224213 834 ntBASIC10.27□□□□□ -0.77
Ccdc71lE9Q4T4 Hes5-201ENSMUST00000049621 1273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.27□□□□□ -0.77
Ccdc71lE9Q4T4 Idnk-201ENSMUST00000051490 764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.27□□□□□ -0.77
Ccdc71lE9Q4T4 Tmem139-201ENSMUST00000095987 1147 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.27□□□□□ -0.77
Ccdc71lE9Q4T4 Adcy6-201ENSMUST00000096224 6038 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.27□□□□□ -0.77
Ccdc71lE9Q4T4 Klhl26-203ENSMUST00000209415 2919 ntTSL 1 (best) BASIC10.27□□□□□ -0.77
Ccdc71lE9Q4T4 Pdxdc1-201ENSMUST00000023361 4228 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.27□□□□□ -0.77
Ccdc71lE9Q4T4 Sema4a-213ENSMUST00000165898 3125 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.27□□□□□ -0.77
Ccdc71lE9Q4T4 Rbm47-202ENSMUST00000094757 4643 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.27□□□□□ -0.77
Ccdc71lE9Q4T4 Tiam1-204ENSMUST00000114124 7406 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.27□□□□□ -0.77
Ccdc71lE9Q4T4 Grm1-202ENSMUST00000105560 4265 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.27□□□□□ -0.77
Ccdc71lE9Q4T4 Sin3b-201ENSMUST00000004494 4115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.27□□□□□ -0.77
Ccdc71lE9Q4T4 4933430H06Rik-201ENSMUST00000200924 1343 ntBASIC10.27□□□□□ -0.77
Ccdc71lE9Q4T4 Robo1-201ENSMUST00000023600 7563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.27□□□□□ -0.77
Ccdc71lE9Q4T4 Mrm3-201ENSMUST00000040577 1510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.27□□□□□ -0.77
Ccdc71lE9Q4T4 Gm5939-201ENSMUST00000119613 2874 ntBASIC10.27□□□□□ -0.77
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