Protein–RNA interactions for Protein: B2RU80

Ptprb, Receptor-type tyrosine-protein phosphatase beta, mousemouse

Predictions only

Length 1,998 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PtprbB2RU80 Klhl29-201ENSMUST00000020958 7041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.52□□□□□ -0.56
PtprbB2RU80 Spo11-203ENSMUST00000109126 1625 ntTSL 1 (best) BASIC11.52□□□□□ -0.56
PtprbB2RU80 Apol9b-201ENSMUST00000109775 1545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.52□□□□□ -0.56
PtprbB2RU80 Smyd3-202ENSMUST00000111134 1229 ntTSL 2 BASIC11.52□□□□□ -0.56
PtprbB2RU80 Dctn6-202ENSMUST00000117243 962 ntTSL 3 BASIC11.52□□□□□ -0.56
PtprbB2RU80 Qdpr-202ENSMUST00000117425 1231 ntTSL 3 BASIC11.52□□□□□ -0.56
PtprbB2RU80 Gm16066-201ENSMUST00000118575 1086 ntTSL 3 BASIC11.52□□□□□ -0.56
PtprbB2RU80 Gm15326-202ENSMUST00000128198 1422 ntTSL 1 (best) BASIC11.52□□□□□ -0.56
PtprbB2RU80 Gm16099-202ENSMUST00000151873 660 ntTSL 5 BASIC11.52□□□□□ -0.56
PtprbB2RU80 Mfrp-202ENSMUST00000161381 4254 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.52□□□□□ -0.56
PtprbB2RU80 Gm25700-201ENSMUST00000177693 110 ntBASIC11.52□□□□□ -0.56
PtprbB2RU80 B230344G16Rik-201ENSMUST00000180782 2024 ntTSL 1 (best) BASIC11.52□□□□□ -0.56
PtprbB2RU80 Gm27023-201ENSMUST00000182372 285 ntBASIC11.52□□□□□ -0.56
PtprbB2RU80 Gm17087-201ENSMUST00000184183 471 ntAPPRIS P1 BASIC11.52□□□□□ -0.56
PtprbB2RU80 2810039B14Rik-206ENSMUST00000185040 1113 ntBASIC11.52□□□□□ -0.56
PtprbB2RU80 Gm42839-201ENSMUST00000198978 525 ntTSL 2 BASIC11.52□□□□□ -0.56
PtprbB2RU80 Gm42800-201ENSMUST00000202494 733 ntTSL 5 BASIC11.52□□□□□ -0.56
PtprbB2RU80 Pcdhgb8-202ENSMUST00000208907 2796 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.52□□□□□ -0.56
PtprbB2RU80 AC110091.3-202ENSMUST00000217104 791 ntTSL 5 BASIC11.52□□□□□ -0.56
PtprbB2RU80 Gpr132-201ENSMUST00000021729 2478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.52□□□□□ -0.56
PtprbB2RU80 AC166095.1-201ENSMUST00000223731 1241 ntBASIC11.52□□□□□ -0.56
PtprbB2RU80 Syngr4-201ENSMUST00000039049 967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.52□□□□□ -0.56
PtprbB2RU80 Hmx2-201ENSMUST00000051997 3102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.52□□□□□ -0.56
PtprbB2RU80 Radil-201ENSMUST00000063635 3700 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.52□□□□□ -0.56
PtprbB2RU80 Mrps21-201ENSMUST00000067298 488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.52□□□□□ -0.56
PtprbB2RU80 Tmem56-203ENSMUST00000128909 6696 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.52□□□□□ -0.56
PtprbB2RU80 Zkscan3-204ENSMUST00000117721 5788 ntTSL 1 (best) BASIC11.52□□□□□ -0.57
PtprbB2RU80 Arhgef40-216ENSMUST00000182760 5130 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.52□□□□□ -0.57
PtprbB2RU80 Arih1-207ENSMUST00000171975 6971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.52□□□□□ -0.57
PtprbB2RU80 Zyx-201ENSMUST00000070635 2301 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.52□□□□□ -0.57
PtprbB2RU80 D6Ertd527e-203ENSMUST00000203747 2216 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.52□□□□□ -0.57
PtprbB2RU80 Ssr1-203ENSMUST00000225246 1825 ntBASIC11.52□□□□□ -0.57
PtprbB2RU80 Gm38157-201ENSMUST00000194178 1698 ntBASIC11.52□□□□□ -0.57
