Protein–RNA interactions for Protein: B1ASB6

Spocd1, SPOC domain-containing 1, mousemouse

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Length 936 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Spocd1B1ASB6 Alkbh3-201ENSMUST00000040005 1228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Spocd1B1ASB6 Atpif1-201ENSMUST00000067496 539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Spocd1B1ASB6 Ctbp2-209ENSMUST00000166439 1997 ntTSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Spocd1B1ASB6 Olfr322-202ENSMUST00000213232 4632 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.59□□□□□ -0.07
Spocd1B1ASB6 BC048403-202ENSMUST00000136432 2968 ntTSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Spocd1B1ASB6 Mfge8-202ENSMUST00000107409 2008 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Spocd1B1ASB6 E130308A19Rik-201ENSMUST00000052420 3205 ntTSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Spocd1B1ASB6 Adcyap1r1-206ENSMUST00000167234 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.59□□□□□ -0.07
Spocd1B1ASB6 Eif4e2-206ENSMUST00000113233 1807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Spocd1B1ASB6 Myh7-204ENSMUST00000168485 6230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Spocd1B1ASB6 Mrgprf-201ENSMUST00000033386 2087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Spocd1B1ASB6 Micu1-201ENSMUST00000020311 2336 ntTSL 5 BASIC14.59□□□□□ -0.07
Spocd1B1ASB6 Bdp1-201ENSMUST00000038104 9921 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.59□□□□□ -0.07
Spocd1B1ASB6 Rgma-201ENSMUST00000094312 3586 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Spocd1B1ASB6 Arhgef2-201ENSMUST00000029694 4300 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Spocd1B1ASB6 Fgfr3-209ENSMUST00000164207 4150 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Spocd1B1ASB6 Dcun1d3-206ENSMUST00000207233 2917 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.59□□□□□ -0.07
Spocd1B1ASB6 Rpsa-201ENSMUST00000035105 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.07
Spocd1B1ASB6 Sacs-202ENSMUST00000119509 3468 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.58□□□□□ -0.07
Spocd1B1ASB6 AC096628.2-201ENSMUST00000225443 1413 ntBASIC14.58□□□□□ -0.07
Spocd1B1ASB6 Lgals12-203ENSMUST00000159983 2470 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.07
Spocd1B1ASB6 Gm44891-201ENSMUST00000208817 2223 ntBASIC14.58□□□□□ -0.07
Spocd1B1ASB6 Gm9754-201ENSMUST00000031305 3004 ntTSL 2 BASIC14.58□□□□□ -0.07
Spocd1B1ASB6 Acbd5-213ENSMUST00000227809 1986 ntAPPRIS ALT2 BASIC14.58□□□□□ -0.07
Spocd1B1ASB6 Zbp1-201ENSMUST00000029018 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.07
Spocd1B1ASB6 Rnf19b-202ENSMUST00000097874 1992 ntTSL 5 BASIC14.58□□□□□ -0.07
Spocd1B1ASB6 Fsd1-201ENSMUST00000011733 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.07
Spocd1B1ASB6 Hsd3b3-201ENSMUST00000090743 1492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Spocd1B1ASB6 Urgcp-203ENSMUST00000118076 4208 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Spocd1B1ASB6 Laptm5-207ENSMUST00000151698 2600 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Spocd1B1ASB6 Islr-202ENSMUST00000168864 2076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Spocd1B1ASB6 Dctn4-202ENSMUST00000223590 1530 ntBASIC14.58□□□□□ -0.08
Spocd1B1ASB6 Net1-201ENSMUST00000091853 2680 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Spocd1B1ASB6 Ypel3-202ENSMUST00000106356 785 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.58□□□□□ -0.08
Spocd1B1ASB6 Gm15198-201ENSMUST00000117283 177 ntBASIC14.58□□□□□ -0.08
Spocd1B1ASB6 Gm13834-201ENSMUST00000123757 137 ntTSL 3 BASIC14.58□□□□□ -0.08
Spocd1B1ASB6 Myadml2os-201ENSMUST00000126642 1044 ntTSL 5 BASIC14.58□□□□□ -0.08
Spocd1B1ASB6 Gm16282-201ENSMUST00000162641 451 ntTSL 3 BASIC14.58□□□□□ -0.08
Spocd1B1ASB6 Naa60-209ENSMUST00000175809 279 ntTSL 5 BASIC14.58□□□□□ -0.08
Spocd1B1ASB6 Gm26721-201ENSMUST00000181723 992 ntTSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Spocd1B1ASB6 Abhd14b-202ENSMUST00000185347 1200 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.58□□□□□ -0.08
Spocd1B1ASB6 Mturn-202ENSMUST00000187701 503 ntTSL 5 BASIC14.58□□□□□ -0.08
Spocd1B1ASB6 Taf1d-201ENSMUST00000034415 1148 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Spocd1B1ASB6 Mrps22-201ENSMUST00000035034 1197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Spocd1B1ASB6 Smim13-201ENSMUST00000165561 4483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Spocd1B1ASB6 Alx4-202ENSMUST00000111254 7056 ntTSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Spocd1B1ASB6 Rcbtb2-202ENSMUST00000110952 2176 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Spocd1B1ASB6 Tcf4-226ENSMUST00000201094 2172 ntTSL 5 BASIC14.58□□□□□ -0.08
