Protein–RNA interactions for Protein: B9EHT4

Clip3, CAP-Gly domain-containing linker protein 3, mousemouse

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Length 547 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Clip3B9EHT4 Prrt3-205ENSMUST00000205170 1903 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.7□□□□□ -0.38
Clip3B9EHT4 Entpd2-201ENSMUST00000028328 1935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
Clip3B9EHT4 Eya1-201ENSMUST00000027066 4347 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.7□□□□□ -0.38
Clip3B9EHT4 Kifc3-202ENSMUST00000169353 2898 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
Clip3B9EHT4 1300002E11Rik-202ENSMUST00000181780 1650 ntTSL 2 BASIC12.7□□□□□ -0.38
Clip3B9EHT4 Mfn2-203ENSMUST00000105715 4043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
Clip3B9EHT4 Erg-203ENSMUST00000113848 2139 ntTSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
Clip3B9EHT4 Nlrc3-203ENSMUST00000177551 5403 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.7□□□□□ -0.38
Clip3B9EHT4 Tsku-201ENSMUST00000094161 2760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
Clip3B9EHT4 Brinp1-201ENSMUST00000030036 3212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
Clip3B9EHT4 Edrf1-202ENSMUST00000128901 4380 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.69□□□□□ -0.38
Clip3B9EHT4 Arr3-201ENSMUST00000113769 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
Clip3B9EHT4 Fn3k-202ENSMUST00000092302 1803 ntTSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
Clip3B9EHT4 Vps4b-202ENSMUST00000112736 4539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
Clip3B9EHT4 Gm15336-201ENSMUST00000128894 1571 ntTSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
Clip3B9EHT4 Mynn-202ENSMUST00000192715 5555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
Clip3B9EHT4 E430018J23Rik-203ENSMUST00000165495 3324 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.69□□□□□ -0.38
Clip3B9EHT4 BC024139-201ENSMUST00000054022 2623 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
Clip3B9EHT4 Tbx6-202ENSMUST00000172352 1529 ntTSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
Clip3B9EHT4 Tbata-201ENSMUST00000035894 1506 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC12.69□□□□□ -0.38
Clip3B9EHT4 Gtf3c4-201ENSMUST00000037117 6941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
Clip3B9EHT4 Slc25a15-201ENSMUST00000033871 3430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
Clip3B9EHT4 Glo1-202ENSMUST00000167624 895 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.69□□□□□ -0.38
Clip3B9EHT4 Gm38230-201ENSMUST00000193572 1159 ntBASIC12.69□□□□□ -0.38
Clip3B9EHT4 Mrpl30-205ENSMUST00000193673 662 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.69□□□□□ -0.38
Clip3B9EHT4 Gm20219-201ENSMUST00000209718 1269 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.69□□□□□ -0.38
Clip3B9EHT4 Nme2-201ENSMUST00000021217 1012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
Clip3B9EHT4 Cfc1-201ENSMUST00000027298 1040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
Clip3B9EHT4 Fau-201ENSMUST00000043074 574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
Clip3B9EHT4 Tmem107-201ENSMUST00000075980 779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
Clip3B9EHT4 Lyzl4-201ENSMUST00000077706 996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
Clip3B9EHT4 Gm10244-201ENSMUST00000090237 830 ntTSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
Clip3B9EHT4 Arhgap11a-203ENSMUST00000110948 4878 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
Clip3B9EHT4 Ehd1-201ENSMUST00000025684 3353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
Clip3B9EHT4 Bmp3-202ENSMUST00000197143 2739 ntTSL 2 BASIC12.69□□□□□ -0.38
Clip3B9EHT4 Ifi47-204ENSMUST00000213728 1678 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.69□□□□□ -0.38
Clip3B9EHT4 Fgfr3-215ENSMUST00000202138 3960 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
Clip3B9EHT4 Gm11725-201ENSMUST00000125607 1850 ntTSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
Clip3B9EHT4 Prr33-201ENSMUST00000054910 2251 ntTSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
Clip3B9EHT4 Stat3-203ENSMUST00000127638 4516 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
Clip3B9EHT4 Zbtb40-201ENSMUST00000049583 7192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
Clip3B9EHT4 Serpine3-201ENSMUST00000171692 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
Clip3B9EHT4 Aire-216ENSMUST00000156417 1627 ntTSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
Clip3B9EHT4 Hoxa7-201ENSMUST00000048715 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
Clip3B9EHT4 4632428C04Rik-201ENSMUST00000181485 2430 ntTSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
Clip3B9EHT4 Gm28539-201ENSMUST00000190050 2982 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.69□□□□□ -0.38
Clip3B9EHT4 1700037C18Rik-202ENSMUST00000115859 2592 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
Clip3B9EHT4 Trim55-201ENSMUST00000029139 2595 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.69□□□□□ -0.38