PtprbB2RU80 Fam118b-202ENSMUST00000063782 1662 ntTSL 1 (best) BASIC11.52□□□□□ -0.57
PtprbB2RU80 Tfe3-206ENSMUST00000115679 3239 ntTSL 1 (best) BASIC11.52□□□□□ -0.57
PtprbB2RU80 4930488N24Rik-201ENSMUST00000188802 1527 ntBASIC11.52□□□□□ -0.57
PtprbB2RU80 Cgnl1-203ENSMUST00000122065 4487 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.52□□□□□ -0.57
PtprbB2RU80 Map4k5-202ENSMUST00000110567 4250 ntTSL 5 BASIC11.52□□□□□ -0.57
PtprbB2RU80 Tnfrsf18-202ENSMUST00000103173 1189 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.52□□□□□ -0.57
PtprbB2RU80 Gpr153-202ENSMUST00000105650 3838 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.52□□□□□ -0.57
PtprbB2RU80 Prr29-202ENSMUST00000106816 771 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.52□□□□□ -0.57
PtprbB2RU80 Prox1os-201ENSMUST00000110279 828 ntTSL 1 (best) BASIC11.52□□□□□ -0.57
PtprbB2RU80 Mogat1-202ENSMUST00000113524 1228 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.52□□□□□ -0.57
PtprbB2RU80 Gm11755-201ENSMUST00000144096 891 ntTSL 1 (best) BASIC11.52□□□□□ -0.57
PtprbB2RU80 Gm15979-201ENSMUST00000149741 590 ntTSL 1 (best) BASIC11.52□□□□□ -0.57
PtprbB2RU80 Mcpt8-201ENSMUST00000015594 836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.52□□□□□ -0.57
PtprbB2RU80 Gm24749-201ENSMUST00000157838 343 ntBASIC11.52□□□□□ -0.57
PtprbB2RU80 Gm20470-201ENSMUST00000174654 331 ntTSL 1 (best) BASIC11.52□□□□□ -0.57
PtprbB2RU80 Ovol3-201ENSMUST00000189482 731 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.52□□□□□ -0.57
PtprbB2RU80 5330425B07Rik-201ENSMUST00000196714 1027 ntBASIC11.52□□□□□ -0.57
PtprbB2RU80 3830422I06Rik-201ENSMUST00000200199 1181 ntBASIC11.52□□□□□ -0.57
PtprbB2RU80 Treml1-205ENSMUST00000225849 974 ntAPPRIS ALT2 BASIC11.52□□□□□ -0.57
PtprbB2RU80 AC161537.1-201ENSMUST00000226199 1015 ntBASIC11.52□□□□□ -0.57
PtprbB2RU80 AC123665.1-201ENSMUST00000228204 438 ntBASIC11.52□□□□□ -0.57
PtprbB2RU80 Tmem14a-202ENSMUST00000027065 1168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.52□□□□□ -0.57
PtprbB2RU80 Gm10308-201ENSMUST00000095183 742 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.52□□□□□ -0.57
PtprbB2RU80 Ormdl1-201ENSMUST00000027266 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.51□□□□□ -0.57
PtprbB2RU80 Srrm1-202ENSMUST00000084846 3740 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.51□□□□□ -0.57
PtprbB2RU80 Hspb7-201ENSMUST00000102486 2769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.51□□□□□ -0.57
PtprbB2RU80 Lrrc30-201ENSMUST00000097290 1759 ntAPPRIS P1 BASIC11.51□□□□□ -0.57
PtprbB2RU80 Pdk1-201ENSMUST00000006669 5185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.51□□□□□ -0.57
PtprbB2RU80 Secisbp2-201ENSMUST00000040117 3328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.51□□□□□ -0.57
PtprbB2RU80 Msh4-201ENSMUST00000005630 3325 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.51□□□□□ -0.57
PtprbB2RU80 Pkn2-201ENSMUST00000043812 6207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.51□□□□□ -0.57
PtprbB2RU80 Mtrr-209ENSMUST00000223398 3861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.51□□□□□ -0.57
PtprbB2RU80 Gm7002-201ENSMUST00000221386 2165 ntBASIC11.51□□□□□ -0.57
PtprbB2RU80 Zfp367-201ENSMUST00000059817 3532 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.51□□□□□ -0.57
