Protein–RNA interactions for Protein: D3YZP9

Ccdc6, Coiled-coil domain-containing protein 6, mousemouse

Predictions only

Length 469 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccdc6D3YZP9 Gata4-202ENSMUST00000118022 3374 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Ccdc6D3YZP9 Gm5136-201ENSMUST00000218023 1397 ntAPPRIS P1 BASIC16.24■□□□□ 0.19
Ccdc6D3YZP9 Mrgprh-201ENSMUST00000075296 1809 ntAPPRIS P1 BASIC16.24■□□□□ 0.19
Ccdc6D3YZP9 Rlbp1-202ENSMUST00000179243 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Ccdc6D3YZP9 Knop1-205ENSMUST00000116280 5382 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
Ccdc6D3YZP9 Lats2-210ENSMUST00000174694 3287 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.23■□□□□ 0.19
Ccdc6D3YZP9 Map6d1-201ENSMUST00000040880 3273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Ccdc6D3YZP9 Psmd11-201ENSMUST00000017572 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Ccdc6D3YZP9 Ak1-203ENSMUST00000113278 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Ccdc6D3YZP9 Gm38102-201ENSMUST00000192791 1935 ntBASIC16.23■□□□□ 0.19
Ccdc6D3YZP9 Eno3-206ENSMUST00000170716 1461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Ccdc6D3YZP9 Sh3gl3-206ENSMUST00000179318 1489 ntTSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
Ccdc6D3YZP9 Dnd1-201ENSMUST00000061522 1451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Ccdc6D3YZP9 Cfap161-201ENSMUST00000011298 1335 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Ccdc6D3YZP9 Mecr-201ENSMUST00000030742 1337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Ccdc6D3YZP9 Hmox2-201ENSMUST00000004172 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Ccdc6D3YZP9 Snhg17-203ENSMUST00000141809 1553 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Ccdc6D3YZP9 Slc14a2-202ENSMUST00000163367 1428 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Ccdc6D3YZP9 Mapk8ip1-202ENSMUST00000111279 3274 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Ccdc6D3YZP9 Zscan10-203ENSMUST00000117606 891 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Ccdc6D3YZP9 Gm5909-201ENSMUST00000119768 1281 ntBASIC16.23■□□□□ 0.19
Ccdc6D3YZP9 Gm13022-201ENSMUST00000121181 285 ntBASIC16.23■□□□□ 0.19
Ccdc6D3YZP9 Gm22144-201ENSMUST00000157402 102 ntBASIC16.23■□□□□ 0.19
Ccdc6D3YZP9 Gm15523-201ENSMUST00000160463 439 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Ccdc6D3YZP9 Pitx2-204ENSMUST00000172645 915 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Ccdc6D3YZP9 Magohb-205ENSMUST00000173837 897 ntTSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
Ccdc6D3YZP9 3830422I06Rik-201ENSMUST00000200199 1181 ntBASIC16.23■□□□□ 0.19
Ccdc6D3YZP9 Serpinh1-203ENSMUST00000207849 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Ccdc6D3YZP9 Gm11149-203ENSMUST00000215465 805 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Ccdc6D3YZP9 Tff2-201ENSMUST00000024826 584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Ccdc6D3YZP9 Ccdc158-204ENSMUST00000151180 3352 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Ccdc6D3YZP9 Pgm1-201ENSMUST00000087324 2369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Ccdc6D3YZP9 Ell3-202ENSMUST00000116432 1674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Ccdc6D3YZP9 Traf3ip1-201ENSMUST00000047242 3474 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Ccdc6D3YZP9 L2hgdh-201ENSMUST00000021370 3340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Ccdc6D3YZP9 Rnf113a2-201ENSMUST00000183146 1383 ntAPPRIS P1 BASIC16.23■□□□□ 0.19
Ccdc6D3YZP9 Gm44981-201ENSMUST00000205549 1943 ntBASIC16.23■□□□□ 0.19
Ccdc6D3YZP9 Id4-201ENSMUST00000021810 3849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Ccdc6D3YZP9 Repin1-207ENSMUST00000163452 2959 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Ccdc6D3YZP9 Rad51-201ENSMUST00000028795 3368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Ccdc6D3YZP9 4732471J01Rik-203ENSMUST00000206300 1887 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Ccdc6D3YZP9 Ripk3-201ENSMUST00000022830 1892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Ccdc6D3YZP9 Card9-201ENSMUST00000028294 1880 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
Ccdc6D3YZP9 Phldb1-201ENSMUST00000034611 5461 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Ccdc6D3YZP9 Smpd4-206ENSMUST00000163997 1722 ntTSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
Ccdc6D3YZP9 Rarb-201ENSMUST00000063750 3108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Ccdc6D3YZP9 2610301B20Rik-202ENSMUST00000101504 2053 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
Ccdc6D3YZP9 Pigb-207ENSMUST00000184389 2079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Ccdc6D3YZP9 Pdzd4-202ENSMUST00000114438 3625 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Ccdc6D3YZP9 Gm22133-201ENSMUST00000102082 109 ntBASIC16.22■□□□□ 0.19
