Protein–RNA interactions for Protein: B1ARD6

Slfn9, Schlafen 9, mousemouse

Predictions only

Length 910 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Slfn9B1ARD6 Mmp28-202ENSMUST00000103209 3438 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.32
Slfn9B1ARD6 Fam160a2-201ENSMUST00000048079 3443 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.32
Slfn9B1ARD6 Bpi-203ENSMUST00000109500 1911 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.02□□□□□ -0.32
Slfn9B1ARD6 Dmbx1-201ENSMUST00000064806 5799 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.32
Slfn9B1ARD6 Cpt1c-206ENSMUST00000212836 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.32
Slfn9B1ARD6 Ubxn10-201ENSMUST00000105809 2757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.32
Slfn9B1ARD6 Dll1-201ENSMUST00000014917 3581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.32
Slfn9B1ARD6 Stpg2-202ENSMUST00000106239 2055 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.02□□□□□ -0.33
Slfn9B1ARD6 Gm12416-201ENSMUST00000120911 1008 ntBASIC13.02□□□□□ -0.33
Slfn9B1ARD6 Gm13562-201ENSMUST00000125198 797 ntTSL 2 BASIC13.02□□□□□ -0.33
Slfn9B1ARD6 Snhg20-201ENSMUST00000145438 459 ntTSL 3 BASIC13.02□□□□□ -0.33
Slfn9B1ARD6 Gm16282-201ENSMUST00000162641 451 ntTSL 3 BASIC13.02□□□□□ -0.33
Slfn9B1ARD6 Gm6460-202ENSMUST00000163787 821 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
Slfn9B1ARD6 Gm8879-201ENSMUST00000170260 1125 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.02□□□□□ -0.33
Slfn9B1ARD6 4933402N22Rik-202ENSMUST00000170301 1092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
Slfn9B1ARD6 Gm37933-201ENSMUST00000193964 981 ntTSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
Slfn9B1ARD6 Sox2ot-208ENSMUST00000197103 802 ntTSL 2 BASIC13.02□□□□□ -0.33
Slfn9B1ARD6 Gm44756-201ENSMUST00000206172 1069 ntTSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
Slfn9B1ARD6 Wfdc1-202ENSMUST00000212901 921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
Slfn9B1ARD6 Gm11427-203ENSMUST00000215482 1203 ntTSL 5 BASIC13.02□□□□□ -0.33
Slfn9B1ARD6 Gm18027-201ENSMUST00000218947 619 ntBASIC13.02□□□□□ -0.33
Slfn9B1ARD6 Dmac1-201ENSMUST00000030103 741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
Slfn9B1ARD6 Lrp8os1-201ENSMUST00000030352 672 ntTSL 5 BASIC13.02□□□□□ -0.33
Slfn9B1ARD6 Csrp3-201ENSMUST00000032658 877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
Slfn9B1ARD6 Ccdc33-202ENSMUST00000098681 1093 ntTSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
Slfn9B1ARD6 Armcx2-203ENSMUST00000119010 3007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
Slfn9B1ARD6 Pcdh8-201ENSMUST00000039568 4000 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
Slfn9B1ARD6 Clcn3-204ENSMUST00000110301 4099 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
Slfn9B1ARD6 Pdgfra-205ENSMUST00000201711 4088 ntTSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
Slfn9B1ARD6 Rgs6-204ENSMUST00000185674 1362 ntTSL 5 BASIC13.02□□□□□ -0.33
Slfn9B1ARD6 Tspan32-205ENSMUST00000105924 1478 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
Slfn9B1ARD6 Smim13-201ENSMUST00000165561 4483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
Slfn9B1ARD6 Cacna1g-204ENSMUST00000107785 7523 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.02□□□□□ -0.33
Slfn9B1ARD6 Ccdc30-202ENSMUST00000063642 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
Slfn9B1ARD6 Bcl2l1-202ENSMUST00000109820 2568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
Slfn9B1ARD6 Nfe2-205ENSMUST00000133600 1605 ntTSL 5 BASIC13.02□□□□□ -0.33
Slfn9B1ARD6 Aire-216ENSMUST00000156417 1627 ntTSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
Slfn9B1ARD6 Tnpo2-202ENSMUST00000166592 4884 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.02□□□□□ -0.33
Slfn9B1ARD6 Gm38037-201ENSMUST00000192600 1624 ntBASIC13.02□□□□□ -0.33
Slfn9B1ARD6 Il12rb1-201ENSMUST00000000808 2873 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
Slfn9B1ARD6 Setdb2-205ENSMUST00000161459 2995 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
Slfn9B1ARD6 Sh3bp2-202ENSMUST00000101316 3031 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
Slfn9B1ARD6 Ces2f-201ENSMUST00000076384 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
Slfn9B1ARD6 Gm13722-201ENSMUST00000117964 3066 ntBASIC13.02□□□□□ -0.33
Slfn9B1ARD6 Selenot-201ENSMUST00000107924 3157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
Slfn9B1ARD6 Gm10433-202ENSMUST00000146364 1984 ntTSL 2 BASIC13.01□□□□□ -0.33
Slfn9B1ARD6 Gm17435-202ENSMUST00000212699 1998 ntBASIC13.01□□□□□ -0.33
Slfn9B1ARD6 Gm45706-201ENSMUST00000213063 2136 ntBASIC13.01□□□□□ -0.33