PtprbB2RU80 Olfr649-202ENSMUST00000106859 1382 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.51□□□□□ -0.57
PtprbB2RU80 Vps29-208ENSMUST00000155671 2716 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.51□□□□□ -0.57
PtprbB2RU80 Gsdma2-201ENSMUST00000017355 1314 ntTSL 1 (best) BASIC11.51□□□□□ -0.57
PtprbB2RU80 Ssfa2-202ENSMUST00000111785 5168 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.51□□□□□ -0.57
PtprbB2RU80 Pnrc2-201ENSMUST00000030436 1919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.51□□□□□ -0.57
PtprbB2RU80 Mir874-201ENSMUST00000104769 76 ntBASIC11.51□□□□□ -0.57
PtprbB2RU80 Myl4-202ENSMUST00000106956 900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.51□□□□□ -0.57
PtprbB2RU80 Gm11531-201ENSMUST00000117614 555 ntBASIC11.51□□□□□ -0.57
PtprbB2RU80 Pdlim2-204ENSMUST00000127836 920 ntTSL 5 BASIC11.51□□□□□ -0.57
PtprbB2RU80 Gm11961-202ENSMUST00000141157 760 ntTSL 3 BASIC11.51□□□□□ -0.57
PtprbB2RU80 Gm23363-201ENSMUST00000175024 79 ntBASIC11.51□□□□□ -0.57
PtprbB2RU80 Tnnt1-213ENSMUST00000178163 934 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.51□□□□□ -0.57
PtprbB2RU80 Mocs2-215ENSMUST00000184335 646 ntTSL 5 BASIC11.51□□□□□ -0.57
PtprbB2RU80 Pfn1-201ENSMUST00000018437 861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.51□□□□□ -0.57
PtprbB2RU80 Myl4-201ENSMUST00000018800 879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.51□□□□□ -0.57
PtprbB2RU80 Gm37201-201ENSMUST00000191845 523 ntBASIC11.51□□□□□ -0.57
PtprbB2RU80 4930539M17Rik-201ENSMUST00000194792 846 ntTSL 1 (best) BASIC11.51□□□□□ -0.57
PtprbB2RU80 Gm45224-201ENSMUST00000208203 414 ntBASIC11.51□□□□□ -0.57
PtprbB2RU80 Gm8959-201ENSMUST00000213150 571 ntBASIC11.51□□□□□ -0.57
PtprbB2RU80 Prss39-201ENSMUST00000027299 1267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.51□□□□□ -0.57
PtprbB2RU80 Slc12a4-201ENSMUST00000034370 3811 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.51□□□□□ -0.57
PtprbB2RU80 Gm22058-201ENSMUST00000083393 310 ntBASIC11.51□□□□□ -0.57
PtprbB2RU80 Dmrtc1c2-201ENSMUST00000087896 1255 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.51□□□□□ -0.57
PtprbB2RU80 Fam84b-201ENSMUST00000100635 5565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.51□□□□□ -0.57
PtprbB2RU80 Espnl-201ENSMUST00000088904 5445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.51□□□□□ -0.57
PtprbB2RU80 9030407P20Rik-201ENSMUST00000180933 2310 ntTSL 1 (best) BASIC11.51□□□□□ -0.57
PtprbB2RU80 Galnt13-203ENSMUST00000112635 7531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.51□□□□□ -0.57
PtprbB2RU80 Smc5-202ENSMUST00000223934 3448 ntAPPRIS P2 BASIC11.51□□□□□ -0.57
PtprbB2RU80 Micalcl-201ENSMUST00000033033 2259 ntTSL 1 (best) BASIC11.51□□□□□ -0.57
PtprbB2RU80 Usp17le-201ENSMUST00000053464 1626 ntTSL 5 BASIC11.51□□□□□ -0.57
PtprbB2RU80 Alk-201ENSMUST00000086639 4866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.51□□□□□ -0.57
PtprbB2RU80 Necab1-202ENSMUST00000108273 2135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.51□□□□□ -0.57
PtprbB2RU80 Kcnd3-201ENSMUST00000079169 2102 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.51□□□□□ -0.57
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 30.8 ms