Protein–RNA interactions for Protein: B2RRD7

Brpf1, Peregrin, mousemouse

Predictions only

Length 1,212 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Brpf1B2RRD7 Cttnbp2nl-202ENSMUST00000098763 4834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Brpf1B2RRD7 Gm7993-201ENSMUST00000200970 1384 ntBASIC16.28■□□□□ 0.2
Brpf1B2RRD7 Wfdc1-201ENSMUST00000024107 1371 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Brpf1B2RRD7 Fbn1-201ENSMUST00000028633 9847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Brpf1B2RRD7 Rgs12-202ENSMUST00000087684 4713 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.28■□□□□ 0.2
Brpf1B2RRD7 Lipe-202ENSMUST00000054301 2661 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Brpf1B2RRD7 Gm9924-202ENSMUST00000192760 2311 ntBASIC16.28■□□□□ 0.2
Brpf1B2RRD7 H2-DMb2-201ENSMUST00000041982 1347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Brpf1B2RRD7 Rnf214-201ENSMUST00000058720 3964 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Brpf1B2RRD7 D030068K23Rik-201ENSMUST00000180382 2617 ntTSL 2 BASIC16.28■□□□□ 0.2
Brpf1B2RRD7 Miat-205ENSMUST00000182953 9163 ntTSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Brpf1B2RRD7 P3h2-201ENSMUST00000039990 3283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Brpf1B2RRD7 Dao-203ENSMUST00000161610 1633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Brpf1B2RRD7 Zfp157-202ENSMUST00000100524 869 ntTSL 3 BASIC16.28■□□□□ 0.2
Brpf1B2RRD7 Cryba4-203ENSMUST00000112385 808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Brpf1B2RRD7 Selenoh-203ENSMUST00000117299 747 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Brpf1B2RRD7 C030047K22Rik-201ENSMUST00000150382 1164 ntTSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Brpf1B2RRD7 Gm2639-201ENSMUST00000156881 1297 ntBASIC16.28■□□□□ 0.2
Brpf1B2RRD7 Mad2l1bp-201ENSMUST00000171172 1269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Brpf1B2RRD7 Tmem205-202ENSMUST00000178988 862 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.28■□□□□ 0.2
Brpf1B2RRD7 Dnm3os-203ENSMUST00000185878 557 ntTSL 5 BASIC16.28■□□□□ 0.2
Brpf1B2RRD7 Spc24-204ENSMUST00000216057 627 ntTSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Brpf1B2RRD7 Sall4-202ENSMUST00000075044 2534 ntTSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Brpf1B2RRD7 Brd4-201ENSMUST00000003726 5955 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Brpf1B2RRD7 Arcn1-201ENSMUST00000034607 4072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Brpf1B2RRD7 Prrt3-203ENSMUST00000204268 3741 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Brpf1B2RRD7 2900097C17Rik-202ENSMUST00000192863 4915 ntBASIC16.28■□□□□ 0.2
Brpf1B2RRD7 Hk1-202ENSMUST00000099691 4278 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Brpf1B2RRD7 Gm34376-201ENSMUST00000218529 2107 ntTSL 5 BASIC16.28■□□□□ 0.2
Brpf1B2RRD7 Pcdh7-203ENSMUST00000191837 8785 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Brpf1B2RRD7 Gm42928-201ENSMUST00000197338 3339 ntBASIC16.28■□□□□ 0.2
Brpf1B2RRD7 Sostdc1-201ENSMUST00000041407 1781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Brpf1B2RRD7 Gm4782-201ENSMUST00000168705 2046 ntBASIC16.28■□□□□ 0.2
Brpf1B2RRD7 Fsd1-201ENSMUST00000011733 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Brpf1B2RRD7 Mageb10-ps-201ENSMUST00000119697 1407 ntBASIC16.28■□□□□ 0.2
Brpf1B2RRD7 4933416C03Rik-201ENSMUST00000099261 2254 ntAPPRIS P1 BASIC16.28■□□□□ 0.2
Brpf1B2RRD7 Gm43570-201ENSMUST00000199951 3688 ntBASIC16.27■□□□□ 0.2
Brpf1B2RRD7 Mob1a-202ENSMUST00000055261 4412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Brpf1B2RRD7 Sh3bp4-201ENSMUST00000066279 4995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Brpf1B2RRD7 Caskin2-201ENSMUST00000041684 4929 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Brpf1B2RRD7 Gm44065-201ENSMUST00000203184 3527 ntBASIC16.27■□□□□ 0.2
Brpf1B2RRD7 Cbs-202ENSMUST00000078509 2403 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Brpf1B2RRD7 AC238940.1-201ENSMUST00000225106 1858 ntBASIC16.27■□□□□ 0.2
Brpf1B2RRD7 Alas1-201ENSMUST00000074082 2129 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Brpf1B2RRD7 Unc45bos-201ENSMUST00000156395 1306 ntTSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Brpf1B2RRD7 Arrdc4-201ENSMUST00000048068 3905 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Brpf1B2RRD7 Esm1-201ENSMUST00000038144 2097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Brpf1B2RRD7 Metap2-206ENSMUST00000180840 2551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Brpf1B2RRD7 Snap25-202ENSMUST00000110098 1014 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC16.27■□□□□ 0.2
Brpf1B2RRD7 Mapkapk5-205ENSMUST00000111786 975 ntTSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Brpf1B2RRD7 Gm43763-201ENSMUST00000201761 683 ntTSL 3 BASIC16.27■□□□□ 0.2