Slfn9B1ARD6 Dct-201ENSMUST00000022725 2202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Slfn9B1ARD6 Tbc1d16-201ENSMUST00000036113 6986 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Slfn9B1ARD6 Alx4-202ENSMUST00000111254 7056 ntTSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Slfn9B1ARD6 Rrnad1-201ENSMUST00000005016 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Slfn9B1ARD6 Ntsr1-202ENSMUST00000170448 2594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Slfn9B1ARD6 Stard5-202ENSMUST00000117410 2832 ntTSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Slfn9B1ARD6 Cldn34c1-201ENSMUST00000113343 3301 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Slfn9B1ARD6 Tmem53-202ENSMUST00000106433 913 ntTSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Slfn9B1ARD6 Gm15371-201ENSMUST00000117057 784 ntBASIC13.01□□□□□ -0.33
Slfn9B1ARD6 Gm15948-201ENSMUST00000150616 403 ntTSL 3 BASIC13.01□□□□□ -0.33
Slfn9B1ARD6 Gm25927-201ENSMUST00000175058 117 ntBASIC13.01□□□□□ -0.33
Slfn9B1ARD6 Cox6b2-204ENSMUST00000182173 391 ntTSL 2 BASIC13.01□□□□□ -0.33
Slfn9B1ARD6 Gm37047-201ENSMUST00000191992 533 ntTSL 5 BASIC13.01□□□□□ -0.33
Slfn9B1ARD6 9430085M18Rik-201ENSMUST00000198824 1178 ntTSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Slfn9B1ARD6 Gm43403-202ENSMUST00000198830 370 ntTSL 3 BASIC13.01□□□□□ -0.33
Slfn9B1ARD6 Rdh5-201ENSMUST00000026406 1258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Slfn9B1ARD6 Alkbh3-201ENSMUST00000040005 1228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Slfn9B1ARD6 Acp5-202ENSMUST00000115315 1349 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.01□□□□□ -0.33
Slfn9B1ARD6 Ckmt2-201ENSMUST00000022122 1486 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Slfn9B1ARD6 Yeats2-201ENSMUST00000090052 5997 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Slfn9B1ARD6 Dab2ip-204ENSMUST00000112983 6051 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Slfn9B1ARD6 Gm12020-201ENSMUST00000119030 2042 ntBASIC13.01□□□□□ -0.33
Slfn9B1ARD6 Atp6ap1-202ENSMUST00000114171 2157 ntTSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Slfn9B1ARD6 Wwox-201ENSMUST00000004756 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Slfn9B1ARD6 Foxred1-202ENSMUST00000127996 2289 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Slfn9B1ARD6 Nup88-203ENSMUST00000108531 2453 ntTSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Slfn9B1ARD6 Ttpa-203ENSMUST00000121491 2862 ntTSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Slfn9B1ARD6 Hk1-205ENSMUST00000130422 2916 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.01□□□□□ -0.33
Slfn9B1ARD6 Grtp1-206ENSMUST00000210317 3013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Slfn9B1ARD6 Evi5l-203ENSMUST00000176149 3938 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.01□□□□□ -0.33
Slfn9B1ARD6 Fbxl12-203ENSMUST00000131128 4182 ntTSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Slfn9B1ARD6 Akna-201ENSMUST00000035724 5387 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.01□□□□□ -0.33
Slfn9B1ARD6 Ankrd17-201ENSMUST00000014421 10458 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC13.01□□□□□ -0.33
Slfn9B1ARD6 Tbc1d9b-201ENSMUST00000093138 4407 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Slfn9B1ARD6 Sltm-206ENSMUST00000216816 3755 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13□□□□□ -0.33
Slfn9B1ARD6 2810430I11Rik-201ENSMUST00000154246 3416 ntTSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Slfn9B1ARD6 Eps15l1-201ENSMUST00000163643 3129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Slfn9B1ARD6 Cyth1-201ENSMUST00000017276 3135 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Slfn9B1ARD6 Crmp1-201ENSMUST00000031004 2906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Slfn9B1ARD6 Dlgap1-208ENSMUST00000135938 2895 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Slfn9B1ARD6 Cnot3-201ENSMUST00000038913 2822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Slfn9B1ARD6 4930520O04Rik-202ENSMUST00000131898 2660 ntTSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Slfn9B1ARD6 Susd2-201ENSMUST00000077610 2275 ntTSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Slfn9B1ARD6 Hjurp-206ENSMUST00000147393 2030 ntTSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Slfn9B1ARD6 Glmn-202ENSMUST00000082121 1945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Slfn9B1ARD6 Aldh3b1-201ENSMUST00000051803 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Slfn9B1ARD6 Trim15-201ENSMUST00000025329 1843 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Slfn9B1ARD6 Rims1-205ENSMUST00000097811 6446 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC13□□□□□ -0.33
Slfn9B1ARD6 Ins2-205ENSMUST00000105933 552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Slfn9B1ARD6 Ins2-206ENSMUST00000105934 480 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13□□□□□ -0.33
Slfn9B1ARD6 Gm42420-201ENSMUST00000126621 634 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13□□□□□ -0.33
Slfn9B1ARD6 Ccdc24-209ENSMUST00000171052 891 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13□□□□□ -0.33
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 27.6 ms