Clip3B9EHT4 Celrr-202ENSMUST00000181433 1561 ntTSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
Clip3B9EHT4 2310035C23Rik-201ENSMUST00000039173 4328 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
Clip3B9EHT4 Nudt21-201ENSMUST00000034204 5010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.68□□□□□ -0.38
Clip3B9EHT4 Ldhb-201ENSMUST00000032373 1304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.68□□□□□ -0.38
Clip3B9EHT4 2310007B03Rik-202ENSMUST00000143419 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.68□□□□□ -0.38
Clip3B9EHT4 A530072M11Rik-201ENSMUST00000151122 1852 ntTSL 1 (best) BASIC12.68□□□□□ -0.38
Clip3B9EHT4 Neil1-203ENSMUST00000190245 1693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.68□□□□□ -0.38
Clip3B9EHT4 Pomgnt1-201ENSMUST00000106494 2226 ntTSL 1 (best) BASIC12.68□□□□□ -0.38
Clip3B9EHT4 Pcdh1-202ENSMUST00000159405 3880 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.68□□□□□ -0.38
Clip3B9EHT4 Slc5a11-201ENSMUST00000033035 2396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.68□□□□□ -0.38
Clip3B9EHT4 Gcat-201ENSMUST00000006544 2365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.68□□□□□ -0.38
Clip3B9EHT4 Mlx-202ENSMUST00000107302 1826 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.68□□□□□ -0.38
Clip3B9EHT4 Pnpo-202ENSMUST00000107629 681 ntTSL 3 BASIC12.68□□□□□ -0.38
Clip3B9EHT4 Tagln2-201ENSMUST00000111228 716 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC12.68□□□□□ -0.38
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Clip3B9EHT4 Gm29649-201ENSMUST00000185649 419 ntBASIC12.68□□□□□ -0.38
Clip3B9EHT4 Bst2-201ENSMUST00000051672 792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.68□□□□□ -0.38
Clip3B9EHT4 Rpsa-ps10-201ENSMUST00000057740 885 ntBASIC12.68□□□□□ -0.38
Clip3B9EHT4 Gps2-201ENSMUST00000057884 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.68□□□□□ -0.38
Clip3B9EHT4 Haus7-202ENSMUST00000077243 1032 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.68□□□□□ -0.38
Clip3B9EHT4 Begain-204ENSMUST00000209829 3272 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.68□□□□□ -0.38
Clip3B9EHT4 Olfr1156-203ENSMUST00000216726 3271 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.68□□□□□ -0.38
Clip3B9EHT4 Herpud1-205ENSMUST00000161576 1952 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.68□□□□□ -0.38
Clip3B9EHT4 Gm42872-201ENSMUST00000200026 1967 ntBASIC12.68□□□□□ -0.38
Clip3B9EHT4 Ldhal6b-201ENSMUST00000189788 1445 ntAPPRIS P1 BASIC12.68□□□□□ -0.38
Clip3B9EHT4 Gm7114-201ENSMUST00000190159 1789 ntBASIC12.68□□□□□ -0.38
Clip3B9EHT4 Eif4enif1-202ENSMUST00000110048 3712 ntTSL 5 BASIC12.68□□□□□ -0.38
Clip3B9EHT4 Micu1-202ENSMUST00000092508 2294 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.68□□□□□ -0.38
Clip3B9EHT4 Mrgprf-201ENSMUST00000033386 2087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.68□□□□□ -0.38
Clip3B9EHT4 Itga2b-201ENSMUST00000103086 3437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.68□□□□□ -0.38
Clip3B9EHT4 Padi2-201ENSMUST00000030765 4774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.68□□□□□ -0.38
Clip3B9EHT4 1110002L01Rik-202ENSMUST00000168012 3569 ntTSL 2 BASIC12.68□□□□□ -0.38
Clip3B9EHT4 Ccdc85a-202ENSMUST00000093253 5431 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.67□□□□□ -0.38
Clip3B9EHT4 Ldha-214ENSMUST00000210815 1535 ntTSL 5 BASIC12.67□□□□□ -0.38
Clip3B9EHT4 Zranb2-201ENSMUST00000029831 2540 ntTSL 5 BASIC12.67□□□□□ -0.38
Clip3B9EHT4 Hnrnpc-211ENSMUST00000228748 1691 ntAPPRIS P5 BASIC12.67□□□□□ -0.38
Clip3B9EHT4 Tcirg1-201ENSMUST00000001801 2688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.67□□□□□ -0.38
Clip3B9EHT4 Gm29455-201ENSMUST00000186504 2659 ntTSL 1 (best) BASIC12.67□□□□□ -0.38
Clip3B9EHT4 Xkr5-202ENSMUST00000095438 2838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.67□□□□□ -0.38
Clip3B9EHT4 Ilvbl-203ENSMUST00000218215 2331 ntTSL 1 (best) BASIC12.67□□□□□ -0.38
Clip3B9EHT4 Ccdc121-201ENSMUST00000058825 1819 ntAPPRIS P1 BASIC12.67□□□□□ -0.38
Clip3B9EHT4 Dph3-202ENSMUST00000067955 2953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.67□□□□□ -0.38
Clip3B9EHT4 Ptp4a1-201ENSMUST00000027232 4145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.67□□□□□ -0.38
Clip3B9EHT4 Ptprk-202ENSMUST00000218276 4754 ntTSL 1 (best) BASIC12.67□□□□□ -0.38
Clip3B9EHT4 Gm2155-201ENSMUST00000181581 1974 ntTSL 1 (best) BASIC12.67□□□□□ -0.38
Clip3B9EHT4 Ggt7-201ENSMUST00000029131 2614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.67□□□□□ -0.38
Clip3B9EHT4 Sqle-201ENSMUST00000022977 2758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.67□□□□□ -0.38
Clip3B9EHT4 Zscan20-202ENSMUST00000097877 5364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.67□□□□□ -0.38
Clip3B9EHT4 Cnbp-209ENSMUST00000204890 1614 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.67□□□□□ -0.38
Clip3B9EHT4 Il13ra1-201ENSMUST00000033418 3712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.67□□□□□ -0.38
Clip3B9EHT4 Uggt2-212ENSMUST00000156203 6456 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.67□□□□□ -0.38
Clip3B9EHT4 4931406C07Rik-208ENSMUST00000216955 1750 ntTSL 1 (best) BASIC12.67□□□□□ -0.38
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