Spocd1B1ASB6 Ccdc71-201ENSMUST00000061209 3092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Spocd1B1ASB6 Ninj1-202ENSMUST00000120733 1321 ntTSL 5 BASIC14.58□□□□□ -0.08
Spocd1B1ASB6 Pex12-207ENSMUST00000176518 2501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Spocd1B1ASB6 Nup205-204ENSMUST00000201374 6411 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Spocd1B1ASB6 Sept12-201ENSMUST00000170323 2576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Spocd1B1ASB6 Ggnbp1-203ENSMUST00000133257 5012 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Spocd1B1ASB6 Creld2-201ENSMUST00000024042 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Spocd1B1ASB6 Ntm-203ENSMUST00000115237 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Spocd1B1ASB6 Kifc1-204ENSMUST00000173492 2350 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Spocd1B1ASB6 Clcn6-201ENSMUST00000030879 3306 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Spocd1B1ASB6 Apbb1-212ENSMUST00000189072 2085 ntTSL 5 BASIC14.57□□□□□ -0.08
Spocd1B1ASB6 Nrf1-209ENSMUST00000115209 2406 ntTSL 5 BASIC14.57□□□□□ -0.08
Spocd1B1ASB6 E230029C05Rik-202ENSMUST00000207458 2445 ntTSL 5 BASIC14.57□□□□□ -0.08
Spocd1B1ASB6 Lgals12-202ENSMUST00000099729 2757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Spocd1B1ASB6 Col9a3-201ENSMUST00000103059 2846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Spocd1B1ASB6 Gm45003-201ENSMUST00000205875 2158 ntBASIC14.57□□□□□ -0.08
Spocd1B1ASB6 Mknk1-201ENSMUST00000019677 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Spocd1B1ASB6 Gm3693-201ENSMUST00000182077 2865 ntTSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Spocd1B1ASB6 Esr1-204ENSMUST00000105590 6339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Spocd1B1ASB6 Heatr3-201ENSMUST00000034079 3251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Spocd1B1ASB6 Lingo1-202ENSMUST00000114247 2287 ntTSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Spocd1B1ASB6 Clec11a-201ENSMUST00000004587 2978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Spocd1B1ASB6 Ilvbl-208ENSMUST00000218875 3020 ntTSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Spocd1B1ASB6 Grb2-203ENSMUST00000106497 2683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Spocd1B1ASB6 Men1-208ENSMUST00000113504 2663 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Spocd1B1ASB6 Rbm11-203ENSMUST00000114253 2699 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Spocd1B1ASB6 Rnps1-202ENSMUST00000115371 1617 ntTSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Spocd1B1ASB6 Gm14350-201ENSMUST00000116642 640 ntBASIC14.57□□□□□ -0.08
Spocd1B1ASB6 C8g-201ENSMUST00000015227 822 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Spocd1B1ASB6 Ppm1h-208ENSMUST00000162969 811 ntTSL 3 BASIC14.57□□□□□ -0.08
Spocd1B1ASB6 Ube2m-208ENSMUST00000165394 1228 ntTSL 5 BASIC14.57□□□□□ -0.08
Spocd1B1ASB6 Smad7-204ENSMUST00000174411 769 ntTSL 5 BASIC14.57□□□□□ -0.08
Spocd1B1ASB6 Proscos-202ENSMUST00000178990 666 ntBASIC14.57□□□□□ -0.08
Spocd1B1ASB6 Gm8565-201ENSMUST00000183259 1014 ntBASIC14.57□□□□□ -0.08
Spocd1B1ASB6 Gm43714-201ENSMUST00000198351 1204 ntTSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Spocd1B1ASB6 3830422I06Rik-201ENSMUST00000200199 1181 ntBASIC14.57□□□□□ -0.08
Spocd1B1ASB6 Gm44974-201ENSMUST00000206387 1279 ntBASIC14.57□□□□□ -0.08
Spocd1B1ASB6 Gm40466-201ENSMUST00000212174 422 ntBASIC14.57□□□□□ -0.08
Spocd1B1ASB6 AC126253.1-201ENSMUST00000227974 824 ntBASIC14.57□□□□□ -0.08
Spocd1B1ASB6 Krtcap2-201ENSMUST00000040888 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Spocd1B1ASB6 Gm11562-201ENSMUST00000073853 817 ntAPPRIS P1 BASIC14.57□□□□□ -0.08
Spocd1B1ASB6 Gm8399-201ENSMUST00000082300 1117 ntBASIC14.57□□□□□ -0.08
Spocd1B1ASB6 Zfp422-202ENSMUST00000079749 3187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Spocd1B1ASB6 Gm11661-201ENSMUST00000121761 1327 ntBASIC14.57□□□□□ -0.08
Spocd1B1ASB6 Armcx6-202ENSMUST00000113194 2120 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.57□□□□□ -0.08
Spocd1B1ASB6 Omp-201ENSMUST00000098281 2144 ntAPPRIS P1 BASIC14.57□□□□□ -0.08
Spocd1B1ASB6 Ccdc85a-204ENSMUST00000109502 5220 ntTSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Spocd1B1ASB6 Psmb9-204ENSMUST00000174576 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Spocd1B1ASB6 Mpp3-202ENSMUST00000100400 2997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Spocd1B1ASB6 Gm38094-201ENSMUST00000195864 2978 ntBASIC14.57□□□□□ -0.08
Spocd1B1ASB6 Sirt2-201ENSMUST00000072965 1843 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Spocd1B1ASB6 Sox11-201ENSMUST00000079063 8311 ntAPPRIS P1 BASIC14.57□□□□□ -0.08
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