Protein–RNA interactions for Protein: A2AKX3

Setx, Probable helicase senataxin, mousemouse

Predictions only

Length 2,646 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SetxA2AKX3 D630033O11Rik-204ENSMUST00000210588 1358 ntTSL 5 BASIC11.64□□□□□ -0.55
SetxA2AKX3 Gm45717-201ENSMUST00000211129 495 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.64□□□□□ -0.55
SetxA2AKX3 Casc4-201ENSMUST00000078752 4215 ntTSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
SetxA2AKX3 Elp4-202ENSMUST00000122965 3048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
SetxA2AKX3 Msx3-201ENSMUST00000055353 2356 ntTSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
SetxA2AKX3 Cdk5rap3-201ENSMUST00000103152 2250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
SetxA2AKX3 Arhgef33-202ENSMUST00000223878 3253 ntAPPRIS P1 BASIC11.64□□□□□ -0.55
SetxA2AKX3 Arhgef33-201ENSMUST00000068175 3260 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.64□□□□□ -0.55
SetxA2AKX3 Gm38355-201ENSMUST00000192514 1570 ntBASIC11.64□□□□□ -0.55
SetxA2AKX3 Dnajb4-201ENSMUST00000029669 1497 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.64□□□□□ -0.55
SetxA2AKX3 Gk-201ENSMUST00000026039 4340 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
SetxA2AKX3 Psmd12-202ENSMUST00000106750 1311 ntTSL 5 BASIC11.64□□□□□ -0.55
SetxA2AKX3 Gm5525-201ENSMUST00000190438 1312 ntBASIC11.64□□□□□ -0.55
SetxA2AKX3 Rcsd1-201ENSMUST00000040357 2622 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
SetxA2AKX3 Actn4-201ENSMUST00000068045 3877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
SetxA2AKX3 Gm14190-201ENSMUST00000105073 153 ntAPPRIS P1 BASIC11.64□□□□□ -0.55
SetxA2AKX3 Gm11980-201ENSMUST00000121445 986 ntBASIC11.64□□□□□ -0.55
SetxA2AKX3 4631405J19Rik-204ENSMUST00000145926 936 ntTSL 3 BASIC11.64□□□□□ -0.55
SetxA2AKX3 Gm13832-202ENSMUST00000151159 370 ntTSL 3 BASIC11.64□□□□□ -0.55
SetxA2AKX3 Plekhd1os-201ENSMUST00000153297 944 ntTSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
SetxA2AKX3 Cox6c-203ENSMUST00000153512 738 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.64□□□□□ -0.55
SetxA2AKX3 Gm22144-201ENSMUST00000157402 102 ntBASIC11.64□□□□□ -0.55
SetxA2AKX3 Gm17231-202ENSMUST00000165858 663 ntTSL 5 BASIC11.64□□□□□ -0.55
SetxA2AKX3 Gm34821-201ENSMUST00000208399 1031 ntTSL 5 BASIC11.64□□□□□ -0.55
SetxA2AKX3 8030455M16Rik-201ENSMUST00000213014 902 ntTSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
SetxA2AKX3 Smco2-201ENSMUST00000032433 1276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
SetxA2AKX3 0610009O20Rik-201ENSMUST00000025314 2404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
SetxA2AKX3 Anxa11-201ENSMUST00000022416 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
SetxA2AKX3 Uck2-202ENSMUST00000053686 4731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
SetxA2AKX3 Pigh-201ENSMUST00000072154 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
SetxA2AKX3 Acot6-201ENSMUST00000056822 3388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
SetxA2AKX3 Mlkl-202ENSMUST00000120432 1976 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
SetxA2AKX3 Tspan13-201ENSMUST00000020896 1932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
SetxA2AKX3 Ptpre-201ENSMUST00000073961 5410 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
SetxA2AKX3 Smarcb1-202ENSMUST00000121304 1622 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
SetxA2AKX3 AC130671.2-201ENSMUST00000227224 1621 ntBASIC11.63□□□□□ -0.55
SetxA2AKX3 Padi4-201ENSMUST00000026381 2316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
SetxA2AKX3 Cacnb2-202ENSMUST00000114719 2117 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
SetxA2AKX3 Kcnk6-201ENSMUST00000085818 4084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
SetxA2AKX3 Gpsm1-204ENSMUST00000114134 2043 ntTSL 3 BASIC11.63□□□□□ -0.55
SetxA2AKX3 Cdkn2aip-202ENSMUST00000212175 3393 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
SetxA2AKX3 Zfp637-210ENSMUST00000164472 1098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
SetxA2AKX3 Gm17831-201ENSMUST00000205579 900 ntBASIC11.63□□□□□ -0.55
SetxA2AKX3 Gm45338-204ENSMUST00000210658 1105 ntTSL 5 BASIC11.63□□□□□ -0.55
SetxA2AKX3 Gm40709-203ENSMUST00000219695 973 ntTSL 5 BASIC11.63□□□□□ -0.55
SetxA2AKX3 Olfr117-201ENSMUST00000073636 954 ntAPPRIS P1 BASIC11.63□□□□□ -0.55
SetxA2AKX3 Vmn1r197-201ENSMUST00000091734 897 ntAPPRIS P1 BASIC11.63□□□□□ -0.55
SetxA2AKX3 Lst1-201ENSMUST00000097336 415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
SetxA2AKX3 Trmt10c-201ENSMUST00000059052 3002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
SetxA2AKX3 4930488B22Rik-201ENSMUST00000172500 1722 ntTSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