Ccdc6D3YZP9 Uqcc1-202ENSMUST00000109631 1091 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
Ccdc6D3YZP9 Gm12943-201ENSMUST00000119616 210 ntBASIC16.22■□□□□ 0.19
Ccdc6D3YZP9 Gm15619-201ENSMUST00000128415 1294 ntTSL 3 BASIC16.22■□□□□ 0.19
Ccdc6D3YZP9 9330179D12Rik-201ENSMUST00000180569 1105 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Ccdc6D3YZP9 8030442B05Rik-201ENSMUST00000192626 1035 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Ccdc6D3YZP9 Gm44980-201ENSMUST00000205826 314 ntBASIC16.22■□□□□ 0.19
Ccdc6D3YZP9 Gm17827-201ENSMUST00000211825 742 ntBASIC16.22■□□□□ 0.19
Ccdc6D3YZP9 Mt3-202ENSMUST00000211915 440 ntTSL 3 BASIC16.22■□□□□ 0.19
Ccdc6D3YZP9 Rps12-203ENSMUST00000218107 584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Ccdc6D3YZP9 Hspb2-201ENSMUST00000042790 773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Ccdc6D3YZP9 1700029P11Rik-201ENSMUST00000074608 1024 ntAPPRIS P1 BASIC16.22■□□□□ 0.19
Ccdc6D3YZP9 Spcs2-201ENSMUST00000036274 2909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Ccdc6D3YZP9 Alkbh3os1-201ENSMUST00000028621 1549 ntTSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
Ccdc6D3YZP9 D17Wsu92e-202ENSMUST00000114859 3522 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Ccdc6D3YZP9 Wt1-201ENSMUST00000111098 2395 ntTSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
Ccdc6D3YZP9 Igsf23-204ENSMUST00000208974 1850 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Ccdc6D3YZP9 Cobl-201ENSMUST00000046755 5615 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Ccdc6D3YZP9 Ptgs1-201ENSMUST00000062069 2867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Ccdc6D3YZP9 Rabggtb-201ENSMUST00000089950 1381 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
Ccdc6D3YZP9 5330413P13Rik-204ENSMUST00000210606 1464 ntTSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
Ccdc6D3YZP9 Serpinb6d-201ENSMUST00000059637 1463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Ccdc6D3YZP9 Ppip5k2-201ENSMUST00000042509 5882 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Ccdc6D3YZP9 Lmf2-201ENSMUST00000023283 2906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Ccdc6D3YZP9 Mybl1-201ENSMUST00000088658 4980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Ccdc6D3YZP9 2900069G24Rik-201ENSMUST00000192780 1311 ntBASIC16.21■□□□□ 0.19
Ccdc6D3YZP9 Synm-201ENSMUST00000051389 6953 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Ccdc6D3YZP9 Stat3-207ENSMUST00000138438 2506 ntTSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
Ccdc6D3YZP9 Syt6-201ENSMUST00000090697 4416 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
Ccdc6D3YZP9 Pisd-ps2-201ENSMUST00000127960 1424 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Ccdc6D3YZP9 Slc25a14-201ENSMUST00000033431 1760 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Ccdc6D3YZP9 Lmnb1-201ENSMUST00000025486 2843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Ccdc6D3YZP9 Daxx-201ENSMUST00000079421 2580 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Ccdc6D3YZP9 Zbp1-201ENSMUST00000029018 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Ccdc6D3YZP9 Fthl17d-201ENSMUST00000105004 856 ntAPPRIS P1 BASIC16.21■□□□□ 0.19
Ccdc6D3YZP9 A230006K03Rik-201ENSMUST00000107533 977 ntTSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
Ccdc6D3YZP9 Gm14274-201ENSMUST00000117182 615 ntBASIC16.21■□□□□ 0.19
Ccdc6D3YZP9 Gm13809-201ENSMUST00000117921 597 ntBASIC16.21■□□□□ 0.19
Ccdc6D3YZP9 Sh2d6-203ENSMUST00000159877 1210 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Ccdc6D3YZP9 Sh2d6-206ENSMUST00000162561 1251 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Ccdc6D3YZP9 Gm21859-201ENSMUST00000178424 1045 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Ccdc6D3YZP9 Gm44953-201ENSMUST00000208745 1286 ntBASIC16.21■□□□□ 0.19
Ccdc6D3YZP9 CT010486.3-201ENSMUST00000224555 811 ntBASIC16.21■□□□□ 0.19
Ccdc6D3YZP9 Rpl15-201ENSMUST00000079419 883 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.21■□□□□ 0.19
Ccdc6D3YZP9 Vegfa-202ENSMUST00000071648 3451 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Ccdc6D3YZP9 Sppl2b-201ENSMUST00000035597 2869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Ccdc6D3YZP9 Elk3-201ENSMUST00000008542 4212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Ccdc6D3YZP9 Sez6-202ENSMUST00000093995 4239 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Ccdc6D3YZP9 Patz1-202ENSMUST00000093402 3173 ntTSL 2 BASIC16.21■□□□□ 0.19
Ccdc6D3YZP9 Mllt1-201ENSMUST00000025053 3608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Ccdc6D3YZP9 Trf-201ENSMUST00000035158 2571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.18
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 41.1 ms