Protein–RNA interactions for Protein: E9Q007

Gm4450, Predicted gene 4450, mousemouse

Predictions only

Length 373 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm4450E9Q007 Ccdc71-201ENSMUST00000061209 3092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.17□□□□□ -0.3
Gm4450E9Q007 Fam83e-201ENSMUST00000129507 2908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.17□□□□□ -0.3
Gm4450E9Q007 Srd5a1-202ENSMUST00000091514 2644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.17□□□□□ -0.3
Gm4450E9Q007 Cad-206ENSMUST00000201838 3153 ntTSL 1 (best) BASIC13.17□□□□□ -0.3
Gm4450E9Q007 AC238940.1-201ENSMUST00000225106 1858 ntBASIC13.17□□□□□ -0.3
Gm4450E9Q007 Gm5939-201ENSMUST00000119613 2874 ntBASIC13.17□□□□□ -0.3
Gm4450E9Q007 Ube2a-201ENSMUST00000016452 1732 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.17□□□□□ -0.3
Gm4450E9Q007 Rfx7-205ENSMUST00000184015 1554 ntTSL 5 BASIC13.17□□□□□ -0.3
Gm4450E9Q007 Trav4-2-201ENSMUST00000103637 370 ntAPPRIS P1 BASIC13.17□□□□□ -0.3
Gm4450E9Q007 Tpd52l2-203ENSMUST00000108799 985 ntTSL 5 BASIC13.17□□□□□ -0.3
Gm4450E9Q007 Cdkn1a-202ENSMUST00000119901 748 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.17□□□□□ -0.3
Gm4450E9Q007 Gm12291-201ENSMUST00000121627 311 ntBASIC13.17□□□□□ -0.3
Gm4450E9Q007 Gm17208-201ENSMUST00000168388 535 ntBASIC13.17□□□□□ -0.3
Gm4450E9Q007 Pced1c-ps-201ENSMUST00000187740 751 ntBASIC13.17□□□□□ -0.3
Gm4450E9Q007 AY702102-202ENSMUST00000194651 1173 ntBASIC13.17□□□□□ -0.3
Gm4450E9Q007 Gm8099-201ENSMUST00000200510 742 ntBASIC13.17□□□□□ -0.3
Gm4450E9Q007 Mien1-201ENSMUST00000002655 747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.17□□□□□ -0.3
Gm4450E9Q007 B230118H07Rik-202ENSMUST00000099682 895 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.17□□□□□ -0.3
Gm4450E9Q007 Cpq-207ENSMUST00000228916 1842 ntAPPRIS P1 BASIC13.17□□□□□ -0.3
Gm4450E9Q007 Avpr2-201ENSMUST00000033765 1812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.17□□□□□ -0.3
Gm4450E9Q007 6030458C11Rik-202ENSMUST00000227299 3206 ntBASIC13.17□□□□□ -0.3
Gm4450E9Q007 Sgip1-201ENSMUST00000066824 4305 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.17□□□□□ -0.3
Gm4450E9Q007 Clec16a-205ENSMUST00000115827 2949 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.17□□□□□ -0.3
Gm4450E9Q007 Mcm6-201ENSMUST00000027601 2910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.17□□□□□ -0.3
Gm4450E9Q007 Pphln1-204ENSMUST00000165935 3473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.17□□□□□ -0.3
Gm4450E9Q007 Slc8b1-204ENSMUST00000111890 2775 ntTSL 1 (best) BASIC13.17□□□□□ -0.3
Gm4450E9Q007 Rph3a-203ENSMUST00000202326 2621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.17□□□□□ -0.3
Gm4450E9Q007 Mdga1-201ENSMUST00000073556 7566 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.17□□□□□ -0.3
Gm4450E9Q007 Tmem159-202ENSMUST00000118737 1395 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.17□□□□□ -0.3
Gm4450E9Q007 Smc5-202ENSMUST00000223934 3448 ntAPPRIS P2 BASIC13.17□□□□□ -0.3
Gm4450E9Q007 Zfp853-202ENSMUST00000212355 2871 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC13.17□□□□□ -0.3
Gm4450E9Q007 Wwox-203ENSMUST00000109108 1771 ntTSL 1 (best) BASIC13.17□□□□□ -0.3
Gm4450E9Q007 Ints7-201ENSMUST00000045450 5347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.17□□□□□ -0.3
Gm4450E9Q007 Noto-201ENSMUST00000089578 1602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.17□□□□□ -0.3
Gm4450E9Q007 Ahcyl2-201ENSMUST00000064872 2019 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.17□□□□□ -0.3
Gm4450E9Q007 Gm1113-201ENSMUST00000183573 2434 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.17□□□□□ -0.3
Gm4450E9Q007 Tsku-204ENSMUST00000165901 2514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
Gm4450E9Q007 Galns-203ENSMUST00000212319 2111 ntTSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
Gm4450E9Q007 Kcnk16-202ENSMUST00000225596 2127 ntBASIC13.16□□□□□ -0.3
Gm4450E9Q007 Map4k2-201ENSMUST00000025897 4644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
Gm4450E9Q007 Acin1-216ENSMUST00000141453 2381 ntTSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
Gm4450E9Q007 Olfr482-202ENSMUST00000217304 2612 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.16□□□□□ -0.3
Gm4450E9Q007 Dlgap1-208ENSMUST00000135938 2895 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
Gm4450E9Q007 5730409E04Rik-202ENSMUST00000164362 2855 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.16□□□□□ -0.3
Gm4450E9Q007 Colgalt1-201ENSMUST00000047903 3207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
Gm4450E9Q007 Trappc2l-201ENSMUST00000015157 1659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
Gm4450E9Q007 Pde10a-202ENSMUST00000089085 7717 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
Gm4450E9Q007 Rcbtb2-202ENSMUST00000110952 2176 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