SetxA2AKX3 Ms4a15-201ENSMUST00000087923 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
SetxA2AKX3 Men1-202ENSMUST00000078137 2738 ntTSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
SetxA2AKX3 Gm45504-201ENSMUST00000211407 2107 ntBASIC11.63□□□□□ -0.55
SetxA2AKX3 Sema5b-202ENSMUST00000120756 4646 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
SetxA2AKX3 Adcyap1r1-204ENSMUST00000165857 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.63□□□□□ -0.55
SetxA2AKX3 Sh3gl3-206ENSMUST00000179318 1489 ntTSL 5 BASIC11.63□□□□□ -0.55
SetxA2AKX3 Slc14a2-202ENSMUST00000163367 1428 ntTSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
SetxA2AKX3 4930550C17Rik-201ENSMUST00000181629 1411 ntTSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
SetxA2AKX3 Cdkn1b-201ENSMUST00000003115 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
SetxA2AKX3 Clic6-201ENSMUST00000023670 3758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
SetxA2AKX3 Tgfb2-201ENSMUST00000045288 5116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
SetxA2AKX3 Psmd1-201ENSMUST00000027432 3112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
SetxA2AKX3 Popdc2-201ENSMUST00000023494 2169 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
SetxA2AKX3 Gm14585-201ENSMUST00000120713 634 ntBASIC11.63□□□□□ -0.55
SetxA2AKX3 Gm13257-201ENSMUST00000132840 665 ntTSL 3 BASIC11.63□□□□□ -0.55
SetxA2AKX3 Smyd1-205ENSMUST00000173297 947 ntTSL 5 BASIC11.63□□□□□ -0.55
SetxA2AKX3 Gm20714-202ENSMUST00000176436 748 ntTSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
SetxA2AKX3 Mir7677-201ENSMUST00000184226 67 ntBASIC11.63□□□□□ -0.55
SetxA2AKX3 Diablo-210ENSMUST00000200247 748 ntTSL 5 BASIC11.63□□□□□ -0.55
SetxA2AKX3 AC154290.1-201ENSMUST00000223786 1240 ntBASIC11.63□□□□□ -0.55
SetxA2AKX3 Pde7b-202ENSMUST00000164195 1665 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.63□□□□□ -0.55
SetxA2AKX3 Atp11a-201ENSMUST00000033818 7549 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
SetxA2AKX3 Adam10-201ENSMUST00000067880 4593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
SetxA2AKX3 Itgb4-210ENSMUST00000169928 6160 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.63□□□□□ -0.55
SetxA2AKX3 Mob3c-201ENSMUST00000030477 2884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
SetxA2AKX3 Atg16l1-201ENSMUST00000027512 3130 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
SetxA2AKX3 Cpped1-201ENSMUST00000073371 1922 ntTSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
SetxA2AKX3 Sp4-203ENSMUST00000222314 2677 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
SetxA2AKX3 Map4k4-202ENSMUST00000168431 5632 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.63□□□□□ -0.55
SetxA2AKX3 Bbof1-201ENSMUST00000081828 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
SetxA2AKX3 Six3os1-211ENSMUST00000176958 2889 ntTSL 2 BASIC11.63□□□□□ -0.55
SetxA2AKX3 Knop1-205ENSMUST00000116280 5382 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC11.63□□□□□ -0.55
SetxA2AKX3 Fbrs-202ENSMUST00000205432 4166 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.62□□□□□ -0.55
SetxA2AKX3 Ptbp2-201ENSMUST00000029780 3364 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
SetxA2AKX3 Strn-203ENSMUST00000145910 8629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
SetxA2AKX3 Spef1-202ENSMUST00000110218 2600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
SetxA2AKX3 9130024F11Rik-202ENSMUST00000185204 2628 ntTSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
SetxA2AKX3 Smyd4-201ENSMUST00000044530 3517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
SetxA2AKX3 Gm7851-201ENSMUST00000117574 323 ntBASIC11.62□□□□□ -0.55
SetxA2AKX3 Timm22-202ENSMUST00000120699 746 ntTSL 3 BASIC11.62□□□□□ -0.55
SetxA2AKX3 U2af1l4-206ENSMUST00000163654 781 ntTSL 2 BASIC11.62□□□□□ -0.55
SetxA2AKX3 U2af1l4-221ENSMUST00000167361 860 ntTSL 2 BASIC11.62□□□□□ -0.55
SetxA2AKX3 Gm15469-201ENSMUST00000201750 961 ntTSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
SetxA2AKX3 Gm10069-203ENSMUST00000204081 907 ntTSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
SetxA2AKX3 Med27-201ENSMUST00000028139 1254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
SetxA2AKX3 2310002L09Rik-201ENSMUST00000030101 958 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
SetxA2AKX3 Wsb2-202ENSMUST00000111959 1526 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
SetxA2AKX3 Eif4enif1-202ENSMUST00000110048 3712 ntTSL 5 BASIC11.62□□□□□ -0.55
SetxA2AKX3 Lsm14b-202ENSMUST00000058764 2566 ntTSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
SetxA2AKX3 Mme-206ENSMUST00000194150 3345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
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