Brpf1B2RRD7 4933424G06Rik-204ENSMUST00000208994 1120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Brpf1B2RRD7 1810062G17Rik-201ENSMUST00000029268 911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Brpf1B2RRD7 Slc8b1-204ENSMUST00000111890 2775 ntTSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Brpf1B2RRD7 Gucd1-201ENSMUST00000039796 3500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Brpf1B2RRD7 Blzf1-203ENSMUST00000120447 2430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
Brpf1B2RRD7 Dnmt3l-208ENSMUST00000151242 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
Brpf1B2RRD7 Ackr4-204ENSMUST00000219146 1654 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.27■□□□□ 0.19
Brpf1B2RRD7 Tbkbp1-201ENSMUST00000066078 3338 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.27■□□□□ 0.19
Brpf1B2RRD7 Polr3g-201ENSMUST00000048993 3054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
Brpf1B2RRD7 Prpf38b-201ENSMUST00000029480 3026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
Brpf1B2RRD7 Adam33-202ENSMUST00000110232 3165 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Brpf1B2RRD7 Gm45684-201ENSMUST00000210244 1571 ntBASIC16.26■□□□□ 0.19
Brpf1B2RRD7 Mfn2-203ENSMUST00000105715 4043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Brpf1B2RRD7 Gm26880-201ENSMUST00000181610 1318 ntTSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
Brpf1B2RRD7 Map4k2-201ENSMUST00000025897 4644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Brpf1B2RRD7 Gm16202-201ENSMUST00000117532 544 ntBASIC16.26■□□□□ 0.19
Brpf1B2RRD7 Gm13369-201ENSMUST00000119442 987 ntBASIC16.26■□□□□ 0.19
Brpf1B2RRD7 Pla2g10os-201ENSMUST00000141172 174 ntTSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
Brpf1B2RRD7 Prr29-204ENSMUST00000188561 592 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
Brpf1B2RRD7 Prr29-206ENSMUST00000190795 822 ntTSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
Brpf1B2RRD7 Ssr2-202ENSMUST00000192495 620 ntTSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
Brpf1B2RRD7 Dnajb6-210ENSMUST00000196528 1018 ntTSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
Brpf1B2RRD7 Gm19184-201ENSMUST00000196798 928 ntBASIC16.26■□□□□ 0.19
Brpf1B2RRD7 Chfr-212ENSMUST00000200038 606 ntTSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Brpf1B2RRD7 Gm19309-201ENSMUST00000218295 205 ntBASIC16.26■□□□□ 0.19
Brpf1B2RRD7 Lsm7-208ENSMUST00000220225 1129 ntTSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Brpf1B2RRD7 AC132317.1-201ENSMUST00000227227 962 ntBASIC16.26■□□□□ 0.19
Brpf1B2RRD7 AC134335.2-201ENSMUST00000227660 440 ntBASIC16.26■□□□□ 0.19
Brpf1B2RRD7 Gm9823-201ENSMUST00000051212 327 ntBASIC16.26■□□□□ 0.19
Brpf1B2RRD7 Nkiras2-202ENSMUST00000051947 831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Brpf1B2RRD7 Pin1rt1-201ENSMUST00000099659 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Brpf1B2RRD7 Nphp4-201ENSMUST00000056567 4583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Brpf1B2RRD7 Pdgfc-201ENSMUST00000029652 3521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Brpf1B2RRD7 Akna-201ENSMUST00000035724 5387 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
Brpf1B2RRD7 Eif5b-201ENSMUST00000027252 7797 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.26■□□□□ 0.19
Brpf1B2RRD7 Adsl-206ENSMUST00000168756 1439 ntTSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
Brpf1B2RRD7 Zbtb20-205ENSMUST00000114695 2977 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Brpf1B2RRD7 Cplx2-201ENSMUST00000026985 4928 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.26■□□□□ 0.19
Brpf1B2RRD7 Zfp467-203ENSMUST00000114558 3115 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Brpf1B2RRD7 Rps6ka4-202ENSMUST00000170516 3105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Brpf1B2RRD7 Rps6ka4-201ENSMUST00000025903 3105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Brpf1B2RRD7 Ctsa-203ENSMUST00000103093 2534 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Brpf1B2RRD7 Zranb2-201ENSMUST00000029831 2540 ntTSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
Brpf1B2RRD7 Fscn2-201ENSMUST00000026445 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Brpf1B2RRD7 Slc11a2-201ENSMUST00000023774 3025 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Brpf1B2RRD7 Vax2os-203ENSMUST00000155159 4063 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Brpf1B2RRD7 Zfp146-201ENSMUST00000062181 2029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Brpf1B2RRD7 Zfp583-201ENSMUST00000062765 2550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Brpf1B2RRD7 Kdm3a-214ENSMUST00000207023 4753 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 29.3 ms