Gm4450E9Q007 Gcdh-201ENSMUST00000003907 2167 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
Gm4450E9Q007 Fgf8-203ENSMUST00000111924 630 ntTSL 5 BASIC13.16□□□□□ -0.3
Gm4450E9Q007 Trav4d-2-201ENSMUST00000120914 335 ntBASIC13.16□□□□□ -0.3
Gm4450E9Q007 Isg20-204ENSMUST00000121645 1087 ntTSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
Gm4450E9Q007 Rdh18-ps-201ENSMUST00000137395 944 ntBASIC13.16□□□□□ -0.3
Gm4450E9Q007 Rdh18-ps-202ENSMUST00000143917 953 ntTSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
Gm4450E9Q007 Dcdc2b-203ENSMUST00000179209 864 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.16□□□□□ -0.3
Gm4450E9Q007 Gm9728-201ENSMUST00000200197 1055 ntBASIC13.16□□□□□ -0.3
Gm4450E9Q007 Lamtor2-201ENSMUST00000029698 668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
Gm4450E9Q007 Mrto4-201ENSMUST00000030513 930 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
Gm4450E9Q007 Brk1-201ENSMUST00000035725 1095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
Gm4450E9Q007 Ccdc113-201ENSMUST00000041569 1288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
Gm4450E9Q007 Olfr91-201ENSMUST00000087144 939 ntAPPRIS P1 BASIC13.16□□□□□ -0.3
Gm4450E9Q007 Pdgfra-205ENSMUST00000201711 4088 ntTSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
Gm4450E9Q007 Rbms1-201ENSMUST00000028347 4436 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
Gm4450E9Q007 Cecr2-202ENSMUST00000112686 9212 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.16□□□□□ -0.3
Gm4450E9Q007 Mknk1-201ENSMUST00000019677 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
Gm4450E9Q007 Eya1-203ENSMUST00000168081 4366 ntTSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
Gm4450E9Q007 Xrra1-201ENSMUST00000036155 2731 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
Gm4450E9Q007 Ano1-201ENSMUST00000033393 4585 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.16□□□□□ -0.3
Gm4450E9Q007 Hdgfl2-210ENSMUST00000225843 2238 ntAPPRIS ALT2 BASIC13.16□□□□□ -0.3
Gm4450E9Q007 Ssc5d-201ENSMUST00000057612 4348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
Gm4450E9Q007 Gm15897-201ENSMUST00000117770 1486 ntBASIC13.16□□□□□ -0.3
Gm4450E9Q007 Nmral1-202ENSMUST00000079130 1459 ntTSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
Gm4450E9Q007 Fgfr1-201ENSMUST00000084027 5025 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.16□□□□□ -0.3
Gm4450E9Q007 Pianp-207ENSMUST00000162170 2053 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
Gm4450E9Q007 Ppp3cb-205ENSMUST00000161445 3298 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Gm4450E9Q007 Bbof1-201ENSMUST00000081828 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Gm4450E9Q007 Plk4-203ENSMUST00000203295 3363 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Gm4450E9Q007 Kif1c-202ENSMUST00000094499 5168 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Gm4450E9Q007 Def8-203ENSMUST00000093049 1909 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Gm4450E9Q007 Pcgf5-211ENSMUST00000225920 6443 ntBASIC13.15□□□□□ -0.3
Gm4450E9Q007 Acta1-201ENSMUST00000034453 1446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Gm4450E9Q007 Dnmt3b-208ENSMUST00000109772 4015 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Gm4450E9Q007 4930444K16Rik-201ENSMUST00000220438 1767 ntBASIC13.15□□□□□ -0.3
Gm4450E9Q007 Pkp3-201ENSMUST00000066873 2848 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Gm4450E9Q007 Kpna7-203ENSMUST00000116454 1500 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Gm4450E9Q007 Lmf2-201ENSMUST00000023283 2906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Gm4450E9Q007 Rsbn1-201ENSMUST00000051139 4762 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Gm4450E9Q007 Dolpp1-202ENSMUST00000113612 1958 ntTSL 3 BASIC13.15□□□□□ -0.3
Gm4450E9Q007 Usp19-204ENSMUST00000178075 4512 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Gm4450E9Q007 Usp19-202ENSMUST00000085044 4520 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Gm4450E9Q007 Ins2-204ENSMUST00000105932 455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Gm4450E9Q007 Glrx2-202ENSMUST00000111957 580 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Gm4450E9Q007 Mrpl2-203ENSMUST00000113430 991 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.15□□□□□ -0.3
Gm4450E9Q007 Gm14921-201ENSMUST00000118643 908 ntBASIC13.15□□□□□ -0.3
Gm4450E9Q007 Polr3c-202ENSMUST00000125183 923 ntTSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Gm4450E9Q007 Gm15046-201ENSMUST00000130153 408 ntTSL 3 BASIC13.15□□□□□ -0.3
Gm4450E9Q007 1700030C14Rik-201ENSMUST00000139912 756 ntTSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Gm4450E9Q007 Surf2-201ENSMUST00000015017 1203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Gm4450E9Q007 Gm22121-201ENSMUST00000175148 54 ntBASIC13.15□□□□□ -0.3
Gm4450E9Q007 Ins2-201ENSMUST00000000220 478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 47.8 ms